UCSC Human Gene Sorter
 
genome assembly search
sort by display output 
#
Name
VisiGene
BLASTP
E-Value
Genome Position
Description
1LINC01099n/a
    
    
     
n/achr4 177,818,750long intergenic non-protein coding RNA 1099 (from HGNC LINC01099)
2ENSG00000232001n/a
    
    
     
n/achr2 106,532,930ENSG00000232001 (from geneSymbol)
3ENSG00000264513n/a
    
    
     
n/achr17 63,123,983ENSG00000264513 (from geneSymbol)
4CYP4F60Pn/a
n/a
n/a
n/a
n/achr9 42,951,098cytochrome P450 family 4 subfamily F member 60, pseudogene (from HGNC CYP4F60P)
5TRBV6-7n/a
n/a
n/a
n/a
n/achr7_KI270803v1_alt 471,654Probable non-functional open reading frame (ORF) of V region  of the variable domain of T cell receptor (TR) beta chain  (PubMed:24600447). Non-functional ORF generally cannot participate in  the synthesis of a productive T cell receptor (TR) chain due to altered  V-(D)-J or switch recombination and/or splicing site (at mRNA level)  and/or conserved amino acid change (protein level) (PubMed:9619395).  Alpha-beta T cell receptors are antigen specific receptors which are  essential to the immune response and are present on the cell surface of  T lymphocytes. Recognize peptide-major histocompatibility (MH) (pMH)  complexes that are displayed by antigen presenting cells (APC), a  prerequisite for efficient T cell adaptive immunity against pathogens  (PubMed:25493333). Binding of alpha-beta TR to pMH complex initiates  TR-CD3 clustering on the cell surface and intracellular activation of  LCK that phosphorylates the ITAM motifs of CD3G, CD3D, CD3E and CD247  enabling the recruitment of ZAP70. In turn ZAP70 phosphorylates LAT,  which recruits numerous signaling molecules to form the LAT  signalosome. The LAT signalosome propagates signal branching to three  major signaling pathways, the calcium, the mitogen-activated protein  kinase (MAPK) kinase and the nuclear factor NF-kappa-B (NF-kB)  pathways, leading to the mobilization of transcription factors that are  critical for gene expression and essential for T cell growth and  differentiation (PubMed:23524462). The T cell repertoire is generated  in the thymus, by V-(D)-J rearrangement. This repertoire is then shaped  by intrathymic selection events to generate a peripheral T cell pool of  self-MH restricted, non-autoaggressive T cells. Post-thymic interaction  of alpha-beta TR with the pMH complexes shapes TR structural and  functional avidity (PubMed:15040585). (from UniProt A0A0A0MS04)
6ENSG00000259993n/a
    
    
     
n/achr15 30,224,290ENSG00000259993 (from geneSymbol)
7ENSG00000242618n/a
    
    
     
n/achr3 72,206,429ENSG00000242618 (from geneSymbol)
8ENSG00000235279n/a
    
    
     
n/achr10 51,304,637ENSG00000235279 (from geneSymbol)
9OR7E155Pn/a
n/a
n/a
n/a
n/achr13 41,440,340olfactory receptor family 7 subfamily E member 155 pseudogene (from HGNC OR7E155P)
10OR8K2Pn/a
    
    
     
n/achr11 56,335,605olfactory receptor family 8 subfamily K member 2 pseudogene (from HGNC OR8K2P)
11SLC19A4Pn/a
    
    
     
n/achr2 227,640,787SLC19A4P (from geneSymbol)
12SLC19A4Pn/a
n/a
n/a
n/a
n/achr2 227,621,705chromosome 2 open reading frame 83, transcript variant 2 (from RefSeq NR_172911.1)
13AMELXn/a
n/a
n/a
n/a
n/achrX 11,297,087amelogenin X-linked, transcript variant 1 (from RefSeq NM_001142.2)
14ZNF385D-AS1n/a
    
    
     
n/achr3 21,561,387ZNF385D antisense RNA 1 (from RefSeq NR_046731.1)
15LINC01623n/a
    
    
     
n/achr6 28,861,487long intergenic non-protein coding RNA 1623 (from HGNC LINC01623)
16PES1P1n/a
    
    
     
n/achr4 134,327,930pescadillo ribosomal biogenesis factor 1 pseudogene 1 (from HGNC PES1P1)
17ENSG00000248475n/a
n/a
n/a
n/a
n/achr5 58,779,340ENSG00000248475 (from geneSymbol)
18ENSG00000227301n/a
    
    
     
n/achr9 33,721,122ENSG00000227301 (from geneSymbol)
19ENSG00000256258n/a
    
    
     
n/achr12 131,622,547ENSG00000256258 (from geneSymbol)
20ENSG00000234580n/a
    
    
     
n/achr10 44,596,656ENSG00000234580 (from geneSymbol)
21CHORDC2Pn/a
    
    
     
n/achr14 89,737,678cysteine and histidine rich domain containing 2, pseudogene (from HGNC CHORDC2P)
22GUSBP12n/a
n/a
n/a
n/a
n/achr7 57,202,211glucuronidase, beta pseudogene 12 (from HGNC GUSBP12)
23IL31n/a
    
    
     
n/achr12 122,173,125interleukin 31 (from RefSeq NM_001014336.2)
24RN7SKP114n/a
    
    
     
n/achr9 34,050,105RNA, 7SK small nuclear pseudogene 114 (from HGNC RN7SKP114)
25LINC01441n/a
    
    
     
n/achr20 55,423,766long intergenic non-protein coding RNA 1441 (from RefSeq NR_110064.1)
26ENSG00000288225n/a
n/a
n/a
n/a
n/achr9 41,644,597ENSG00000288225 (from geneSymbol)
27CRIPTOP2n/a
    
    
     
n/achr2 227,870,363CRIPTOP2 (from geneSymbol)
28ENSG00000234173n/a
    
    
     
n/achr10 54,571,140uncharacterized LOC105378311 (from RefSeq NR_134503.1)
29ENSG00000250712n/a
    
    
     
n/achr4 165,011,155ENSG00000250712 (from geneSymbol)
30HES3n/a
    
    
     
n/achr1 6,244,878hes family bHLH transcription factor 3 (from RefSeq NM_001024598.4)
31ENSG00000224529n/a
    
    
     
n/achr2 208,136,545ENSG00000224529 (from geneSymbol)
32ENSG00000227809n/a
    
    
     
n/achr9 74,378,199ENSG00000227809 (from geneSymbol)
33NDUFB1P1n/a
    
    
     
n/achr3 48,181,636NADH:ubiquinone oxidoreductase subunit B1 pseudogene 1 (from HGNC NDUFB1P1)
34LINC02278n/a
    
    
     
n/achr4 38,568,012long intergenic non-protein coding RNA 2278 (from HGNC LINC02278)
35ENSG00000257587n/a
    
    
     
n/achr12 73,913,138ENSG00000257587 (from geneSymbol)
36BNIP3P31n/a
    
    
     
n/achr19 22,299,422BCL2 interacting protein 3 pseudogene 31 (from HGNC BNIP3P31)
37SNORA70n/a
    
    
     
n/achr8 5,128,345small nucleolar RNA, H/ACA box 70 (from HGNC SNORA70)
38RPS10P29n/a
    
    
     
n/achr22 24,269,740ribosomal protein S10 pseudogene 29 (from HGNC RPS10P29)
39ENSG00000234275n/a
    
    
     
n/achr2 6,300,065ENSG00000234275 (from geneSymbol)
40ZBTB20-AS3n/a
    
    
     
n/achr3 114,874,814ZBTB20 antisense RNA 3 (from RefSeq NR_126422.1)
41KRTAP5-13Pn/a
    
    
     
n/achr11 71,568,807keratin associated protein 5-13, pseudogene (from HGNC KRTAP5-13P)
42ENSG00000250193n/a
    
    
     
n/achr4 129,302,098ENSG00000250193 (from geneSymbol)
43ENSG00000253424n/a
    
    
     
n/achr5 158,257,286ENSG00000253424 (from geneSymbol)
44ENSG00000253499n/a
    
    
     
n/achr8 114,318,655ENSG00000253499 (from geneSymbol)
45ENSG00000259312n/a
    
    
     
n/achr15 96,441,418ENSG00000259312 (from geneSymbol)
46OR14K1n/a
    
    
     
n/achr1 247,739,087olfactory receptor family 14 subfamily K member 1 (from RefSeq NM_001004732.2)
47CRIP1P4n/a
n/a
n/a
n/a
n/achr22 24,712,406cysteine rich protein 1 pseudogene 4 (from HGNC CRIP1P4)
48ENSG00000232309n/a
    
    
     
n/achr1 182,127,989ENSG00000232309 (from geneSymbol)
49RPL13AP21n/a
    
    
     
n/achr12 46,004,361ribosomal protein L13a pseudogene 21 (from HGNC RPL13AP21)
50ENSG00000258829n/a
    
    
     
n/achr14 79,073,447ENSG00000258829 (from geneSymbol)