UCSC Human Gene Sorter
 
genome assembly search
sort by display output 
#
Name
VisiGene
BLASTP
E-Value
Genome Position
Description
1IGKV1D-37n/a
    
    
     
2e-58chr2 89,884,978Probable non-functional open reading frame (ORF) of V region  of the variable domain of immunoglobulin light chains  (PubMed:24600447). Non-functional ORF generally cannot participate in  the synthesis of a productive immunoglobulin chain due to altered V-  (D)-J or switch recombination and/or splicing site (at mRNA level)  and/or conserved amino acid change (protein level) (PubMed:9619395).  Immunoglobulins, also known as antibodies, are membrane-bound or  secreted glycoproteins produced by B lymphocytes. In the recognition  phase of humoral immunity, the membrane-bound immunoglobulins serve as  receptors which, upon binding of a specific antigen, trigger the clonal  expansion and differentiation of B lymphocytes into immunoglobulins-  secreting plasma cells. Secreted immunoglobulins mediate the effector  phase of humoral immunity, which results in the elimination of bound  antigens (PubMed:22158414, PubMed:20176268). The antigen binding site  is formed by the variable domain of one heavy chain, together with that  of its associated light chain. Thus, each immunoglobulin has two  antigen binding sites with remarkable affinity for a particular  antigen. The variable domains are assembled by a process called V-(D)-J  rearrangement and can then be subjected to somatic hypermutations  which, after exposure to antigen and selection, allow affinity  maturation for a particular antigen (PubMed:20176268, PubMed:17576170). (from UniProt P0DSN7)
2IGKV3OR2-268n/a
    
    
     
1e-28chr2 87,338,773immunoglobulin kappa variable 3/OR2-268 (non-functional) (from HGNC IGKV3OR2-268)
3OR5BQ1Pn/a
    
    
     
n/achr11 57,029,565olfactory receptor family 5 subfamily BQ member 1 pseudogene (from HGNC OR5BQ1P)
4IGKV2-18n/a
    
    
     
n/achr2 89,129,103immunoglobulin kappa variable 2-18 (pseudogene) (from HGNC IGKV2-18)
5IGHV1-17n/a
    
    
     
n/achr14 106,174,551immunoglobulin heavy variable 1-17 (pseudogene) (from HGNC IGHV1-17)
6RN7SL706Pn/a
n/a
n/a
n/a
n/achr14 68,149,762RNA, 7SL, cytoplasmic 706, pseudogene (from HGNC RN7SL706P)
7IGLV1-62n/a
    
    
     
n/achr22 22,086,835immunoglobulin lambda variable 1-62 (pseudogene) (from HGNC IGLV1-62)
8MRPL42P2n/a
    
    
     
n/achr6 16,171,818mitochondrial ribosomal protein L42 pseudogene 2 (from HGNC MRPL42P2)
9RNA5SP260n/a
    
    
     
n/achr8 29,048,549RNA, 5S ribosomal pseudogene 260 (from HGNC RNA5SP260)
10IGLV2-33n/a
n/a
n/a
n/a
0.000002chr22 22,588,421Probable non-functional open reading frame (ORF) of V region  of the variable domain of immunoglobulin light chains  (PubMed:24600447). Non-functional ORF generally cannot participate in  the synthesis of a productive immunoglobulin chain due to altered V-  (D)-J or switch recombination and/or splicing site (at mRNA level)  and/or conserved amino acid change (protein level) (PubMed:9619395).  Immunoglobulins, also known as antibodies, are membrane-bound or  secreted glycoproteins produced by B lymphocytes. In the recognition  phase of humoral immunity, the membrane-bound immunoglobulins serve as  receptors which, upon binding of a specific antigen, trigger the clonal  expansion and differentiation of B lymphocytes into immunoglobulins-  secreting plasma cells. Secreted immunoglobulins mediate the effector  phase of humoral immunity, which results in the elimination of bound  antigens (PubMed:22158414, PubMed:20176268). The antigen binding site  is formed by the variable domain of one heavy chain, together with that  of its associated light chain. Thus, each immunoglobulin has two  antigen binding sites with remarkable affinity for a particular  antigen. The variable domains are assembled by a process called V-(D)-J  rearrangement and can then be subjected to somatic hypermutations  which, after exposure to antigen and selection, allow affinity  maturation for a particular antigen (PubMed:20176268, PubMed:17576170). (from UniProt A0A075B6J2)
11RN7SL301Pn/a
n/a
n/a
n/a
n/achr17 36,110,298RNA, 7SL, cytoplasmic 301, pseudogene (from HGNC RN7SL301P)
12OR5G1Pn/a
n/a
n/a
n/a
n/achr11 56,775,733olfactory receptor family 5 subfamily G member 1 pseudogene (from HGNC OR5G1P)
13ENSG00000231392n/a
    
    
     
n/achr22 22,774,610ENSG00000231392 (from geneSymbol)
14IGLV3-6n/a
    
    
     
n/achr22 22,850,499immunoglobulin lambda variable 3-6 (pseudogene) (from HGNC IGLV3-6)
15ENSG00000226918n/a
    
    
     
n/achrY 21,315,081ENSG00000226918 (from geneSymbol)
16RNU4-53Pn/a
    
    
     
n/achr9 36,267,852RNA, U4 small nuclear 53, pseudogene (from HGNC RNU4-53P)
17ENSG00000267085n/a
    
    
     
n/achr9 65,222,649ENSG00000267085 (from geneSymbol)
18IGLVI-63n/a
    
    
     
n/achr22 22,080,016immunoglobulin lambda variable (I)-63 (pseudogene) (from HGNC IGLVI-63)
19C11orf98P3n/a
    
    
     
n/achr3 23,389,785C11orf98P3 (from geneSymbol)
20ENSG00000225741n/a
    
    
     
n/achr22 22,104,038ENSG00000225741 (from geneSymbol)
21ENSG00000243038n/a
    
    
     
n/achr14 50,053,213ENSG00000243038 (from geneSymbol)
22IGHV1-12n/a
    
    
     
n/achr14 106,122,564immunoglobulin heavy variable 1-12 (pseudogene) (from HGNC IGHV1-12)
23IGKV2D-23n/a
    
    
     
n/achr2 90,009,664immunoglobulin kappa variable 2D-23 (pseudogene) (from HGNC IGKV2D-23)
24IGLV3-13n/a
    
    
     
n/achr22 22,762,405immunoglobulin lambda variable 3-13 (pseudogene) (from HGNC IGLV3-13)
25IGHV3-71n/a
    
    
     
n/achr14 106,775,387immunoglobulin heavy variable 3-71 (pseudogene) (from HGNC IGHV3-71)
26ENSG00000270542n/a
    
    
     
n/achr9 33,449,848ENSG00000270542 (from geneSymbol)
27ENSG00000224523n/a
    
    
     
n/achrX 81,418,107ENSG00000224523 (from geneSymbol)
28IGHV1-14n/a
    
    
     
n/achr14 106,146,011immunoglobulin heavy variable 1-14 (pseudogene) (from HGNC IGHV1-14)
29ENSG00000205325n/a
    
    
     
n/achr17 14,773,893ENSG00000205325 (from geneSymbol)
30IGHV3-32n/a
n/a
n/a
n/a
n/achr14 106,331,334immunoglobulin heavy variable 3-32 (pseudogene) (from HGNC IGHV3-32)
31ENSG00000236731n/a
    
    
     
n/achr1 157,630,333ENSG00000236731 (from geneSymbol)
32PRELID3BP6n/a
    
    
     
n/achr5 42,917,699PRELI domain containing 3B pseudogene 6 (from HGNC PRELID3BP6)
33RNU6-844Pn/a
    
    
     
n/achr15 57,405,124RNA, U6 small nuclear 844, pseudogene (from HGNC RNU6-844P)
34ENSG00000258115n/a
    
    
     
n/achr12 72,051,763ENSG00000258115 (from geneSymbol)
35IGHV3-52n/a
    
    
     
n/achr14 106,586,601immunoglobulin heavy variable 3-52 (pseudogene) (from HGNC IGHV3-52)
36IGHVII-60-1n/a
    
    
     
n/achr14 106,637,845immunoglobulin heavy variable (II)-60-1 (pseudogene) (from HGNC IGHVII-60-1)
37RNA5SP368n/a
n/a
n/a
n/a
n/achr12 101,779,871RNA, 5S ribosomal pseudogene 368 (from HGNC RNA5SP368)
38IGLV2-34n/a
    
    
     
n/achr22 22,580,155immunoglobulin lambda variable 2-34 (pseudogene) (from HGNC IGLV2-34)
39IGKV2OR2-2n/a
    
    
     
n/achr2 97,050,878immunoglobulin kappa variable 2/OR2-2 (pseudogene) (from HGNC IGKV2OR2-2)
40LINC02707n/a
    
    
     
n/achr11 34,572,429LINC02707 (from geneSymbol)
41AKR1D1P1n/a
    
    
     
n/achr1 167,520,061aldo-keto reductase family 1 member D1 pseudogene 1 (from HGNC AKR1D1P1)
42IGKV2-4n/a
    
    
     
n/achr2 88,932,023immunoglobulin kappa variable 2-4 (pseudogene) (from HGNC IGKV2-4)
43IGLV3-24n/a
    
    
     
n/achr22 22,694,695immunoglobulin lambda variable 3-24 (pseudogene) (from HGNC IGLV3-24)
44RNU6-226Pn/a
    
    
     
n/achr5 175,703,951RNA, U6 small nuclear 226, pseudogene (from HGNC RNU6-226P)
45PPIAP60n/a
n/a
n/a
n/a
n/achr2 11,351,872peptidylprolyl isomerase A pseudogene 60 (from HGNC PPIAP60)
46UGT1A13Pn/a
    
    
     
n/achr2 233,648,476UDP glucuronosyltransferase family 1 member A13, pseudogene (from HGNC UGT1A13P)
47OR9G4n/a
    
    
     
n/achr11 56,744,960olfactory receptor family 9 subfamily G member 4, transcript variant 2 (from RefSeq NM_001390832.1)
48ENSG00000258021n/a
    
    
     
n/achr12 51,900,950ENSG00000258021 (from geneSymbol)
49IGLC4n/a
    
    
     
n/achr22 22,910,951immunoglobulin lambda constant 4 (pseudogene) (from HGNC IGLC4)
50ENSG00000261030n/a
    
    
     
n/achrX 13,094,116ENSG00000261030 (from geneSymbol)