UCSC Human Gene Sorter
 
genome assembly search
sort by display output 
#
Name
VisiGene
BLASTP
E-Value
Genome Position
Description
1IGHVII-78-1n/a
    
    
     
n/achr14 106,865,761immunoglobulin heavy variable (II)-78-1 (pseudogene) (from HGNC IGHVII-78-1)
2Y_RNAn/a
n/a
n/a
n/a
n/achr20 44,344,886Y_RNA (from geneSymbol)
3RPL6P23n/a
    
    
     
n/achr8 94,202,482RPL6P23 (from geneSymbol)
4IGHV3-79n/a
n/a
n/a
n/a
n/achr14 106,867,876immunoglobulin heavy variable 3-79 (pseudogene) (from HGNC IGHV3-79)
5HNRNPA1P17n/a
    
    
     
n/achr3 108,326,167heterogeneous nuclear ribonucleoprotein A1 pseudogene 17 (from HGNC HNRNPA1P17)
6IGHV4-80n/a
n/a
n/a
n/a
n/achr14 106,872,984immunoglobulin heavy variable 4-80 (pseudogene) (from HGNC IGHV4-80)
7IGHV7-81n/a
    
    
     
n/achr14 106,874,827Probable non-functional open reading frame (ORF) of V region  of the variable domain of immunoglobulin heavy chains  (PubMed:24600447). Non-functional ORF generally cannot participate in  the synthesis of a productive immunoglobulin chain due to altered V-  (D)-J or switch recombination and/or splicing site (at mRNA level)  and/or conserved amino acid change (protein level) (PubMed:9619395).  Immunoglobulins, also known as antibodies, are membrane-bound or  secreted glycoproteins produced by B lymphocytes. In the recognition  phase of humoral immunity, the membrane-bound immunoglobulins serve as  receptors which, upon binding of a specific antigen, trigger the clonal  expansion and differentiation of B lymphocytes into immunoglobulins-  secreting plasma cells. Secreted immunoglobulins mediate the effector  phase of humoral immunity, which results in the elimination of bound  antigens (PubMed:22158414, PubMed:20176268). The antigen binding site  is formed by the variable domain of one heavy chain, together with that  of its associated light chain. Thus, each immunoglobulin has two  antigen binding sites with remarkable affinity for a particular  antigen. The variable domains are assembled by a process called V-(D)-J  rearrangement and can then be subjected to somatic hypermutations  which, after exposure to antigen and selection, allow affinity  maturation for a particular antigen (PubMed:20176268, PubMed:17576170). (from UniProt A0A0B4J1V7)
8BUB1P1n/a
    
    
     
n/achr10 127,868,184BUB1 mitotic checkpoint serine/threonine kinase pseudogene 1 (from HGNC BUB1P1)
9RNU2-33Pn/a
    
    
     
n/achr14 96,384,719RNA, U2 small nuclear 33, pseudogene (from HGNC RNU2-33P)
10RNA5SP434n/a
    
    
     
n/achr17 4,056,816RNA, 5S ribosomal pseudogene 434 (from HGNC RNA5SP434)
11RNA5SP507n/a
    
    
     
n/achrX 70,253,102RNA, 5S ribosomal pseudogene 507 (from HGNC RNA5SP507)
12ENSG00000256843n/a
    
    
     
n/achr12 31,748,170ENSG00000256843 (from geneSymbol)
13MIR3944n/a
    
    
     
n/achr10 133,371,609microRNA 3944 (from RefSeq NR_037509.1)
14HTR3En/a
n/a
n/a
n/a
n/achr3 184,102,0295-hydroxytryptamine receptor 3E, transcript variant 4 (from RefSeq NM_001256613.2)
15CTNNA1P1n/a
    
    
     
n/achr5 115,391,006catenin alpha 1 pseudogene 1 (from HGNC CTNNA1P1)
16ENSG00000258021n/a
    
    
     
n/achr12 51,900,950ENSG00000258021 (from geneSymbol)
17UGT1A13Pn/a
    
    
     
n/achr2 233,648,476UDP glucuronosyltransferase family 1 member A13, pseudogene (from HGNC UGT1A13P)
18ENSG00000240995n/a
    
    
     
n/achr17 49,148,725ENSG00000240995 (from geneSymbol)
19TAS2R38n/a
    
    
     
n/achr7 141,973,202taste 2 receptor member 38 (from RefSeq NM_176817.5)
20DEFA11Pn/a
    
    
     
n/achr8 7,029,065defensin alpha 11, pseudogene (from RefSeq NR_073421.2)
21HTR3E-AS1n/a
    
    
     
n/achr3 184,100,148HTR3E antisense RNA 1 (from RefSeq NR_133658.1)
22RPL9P28n/a
    
    
     
n/achr17 48,691,405ribosomal protein L9 pseudogene 28 (from HGNC RPL9P28)
23RPL32P33n/a
    
    
     
n/achr17 72,627,427ribosomal protein L32 pseudogene 33 (from HGNC RPL32P33)
24UGT2B29Pn/a
    
    
     
n/achr4 68,513,544UDP glucuronosyltransferase family 2 member B29, pseudogene (from HGNC UGT2B29P)
25MIR1227n/a
    
    
     
n/achr19 2,234,105microRNA 1227 (from RefSeq NR_031596.1)
26ENSG00000232806n/a
    
    
     
n/achr21 41,561,041ENSG00000232806 (from geneSymbol)
27KRTAP13-2n/a
n/a
n/a
n/a
n/achr21 30,371,830keratin associated protein 13-2 (from RefSeq NM_181621.4)
28ENSG00000226991n/a
    
    
     
n/achr2 110,358,958ENSG00000226991 (from geneSymbol)
29ENSG00000271302n/a
    
    
     
n/achr4 121,118,516ENSG00000271302 (from geneSymbol)
30RPS16P2n/a
    
    
     
n/achr2 20,155,837ribosomal protein S16 pseudogene 2 (from HGNC RPS16P2)
31APOOP2n/a
    
    
     
n/achr3 87,595,107apolipoprotein O pseudogene 2 (from HGNC APOOP2)
32ENSG00000268209n/a
    
    
     
n/achr4 69,387,943ENSG00000268209 (from geneSymbol)
33RN7SL246Pn/a
n/a
n/a
n/a
n/achr12 45,874,182RNA, 7SL, cytoplasmic 246, pseudogene (from HGNC RN7SL246P)
34ENSG00000282610n/a
n/a
n/a
n/a
n/achr7_KI270803v1_alt 511,206V region of the variable domain of T cell receptor (TR) beta  chain that participates in the antigen recognition (PubMed:24600447).  Alpha-beta T cell receptors are antigen specific receptors which are  essential to the immune response and are present on the cell surface of  T lymphocytes. Recognize peptide-major histocompatibility (MH) (pMH)  complexes that are displayed by antigen presenting cells (APC), a  prerequisite for efficient T cell adaptive immunity against pathogens  (PubMed:25493333). Binding of alpha-beta TR to pMH complex initiates  TR-CD3 clustering on the cell surface and intracellular activation of  LCK that phosphorylates the ITAM motifs of CD3G, CD3D, CD3E and CD247  enabling the recruitment of ZAP70. In turn ZAP70 phosphorylates LAT,  which recruits numerous signaling molecules to form the LAT  signalosome. The LAT signalosome propagates signal branching to three  major signaling pathways, the calcium, the mitogen-activated protein  kinase (MAPK) kinase and the nuclear factor NF-kappa-B (NF-kB)  pathways, leading to the mobilization of transcription factors that are  critical for gene expression and essential for T cell growth and  differentiation (PubMed:23524462). The T cell repertoire is generated  in the thymus, by V-(D)-J rearrangement. This repertoire is then shaped  by intrathymic selection events to generate a peripheral T cell pool of  self-MH restricted, non-autoaggressive T cells. Post-thymic interaction  of alpha-beta TR with the pMH complexes shapes TR structural and  functional avidity (PubMed:15040585). (from UniProt A0A0J9YX75)
35RPS3AP46n/a
    
    
     
n/achr14 53,613,064ribosomal protein S3a pseudogene 46 (from HGNC RPS3AP46)
36BRWD1P3n/a
    
    
     
n/achr7 17,033,283bromodomain and WD repeat domain containing 1 pseudogene 3 (from HGNC BRWD1P3)
37RN7SL865Pn/a
n/a
n/a
n/a
n/achr12 115,717,869RNA, 7SL, cytoplasmic 865, pseudogene (from HGNC RN7SL865P)
38ENSG00000261627n/a
    
    
     
n/achr18 6,642,224ENSG00000261627 (from geneSymbol)
39RN7SL385Pn/a
n/a
n/a
n/a
n/achr22 37,669,601RNA, 7SL, cytoplasmic 385, pseudogene (from HGNC RN7SL385P)
40RPS4XP8n/a
    
    
     
n/achr6 154,576,694ribosomal protein S4X pseudogene 8 (from HGNC RPS4XP8)
41AKIRIN1P1n/a
    
    
     
n/achr12 80,561,288akirin 1 pseudogene 1 (from HGNC AKIRIN1P1)
42ENSG00000228289n/a
    
    
     
n/achr1 163,769,515ENSG00000228289 (from geneSymbol)
43ENSG00000228776n/a
    
    
     
n/achr1 42,141,013ENSG00000228776 (from geneSymbol)
44RN7SKP249n/a
    
    
     
n/achr8 101,138,136RNA, 7SK small nuclear pseudogene 249 (from HGNC RN7SKP249)
45ENSG00000226041n/a
    
    
     
n/achr2 16,203,328ENSG00000226041 (from geneSymbol)
46SDHBP1n/a
    
    
     
n/achr3 135,926,029SDHBP1 (from geneSymbol)
47ENSG00000232072n/a
    
    
     
n/achr7 46,970,152ENSG00000232072 (from geneSymbol)
48RN7SL434Pn/a
n/a
n/a
n/a
n/achr3 196,397,643RNA, 7SL, cytoplasmic 434, pseudogene (from HGNC RN7SL434P)
49GMFBP1n/a
    
    
     
n/achr3 100,665,263glia maturation factor beta pseudogene 1 (from HGNC GMFBP1)
50RPL34P1n/a
    
    
     
n/achr1 168,210,792ribosomal protein L34 pseudogene 1 (from HGNC RPL34P1)