UCSC Human Gene Sorter
 
genome assembly search
sort by display output 
#
Name
VisiGene
BLASTP
E-Value
Genome Position
Description
1ENSG00000253105n/a
n/a
n/a
n/a
n/achr8 96,379,119uncharacterized LOC102724804, transcript variant 1 (from RefSeq NR_125828.1)
2RNU1-36Pn/a
    
    
     
n/achr4 88,000,319RNA, U1 small nuclear 36, pseudogene (from HGNC RNU1-36P)
3SSXP10n/a
    
    
     
n/achr6 118,589,352SSX family pseudogene 10 (from HGNC SSXP10)
4ENSG00000225028n/a
    
    
     
n/achr1 47,819,151ENSG00000225028 (from geneSymbol)
5HMGB3P7n/a
    
    
     
n/achr13 101,802,183high mobility group box 3 pseudogene 7 (from HGNC HMGB3P7)
6HSPA8P4n/a
    
    
     
n/achr5 130,140,990heat shock protein family A (Hsp70) member 8 pseudogene 4 (from HGNC HSPA8P4)
7HCCAT5n/a
    
    
     
n/achr16 73,096,013hepatocellular carcinoma associated transcript 5 (non-protein coding) (from HGNC HCCAT5)
8CSPG4P13n/a
n/a
n/a
n/a
n/achr15 77,899,679chondroitin sulfate proteoglycan 4 pseudogene 13 (from HGNC CSPG4P13)
9ENSG00000290664n/a
n/a
n/a
n/a
n/achr15 77,903,011ENSG00000290664 (from geneSymbol)
10PPIAP52n/a
    
    
     
n/achr17 8,560,716peptidylprolyl isomerase A pseudogene 52 (from HGNC PPIAP52)
11LINC02468n/a
    
    
     
n/achr12 20,128,553long intergenic non-protein coding RNA 2468 (from HGNC LINC02468)
12KIAA1191P2n/a
    
    
     
n/achr11 101,594,477KIAA1191P2 (from geneSymbol)
13ENSG00000293058n/a
    
    
     
n/achr11 101,589,725ENSG00000293058 (from geneSymbol)
14ENSG00000229625n/a
    
    
     
n/achr8 98,964,856ENSG00000229625 (from geneSymbol)
15CASC18n/a
    
    
     
n/achr12 105,724,636cancer susceptibility 18 (non-protein coding) (from HGNC CASC18)
16MIR3622Bn/a
n/a
n/a
n/a
n/achr8 27,701,720microRNA 3622b (from RefSeq NR_037418.1)
17TRAV39n/a
    
    
     
n/achr14 22,304,303V region of the variable domain of T cell receptor (TR) alpha  chain that participates in the antigen recognition (PubMed:24600447).  Alpha-beta T cell receptors are antigen specific receptors which are  essential to the immune response and are present on the cell surface of  T lymphocytes. Recognize peptide-major histocompatibility (MH) (pMH)  complexes that are displayed by antigen presenting cells (APC), a  prerequisite for efficient T cell adaptive immunity against pathogens  (PubMed:25493333). Binding of alpha-beta TR to pMH complex initiates  TR-CD3 clustering on the cell surface and intracellular activation of  LCK that phosphorylates the ITAM motifs of CD3G, CD3D, CD3E and CD247  enabling the recruitment of ZAP70. In turn ZAP70 phosphorylates LAT,  which recruits numerous signaling molecules to form the LAT  signalosome. The LAT signalosome propagates signal branching to three  major signaling pathways, the calcium, the mitogen-activated protein  kinase (MAPK) kinase and the nuclear factor NF-kappa-B (NF-kB)  pathways, leading to the mobilization of transcription factors that are  critical for gene expression and essential for T cell growth and  differentiation (PubMed:23524462). The T cell repertoire is generated  in the thymus, by V-(D)-J rearrangement. This repertoire is then shaped  by intrathymic selection events to generate a peripheral T cell pool of  self-MH restricted, non-autoaggressive T cells. Post-thymic interaction  of alpha-beta TR with the pMH complexes shapes TR structural and  functional avidity (PubMed:15040585). (from UniProt A0A0B4J263)
18LINC01449n/a
    
    
     
n/achr7 41,117,555long intergenic non-protein coding RNA 1449 (from RefSeq NR_110832.1)
19RPS3AP14n/a
    
    
     
n/achr3 125,795,495ribosomal protein S3a pseudogene 14 (from HGNC RPS3AP14)
20GTF2F2P1n/a
    
    
     
n/achr4 147,506,428general transcription factor IIF subunit 2 pseudogene 1 (from HGNC GTF2F2P1)
21ENSG00000229263n/a
    
    
     
n/achr7 30,800,050ENSG00000229263 (from geneSymbol)
22ENSG00000244604n/a
    
    
     
n/achr17 8,561,403ENSG00000244604 (from geneSymbol)
23ENSG00000249002n/a
    
    
     
n/achr4 119,006,216ENSG00000249002 (from geneSymbol)
24ENSG00000254851n/a
    
    
     
n/achr11 117,137,055ENSG00000254851 (from geneSymbol)
25RNU6-1098Pn/a
    
    
     
n/achr3 149,525,678RNA, U6 small nuclear 1098, pseudogene (from HGNC RNU6-1098P)
26ENSG00000232375n/a
    
    
     
n/achr3 43,037,286ENSG00000232375 (from geneSymbol)
27ENSG00000270387n/a
    
    
     
n/achr4 147,916,957ENSG00000270387 (from geneSymbol)
28WWTR1-IT1n/a
    
    
     
n/achr3 149,649,590WWTR1 intronic transcript 1 (from HGNC WWTR1-IT1)
29RNU1-100Pn/a
    
    
     
n/achr3 142,420,287RNA, U1 small nuclear 100, pseudogene (from HGNC RNU1-100P)
30ENSG00000258976n/a
    
    
     
n/achr14 74,615,652ENSG00000258976 (from geneSymbol)
31ENSG00000269950n/a
    
    
     
n/achr21 16,578,677ENSG00000269950 (from geneSymbol)
32PSME2P4n/a
    
    
     
n/achr4 37,995,848proteasome activator subunit 2 pseudogene 4 (from HGNC PSME2P4)
33ENSG00000226576n/a
    
    
     
n/achr10 49,001,730ENSG00000226576 (from geneSymbol)
34OR7E2Pn/a
    
    
     
n/achr11 86,857,503olfactory receptor family 7 subfamily E member 2 pseudogene (from RefSeq NR_045004.1)
35SETP12n/a
    
    
     
n/achr4 120,896,288SET pseudogene 12 (from HGNC SETP12)
36ENSG00000255191n/a
    
    
     
n/achr11 70,000,845ENSG00000255191 (from geneSymbol)
37ENSG00000261646n/a
    
    
     
n/achr4 173,468,937ENSG00000261646 (from geneSymbol)
38KIRREL1-IT1n/a
    
    
     
n/achr1 158,028,358KIRREL1 intronic transcript 1 (from RefSeq NR_145471.1)
39RPS23P1n/a
    
    
     
n/achr8 97,865,269ribosomal protein S23 pseudogene 1 (from HGNC RPS23P1)
40ENSG00000254850n/a
    
    
     
n/achr11 67,935,742ENSG00000254850 (from geneSymbol)
41ENSG00000220702n/a
    
    
     
n/achr22 44,365,917ENSG00000220702 (from geneSymbol)
42COX6CP10n/a
    
    
     
n/achr3 33,554,747cytochrome c oxidase subunit 6C pseudogene 10 (from HGNC COX6CP10)
43TILAMn/a
    
    
     
n/achr17 50,212,433TILAM (from geneSymbol)
44ZNF630-AS1n/a
n/a
n/a
n/a
n/achrX 48,061,446ZNF630 antisense RNA 1 (from RefSeq NR_046742.2)
45NOP56P1n/a
    
    
     
n/achr6 28,783,818NOP56 ribonucleoprotein pseudogene 1 (from HGNC NOP56P1)
46RNA5SP298n/a
    
    
     
n/achr10 282,070RNA, 5S ribosomal pseudogene 298 (from HGNC RNA5SP298)
47ENSG00000229720n/a
    
    
     
n/achr6 169,034,919uncharacterized LOC101929460 (from RefSeq NR_134622.1)
48ENSG00000270077n/a
    
    
     
n/achr8 97,144,446ENSG00000270077 (from geneSymbol)
49TCEAL3-AS1n/a
    
    
     
n/achrX 103,626,284TCEAL3 antisense RNA 1 (from HGNC TCEAL3-AS1)
50ENSG00000237550n/a
n/a
n/a
n/a
n/achr15 82,372,599ENSG00000237550 (from geneSymbol)