UCSC Human Gene Sorter
 
genome assembly search
sort by display output 
#
Name
VisiGene
BLASTP
E-Value
Genome Position
Description
1ENSG00000254287n/a
    
    
     
n/achr8 39,919,483ENSG00000254287 (from geneSymbol)
2NT5C3AP2n/a
    
    
     
n/achr3 111,634,380NT5C3AP2 (from geneSymbol)
3ENSG00000260695n/a
    
    
     
n/achr16 65,862,448ENSG00000260695 (from geneSymbol)
4ALPPn/a
    
    
     
n/achr2 232,380,820alkaline phosphatase, placental (from RefSeq NM_001632.5)
5ENSG00000264125n/a
    
    
     
n/achr17 30,205,393ENSG00000264125 (from geneSymbol)
6SOD1P3n/a
    
    
     
n/achr8 125,952,087superoxide dismutase 1 pseudogene 3 (from HGNC SOD1P3)
7HTR3Cn/a
    
    
     
n/achr3 184,056,8605-hydroxytryptamine receptor 3C (from RefSeq NM_130770.3)
8ENSG00000241490n/a
    
    
     
n/achr3 114,225,297ENSG00000241490 (from geneSymbol)
9PLA2G10CPn/a
    
    
     
n/achr16 29,080,588PLA2G10CP (from geneSymbol)
10ENSG00000290677n/a
    
    
     
n/achr16 29,105,684ENSG00000290677 (from geneSymbol)
11MYO16-AS1n/a
    
    
     
n/achr13 109,182,692MYO16 antisense RNA 1 (from RefSeq NR_047700.1)
12TRBV23-1n/a
    
    
     
n/achr7 142,646,214Probable non-functional open reading frame (ORF) of V region  of the variable domain of T cell receptor (TR) beta chain  (PubMed:24600447). Non-functional ORF generally cannot participate in  the synthesis of a productive T cell receptor (TR) chain due to altered  V-(D)-J or switch recombination and/or splicing site (at mRNA level)  and/or conserved amino acid change (protein level) (PubMed:9619395).  Alpha-beta T cell receptors are antigen specific receptors which are  essential to the immune response and are present on the cell surface of  T lymphocytes. Recognize peptide-major histocompatibility (MH) (pMH)  complexes that are displayed by antigen presenting cells (APC), a  prerequisite for efficient T cell adaptive immunity against pathogens  (PubMed:25493333). Binding of alpha-beta TR to pMH complex initiates  TR-CD3 clustering on the cell surface and intracellular activation of  LCK that phosphorylates the ITAM motifs of CD3G, CD3D, CD3E and CD247  enabling the recruitment of ZAP70. In turn ZAP70 phosphorylates LAT,  which recruits numerous signaling molecules to form the LAT  signalosome. The LAT signalosome propagates signal branching to three  major signaling pathways, the calcium, the mitogen-activated protein  kinase (MAPK) kinase and the nuclear factor NF-kappa-B (NF-kB)  pathways, leading to the mobilization of transcription factors that are  critical for gene expression and essential for T cell growth and  differentiation (PubMed:23524462). The T cell repertoire is generated  in the thymus, by V-(D)-J rearrangement. This repertoire is then shaped  by intrathymic selection events to generate a peripheral T cell pool of  self-MH restricted, non-autoaggressive T cells. Post-thymic interaction  of alpha-beta TR with the pMH complexes shapes TR structural and  functional avidity (PubMed:15040585). (from UniProt A0A0A0MS06)
13ENSG00000249574n/a
    
    
     
n/achr7 381,035uncharacterized LOC442497 (from RefSeq NR_033960.1)
14IGHEn/a
n/a
n/a
n/a
n/achr14 105,599,709Constant region of immunoglobulin heavy chains.  Immunoglobulins, also known as antibodies, are membrane-bound or  secreted glycoproteins produced by B lymphocytes. In the recognition  phase of humoral immunity, the membrane-bound immunoglobulins serve as  receptors which, upon binding of a specific antigen, trigger the clonal  expansion and differentiation of B lymphocytes into immunoglobulins-  secreting plasma cells. Secreted immunoglobulins mediate the effector  phase of humoral immunity, which results in the elimination of bound  antigens (PubMed:22158414, PubMed:20176268). The antigen binding site  is formed by the variable domain of one heavy chain, together with that  of its associated light chain. Thus, each immunoglobulin has two  antigen binding sites with remarkable affinity for a particular  antigen. The variable domains are assembled by a process called V-(D)-J  rearrangement and can then be subjected to somatic hypermutations  which, after exposure to antigen and selection, allow affinity  maturation for a particular antigen (PubMed:17576170, PubMed:20176268). (from UniProt P01854)
15ENSG00000229664n/a
    
    
     
n/achr10 6,031,202ENSG00000229664 (from geneSymbol)
16IGHV1OR15-3n/a
    
    
     
n/achr15 22,178,324immunoglobulin heavy variable 1/OR15-3 (pseudogene) (from HGNC IGHV1OR15-3)
17RPSAP20n/a
    
    
     
n/achr1 56,208,011ribosomal protein SA pseudogene 20 (from HGNC RPSAP20)
18GIMAP3Pn/a
n/a
n/a
n/a
n/achr7 150,747,310GTPase, IMAP family member 3 pseudogene (from HGNC GIMAP3P)
19AK4P4n/a
    
    
     
n/achr9 5,856,103adenylate kinase 4 pseudogene 4 (from HGNC AK4P4)
20TMEM236n/a
n/a
n/a
n/a
n/achr10 17,776,534transmembrane protein 236 (from RefSeq NM_001098844.3)
21ENSG00000264705n/a
    
    
     
n/achr18 69,213,313ENSG00000264705 (from geneSymbol)
22HTRA4n/a
    
    
     
n/achr8 38,981,445HtrA serine peptidase 4 (from RefSeq NM_153692.4)
23ENSG00000228027n/a
    
    
     
n/achr10 11,010,641ENSG00000228027 (from geneSymbol)
24ENSG00000268316n/a
    
    
     
n/achr19 51,840,358ENSG00000268316 (from geneSymbol)
25LINC00974n/a
    
    
     
n/achr17 41,552,050long intergenic non-protein coding RNA 974 (from RefSeq NR_038442.1)
26ENSG00000258303n/a
    
    
     
n/achr12 93,837,102ENSG00000258303 (from geneSymbol)
27GPR82n/a
    
    
     
n/achrX 41,727,155G protein-coupled receptor 82 (from RefSeq NM_080817.5)
28TRAV17n/a
    
    
     
n/achr14 21,997,853V region of the variable domain of T cell receptor (TR) alpha  chain that participates in the antigen recognition (PubMed:24600447).  Alpha-beta T cell receptors are antigen specific receptors which are  essential to the immune response and are present on the cell surface of  T lymphocytes. Recognize peptide-major histocompatibility (MH) (pMH)  complexes that are displayed by antigen presenting cells (APC), a  prerequisite for efficient T cell adaptive immunity against pathogens  (PubMed:25493333). Binding of alpha-beta TR to pMH complex initiates  TR-CD3 clustering on the cell surface and intracellular activation of  LCK that phosphorylates the ITAM motifs of CD3G, CD3D, CD3E and CD247  enabling the recruitment of ZAP70. In turn ZAP70 phosphorylates LAT,  which recruits numerous signaling molecules to form the LAT  signalosome. The LAT signalosome propagates signal branching to three  major signaling pathways, the calcium, the mitogen-activated protein  kinase (MAPK) kinase and the nuclear factor NF-kappa-B (NF-kB)  pathways, leading to the mobilization of transcription factors that are  critical for gene expression and essential for T cell growth and  differentiation (PubMed:23524462). The T cell repertoire is generated  in the thymus, by V-(D)-J rearrangement. This repertoire is then shaped  by intrathymic selection events to generate a peripheral T cell pool of  self-MH restricted, non-autoaggressive T cells. Post-thymic interaction  of alpha-beta TR with the pMH complexes shapes TR structural and  functional avidity (PubMed:15040585). (from UniProt A0A0B4J275)
29RPS29P11n/a
    
    
     
n/achr4 25,678,935ribosomal protein S29 pseudogene 11 (from HGNC RPS29P11)
30ENSG00000270911n/a
    
    
     
n/achr1 97,856,200ENSG00000270911 (from geneSymbol)
31ARR3n/a
n/a
n/a
n/a
n/achrX 70,275,087arrestin 3 (from RefSeq NM_004312.3)
32CD1Bn/a
n/a
n/a
n/a
n/achr1 158,329,743CD1b molecule (from RefSeq NM_001764.3)
33MIR559n/a
    
    
     
n/achr2 47,377,722microRNA 559 (from RefSeq NR_030286.1)
34ENSG00000262358n/a
    
    
     
n/achr17 3,729,927ENSG00000262358 (from geneSymbol)
35CDC37P2n/a
    
    
     
n/achr16 28,414,360cell division cycle 37 pseudogene 2 (from HGNC CDC37P2)
36RPL7AP21n/a
    
    
     
n/achr1 168,579,046ribosomal protein L7a pseudogene 21 (from HGNC RPL7AP21)
37ENSG00000267137n/a
    
    
     
n/achr17 61,461,804ENSG00000267137 (from geneSymbol)
38ENSG00000267359n/a
    
    
     
n/achr17 35,553,986uncharacterized LOC107985033, transcript variant 2 (from RefSeq NR_138032.1)
39MICDn/a
    
    
     
n/achr6 29,971,632MHC class I polypeptide-related sequence D (pseudogene) (from HGNC MICD)
40ENSG00000258412n/a
    
    
     
n/achr14 96,212,839ENSG00000258412 (from geneSymbol)
41ASB9P1n/a
    
    
     
n/achr15 92,796,043ankyrin repeat and SOCS box containing 9 pseudogene 1 (from HGNC ASB9P1)
42TWF1P2n/a
    
    
     
n/achrX 155,290,856twinfilin 1 pseudogene 2 (from HGNC TWF1P2)
43RPL3P13n/a
    
    
     
n/achr4 84,544,411ribosomal protein L3 pseudogene 13 (from HGNC RPL3P13)
44CDC37P1n/a
    
    
     
n/achr16 28,700,917cell division cycle 37 pseudogene 1 (from HGNC CDC37P1)
45MDS2n/a
n/a
n/a
n/a
n/achr1 23,611,031myelodysplastic syndrome 2 translocation associated (from HGNC MDS2)
46GUCY1B2n/a
n/a
n/a
n/a
n/achr13 51,034,942guanylate cyclase 1 soluble subunit beta 2 (pseudogene) (from HGNC GUCY1B2)
47ENSG00000267349n/a
    
    
     
n/achr17 35,478,219ENSG00000267349 (from geneSymbol)
48GUCY1B2n/a
n/a
n/a
n/a
n/achr13 51,037,762guanylate cyclase 1 soluble subunit beta 2 (pseudogene) (from HGNC GUCY1B2)
49RPL36AP4n/a
    
    
     
n/achr14 93,244,166ribosomal protein L36a pseudogene 4 (from HGNC RPL36AP4)
50MAPK6P5n/a
    
    
     
n/achr8 109,470,624MAPK6P5 (from geneSymbol)