UCSC Human Gene Sorter
 
genome assembly search
sort by display output 
#
Name
VisiGene
BLASTP
E-Value
Genome Position
Description
1ENSG00000253483n/a
    
    
     
n/achr8 23,483,275ENSG00000253483 (from geneSymbol)
2ENTPD4-DTn/a
    
    
     
n/achr8 23,471,786ENTPD4-DT (from geneSymbol)
3ENSG00000250057n/a
    
    
     
n/achr4 83,240,362ENSG00000250057 (from geneSymbol)
4RPL29P27n/a
    
    
     
n/achr12 28,564,909ribosomal protein L29 pseudogene 27 (from HGNC RPL29P27)
5ENSG00000270228n/a
    
    
     
n/achr4 67,721,629ENSG00000270228 (from geneSymbol)
6TRBV10-2n/a
n/a
n/a
n/a
n/achr7_KI270803v1_alt 408,782V region of the variable domain of T cell receptor (TR) beta  chain that participates in the antigen recognition (PubMed:24600447).  Alpha-beta T cell receptors are antigen specific receptors which are  essential to the immune response and are present on the cell surface of  T lymphocytes. Recognize peptide-major histocompatibility (MH) (pMH)  complexes that are displayed by antigen presenting cells (APC), a  prerequisite for efficient T cell adaptive immunity against pathogens  (PubMed:25493333). Binding of alpha-beta TR to pMH complex initiates  TR-CD3 clustering on the cell surface and intracellular activation of  LCK that phosphorylates the ITAM motifs of CD3G, CD3D, CD3E and CD247  enabling the recruitment of ZAP70. In turn ZAP70 phosphorylates LAT,  which recruits numerous signaling molecules to form the LAT  signalosome. The LAT signalosome propagates signal branching to three  major signaling pathways, the calcium, the mitogen-activated protein  kinase (MAPK) kinase and the nuclear factor NF-kappa-B (NF-kB)  pathways, leading to the mobilization of transcription factors that are  critical for gene expression and essential for T cell growth and  differentiation (PubMed:23524462). The T cell repertoire is generated  in the thymus, by V-(D)-J rearrangement. This repertoire is then shaped  by intrathymic selection events to generate a peripheral T cell pool of  self-MH restricted, non-autoaggressive T cells. Post-thymic interaction  of alpha-beta TR with the pMH complexes shapes TR structural and  functional avidity (PubMed:15040585). (from UniProt A0A0K0K1G8)
7TRBV7-4n/a
n/a
n/a
n/a
n/achr7_KI270803v1_alt 438,983T cell receptor beta variable 7-4 (gene/pseudogene) (from HGNC TRBV7-4)
8ENSG00000238035n/a
n/a
n/a
n/a
n/achr5 181,315,316ENSG00000238035 (from geneSymbol)
9ENSG00000248401n/a
    
    
     
n/achr4 83,247,692ENSG00000248401 (from geneSymbol)
10ENSG00000250522n/a
    
    
     
n/achr4 105,546,272ENSG00000250522 (from geneSymbol)
11CICP27n/a
    
    
     
n/achr1 132,930capicua transcriptional repressor pseudogene 27 (from HGNC CICP27)
12ENSG00000269444n/a
    
    
     
n/achr19 6,388,581ENSG00000269444 (from geneSymbol)
13TPRKBP2n/a
    
    
     
n/achr16 28,111,410TP53RK binding protein pseudogene 2 (from HGNC TPRKBP2)
14ENSG00000203496n/a
n/a
n/a
n/a
n/achr10 38,459,678ENSG00000203496 (from geneSymbol)
15RPL17P15n/a
n/a
n/a
n/a
n/achr2 119,699,387ribosomal protein L17 pseudogene 15 (from HGNC RPL17P15)
16LINC00332n/a
    
    
     
n/achr13 40,180,766long intergenic non-protein coding RNA 332 (from RefSeq NR_046870.1)
17ENSG00000238150n/a
    
    
     
n/achr19 53,775,740ENSG00000238150 (from geneSymbol)
18RPL12P32n/a
    
    
     
n/achr12 31,948,580ribosomal protein L12 pseudogene 32 (from HGNC RPL12P32)
19FCF1P1n/a
    
    
     
n/achr7 23,621,079FCF1 pseudogene 1 (from HGNC FCF1P1)
20ENSG00000249753n/a
    
    
     
n/achr12 63,709,753ENSG00000249753 (from geneSymbol)
21RPL10AP1n/a
    
    
     
n/achr14 103,412,440ribosomal protein L10a pseudogene 1 (from HGNC RPL10AP1)
22CICP6n/a
    
    
     
n/achr3 198,224,903capicua transcriptional repressor pseudogene 6 (from HGNC CICP6)
23ENSG00000254263n/a
    
    
     
n/achr8 129,896,111ENSG00000254263 (from geneSymbol)
24CSF2RBP1n/a
    
    
     
n/achr22 36,952,126colony stimulating factor 2 receptor beta common subunit pseudogene 1 (from HGNC CSF2RBP1)
25SLC45A4-AS1n/a
    
    
     
n/achr8 141,255,691SLC45A4 antisense RNA 1 (from RefSeq NR_161376.1)
26TRBV6-4n/a
n/a
n/a
n/a
n/achr7_KI270803v1_alt 364,610T cell receptor beta variable 6-4 (from HGNC TRBV6-4)
27ENSG00000225402n/a
    
    
     
n/achr2 37,817,438ENSG00000225402 (from geneSymbol)
28CD300LDn/a
    
    
     
n/achr17 74,585,824CD300 molecule like family member d (from RefSeq NM_001115152.2)
29ENSG00000253966n/a
    
    
     
n/achr5 170,900,695ENSG00000253966 (from geneSymbol)
30ENSG00000276054n/a
n/a
n/a
n/a
n/achr17 37,387,406ENSG00000276054 (from geneSymbol)
31DDX39BP2n/a
    
    
     
n/achr6 29,993,407DEAD-box helicase 39B pseudogene 2 (from HGNC DDX39BP2)
32MTCO1P30n/a
    
    
     
n/achr5 5,395,667mitochondrially encoded cytochrome c oxidase I pseudogene 30 (from HGNC MTCO1P30)
33IGKV2-4n/a
    
    
     
n/achr2 88,932,023immunoglobulin kappa variable 2-4 (pseudogene) (from HGNC IGKV2-4)
34ENSG00000205794n/a
    
    
     
n/achr4 40,043,667ENSG00000205794 (from geneSymbol)
35ENSG00000293349n/a
    
    
     
n/achr4 40,050,058acyl-CoA thioesterase 7 pseudogene (from RefSeq NR_027277.2)
36RPL7P24n/a
    
    
     
n/achr5 80,500,866ribosomal protein L7 pseudogene 24 (from HGNC RPL7P24)
37TRBV21-1n/a
    
    
     
n/achr7 142,637,154T cell receptor beta variable 21-1 (pseudogene) (from HGNC TRBV21-1)
38ENSG00000259064n/a
    
    
     
n/achr15 92,627,243ENSG00000259064 (from geneSymbol)
39RPL4P1n/a
    
    
     
n/achr14 21,750,907ribosomal protein L4 pseudogene 1 (from HGNC RPL4P1)
40GAPDHP38n/a
    
    
     
n/achr19 46,559,141glyceraldehyde 3 phosphate dehydrogenase pseudogene 38 (from HGNC GAPDHP38)
41ENSG00000223576n/a
    
    
     
n/achr13 19,842,749ENSG00000223576 (from geneSymbol)
42SCGB1C1n/a
    
    
     
n/achr11 193,826secretoglobin family 1C member 1 (from RefSeq NM_145651.3)
43CEACAM16n/a
n/a
n/a
n/a
n/achr19 44,704,934CEA cell adhesion molecule 16, tectorial membrane component (from RefSeq NM_001039213.4)
44LINC02825n/a
    
    
     
n/achr12 126,403,160LINC02825 (from geneSymbol)
45ENSG00000266803n/a
    
    
     
n/achr17 16,558,627ENSG00000266803 (from geneSymbol)
46PA2G4P6n/a
    
    
     
n/achr9 89,450,156proliferation-associated 2G4 pseudogene 6 (from HGNC PA2G4P6)
47ENSG00000258354n/a
    
    
     
n/achr16 14,910,616ENSG00000258354 (from geneSymbol)
48ENSG00000268289n/a
    
    
     
n/achr19 17,053,540ENSG00000268289 (from geneSymbol)
49SNRPGP5n/a
    
    
     
n/achr10 13,104,683small nuclear ribonucleoprotein polypeptide G pseudogene 5 (from HGNC SNRPGP5)
50TRBV5-5n/a
n/a
n/a
n/a
n/achr7_KI270803v1_alt 466,379T cell receptor beta variable 5-5 (from HGNC TRBV5-5)