UCSC Human Gene Sorter
 
genome assembly search
sort by display output 
#
Name
VisiGene
BLASTP
E-Value
Genome Position
Description
1ENSG00000255065n/a
    
    
     
n/achr11 106,310,918ENSG00000255065 (from geneSymbol)
2MYLKP1n/a
    
    
     
n/achr3 75,333,810myosin light chain kinase pseudogene 1 (from HGNC MYLKP1)
3ENSG00000251529n/a
    
    
     
n/achr4 68,878,878ENSG00000251529 (from geneSymbol)
4PMM2P2n/a
    
    
     
n/achr18 12,192,568phosphomannomutase 2 pseudogene 2 (from HGNC PMM2P2)
5ENSG00000267478n/a
    
    
     
n/achr18 12,092,407ENSG00000267478 (from geneSymbol)
6ENSG00000234441n/a
    
    
     
n/achr1 103,668,169ENSG00000234441 (from geneSymbol)
7ENSG00000235728n/a
    
    
     
n/achr7 36,781,898ENSG00000235728 (from geneSymbol)
8CDRT15P3n/a
n/a
n/a
n/a
n/achr2 131,795,657CDRT15P3 (from geneSymbol)
9CDRT15P3n/a
n/a
n/a
n/a
n/achr2 131,798,311CDRT15 pseudogene 3 (from RefSeq NR_161366.1)
10ENSG00000226535n/a
    
    
     
n/achr9 107,170,358ENSG00000226535 (from geneSymbol)
11TRBV6-7n/a
n/a
n/a
n/a
n/achr7_KI270803v1_alt 471,654Probable non-functional open reading frame (ORF) of V region  of the variable domain of T cell receptor (TR) beta chain  (PubMed:24600447). Non-functional ORF generally cannot participate in  the synthesis of a productive T cell receptor (TR) chain due to altered  V-(D)-J or switch recombination and/or splicing site (at mRNA level)  and/or conserved amino acid change (protein level) (PubMed:9619395).  Alpha-beta T cell receptors are antigen specific receptors which are  essential to the immune response and are present on the cell surface of  T lymphocytes. Recognize peptide-major histocompatibility (MH) (pMH)  complexes that are displayed by antigen presenting cells (APC), a  prerequisite for efficient T cell adaptive immunity against pathogens  (PubMed:25493333). Binding of alpha-beta TR to pMH complex initiates  TR-CD3 clustering on the cell surface and intracellular activation of  LCK that phosphorylates the ITAM motifs of CD3G, CD3D, CD3E and CD247  enabling the recruitment of ZAP70. In turn ZAP70 phosphorylates LAT,  which recruits numerous signaling molecules to form the LAT  signalosome. The LAT signalosome propagates signal branching to three  major signaling pathways, the calcium, the mitogen-activated protein  kinase (MAPK) kinase and the nuclear factor NF-kappa-B (NF-kB)  pathways, leading to the mobilization of transcription factors that are  critical for gene expression and essential for T cell growth and  differentiation (PubMed:23524462). The T cell repertoire is generated  in the thymus, by V-(D)-J rearrangement. This repertoire is then shaped  by intrathymic selection events to generate a peripheral T cell pool of  self-MH restricted, non-autoaggressive T cells. Post-thymic interaction  of alpha-beta TR with the pMH complexes shapes TR structural and  functional avidity (PubMed:15040585). (from UniProt A0A0A0MS04)
12ENSG00000230121n/a
    
    
     
n/achr10 7,534,886uncharacterized LOC105376390 (from RefSeq NR_188188.1)
13LINC02825n/a
    
    
     
n/achr12 126,403,160LINC02825 (from geneSymbol)
14RPS20P1n/a
    
    
     
n/achr21 35,724,923ribosomal protein S20 pseudogene 1 (from HGNC RPS20P1)
15MIX23P3n/a
    
    
     
n/achr18 12,211,592MIX23P3 (from geneSymbol)
16ENSG00000250637n/a
    
    
     
n/achr8 43,447,907ENSG00000250637 (from geneSymbol)
17GPX6n/a
n/a
n/a
n/a
n/achr6 28,509,544glutathione peroxidase 6 (from RefSeq NM_182701.1)
18MTND5P8n/a
    
    
     
n/achr7 112,373,188mitochondrially encoded NADH:ubiquinone oxidoreductase core subunit 5 pseudogene 8 (from HGNC MTND5P8)
19ENSG00000233960n/a
    
    
     
n/achr7 52,179,074ENSG00000233960 (from geneSymbol)
20ENSG00000236495n/a
    
    
     
n/achr10 14,656,635ENSG00000236495 (from geneSymbol)
21LINC02477n/a
    
    
     
n/achr4 160,563,035long intergenic non-protein coding RNA 2477 (from HGNC LINC02477)
22NREP-AS1n/a
n/a
n/a
n/a
n/achr5 111,964,907NREP antisense RNA 1 (from RefSeq NR_046678.1)
23ENSG00000267533n/a
    
    
     
n/achr18 12,067,795ENSG00000267533 (from geneSymbol)
24ANKEF1n/a
n/a
n/a
n/a
n/achr20 10,046,645ankyrin repeat and EF-hand domain containing 1, transcript variant 1 (from RefSeq NM_022096.6)
25ZNF705Bn/a
n/a
n/a
n/a
n/achr8 7,939,375zinc finger protein 705B (from RefSeq NM_001193630.1)
26RPL6P17n/a
    
    
     
n/achr6 15,103,538ribosomal protein L6 pseudogene 17 (from HGNC RPL6P17)
27CAPZA1P4n/a
    
    
     
n/achr7 131,893,115CAPZA1P4 (from geneSymbol)
28ENSG00000237297n/a
    
    
     
n/achr10 45,798ENSG00000237297 (from geneSymbol)
29ENSG00000237633n/a
    
    
     
n/achr2 16,539,377ENSG00000237633 (from geneSymbol)
30ENSG00000255164n/a
    
    
     
n/achr8 144,993,875ENSG00000255164 (from geneSymbol)
31YWHAEP2n/a
    
    
     
n/achr17 18,418,250tyrosine 3-monooxygenase/tryptophan 5-monooxygenase activation protein epsilon pseudogene 2 (from HGNC YWHAEP2)
32RNF11P2n/a
    
    
     
n/achr20 14,547,403ring finger protein 11 pseudogene 2 (from HGNC RNF11P2)
33TRMT1P1n/a
    
    
     
n/achrX 145,631,296TRMT1P1 (from geneSymbol)
34ENSG00000255628n/a
    
    
     
n/achr12 34,156,038ENSG00000255628 (from geneSymbol)
35RN7SL678Pn/a
n/a
n/a
n/a
n/achr21 37,215,754RNA, 7SL, cytoplasmic 678, pseudogene (from HGNC RN7SL678P)
36DEFB125n/a
    
    
     
n/achr20 92,383defensin beta 125 (from RefSeq NM_153325.4)
37OR5H5Pn/a
    
    
     
n/achr3 98,197,674olfactory receptor family 5 subfamily H member 5 pseudogene (from HGNC OR5H5P)
38LINC01427n/a
n/a
n/a
n/a
n/achr20 22,273,595long intergenic non-protein coding RNA 1427 (from HGNC LINC01427)
39ENSG00000227499n/a
    
    
     
n/achr7 55,878,038ENSG00000227499 (from geneSymbol)
40ENSG00000232140n/a
    
    
     
n/achr2 120,554,049ENSG00000232140 (from geneSymbol)
41KRT18P40n/a
n/a
n/a
n/a
n/achr19 20,963,098keratin 18 pseudogene 40 (from HGNC KRT18P40)
42PRSS40Bn/a
    
    
     
n/achr2 130,544,462serine protease 40B (from HGNC PRSS40B)
43KRTAP19-8n/a
    
    
     
n/achr21 31,038,317keratin associated protein 19-8 (from RefSeq NM_001099219.1)
44FABP5P10n/a
    
    
     
n/achr2 151,186,391fatty acid binding protein 5 pseudogene 10 (from HGNC FABP5P10)
45Y_RNAn/a
    
    
     
n/achr2 170,783,219Y_RNA (from geneSymbol)
46RPL35AP4n/a
    
    
     
n/achr6 33,389,424ribosomal protein L35a pseudogene 4 (from HGNC RPL35AP4)
47ENSG00000229066n/a
    
    
     
n/achr2 175,360,271ENSG00000229066 (from geneSymbol)
48SLC25A1P4n/a
    
    
     
n/achr16 35,173,704solute carrier family 25 member 1 pseudogene 4 (from HGNC SLC25A1P4)
49RACK1P2n/a
    
    
     
n/achr2 36,656,631RACK1P2 (from geneSymbol)
50MIR632n/a
n/a
n/a
n/a
n/achr17 32,350,155microRNA 632 (from RefSeq NR_030362.1)