UCSC Human Gene Sorter
 
genome assembly search
sort by display output 
#
Name
VisiGene
BLASTP
E-Value
Genome Position
Description
1ENSG00000255240n/a
n/a
n/a
n/a
n/achr11 58,996,151uncharacterized LOC283194 (from RefSeq NR_033853.2)
2ENSG00000254877n/a
    
    
     
n/achr11 58,967,943ENSG00000254877 (from geneSymbol)
3ENSG00000225407n/a
    
    
     
n/achr5 76,703,827ENSG00000225407 (from geneSymbol)
4AK4P4n/a
    
    
     
n/achr9 5,856,103adenylate kinase 4 pseudogene 4 (from HGNC AK4P4)
5ENSG00000234428n/a
    
    
     
n/achr12 26,636,424ENSG00000234428 (from geneSymbol)
6ENSG00000260681n/a
    
    
     
n/achr16 19,411,195ENSG00000260681 (from geneSymbol)
7SEPTIN7P10n/a
    
    
     
n/achr5 119,127,613SEPTIN7P10 (from geneSymbol)
8ENSG00000234937n/a
    
    
     
n/achr1 155,845,995ENSG00000234937 (from geneSymbol)
9PGAM1P11n/a
    
    
     
n/achr1 10,059,159phosphoglycerate mutase 1 pseudogene 11 (from HGNC PGAM1P11)
10OACYLPn/a
n/a
n/a
n/a
n/achr18 59,033,036O-acyltransferase like, pseudogene (from HGNC OACYLP)
11ENSG00000266805n/a
    
    
     
n/achr18 9,507,984ENSG00000266805 (from geneSymbol)
12ENSG00000293539n/a
n/a
n/a
n/a
n/achr18 59,040,424ENSG00000293539 (from geneSymbol)
13TBPL1P1n/a
    
    
     
n/achr3 172,522,336TBPL1P1 (from geneSymbol)
14CD1Bn/a
n/a
n/a
n/a
n/achr1 158,329,743CD1b molecule (from RefSeq NM_001764.3)
15POGLUT2P1n/a
    
    
     
n/achr5 128,110,240POGLUT2P1 (from geneSymbol)
16ENSG00000258303n/a
    
    
     
n/achr12 93,837,102ENSG00000258303 (from geneSymbol)
17GLYATL1P4n/a
    
    
     
n/achr11 59,046,854glycine-N-acyltransferase like 1 pseudogene 4 (from HGNC GLYATL1P4)
18LINC03050n/a
    
    
     
n/achr2 65,614,871long intergenic non-protein coding RNA 3050 (from RefSeq NR_182288.2)
19ENSG00000248571n/a
    
    
     
n/achr4 152,668,237ENSG00000248571 (from geneSymbol)
20ENSG00000233953n/a
    
    
     
n/achr2 60,497,825ENSG00000233953 (from geneSymbol)
21ENSG00000262380n/a
    
    
     
n/achr16 15,683,930ENSG00000262380 (from geneSymbol)
22RPL12P44n/a
    
    
     
n/achr3 44,938,077ribosomal protein L12 pseudogene 44 (from HGNC RPL12P44)
23DUTP2n/a
    
    
     
n/achr8 123,352,412deoxyuridine triphosphatase pseudogene 2 (from HGNC DUTP2)
24CDC42-IT1n/a
    
    
     
n/achr1 22,061,698CDC42 intronic transcript 1 (from HGNC CDC42-IT1)
25ENSG00000269653n/a
    
    
     
n/achr19 38,185,320ENSG00000269653 (from geneSymbol)
26KRT39n/a
n/a
n/a
n/a
n/achr17 40,962,682keratin 39 (from RefSeq NM_213656.4)
27CSGALNACT2P1n/a
n/a
n/a
n/a
n/achrX 100,957,065CSGALNACT2P1 (from geneSymbol)
28LINC01934n/a
n/a
n/a
n/a
n/achr2 181,266,579long intergenic non-protein coding RNA 1934 (from RefSeq NR_130784.1)
29ENSG00000225092n/a
    
    
     
n/achr6 7,184,185ENSG00000225092 (from geneSymbol)
30PRELID1P5n/a
n/a
n/a
n/a
n/achr1 211,207,568PRELID1P5 (from geneSymbol)
31ENSG00000262810n/a
    
    
     
n/achr17 2,095,620ENSG00000262810 (from geneSymbol)
32ENSG00000279040n/a
n/a
n/a
n/a
n/achr17 2,101,604ENSG00000279040 (from geneSymbol)
33BNIP3P4n/a
    
    
     
n/achr9 64,811,147BCL2 interacting protein 3 pseudogene 4 (from HGNC BNIP3P4)
34RPL7AP82n/a
    
    
     
n/achr1 246,632,364RPL7AP82 (from geneSymbol)
35PCAT1n/a
    
    
     
n/achr8 126,925,377prostate cancer associated transcript 1 (non-protein coding) (from HGNC PCAT1)
36SAP30P1n/a
    
    
     
n/achr3 150,611,569SAP30P1 (from geneSymbol)
37HNRNPA3P3n/a
n/a
n/a
n/a
n/achrX 140,032,912heterogeneous nuclear ribonucleoprotein A3 pseudogene 3 (from HGNC HNRNPA3P3)
38RPL7AP21n/a
    
    
     
n/achr1 168,579,046ribosomal protein L7a pseudogene 21 (from HGNC RPL7AP21)
39ENSG00000218682n/a
    
    
     
n/achr2 25,856,713ENSG00000218682 (from geneSymbol)
40RPL31P11n/a
    
    
     
n/achr1 161,685,023ribosomal protein L31 pseudogene 11 (from HGNC RPL31P11)
41RTEL1P1n/a
    
    
     
n/achr4 112,357,977regulator of telomere elongation helicase 1 pseudogene 1 (from HGNC RTEL1P1)
42ENSG00000293208n/a
    
    
     
n/achr4 112,365,372ENSG00000293208 (from geneSymbol)
43GLYR1P1n/a
    
    
     
n/achr20 49,830,105GLYR1P1 (from geneSymbol)
44ENSG00000261291n/a
    
    
     
n/achr16 53,168,986ENSG00000261291 (from geneSymbol)
45IKBKE-AS1n/a
    
    
     
n/achr1 206,494,422IKBKE antisense RNA 1 (from RefSeq NR_172918.1)
46EIF4A1P4n/a
    
    
     
n/achr12 53,153,878eukaryotic translation initiation factor 4A1 pseudogene 4 (from HGNC EIF4A1P4)
47ENSG00000269085n/a
    
    
     
n/achr19 16,565,940ENSG00000269085 (from geneSymbol)
48TRGV1n/a
    
    
     
n/achr7 38,367,877Probable non-functional open reading frame (ORF) of V region  of the variable domain of T cell receptor (TR) gamma chain  (PubMed:24600447). Non-functional ORF generally cannot participate in  the synthesis of a productive T cell receptor (TR) chain due to altered  V-(D)-J or switch recombination and/or splicing site (at mRNA level)  and/or conserved amino acid change (protein level) (PubMed:9619395).  Gamma-delta TRs recognize a variety of self and foreign non-peptide  antigens frequently expressed at the epithelial boundaries between the  host and external environment, including endogenous lipids presented by  MH-like protein CD1D and phosphoantigens presented by butyrophilin-like  molecule BTN3A1. Upon antigen recognition induces rapid, innate-like  immune responses involved in pathogen clearance and tissue repair  (PubMed:23348415, PubMed:28920588). Binding of gamma-delta TR complex  to antigen triggers phosphorylation of immunoreceptor tyrosine-based  activation motifs (ITAMs) in the CD3 chains by the LCK and FYN kinases,  allowing the recruitment, phosphorylation, and activation of ZAP70 that  facilitates phosphorylation of the scaffolding proteins LCP2 and LAT.  This lead to the formation of a supramolecular signalosome that  recruits the phospholipase PLCG1, resulting in calcium mobilization and  ERK activation, ultimately leading to T cell expansion and  differentiation into effector cells (PubMed:25674089). Gamma-delta TRs  are produced through somatic rearrangement of a limited repertoire of  variable (V), diversity (D), and joining (J) genes. The potential  diversity of gamma-delta TRs is conferred by the unique ability to  rearrange (D) genes in tandem and to utilize all three reading frames.  The combinatorial diversity is considerably increased by the sequence  exonuclease trimming and random nucleotide (N) region additions which  occur during the V-(D)-J rearrangements (PubMed:24387714). (from UniProt A0A0A0MS02)
49EEF1A1P14n/a
    
    
     
n/achr1 194,189,654eukaryotic translation elongation factor 1 alpha 1 pseudogene 14 (from HGNC EEF1A1P14)
50ENSG00000266801n/a
    
    
     
n/achr16 68,935,772ENSG00000266801 (from geneSymbol)