UCSC Human Gene Sorter
 
genome assembly search
sort by display output 
#
Name
VisiGene
BLASTP
E-Value
Genome Position
Description
1NLRP9P1n/a
    
    
     
n/achr12 129,014,999NLR family pyrin domain containing 9 pseudogene 1 (from HGNC NLRP9P1)
2AK3P6n/a
    
    
     
n/achr12 128,944,738adenylate kinase 3 pseudogene 6 (from HGNC AK3P6)
3SCARNA20n/a
    
    
     
n/achr17 60,231,581small Cajal body-specific RNA 20 (from RefSeq NR_002999.2)
4ENSG00000232208n/a
    
    
     
n/achr1 8,907,568ENSG00000232208 (from geneSymbol)
5CABP5n/a
    
    
     
n/achr19 48,036,731calcium binding protein 5 (from RefSeq NM_019855.5)
6MTCYBP35n/a
    
    
     
n/achr5 94,570,108mitochondrially encoded cytochrome b pseudogene 35 (from HGNC MTCYBP35)
7HNRNPA1P52n/a
    
    
     
n/achr19 41,830,315heterogeneous nuclear ribonucleoprotein A1 pseudogene 52 (from HGNC HNRNPA1P52)
8CSF2RBP1n/a
    
    
     
n/achr22 36,952,126colony stimulating factor 2 receptor beta common subunit pseudogene 1 (from HGNC CSF2RBP1)
9RNU6-917Pn/a
    
    
     
n/achr20 1,529,107RNA, U6 small nuclear 917, pseudogene (from HGNC RNU6-917P)
10RPL5P25n/a
    
    
     
n/achr10 13,058,289ribosomal protein L5 pseudogene 25 (from HGNC RPL5P25)
11ENSG00000225402n/a
    
    
     
n/achr2 37,817,438ENSG00000225402 (from geneSymbol)
12FLT1P1n/a
    
    
     
n/achr3 46,143,017fms related tyrosine kinase 1 pseudogene 1 (from HGNC FLT1P1)
13RNU6-1005Pn/a
    
    
     
n/achr16 21,642,107RNA, U6 small nuclear 1005, pseudogene (from HGNC RNU6-1005P)
14ENSG00000238150n/a
    
    
     
n/achr19 53,775,740ENSG00000238150 (from geneSymbol)
15ENSG00000220522n/a
    
    
     
n/achr6 127,416,743ENSG00000220522 (from geneSymbol)
16CD300LDn/a
    
    
     
n/achr17 74,585,824CD300 molecule like family member d (from RefSeq NM_001115152.2)
17RPL19P20n/a
n/a
n/a
n/a
n/achrX 44,649,424ribosomal protein L19 pseudogene 20 (from HGNC RPL19P20)
18ENSG00000251510n/a
    
    
     
n/achrY 18,519,719ENSG00000251510 (from geneSymbol)
19MTND5P32n/a
    
    
     
n/achr15 58,153,506mitochondrially encoded NADH:ubiquinone oxidoreductase core subunit 5 pseudogene 32 (from HGNC MTND5P32)
20RPL7L1P5n/a
    
    
     
n/achr17 44,365,382ribosomal protein L7 like 1 pseudogene 5 (from HGNC RPL7L1P5)
21TREML5Pn/a
    
    
     
n/achr6 41,248,509triggering receptor expressed on myeloid cells like 5, pseudogene (from HGNC TREML5P)
22RRM2P2n/a
    
    
     
n/achr1 161,379,032ribonucleotide reductase M2 polypeptide pseudogene 2 (from HGNC RRM2P2)
23MTCO3P5n/a
    
    
     
n/achr2 143,099,415mitochondrially encoded cytochrome c oxidase III pseudogene 5 (from HGNC MTCO3P5)
24HNRNPA3P2n/a
    
    
     
n/achr20 36,620,913heterogeneous nuclear ribonucleoprotein A3 pseudogene 2 (from HGNC HNRNPA3P2)
25ZNF33CPn/a
    
    
     
n/achr10 37,895,651zinc finger protein 33C, pseudogene (from HGNC ZNF33CP)
26RPS8P4n/a
    
    
     
n/achr10 119,638,769ribosomal protein S8 pseudogene 4 (from HGNC RPS8P4)
27VN1R90Pn/a
    
    
     
n/achr19 23,288,982vomeronasal 1 receptor 90 pseudogene (from HGNC VN1R90P)
28ZNRF3-IT1n/a
    
    
     
n/achr22 29,005,670ZNRF3 intronic transcript 1 (from HGNC ZNRF3-IT1)
29GOLGA5P1n/a
    
    
     
n/achr5 39,169,772golgin A5 pseudogene 1 (from HGNC GOLGA5P1)
30TRDV2n/a
    
    
     
n/achr14 22,422,706V region of the variable domain of T cell receptor (TR) delta  chain that participates in the antigen recognition (PubMed:24600447).  Gamma-delta TRs recognize a variety of self and foreign non-peptide  antigens frequently expressed at the epithelial boundaries between the  host and external environment, including endogenous lipids presented by  MH-like protein CD1D and phosphoantigens presented by butyrophilin-like  molecule BTN3A1. Upon antigen recognition induces rapid, innate-like  immune responses involved in pathogen clearance and tissue repair  (PubMed:28920588, PubMed:23348415). Binding of gamma-delta TR complex  to antigen triggers phosphorylation of immunoreceptor tyrosine-based  activation motifs (ITAMs) in the CD3 chains by the LCK and FYN kinases,  allowing the recruitment, phosphorylation, and activation of ZAP70 that  facilitates phosphorylation of the scaffolding proteins LCP2 and LAT.  This lead to the formation of a supramolecular signalosome that  recruits the phospholipase PLCG1, resulting in calcium mobilization and  ERK activation, ultimately leading to T cell expansion and  differentiation into effector cells (PubMed:25674089). Gamma-delta TRs  are produced through somatic rearrangement of a limited repertoire of  variable (V), diversity (D), and joining (J) genes. The potential  diversity of gamma-delta TRs is conferred by the unique ability to  rearrange (D) genes in tandem and to utilize all three reading frames.  The combinatorial diversity is considerably increased by the sequence  exonuclease trimming and random nucleotide (N) region additions which  occur during the V-(D)-J rearrangements (PubMed:24387714). (from UniProt A0JD36)
31RPL21P34n/a
    
    
     
n/achr2 128,217,830ribosomal protein L21 pseudogene 34 (from HGNC RPL21P34)
32TRBV5-5n/a
n/a
n/a
n/a
n/achr7_KI270803v1_alt 466,379T cell receptor beta variable 5-5 (from HGNC TRBV5-5)
33TRBV11-1n/a
n/a
n/a
n/a
n/achr7_KI270803v1_alt 391,491V region of the variable domain of T cell receptor (TR) beta  chain that participates in the antigen recognition (PubMed:24600447).  Alpha-beta T cell receptors are antigen specific receptors which are  essential to the immune response and are present on the cell surface of  T lymphocytes. Recognize peptide-major histocompatibility (MH) (pMH)  complexes that are displayed by antigen presenting cells (APC), a  prerequisite for efficient T cell adaptive immunity against pathogens  (PubMed:25493333). Binding of alpha-beta TR to pMH complex initiates  TR-CD3 clustering on the cell surface and intracellular activation of  LCK that phosphorylates the ITAM motifs of CD3G, CD3D, CD3E and CD247  enabling the recruitment of ZAP70. In turn ZAP70 phosphorylates LAT,  which recruits numerous signaling molecules to form the LAT  signalosome. The LAT signalosome propagates signal branching to three  major signaling pathways, the calcium, the mitogen-activated protein  kinase (MAPK) kinase and the nuclear factor NF-kappa-B (NF-kB)  pathways, leading to the mobilization of transcription factors that are  critical for gene expression and essential for T cell growth and  differentiation (PubMed:23524462). The T cell repertoire is generated  in the thymus, by V-(D)-J rearrangement. This repertoire is then shaped  by intrathymic selection events to generate a peripheral T cell pool of  self-MH restricted, non-autoaggressive T cells. Post-thymic interaction  of alpha-beta TR with the pMH complexes shapes TR structural and  functional avidity (PubMed:15040585). (from UniProt A0A0K0K1C0)
34MTND5P12n/a
    
    
     
n/achr5 94,568,185mitochondrially encoded NADH:ubiquinone oxidoreductase core subunit 5 pseudogene 12 (from HGNC MTND5P12)
35ENSG00000229261n/a
    
    
     
n/achr10 69,223,911uncharacterized LOC101928994 (from RefSeq NR_120648.1)
36ENSG00000288177n/a
    
    
     
n/achr11 49,868,258ENSG00000288177 (from geneSymbol)
37FRG2Bn/a
n/a
n/a
n/a
n/achr10 133,625,345FSHD region gene 2 family member B (from RefSeq NM_001080998.2)
38ENSG00000259962n/a
    
    
     
n/achr16 53,362,848ENSG00000259962 (from geneSymbol)
39SEPTIN7P8n/a
    
    
     
n/achr19 53,772,893SEPTIN7P8 (from geneSymbol)
40LINC00387n/a
    
    
     
n/achr13 18,674,495long intergenic non-protein coding RNA 387 (from HGNC LINC00387)
41GAPDHP66n/a
    
    
     
n/achr18 3,978,132glyceraldehyde-3-phosphate dehydrogenase pseudogene 66 (from HGNC GAPDHP66)
42ENSG00000254158n/a
    
    
     
n/achr5 178,998,392ENSG00000254158 (from geneSymbol)
43ENSG00000257180n/a
    
    
     
n/achr16 6,074,964ENSG00000257180 (from geneSymbol)
44IMPDH1P11n/a
    
    
     
n/achr16 10,112,133inosine monophosphate dehydrogenase 1 pseudogene 11 (from HGNC IMPDH1P11)
45TRIM51FPn/a
    
    
     
n/achr11 49,836,230tripartite motif-containing 51F, pseudogene (from HGNC TRIM51FP)
46DPPA5P1n/a
    
    
     
n/achr19 52,426,032developmental pluripotency associated 5 pseudogene 1 (from HGNC DPPA5P1)
47ENSG00000257458n/a
    
    
     
n/achr12 98,954,169ENSG00000257458 (from geneSymbol)
48GYPAn/a
n/a
n/a
n/a
n/achr4 144,125,010glycophorin A (MNS blood group), transcript variant 1 (from RefSeq NM_002099.8)
49RN7SL45Pn/a
n/a
n/a
n/a
n/achr17 31,518,580RNA, 7SL, cytoplasmic 45, pseudogene (from HGNC RN7SL45P)
50ENSG00000285783n/a
n/a
n/a
n/a
n/achr4 144,490,996ENSG00000285783 (from geneSymbol)