UCSC Human Gene Sorter
 
genome assembly search
sort by display output
#
Name
VisiGene
BLASTP
E-Value
Genome Position
Description                                       
1ENSG00000257429n/a
    
    
     
n/achr12 80,588,692ENSG00000257429 (from geneSymbol)
2PHB1P21n/a
    
    
     
n/achr16 52,935,224PHB1P21 (from geneSymbol)
3RPS18P8n/a
    
    
     
n/achr6 4,979,283ribosomal protein S18 pseudogene 8 (from HGNC RPS18P8)
4ENSG00000251691n/a
    
    
     
n/achr4 69,306,821ENSG00000251691 (from geneSymbol)
5AKIRIN1P1n/a
    
    
     
n/achr12 80,561,288akirin 1 pseudogene 1 (from HGNC AKIRIN1P1)
6RN7SL505Pn/a
n/a
n/a
n/a
n/achr7 33,045,944RNA, 7SL, cytoplasmic 505, pseudogene (from HGNC RN7SL505P)
7ENSG00000282610n/a
n/a
n/a
n/a
n/achr7_KI270803v1_alt 511,206V region of the variable domain of T cell receptor (TR) beta  chain that participates in the antigen recognition (PubMed:24600447).  Alpha-beta T cell receptors are antigen specific receptors which are  essential to the immune response and are present on the cell surface of  T lymphocytes. Recognize peptide-major histocompatibility (MH) (pMH)  complexes that are displayed by antigen presenting cells (APC), a  prerequisite for efficient T cell adaptive immunity against pathogens  (PubMed:25493333). Binding of alpha-beta TR to pMH complex initiates  TR-CD3 clustering on the cell surface and intracellular activation of  LCK that phosphorylates the ITAM motifs of CD3G, CD3D, CD3E and CD247  enabling the recruitment of ZAP70. In turn ZAP70 phosphorylates LAT,  which recruits numerous signaling molecules to form the LAT  signalosome. The LAT signalosome propagates signal branching to three  major signaling pathways, the calcium, the mitogen-activated protein  kinase (MAPK) kinase and the nuclear factor NF-kappa-B (NF-kB)  pathways, leading to the mobilization of transcription factors that are  critical for gene expression and essential for T cell growth and  differentiation (PubMed:23524462). The T cell repertoire is generated  in the thymus, by V-(D)-J rearrangement. This repertoire is then shaped  by intrathymic selection events to generate a peripheral T cell pool of  self-MH restricted, non-autoaggressive T cells. Post-thymic interaction  of alpha-beta TR with the pMH complexes shapes TR structural and  functional avidity (PubMed:15040585). (from UniProt A0A0J9YX75)
8APOOP2n/a
    
    
     
n/achr3 87,595,107apolipoprotein O pseudogene 2 (from HGNC APOOP2)
9ENSG00000268209n/a
    
    
     
n/achr4 69,387,943ENSG00000268209 (from geneSymbol)
10ENSG00000268931n/a
    
    
     
n/achr19 8,425,591ENSG00000268931 (from geneSymbol)
11RN7SL246Pn/a
n/a
n/a
n/a
n/achr12 45,874,182RNA, 7SL, cytoplasmic 246, pseudogene (from HGNC RN7SL246P)
12BRWD1P3n/a
    
    
     
n/achr7 17,033,283bromodomain and WD repeat domain containing 1 pseudogene 3 (from HGNC BRWD1P3)
13RN7SL865Pn/a
n/a
n/a
n/a
n/achr12 115,717,869RNA, 7SL, cytoplasmic 865, pseudogene (from HGNC RN7SL865P)
14ENSG00000261627n/a
    
    
     
n/achr18 6,642,224ENSG00000261627 (from geneSymbol)
15RPL14P6n/a
    
    
     
n/achr2 128,203,568RPL14P6 (from geneSymbol)
16LINC01787n/a
    
    
     
n/achr1 96,314,097long intergenic non-protein coding RNA 1787 (from RefSeq NR_110693.1)
17OR7E93Pn/a
    
    
     
n/achr3 125,724,992olfactory receptor family 7 subfamily E member 93 pseudogene (from HGNC OR7E93P)
18ENSG00000261774n/a
    
    
     
n/achr16 72,278,418ENSG00000261774 (from geneSymbol)
19OR10J3n/a
    
    
     
n/achr1 159,314,189olfactory receptor family 10 subfamily J member 3 (from RefSeq NR_172557.1)
20ENSG00000213560n/a
    
    
     
n/achr1 78,091,776ENSG00000213560 (from geneSymbol)
21ENSG00000212421n/a
    
    
     
n/achr9 87,260,517ENSG00000212421 (from geneSymbol)
22ENSG00000251858n/a
    
    
     
n/achr14 41,594,527ENSG00000251858 (from geneSymbol)
23ENSG00000256399n/a
    
    
     
n/achr12 63,887,988ENSG00000256399 (from geneSymbol)
24SPINT4n/a
    
    
     
n/achr20 45,724,088serine peptidase inhibitor, Kunitz type 4 (from RefSeq NM_178455.3)
25OR1L1n/a
    
    
     
n/achr9 122,662,182olfactory receptor family 1 subfamily L member 1 (from RefSeq NM_001005236.3)
26OR2A3Pn/a
    
    
     
n/achr7 144,157,702olfactory receptor family 2 subfamily A member 3 pseudogene (from HGNC OR2A3P)
27ENSG00000290815n/a
    
    
     
n/achr7 144,156,195ENSG00000290815 (from geneSymbol)
28ENSG00000248560n/a
    
    
     
n/achr5 181,114,890ENSG00000248560 (from geneSymbol)
29MIR133Bn/a
    
    
     
n/achr6 52,148,982microRNA 133b (from RefSeq NR_029903.1)
30ENSG00000219492n/a
    
    
     
n/achr4 9,386,500ENSG00000219492 (from geneSymbol)
31ENSG00000225869n/a
    
    
     
n/achr5 143,752,397ENSG00000225869 (from geneSymbol)
32ENSG00000264596n/a
    
    
     
n/achr18 7,814,924ENSG00000264596 (from geneSymbol)
33PSG2n/a
n/a
n/a
n/a
n/achr19 43,073,455pregnancy specific beta-1-glycoprotein 2 (from RefSeq NM_031246.4)
34ENSG00000225129n/a
    
    
     
n/achr20 59,354,984ENSG00000225129 (from geneSymbol)
35VPS51P18n/a
    
    
     
n/achr4 9,522,093VPS51P18 (from geneSymbol)
36ENSG00000233129n/a
    
    
     
n/achr1 93,934,861ENSG00000233129 (from geneSymbol)
37RPL12P20n/a
    
    
     
n/achr4 41,389,354ribosomal protein L12 pseudogene 20 (from HGNC RPL12P20)
38RPL18AP9n/a
    
    
     
n/achr3 43,485,426RPL18AP9 (from geneSymbol)
39LINC02672n/a
    
    
     
n/achr10 53,001,318long intergenic non-protein coding RNA 2672, transcript variant 1 (from RefSeq NR_186376.1)
40RPEP6n/a
    
    
     
n/achr11 72,131,594ribulose-5-phosphate-3-epimerase pseudogene 6 (from HGNC RPEP6)
41XGY1n/a
    
    
     
n/achrY 12,473,707Xg pseudogene, Y-linked 1 (from HGNC XGY1)
42Y_RNAn/a
    
    
     
n/achr1 111,446,853Y_RNA (from geneSymbol)
43ESDP1n/a
    
    
     
n/achr6 17,381,743ESDP1 (from geneSymbol)
44HNRNPA1P69n/a
    
    
     
n/achr12 63,271,870heterogeneous nuclear ribonucleoprotein A1 pseudogene 69 (from HGNC HNRNPA1P69)
45NIPA2P1n/a
    
    
     
n/achr7 91,320,615NIPA magnesium transporter 2 pseudogene 1 (from HGNC NIPA2P1)
46RPS14P4n/a
    
    
     
n/achr2 111,295,837ribosomal protein S14 pseudogene 4 (from HGNC RPS14P4)
47ENSG00000235959n/a
    
    
     
n/achr2 95,640,392ENSG00000235959 (from geneSymbol)
48WSPARn/a
    
    
     
n/achr5 133,915,473WNT signaling pathway activating non-coding RNA (from RefSeq NR_131252.1)
49ENSG00000253619n/a
    
    
     
n/achr8 121,016,409ENSG00000253619 (from geneSymbol)
50ENSG00000227120n/a
    
    
     
n/achr2 95,436,344ENSG00000227120 (from geneSymbol)