UCSC Human Gene Sorter
 
genome assembly search
sort by display output 
#
Name
VisiGene
BLASTP
E-Value
Genome Position
Description
1PTBP1Pn/a
    
    
     
n/achr14 65,280,216polypyrimidine tract binding protein 1 pseudogene (from HGNC PTBP1P)
2ENSG00000255921n/a
    
    
     
n/achr12 24,954,660ENSG00000255921 (from geneSymbol)
3RN7SL842Pn/a
n/a
n/a
n/a
n/achr19 14,588,506RNA, 7SL, cytoplasmic 842, pseudogene (from HGNC RN7SL842P)
4CCR8n/a
n/a
n/a
n/a
n/achr3 39,331,694C-C motif chemokine receptor 8 (from RefSeq NM_005201.4)
5ENSG00000258878n/a
    
    
     
n/achr14 65,234,808ENSG00000258878 (from geneSymbol)
6RNU6-216Pn/a
    
    
     
n/achr11 74,968,240RNA, U6 small nuclear 216, pseudogene (from HGNC RNU6-216P)
7LINC02642n/a
    
    
     
n/achr10 7,458,100long intergenic non-protein coding RNA 2642, transcript variant 12 (from RefSeq NR_184124.1)
8FCRL4n/a
n/a
n/a
n/a
n/achr1 157,585,916Fc receptor like 4 (from RefSeq NM_031282.3)
9ENSG00000225885n/a
n/a
n/a
n/a
n/achr8 118,345,906ENSG00000225885 (from geneSymbol)
10ENSG00000279846n/a
n/a
n/a
n/a
n/achr15 99,498,093ENSG00000279846 (from geneSymbol)
11RNY1P11n/a
    
    
     
n/achr7 129,164,905RNA, Ro-associated Y1 pseudogene 11 (from HGNC RNY1P11)
12ENSG00000258760n/a
    
    
     
n/achr14 65,269,580ENSG00000258760 (from geneSymbol)
13NCR2n/a
n/a
n/a
n/a
n/achr6 41,343,248natural cytotoxicity triggering receptor 2, transcript variant 1 (from RefSeq NM_004828.4)
14RPL39P41n/a
    
    
     
n/achr22 37,215,814ribosomal protein L39 pseudogene 41 (from HGNC RPL39P41)
15GLYATL1Bn/a
    
    
     
n/achr11 59,090,546glycine-N-acyltransferase like 1B (from RefSeq NM_001355566.1)
16ENSG00000249334n/a
    
    
     
n/achr4 10,691,332ENSG00000249334 (from geneSymbol)
17ENSG00000236941n/a
n/a
n/a
n/a
n/achr4 164,948,758ENSG00000236941 (from geneSymbol)
18RPL21P7n/a
    
    
     
n/achr14 65,267,164ribosomal protein L21 pseudogene 7 (from HGNC RPL21P7)
19LINC02909n/a
n/a
n/a
n/a
n/achr12 25,000,733LINC02909 (from geneSymbol)
20ENSG00000262703n/a
    
    
     
n/achr16 11,348,732ENSG00000262703 (from geneSymbol)
21TPM3P8n/a
    
    
     
n/achr2 230,573,488tropomyosin 3 pseudogene 8 (from HGNC TPM3P8)
22LDC1Pn/a
n/a
n/a
n/a
n/achr1 31,505,523LDC1P (from geneSymbol)
23LINC01226n/a
n/a
n/a
n/a
n/achr1 31,544,790long intergenic non-protein coding RNA 1226 (from HGNC LINC01226)
24LDC1Pn/a
n/a
n/a
n/a
n/achr1 31,504,325leucine decarboxylase 1, pseudogene (from RefSeq NR_034112.2)
25OR7E155Pn/a
n/a
n/a
n/a
n/achr13 41,440,340olfactory receptor family 7 subfamily E member 155 pseudogene (from HGNC OR7E155P)
26ENSG00000256988n/a
    
    
     
n/achr12 4,817,638ENSG00000256988 (from geneSymbol)
27TRGV1n/a
    
    
     
n/achr7 38,367,877Probable non-functional open reading frame (ORF) of V region  of the variable domain of T cell receptor (TR) gamma chain  (PubMed:24600447). Non-functional ORF generally cannot participate in  the synthesis of a productive T cell receptor (TR) chain due to altered  V-(D)-J or switch recombination and/or splicing site (at mRNA level)  and/or conserved amino acid change (protein level) (PubMed:9619395).  Gamma-delta TRs recognize a variety of self and foreign non-peptide  antigens frequently expressed at the epithelial boundaries between the  host and external environment, including endogenous lipids presented by  MH-like protein CD1D and phosphoantigens presented by butyrophilin-like  molecule BTN3A1. Upon antigen recognition induces rapid, innate-like  immune responses involved in pathogen clearance and tissue repair  (PubMed:23348415, PubMed:28920588). Binding of gamma-delta TR complex  to antigen triggers phosphorylation of immunoreceptor tyrosine-based  activation motifs (ITAMs) in the CD3 chains by the LCK and FYN kinases,  allowing the recruitment, phosphorylation, and activation of ZAP70 that  facilitates phosphorylation of the scaffolding proteins LCP2 and LAT.  This lead to the formation of a supramolecular signalosome that  recruits the phospholipase PLCG1, resulting in calcium mobilization and  ERK activation, ultimately leading to T cell expansion and  differentiation into effector cells (PubMed:25674089). Gamma-delta TRs  are produced through somatic rearrangement of a limited repertoire of  variable (V), diversity (D), and joining (J) genes. The potential  diversity of gamma-delta TRs is conferred by the unique ability to  rearrange (D) genes in tandem and to utilize all three reading frames.  The combinatorial diversity is considerably increased by the sequence  exonuclease trimming and random nucleotide (N) region additions which  occur during the V-(D)-J rearrangements (PubMed:24387714). (from UniProt A0A0A0MS02)
28RNA5SP69n/a
    
    
     
n/achr1 178,560,971RNA, 5S ribosomal pseudogene 69 (from HGNC RNA5SP69)
29MAF1P1n/a
    
    
     
n/achr3 133,491,164MAF1P1 (from geneSymbol)
30ENSG00000242444n/a
    
    
     
n/achr12 4,109,938ENSG00000242444 (from geneSymbol)
31ENSG00000263727n/a
    
    
     
n/achr18 655,622ENSG00000263727 (from geneSymbol)
32SIDT1-AS1n/a
    
    
     
n/achr3 113,589,468SIDT1 antisense RNA 1 (from RefSeq NR_046729.1)
33RNVU1-6n/a
    
    
     
n/achr1 146,052,162RNA, variant U1 small nuclear 6 (from RefSeq NR_104085.1)
34OR2B6n/a
    
    
     
n/achr6 27,957,711olfactory receptor family 2 subfamily B member 6 (from RefSeq NM_012367.1)
35MIR4538n/a
n/a
n/a
n/a
n/achr14 105,858,203microRNA 4538 (from RefSeq NR_130467.1)
36MIR4507n/a
n/a
n/a
n/a
n/achr14 105,858,149microRNA 4507 (from RefSeq NR_039730.1)
37ENSG00000268289n/a
    
    
     
n/achr19 17,053,540ENSG00000268289 (from geneSymbol)
38RNU6-1069Pn/a
    
    
     
n/achr12 31,803,024RNA, U6 small nuclear 1069, pseudogene (from HGNC RNU6-1069P)
39ATP5MC2P3n/a
    
    
     
n/achr2 197,263,323ATP synthase membrane subunit c locus 2 pseudogene 3 (from HGNC ATP5MC2P3)
40RNU2-6Pn/a
    
    
     
n/achr13 46,374,495RNA, U2 small nuclear 6, pseudogene (from HGNC RNU2-6P)
41ENSG00000254406n/a
    
    
     
n/achr11 119,821,716ENSG00000254406 (from geneSymbol)
42HNRNPA1P21n/a
    
    
     
n/achr3 39,335,459heterogeneous nuclear ribonucleoprotein A1 pseudogene 21 (from HGNC HNRNPA1P21)
43VTRNA1-3n/a
    
    
     
n/achr5 140,726,202vault RNA 1-3 (from RefSeq NR_026705.1)
44ARB2BPn/a
n/a
n/a
n/a
n/achr3 101,522,435ARB2BP (from geneSymbol)
45LINC01934n/a
n/a
n/a
n/a
n/achr2 181,266,579long intergenic non-protein coding RNA 1934 (from RefSeq NR_130784.1)
46RNU1-11Pn/a
    
    
     
n/achr6 13,214,137RNA, U1 small nuclear 11, pseudogene (from HGNC RNU1-11P)
47BTBD6P1n/a
    
    
     
n/achr1 23,902,104BTB domain containing 6 pseudogene 1 (from HGNC BTBD6P1)
48ENSG00000229559n/a
    
    
     
n/achr6 37,546,935ENSG00000229559 (from geneSymbol)
49ENSG00000293212n/a
    
    
     
n/achr6 37,545,154ENSG00000293212 (from geneSymbol)
50LINC02812n/a
    
    
     
n/achr1 53,367,389LINC02812 (from geneSymbol)