UCSC Human Gene Sorter
 
genome assembly search
sort by display output 
#
Name
VisiGene
BLASTP
E-Value
Genome Position
Description
1ENSG00000259042n/a
n/a
n/a
n/a
n/achr14 22,417,009ENSG00000259042 (from geneSymbol)
2IGKV2-18n/a
    
    
     
n/achr2 89,129,103immunoglobulin kappa variable 2-18 (pseudogene) (from HGNC IGKV2-18)
3RNA5SP260n/a
    
    
     
n/achr8 29,048,549RNA, 5S ribosomal pseudogene 260 (from HGNC RNA5SP260)
4OR5BQ1Pn/a
    
    
     
n/achr11 57,029,565olfactory receptor family 5 subfamily BQ member 1 pseudogene (from HGNC OR5BQ1P)
5RN7SL301Pn/a
n/a
n/a
n/a
n/achr17 36,110,298RNA, 7SL, cytoplasmic 301, pseudogene (from HGNC RN7SL301P)
6OR5G1Pn/a
n/a
n/a
n/a
n/achr11 56,775,733olfactory receptor family 5 subfamily G member 1 pseudogene (from HGNC OR5G1P)
7ENSG00000231392n/a
    
    
     
n/achr22 22,774,610ENSG00000231392 (from geneSymbol)
8ENSG00000200235n/a
    
    
     
n/achr5 140,579,729ENSG00000200235 (from geneSymbol)
9ENSG00000249189n/a
    
    
     
n/achr19 54,246,711ENSG00000249189 (from geneSymbol)
10IGLVI-63n/a
    
    
     
n/achr22 22,080,016immunoglobulin lambda variable (I)-63 (pseudogene) (from HGNC IGLVI-63)
11RN7SL105Pn/a
n/a
n/a
n/a
n/achr17 1,604,523RNA, 7SL, cytoplasmic 105, pseudogene (from HGNC RN7SL105P)
12IGHV1-12n/a
    
    
     
n/achr14 106,122,564immunoglobulin heavy variable 1-12 (pseudogene) (from HGNC IGHV1-12)
13IGKV2D-23n/a
    
    
     
n/achr2 90,009,664immunoglobulin kappa variable 2D-23 (pseudogene) (from HGNC IGKV2D-23)
14IGLV3-6n/a
    
    
     
n/achr22 22,850,499immunoglobulin lambda variable 3-6 (pseudogene) (from HGNC IGLV3-6)
15IGLV3-13n/a
    
    
     
n/achr22 22,762,405immunoglobulin lambda variable 3-13 (pseudogene) (from HGNC IGLV3-13)
16ENSG00000259962n/a
    
    
     
n/achr16 53,362,848ENSG00000259962 (from geneSymbol)
17TRAV34n/a
    
    
     
n/achr14 22,207,825V region of the variable domain of T cell receptor (TR) alpha  chain that participates in the antigen recognition (PubMed:24600447).  Alpha-beta T cell receptors are antigen specific receptors which are  essential to the immune response and are present on the cell surface of  T lymphocytes. Recognize peptide-major histocompatibility (MH) (pMH)  complexes that are displayed by antigen presenting cells (APC), a  prerequisite for efficient T cell adaptive immunity against pathogens  (PubMed:25493333). Binding of alpha-beta TR to pMH complex initiates  TR-CD3 clustering on the cell surface and intracellular activation of  LCK that phosphorylates the ITAM motifs of CD3G, CD3D, CD3E and CD247  enabling the recruitment of ZAP70. In turn ZAP70 phosphorylates LAT,  which recruits numerous signaling molecules to form the LAT  signalosome. The LAT signalosome propagates signal branching to three  major signaling pathways, the calcium, the mitogen-activated protein  kinase (MAPK) kinase and the nuclear factor NF-kappa-B (NF-kB)  pathways, leading to the mobilization of transcription factors that are  critical for gene expression and essential for T cell growth and  differentiation (PubMed:23524462). The T cell repertoire is generated  in the thymus, by V-(D)-J rearrangement. This repertoire is then shaped  by intrathymic selection events to generate a peripheral T cell pool of  self-MH restricted, non-autoaggressive T cells. Post-thymic interaction  of alpha-beta TR with the pMH complexes shapes TR structural and  functional avidity (PubMed:15040585). (from UniProt A0A0B4J273)
18ENSG00000226918n/a
    
    
     
n/achrY 21,315,081ENSG00000226918 (from geneSymbol)
19ENSG00000224523n/a
    
    
     
n/achrX 81,418,107ENSG00000224523 (from geneSymbol)
20IGHV1-14n/a
    
    
     
n/achr14 106,146,011immunoglobulin heavy variable 1-14 (pseudogene) (from HGNC IGHV1-14)
21ENSG00000254649n/a
    
    
     
n/achr11 78,390,233ENSG00000254649 (from geneSymbol)
22KIR2DL1n/a
n/a
n/a
n/a
n/achr19 54,777,057killer cell immunoglobulin like receptor, two Ig domains and long cytoplasmic tail 1 (from RefSeq NM_014218.3)
23ENSG00000215765n/a
    
    
     
n/achr19 54,761,390ENSG00000215765 (from geneSymbol)
24PRELID3BP6n/a
    
    
     
n/achr5 42,917,699PRELI domain containing 3B pseudogene 6 (from HGNC PRELID3BP6)
25ENSG00000258115n/a
    
    
     
n/achr12 72,051,763ENSG00000258115 (from geneSymbol)
26IGHV3-52n/a
    
    
     
n/achr14 106,586,601immunoglobulin heavy variable 3-52 (pseudogene) (from HGNC IGHV3-52)
27ENSG00000225741n/a
    
    
     
n/achr22 22,104,038ENSG00000225741 (from geneSymbol)
28IGHVII-60-1n/a
    
    
     
n/achr14 106,637,845immunoglobulin heavy variable (II)-60-1 (pseudogene) (from HGNC IGHVII-60-1)
29ENSG00000257691n/a
    
    
     
n/achr16 29,475,209ENSG00000257691 (from geneSymbol)
30CEACAMP3n/a
    
    
     
n/achr19 41,602,478carcinoembryonic antigen related cell adhesion molecule pseudogene 3 (from HGNC CEACAMP3)
31ENSG00000291001n/a
    
    
     
n/achr19 41,604,113ENSG00000291001 (from geneSymbol)
32ENSG00000241599n/a
    
    
     
n/achr1 160,985ENSG00000241599 (from geneSymbol)
33HMGB1P9n/a
    
    
     
n/achr2 218,200,911high mobility group box 1 pseudogene 9 (from HGNC HMGB1P9)
34ENSG00000257094n/a
    
    
     
n/achr12 32,007,281ENSG00000257094 (from geneSymbol)
35LINC02092n/a
    
    
     
n/achr17 73,747,205uncharacterized LOC100134391 (from RefSeq NR_164140.1)
36MRPL42P2n/a
    
    
     
n/achr6 16,171,818mitochondrial ribosomal protein L42 pseudogene 2 (from HGNC MRPL42P2)
37RNU6-226Pn/a
    
    
     
n/achr5 175,703,951RNA, U6 small nuclear 226, pseudogene (from HGNC RNU6-226P)
38PPIAP60n/a
n/a
n/a
n/a
n/achr2 11,351,872peptidylprolyl isomerase A pseudogene 60 (from HGNC PPIAP60)
39DPY19L4P1n/a
    
    
     
n/achr1 248,772,713DPY19L4P1 (from geneSymbol)
40RPL21P123n/a
    
    
     
n/achr17 29,716,482ribosomal protein L21 pseudogene 123 (from HGNC RPL21P123)
41OR9G4n/a
    
    
     
n/achr11 56,744,960olfactory receptor family 9 subfamily G member 4, transcript variant 2 (from RefSeq NM_001390832.1)
42OR7E149Pn/a
    
    
     
n/achr12 8,437,914olfactory receptor family 7 subfamily E member 149 pseudogene (from HGNC OR7E149P)
43RPL23AP30n/a
    
    
     
n/achr2 201,066,941ribosomal protein L23a pseudogene 30 (from HGNC RPL23AP30)
44IGHV1-67n/a
    
    
     
n/achr14 106,680,822immunoglobulin heavy variable 1-67 (pseudogene) (from HGNC IGHV1-67)
45LGALS9DPn/a
    
    
     
n/achr17 27,750,543galectin 9D, pseudogene (from HGNC LGALS9DP)
46IFNL1n/a
    
    
     
n/achr19 39,297,540interferon lambda 1 (from RefSeq NM_172140.2)
47IGLV3-24n/a
    
    
     
n/achr22 22,694,695immunoglobulin lambda variable 3-24 (pseudogene) (from HGNC IGLV3-24)
48IGHV1-17n/a
    
    
     
n/achr14 106,174,551immunoglobulin heavy variable 1-17 (pseudogene) (from HGNC IGHV1-17)
49ENSG00000276636n/a
n/a
n/a
n/a
n/achr22_KI270879v1_alt 262,993ENSG00000276636 (from geneSymbol)
50IGKV2OR2-2n/a
    
    
     
n/achr2 97,050,878immunoglobulin kappa variable 2/OR2-2 (pseudogene) (from HGNC IGKV2OR2-2)