UCSC Human Gene Sorter
 
genome assembly search
sort by display output 
#
Name
VisiGene
BLASTP
E-Value
Genome Position
Description
1ENSG00000261000n/a
    
    
     
n/achr1 206,504,202ENSG00000261000 (from geneSymbol)
2IL9RP3n/a
    
    
     
n/achr16 33,828interleukin 9 receptor pseudogene 3 (from HGNC IL9RP3)
3ACTG1P14n/a
    
    
     
n/achr9 6,835,016actin gamma 1 pseudogene 14 (from HGNC ACTG1P14)
4BTG2-DTn/a
n/a
n/a
n/a
n/achr1 203,302,033BTG2 divergent transcript, transcript variant 2 (from RefSeq NR_034150.1)
5ENSG00000232536n/a
    
    
     
n/achr1 151,551,185ENSG00000232536 (from geneSymbol)
6ENSG00000258922n/a
    
    
     
n/achr15 92,807,168ENSG00000258922 (from geneSymbol)
7NARF-AS1n/a
    
    
     
n/achr17 82,477,260NARF antisense RNA 1 (from HGNC NARF-AS1)
8ODCPn/a
    
    
     
n/achr7 129,029,708ornithine decarboxylase pseudogene (from HGNC ODCP)
9ENSG00000266126n/a
    
    
     
n/achr17 19,929,554ENSG00000266126 (from geneSymbol)
10ENSG00000269161n/a
    
    
     
n/achr19 17,519,447ENSG00000269161 (from geneSymbol)
11SNORD9n/a
    
    
     
n/achr14 21,392,201small nucleolar RNA, C/D box 9 (from RefSeq NR_003029.2)
12ENSG00000225871n/a
    
    
     
n/achr1 148,436,015ENSG00000225871 (from geneSymbol)
13RN7SL650Pn/a
n/a
n/a
n/a
n/achr14 21,429,657RNA, 7SL, cytoplasmic 650, pseudogene (from HGNC RN7SL650P)
14ENSG00000268499n/a
    
    
     
n/achr19 38,200,385ENSG00000268499 (from geneSymbol)
15TRGV8n/a
    
    
     
n/achr7 38,330,639V region of the variable domain of T cell receptor (TR) gamma  chain that participates in the antigen recognition (PubMed:24600447).  Gamma-delta TRs recognize a variety of self and foreign non-peptide  antigens frequently expressed at the epithelial boundaries between the  host and external environment, including endogenous lipids presented by  MH-like protein CD1D and phosphoantigens presented by butyrophilin-like  molecule BTN3A1. Upon antigen recognition induces rapid, innate-like  immune responses involved in pathogen clearance and tissue repair  (PubMed:23348415, PubMed:28920588). Binding of gamma-delta TR complex  to antigen triggers phosphorylation of immunoreceptor tyrosine-based  activation motifs (ITAMs) in the CD3 chains by the LCK and FYN kinases,  allowing the recruitment, phosphorylation, and activation of ZAP70 that  facilitates phosphorylation of the scaffolding proteins LCP2 and LAT.  This lead to the formation of a supramolecular signalosome that  recruits the phospholipase PLCG1, resulting in calcium mobilization and  ERK activation, ultimately leading to T cell expansion and  differentiation into effector cells (PubMed:25674089). Gamma-delta TRs  are produced through somatic rearrangement of a limited repertoire of  variable (V), diversity (D), and joining (J) genes. The potential  diversity of gamma-delta TRs is conferred by the unique ability to  rearrange (D) genes in tandem and to utilize all three reading frames.  The combinatorial diversity is considerably increased by the sequence  exonuclease trimming and random nucleotide (N) region additions which  occur during the V-(D)-J rearrangements (PubMed:24387714). (from UniProt A0A0C4DH27)
16ENSG00000236942n/a
    
    
     
n/achr1 205,625,818ENSG00000236942 (from geneSymbol)
17ENSG00000241490n/a
    
    
     
n/achr3 114,225,297ENSG00000241490 (from geneSymbol)
18ENSG00000224207n/a
n/a
n/a
n/a
n/achr4 102,734,485ENSG00000224207 (from geneSymbol)
19RN7SL32Pn/a
n/a
n/a
n/a
n/achr2 233,205,339RNA, 7SL, cytoplasmic 32, pseudogene (from HGNC RN7SL32P)
20ENSG00000258593n/a
    
    
     
n/achr14 104,858,314ENSG00000258593 (from geneSymbol)
21ENSG00000261732n/a
n/a
n/a
n/a
n/achr16 1,659,487ENSG00000261732 (from geneSymbol)
22HSPB1P2n/a
    
    
     
n/achrX 49,234,228heat shock protein family B (small) member 1 pseudogene 2 (from HGNC HSPB1P2)
23ENSG00000228079n/a
n/a
n/a
n/a
n/achr2 64,087,299ENSG00000228079 (from geneSymbol)
24SOCS5P4n/a
    
    
     
n/achrX 71,044,342suppressor of cytokine signaling 5 pseudogene 4 (from HGNC SOCS5P4)
25ENSG00000266897n/a
    
    
     
n/achr19 13,131,990ENSG00000266897 (from geneSymbol)
26BNIP3P39n/a
    
    
     
n/achr19 23,799,200BCL2 interacting protein 3 pseudogene 39 (from HGNC BNIP3P39)
27ENSG00000254691n/a
    
    
     
n/achr11 77,851,057ENSG00000254691 (from geneSymbol)
28RPL34P22n/a
    
    
     
n/achr11 44,629,515ribosomal protein L34 pseudogene 22 (from HGNC RPL34P22)
29ENSG00000233478n/a
    
    
     
n/achr1 25,651,827ENSG00000233478 (from geneSymbol)
30RPL21P94n/a
    
    
     
n/achr11 6,686,130ribosomal protein L21 pseudogene 94 (from HGNC RPL21P94)
31ENSG00000255621n/a
    
    
     
n/achr12 13,020,565ENSG00000255621 (from geneSymbol)
32HTR7P1n/a
n/a
n/a
n/a
n/achr12 13,002,6255-hydroxytryptamine receptor 7 pseudogene 1 (from RefSeq NR_002774.3)
33ARGFXP2n/a
    
    
     
n/achr17 32,150,968arginine-fifty homeobox pseudogene 2 (from RefSeq NR_002222.1)
34ENSG00000266918n/a
    
    
     
n/achr17 45,532,707ENSG00000266918 (from geneSymbol)
35ENSG00000268070n/a
    
    
     
n/achr19 20,033,888ENSG00000268070 (from geneSymbol)
36IGLC5n/a
    
    
     
n/achr22 22,915,781immunoglobulin lambda constant 5 (pseudogene) (from HGNC IGLC5)
37ENSG00000243304n/a
    
    
     
n/achr5 115,265,066ENSG00000243304 (from geneSymbol)
38ENSG00000228028n/a
    
    
     
n/achr3 196,251,101ENSG00000228028 (from geneSymbol)
39ENSG00000225411n/a
    
    
     
n/achr9 63,808,151ENSG00000225411 (from geneSymbol)
40PHB1P15n/a
n/a
n/a
n/a
n/achr7 74,741,789PHB1P15 (from geneSymbol)
41ENSG00000290735n/a
n/a
n/a
n/a
n/achr1 143,892,081ENSG00000290735 (from geneSymbol)
42HMGB3P32n/a
    
    
     
n/achr16 57,603,417high mobility group box 3 pseudogene 32 (from HGNC HMGB3P32)
43MPHOSPH6P1n/a
    
    
     
n/achr1 22,068,583MPHOSPH6P1 (from geneSymbol)
44IGHEn/a
n/a
n/a
n/a
n/achr14 105,599,709Constant region of immunoglobulin heavy chains.  Immunoglobulins, also known as antibodies, are membrane-bound or  secreted glycoproteins produced by B lymphocytes. In the recognition  phase of humoral immunity, the membrane-bound immunoglobulins serve as  receptors which, upon binding of a specific antigen, trigger the clonal  expansion and differentiation of B lymphocytes into immunoglobulins-  secreting plasma cells. Secreted immunoglobulins mediate the effector  phase of humoral immunity, which results in the elimination of bound  antigens (PubMed:22158414, PubMed:20176268). The antigen binding site  is formed by the variable domain of one heavy chain, together with that  of its associated light chain. Thus, each immunoglobulin has two  antigen binding sites with remarkable affinity for a particular  antigen. The variable domains are assembled by a process called V-(D)-J  rearrangement and can then be subjected to somatic hypermutations  which, after exposure to antigen and selection, allow affinity  maturation for a particular antigen (PubMed:17576170, PubMed:20176268). (from UniProt P01854)
45LINC02390n/a
    
    
     
n/achr12 9,706,713long intergenic non-protein coding RNA 2390 (from HGNC LINC02390)
46IKBKE-AS1n/a
    
    
     
n/achr1 206,494,422IKBKE antisense RNA 1 (from RefSeq NR_172918.1)
47ENSG00000254936n/a
n/a
n/a
n/a
n/achr8 11,124,722ENSG00000254936 (from geneSymbol)
48ENSG00000224478n/a
    
    
     
n/achr6 159,110,289ENSG00000224478 (from geneSymbol)
49IGKV2D-30n/a
    
    
     
n/achr2 89,937,269V region of the variable domain of immunoglobulin light  chains that participates in the antigen recognition (PubMed:24600447).  Immunoglobulins, also known as antibodies, are membrane-bound or  secreted glycoproteins produced by B lymphocytes. In the recognition  phase of humoral immunity, the membrane-bound immunoglobulins serve as  receptors which, upon binding of a specific antigen, trigger the clonal  expansion and differentiation of B lymphocytes into immunoglobulins-  secreting plasma cells. Secreted immunoglobulins mediate the effector  phase of humoral immunity, which results in the elimination of bound  antigens (PubMed:20176268, PubMed:22158414). The antigen binding site  is formed by the variable domain of one heavy chain, together with that  of its associated light chain. Thus, each immunoglobulin has two  antigen binding sites with remarkable affinity for a particular  antigen. The variable domains are assembled by a process called V-(D)-J  rearrangement and can then be subjected to somatic hypermutations  which, after exposure to antigen and selection, allow affinity  maturation for a particular antigen (PubMed:20176268, PubMed:17576170). (from UniProt A0A075B6S6)
50IGHV3-22n/a
    
    
     
n/achr14 106,257,992immunoglobulin heavy variable 3-22 (pseudogene) (from HGNC IGHV3-22)