UCSC Human Gene Sorter
 
genome assembly search
sort by display output 
#
Name
VisiGene
BLASTP
E-Value
Genome Position
Description
1ENSG00000260467n/a
    
    
     
n/achr16 57,691,427ENSG00000260467 (from geneSymbol)
2ADGRE3n/a
n/a
n/a
n/a
n/achr19 14,646,980adhesion G protein-coupled receptor E3, transcript variant 1 (from RefSeq NM_032571.5)
3RAB3D26109
n/a
n/a
n/a
n/achr19 11,330,862RAB3D, member RAS oncogene family (from RefSeq NM_004283.4)
4MIR223n/a
n/a
n/a
n/a
n/achrX 66,018,924microRNA 223 (from RefSeq NR_029637.1)
5CLEC4Dn/a
n/a
n/a
n/a
n/achr12 8,517,934C-type lectin domain family 4 member D (from RefSeq NM_080387.5)
6TREML3Pn/a
n/a
n/a
n/a
n/achr6 41,213,790triggering receptor expressed on myeloid cells like 3, pseudogene (from HGNC TREML3P)
7VSTM1n/a
n/a
n/a
n/a
n/achr19 54,052,361V-set and transmembrane domain containing 1, transcript variant 5 (from RefSeq NR_110142.2)
8CD300LBn/a
n/a
n/a
n/a
n/achr17 74,526,324CD300 molecule like family member b (from RefSeq NM_174892.4)
9ENSG00000285347n/a
n/a
n/a
n/a
n/achr20 38,274,576uncharacterized LOC149684 (from RefSeq NR_104170.1)
10ADGRE1n/a
n/a
n/a
n/a
n/achr19 6,914,014adhesion G protein-coupled receptor E1, transcript variant 1 (from RefSeq NM_001974.5)
11CEACAM8n/a
n/a
n/a
n/a
n/achr19 42,587,583CEA cell adhesion molecule 8 (from RefSeq NM_001816.4)
12TRBV27n/a
    
    
     
n/achr7 142,715,603V region of the variable domain of T cell receptor (TR) beta  chain that participates in the antigen recognition (PubMed:24600447).  Alpha-beta T cell receptors are antigen specific receptors which are  essential to the immune response and are present on the cell surface of  T lymphocytes. Recognize peptide-major histocompatibility (MH) (pMH)  complexes that are displayed by antigen presenting cells (APC), a  prerequisite for efficient T cell adaptive immunity against pathogens  (PubMed:25493333). Binding of alpha-beta TR to pMH complex initiates  TR-CD3 clustering on the cell surface and intracellular activation of  LCK that phosphorylates the ITAM motifs of CD3G, CD3D, CD3E and CD247  enabling the recruitment of ZAP70. In turn ZAP70 phosphorylates LAT,  which recruits numerous signaling molecules to form the LAT  signalosome. The LAT signalosome propagates signal branching to three  major signaling pathways, the calcium, the mitogen-activated protein  kinase (MAPK) kinase and the nuclear factor NF-kappa-B (NF-kB)  pathways, leading to the mobilization of transcription factors that are  critical for gene expression and essential for T cell growth and  differentiation (PubMed:23524462). The T cell repertoire is generated  in the thymus, by V-(D)-J rearrangement. This repertoire is then shaped  by intrathymic selection events to generate a peripheral T cell pool of  self-MH restricted, non-autoaggressive T cells. Post-thymic interaction  of alpha-beta TR with the pMH complexes shapes TR structural and  functional avidity (PubMed:15040585). (from UniProt A0A0K0K1C4)
13PEAK3n/a
n/a
n/a
n/a
n/achr19 2,278,403PEAK family member 3 (from RefSeq NM_198532.3)
14ENSG00000234484n/a
    
    
     
n/achr6 132,753,313ENSG00000234484 (from geneSymbol)
15NAIPP1n/a
n/a
n/a
n/a
n/achr5 70,476,014NAIPP1 (from geneSymbol)
16TRIM58n/a
    
    
     
n/achr1 247,868,662tripartite motif containing 58 (from RefSeq NM_015431.4)
17TREML2n/a
    
    
     
n/achr6 41,195,449triggering receptor expressed on myeloid cells like 2 (from RefSeq NM_024807.4)
18NAIPP3n/a
n/a
n/a
n/a
n/achr5 69,620,879NAIPP3 (from geneSymbol)
19OR52K3Pn/a
n/a
n/a
n/a
n/achr11 4,475,284olfactory receptor family 52 subfamily K member 3 pseudogene (from HGNC OR52K3P)
20NME8n/a
n/a
n/a
n/a
n/achr7 37,874,497NME/NM23 family member 8 (from RefSeq NM_016616.5)
21NCR1n/a
n/a
n/a
n/a
n/achr19 54,909,610natural cytotoxicity triggering receptor 1, transcript variant 1 (from RefSeq NM_004829.7)
22ENSG00000234389n/a
    
    
     
n/achr2 102,439,594ENSG00000234389 (from geneSymbol)
23CD300Hn/a
n/a
n/a
n/a
n/achr17 74,564,022CD300H molecule (gene/pseudogene), transcript variant 3 (from RefSeq NM_001405511.1)
24MS4A3n/a
n/a
n/a
n/a
n/achr11 60,063,890membrane spanning 4-domains A3, transcript variant 1 (from RefSeq NM_006138.5)
25LILRA2n/a
n/a
n/a
n/a
n/achr19 54,582,038leukocyte immunoglobulin like receptor A2, transcript variant 1 (from RefSeq NM_001130917.3)
26ENSG00000269271n/a
n/a
n/a
n/a
n/achr19 54,589,864ENSG00000269271 (from geneSymbol)
27IFIT1Bn/a
    
    
     
n/achr10 89,381,630interferon induced protein with tetratricopeptide repeats 1B (from RefSeq NM_001010987.2)
28TRBV19n/a
    
    
     
n/achr7 142,619,190V region of the variable domain of T cell receptor (TR) beta  chain that participates in the antigen recognition (PubMed:24600447).  Alpha-beta T cell receptors are antigen specific receptors which are  essential to the immune response and are present on the cell surface of  T lymphocytes. Recognize peptide-major histocompatibility (MH) (pMH)  complexes that are displayed by antigen presenting cells (APC), a  prerequisite for efficient T cell adaptive immunity against pathogens  (PubMed:25493333). Binding of alpha-beta TR to pMH complex initiates  TR-CD3 clustering on the cell surface and intracellular activation of  LCK that phosphorylates the ITAM motifs of CD3G, CD3D, CD3E and CD247  enabling the recruitment of ZAP70. In turn ZAP70 phosphorylates LAT,  which recruits numerous signaling molecules to form the LAT  signalosome. The LAT signalosome propagates signal branching to three  major signaling pathways, the calcium, the mitogen-activated protein  kinase (MAPK) kinase and the nuclear factor NF-kappa-B (NF-kB)  pathways, leading to the mobilization of transcription factors that are  critical for gene expression and essential for T cell growth and  differentiation (PubMed:23524462). The T cell repertoire is generated  in the thymus, by V-(D)-J rearrangement. This repertoire is then shaped  by intrathymic selection events to generate a peripheral T cell pool of  self-MH restricted, non-autoaggressive T cells. Post-thymic interaction  of alpha-beta TR with the pMH complexes shapes TR structural and  functional avidity (PubMed:15040585). (from UniProt A0A075B6N1)
29TRBV29-1n/a
    
    
     
n/achr7 142,740,550V region of the variable domain of T cell receptor (TR) beta  chain that participates in the antigen recognition (PubMed:24600447).  Alpha-beta T cell receptors are antigen specific receptors which are  essential to the immune response and are present on the cell surface of  T lymphocytes. Recognize peptide-major histocompatibility (MH) (pMH)  complexes that are displayed by antigen presenting cells (APC), a  prerequisite for efficient T cell adaptive immunity against pathogens  (PubMed:25493333). Binding of alpha-beta TR to pMH complex initiates  TR-CD3 clustering on the cell surface and intracellular activation of  LCK that phosphorylates the ITAM motifs of CD3G, CD3D, CD3E and CD247  enabling the recruitment of ZAP70. In turn ZAP70 phosphorylates LAT,  which recruits numerous signaling molecules to form the LAT  signalosome. The LAT signalosome propagates signal branching to three  major signaling pathways, the calcium, the mitogen-activated protein  kinase (MAPK) kinase and the nuclear factor NF-kappa-B (NF-kB)  pathways, leading to the mobilization of transcription factors that are  critical for gene expression and essential for T cell growth and  differentiation (PubMed:23524462). The T cell repertoire is generated  in the thymus, by V-(D)-J rearrangement. This repertoire is then shaped  by intrathymic selection events to generate a peripheral T cell pool of  self-MH restricted, non-autoaggressive T cells. Post-thymic interaction  of alpha-beta TR with the pMH complexes shapes TR structural and  functional avidity (PubMed:15040585). (from UniProt A0A5B7)
30ENSG00000266106n/a
    
    
     
n/achr17 74,308,500ENSG00000266106 (from geneSymbol)
31KIR2DS4n/a
n/a
n/a
n/a
n/achr19 54,840,622killer cell immunoglobulin like receptor, two Ig domains and short cytoplasmic tail 4 (from HGNC KIR2DS4)
32ENSG00000218809n/a
    
    
     
n/achr6 41,270,057ENSG00000218809 (from geneSymbol)
33CLCn/a
    
    
     
n/achr19 39,734,642Charcot-Leyden crystal galectin (from RefSeq NM_001828.6)
34TRBV28n/a
n/a
n/a
n/a
n/achr7 142,720,910V region of the variable domain of T cell receptor (TR) beta  chain that participates in the antigen recognition (PubMed:24600447).  Alpha-beta T cell receptors are antigen specific receptors which are  essential to the immune response and are present on the cell surface of  T lymphocytes. Recognize peptide-major histocompatibility (MH) (pMH)  complexes that are displayed by antigen presenting cells (APC), a  prerequisite for efficient T cell adaptive immunity against pathogens  (PubMed:25493333). Binding of alpha-beta TR to pMH complex initiates  TR-CD3 clustering on the cell surface and intracellular activation of  LCK that phosphorylates the ITAM motifs of CD3G, CD3D, CD3E and CD247  enabling the recruitment of ZAP70. In turn ZAP70 phosphorylates LAT,  which recruits numerous signaling molecules to form the LAT  signalosome. The LAT signalosome propagates signal branching to three  major signaling pathways, the calcium, the mitogen-activated protein  kinase (MAPK) kinase and the nuclear factor NF-kappa-B (NF-kB)  pathways, leading to the mobilization of transcription factors that are  critical for gene expression and essential for T cell growth and  differentiation (PubMed:23524462). The T cell repertoire is generated  in the thymus, by V-(D)-J rearrangement. This repertoire is then shaped  by intrathymic selection events to generate a peripheral T cell pool of  self-MH restricted, non-autoaggressive T cells. Post-thymic interaction  of alpha-beta TR with the pMH complexes shapes TR structural and  functional avidity (PubMed:15040585). (from UniProt A0A5B6)
35TRBV20-1n/a
    
    
     
n/achr7 142,627,024V region of the variable domain of T cell receptor (TR) beta  chain that participates in the antigen recognition (PubMed:24600447).  Alpha-beta T cell receptors are antigen specific receptors which are  essential to the immune response and are present on the cell surface of  T lymphocytes. Recognize peptide-major histocompatibility (MH) (pMH)  complexes that are displayed by antigen presenting cells (APC), a  prerequisite for efficient T cell adaptive immunity against pathogens  (PubMed:25493333). Binding of alpha-beta TR to pMH complex initiates  TR-CD3 clustering on the cell surface and intracellular activation of  LCK that phosphorylates the ITAM motifs of CD3G, CD3D, CD3E and CD247  enabling the recruitment of ZAP70. In turn ZAP70 phosphorylates LAT,  which recruits numerous signaling molecules to form the LAT  signalosome. The LAT signalosome propagates signal branching to three  major signaling pathways, the calcium, the mitogen-activated protein  kinase (MAPK) kinase and the nuclear factor NF-kappa-B (NF-kB)  pathways, leading to the mobilization of transcription factors that are  critical for gene expression and essential for T cell growth and  differentiation (PubMed:23524462). The T cell repertoire is generated  in the thymus, by V-(D)-J rearrangement. This repertoire is then shaped  by intrathymic selection events to generate a peripheral T cell pool of  self-MH restricted, non-autoaggressive T cells. Post-thymic interaction  of alpha-beta TR with the pMH complexes shapes TR structural and  functional avidity (PubMed:15040585). (from UniProt A0A075B6N2)
36TRBV5-1n/a
    
    
     
n/achr7 142,321,110V region of the variable domain of T cell receptor (TR) beta  chain that participates in the antigen recognition (PubMed:24600447).  Alpha-beta T cell receptors are antigen specific receptors which are  essential to the immune response and are present on the cell surface of  T lymphocytes. Recognize peptide-major histocompatibility (MH) (pMH)  complexes that are displayed by antigen presenting cells (APC), a  prerequisite for efficient T cell adaptive immunity against pathogens  (PubMed:25493333). Binding of alpha-beta TR to pMH complex initiates  TR-CD3 clustering on the cell surface and intracellular activation of  LCK that phosphorylates the ITAM motifs of CD3G, CD3D, CD3E and CD247  enabling the recruitment of ZAP70. In turn ZAP70 phosphorylates LAT,  which recruits numerous signaling molecules to form the LAT  signalosome. The LAT signalosome propagates signal branching to three  major signaling pathways, the calcium, the mitogen-activated protein  kinase (MAPK) kinase and the nuclear factor NF-kappa-B (NF-kB)  pathways, leading to the mobilization of transcription factors that are  critical for gene expression and essential for T cell growth and  differentiation (PubMed:23524462). The T cell repertoire is generated  in the thymus, by V-(D)-J rearrangement. This repertoire is then shaped  by intrathymic selection events to generate a peripheral T cell pool of  self-MH restricted, non-autoaggressive T cells. Post-thymic interaction  of alpha-beta TR with the pMH complexes shapes TR structural and  functional avidity (PubMed:15040585). (from UniProt A0A578)
37ENSG00000267293n/a
    
    
     
n/achr18 46,029,067ENSG00000267293 (from geneSymbol)
38LINC01801n/a
    
    
     
n/achr19 34,803,619long intergenic non-protein coding RNA 1801 (from HGNC LINC01801)
39ENSG00000230637n/a
    
    
     
n/achr22 25,333,613ENSG00000230637 (from geneSymbol)
40SLA2n/a
n/a
n/a
n/a
n/achr20 36,629,257Src like adaptor 2, transcript variant 1 (from RefSeq NM_032214.4)
41TTLL10-AS1n/a
    
    
     
n/achr1 1,176,305TTLL10 antisense RNA 1 (from RefSeq NR_173246.1)
42CSNK1A1Ln/a
n/a
n/a
n/a
n/achr13 37,104,461casein kinase 1 alpha 1 like (from RefSeq NM_145203.6)
43CCNYL2n/a
n/a
n/a
n/a
n/achr10 42,432,056cyclin Y-like 2 (pseudogene) (from HGNC CCNYL2)
44ENSG00000254980n/a
    
    
     
n/achr11 111,520,399ENSG00000254980 (from geneSymbol)
45ENSG00000279239n/a
n/a
n/a
n/a
n/achr10 42,470,175ENSG00000279239 (from geneSymbol)
46CCNYL2n/a
n/a
n/a
n/a
n/achr10 42,440,204cyclin Y like 2 (pseudogene) (from RefSeq NR_103829.1)
47NCAPGP2n/a
    
    
     
n/achr15 30,005,817non-SMC condensin I complex subunit G pseudogene 2 (from HGNC NCAPGP2)
48ENSG00000243273n/a
    
    
     
n/achr3 150,964,727ENSG00000243273 (from geneSymbol)
49ENSG00000232642n/a
    
    
     
n/achr2 24,170,352ENSG00000232642 (from geneSymbol)
50KIR3DL1n/a
n/a
n/a
n/a
n/achr19 54,823,623killer cell immunoglobulin like receptor, three Ig domains and long cytoplasmic tail 1, transcript variant 1 (reference allele) (from RefSeq NM_013289.4)