UCSC Human Gene Sorter
 
genome assembly search
sort by display output 
#
Name
VisiGene
BLASTP
E-Value
Genome Position
Description
1CFAP69P1n/a
    
    
     
n/achr16 57,013,585CFAP69P1 (from geneSymbol)
2RPL21P123n/a
    
    
     
n/achr17 29,716,482ribosomal protein L21 pseudogene 123 (from HGNC RPL21P123)
3ATOSBP1n/a
    
    
     
n/achr3 114,232,209ATOSBP1 (from geneSymbol)
4ENSG00000259962n/a
    
    
     
n/achr16 53,362,848ENSG00000259962 (from geneSymbol)
5TRAV34n/a
    
    
     
n/achr14 22,207,825V region of the variable domain of T cell receptor (TR) alpha  chain that participates in the antigen recognition (PubMed:24600447).  Alpha-beta T cell receptors are antigen specific receptors which are  essential to the immune response and are present on the cell surface of  T lymphocytes. Recognize peptide-major histocompatibility (MH) (pMH)  complexes that are displayed by antigen presenting cells (APC), a  prerequisite for efficient T cell adaptive immunity against pathogens  (PubMed:25493333). Binding of alpha-beta TR to pMH complex initiates  TR-CD3 clustering on the cell surface and intracellular activation of  LCK that phosphorylates the ITAM motifs of CD3G, CD3D, CD3E and CD247  enabling the recruitment of ZAP70. In turn ZAP70 phosphorylates LAT,  which recruits numerous signaling molecules to form the LAT  signalosome. The LAT signalosome propagates signal branching to three  major signaling pathways, the calcium, the mitogen-activated protein  kinase (MAPK) kinase and the nuclear factor NF-kappa-B (NF-kB)  pathways, leading to the mobilization of transcription factors that are  critical for gene expression and essential for T cell growth and  differentiation (PubMed:23524462). The T cell repertoire is generated  in the thymus, by V-(D)-J rearrangement. This repertoire is then shaped  by intrathymic selection events to generate a peripheral T cell pool of  self-MH restricted, non-autoaggressive T cells. Post-thymic interaction  of alpha-beta TR with the pMH complexes shapes TR structural and  functional avidity (PubMed:15040585). (from UniProt A0A0B4J273)
6ENSG00000249189n/a
    
    
     
n/achr19 54,246,711ENSG00000249189 (from geneSymbol)
7GOLGA5P1n/a
    
    
     
n/achr5 39,169,772golgin A5 pseudogene 1 (from HGNC GOLGA5P1)
8SDR42E1P5n/a
    
    
     
n/achr2 102,411,675short chain dehydrogenase/reductase family 42E, member 1 pseudogene 5 (from HGNC SDR42E1P5)
9ENSG00000254325n/a
    
    
     
n/achr8 55,894,667ENSG00000254325 (from geneSymbol)
10ENSG00000257691n/a
    
    
     
n/achr16 29,475,209ENSG00000257691 (from geneSymbol)
11ENSG00000200235n/a
    
    
     
n/achr5 140,579,729ENSG00000200235 (from geneSymbol)
12RN7SL105Pn/a
n/a
n/a
n/a
n/achr17 1,604,523RNA, 7SL, cytoplasmic 105, pseudogene (from HGNC RN7SL105P)
13CR1Ln/a
n/a
n/a
n/a
n/achr1 207,684,418complement C3b/C4b receptor 1 like (from RefSeq NM_175710.2)
14CD46P1n/a
    
    
     
n/achr1 207,651,322CD46 molecule pseudogene 1 (from HGNC CD46P1)
15ENSG00000226918n/a
    
    
     
n/achrY 21,315,081ENSG00000226918 (from geneSymbol)
16IGLV2-34n/a
    
    
     
n/achr22 22,580,155immunoglobulin lambda variable 2-34 (pseudogene) (from HGNC IGLV2-34)
17RN7SL301Pn/a
n/a
n/a
n/a
n/achr17 36,110,298RNA, 7SL, cytoplasmic 301, pseudogene (from HGNC RN7SL301P)
18OR5G1Pn/a
n/a
n/a
n/a
n/achr11 56,775,733olfactory receptor family 5 subfamily G member 1 pseudogene (from HGNC OR5G1P)
19ENSG00000231392n/a
    
    
     
n/achr22 22,774,610ENSG00000231392 (from geneSymbol)
20MRPL42P2n/a
    
    
     
n/achr6 16,171,818mitochondrial ribosomal protein L42 pseudogene 2 (from HGNC MRPL42P2)
21TRGVAn/a
    
    
     
n/achr7 38,322,588T cell receptor gamma variable A (pseudogene) (from HGNC TRGVA)
22KIR2DL1n/a
n/a
n/a
n/a
n/achr19 54,777,057killer cell immunoglobulin like receptor, two Ig domains and long cytoplasmic tail 1 (from RefSeq NM_014218.3)
23RNA5SP260n/a
    
    
     
n/achr8 29,048,549RNA, 5S ribosomal pseudogene 260 (from HGNC RNA5SP260)
24ENSG00000215765n/a
    
    
     
n/achr19 54,761,390ENSG00000215765 (from geneSymbol)
25ENSG00000261030n/a
    
    
     
n/achrX 13,094,116ENSG00000261030 (from geneSymbol)
26IFNL1n/a
    
    
     
n/achr19 39,297,540interferon lambda 1 (from RefSeq NM_172140.2)
27MIR144n/a
n/a
n/a
n/a
n/achr17 28,861,575microRNA 144 (from RefSeq NR_029685.1)
28MIR4732n/a
n/a
n/a
n/a
n/achr17 28,861,692microRNA 4732 (from RefSeq NR_039885.1)
29MIR451An/a
n/a
n/a
n/a
n/achr17 28,861,404microRNA 451a (from RefSeq NR_029970.1)
30IGLVI-63n/a
    
    
     
n/achr22 22,080,016immunoglobulin lambda variable (I)-63 (pseudogene) (from HGNC IGLVI-63)
31IGKV2-18n/a
    
    
     
n/achr2 89,129,103immunoglobulin kappa variable 2-18 (pseudogene) (from HGNC IGKV2-18)
32ENSG00000262408n/a
    
    
     
n/achr17 56,884,729ENSG00000262408 (from geneSymbol)
33MTCO2P33n/a
    
    
     
n/achr6 24,948,112mitochondrially encoded cytochrome c oxidase II pseudogene 33 (from HGNC MTCO2P33)
34ENSG00000225741n/a
    
    
     
n/achr22 22,104,038ENSG00000225741 (from geneSymbol)
35ENSG00000253924n/a
    
    
     
n/achr8 52,296,790ENSG00000253924 (from geneSymbol)
36IGHV1-12n/a
    
    
     
n/achr14 106,122,564immunoglobulin heavy variable 1-12 (pseudogene) (from HGNC IGHV1-12)
37RCBTB2P1n/a
    
    
     
n/achr10 88,786,330RCC1 and BTB domain containing protein 2 pseudogene 1 (from HGNC RCBTB2P1)
38IGKV2D-23n/a
    
    
     
n/achr2 90,009,664immunoglobulin kappa variable 2D-23 (pseudogene) (from HGNC IGKV2D-23)
39ENSG00000226987n/a
    
    
     
n/achr9 131,241,205ENSG00000226987 (from geneSymbol)
40OR5BQ1Pn/a
    
    
     
n/achr11 57,029,565olfactory receptor family 5 subfamily BQ member 1 pseudogene (from HGNC OR5BQ1P)
41SEPTIN7P8n/a
    
    
     
n/achr19 53,772,893SEPTIN7P8 (from geneSymbol)
42RN7SL587Pn/a
n/a
n/a
n/a
n/achr14 77,547,706RNA, 7SL, cytoplasmic 587, pseudogene (from HGNC RN7SL587P)
43IGLV3-13n/a
    
    
     
n/achr22 22,762,405immunoglobulin lambda variable 3-13 (pseudogene) (from HGNC IGLV3-13)
44TLR8-AS1n/a
    
    
     
n/achrX 12,905,575TLR8 antisense RNA 1 (from HGNC TLR8-AS1)
45ENSG00000229405n/a
    
    
     
n/achr2 7,736,766ENSG00000229405 (from geneSymbol)
46RN7SL288Pn/a
n/a
n/a
n/a
n/achr13 46,169,603RNA, 7SL, cytoplasmic 288, pseudogene (from HGNC RN7SL288P)
47ENSG00000269066n/a
    
    
     
n/achr19 17,097,362ENSG00000269066 (from geneSymbol)
48RPL4P7n/a
    
    
     
n/achr2 197,029,427RPL4P7 (from geneSymbol)
49ENSG00000243038n/a
    
    
     
n/achr14 50,053,213ENSG00000243038 (from geneSymbol)
50AMZ2P2n/a
    
    
     
n/achr6 158,726,275archaelysin family metallopeptidase 2 pseudogene 2 (from HGNC AMZ2P2)