UCSC Human Gene Sorter
 
genome assembly search
sort by display output 
#
Name
VisiGene
BLASTP
E-Value
Genome Position
Description
1RN7SL411Pn/a
n/a
n/a
n/a
n/achr3 40,209,154RNA, 7SL, cytoplasmic 411, pseudogene (from HGNC RN7SL411P)
2IGHV3-35n/a
    
    
     
n/achr14 106,389,625Probable non-functional open reading frame (ORF) of V region  of the variable domain of immunoglobulin heavy chains  (PubMed:24600447). Non-functional ORF generally cannot participate in  the synthesis of a productive immunoglobulin chain due to altered V-  (D)-J or switch recombination and/or splicing site (at mRNA level)  and/or conserved amino acid change (protein level) (PubMed:9619395).  Immunoglobulins, also known as antibodies, are membrane-bound or  secreted glycoproteins produced by B lymphocytes. In the recognition  phase of humoral immunity, the membrane-bound immunoglobulins serve as  receptors which, upon binding of a specific antigen, trigger the clonal  expansion and differentiation of B lymphocytes into immunoglobulins-  secreting plasma cells. Secreted immunoglobulins mediate the effector  phase of humoral immunity, which results in the elimination of bound  antigens (PubMed:22158414, PubMed:20176268). The antigen binding site  is formed by the variable domain of one heavy chain, together with that  of its associated light chain. Thus, each immunoglobulin has two  antigen binding sites with remarkable affinity for a particular  antigen. The variable domains are assembled by a process called V-(D)-J  rearrangement and can then be subjected to somatic hypermutations  which, after exposure to antigen and selection, allow affinity  maturation for a particular antigen (PubMed:20176268, PubMed:17576170). (from UniProt A0A0C4DH35)
3ENSG00000255491n/a
n/a
n/a
n/a
n/achr8 124,829,669ENSG00000255491 (from geneSymbol)
4RN7SL825Pn/a
n/a
n/a
n/a
n/achr10 31,992,234RNA, 7SL, cytoplasmic 825, pseudogene (from HGNC RN7SL825P)
5IGHV3-16n/a
    
    
     
n/achr14 106,165,467Probable non-functional open reading frame (ORF) of V region  of the variable domain of immunoglobulin heavy chains  (PubMed:24600447). Non-functional ORF generally cannot participate in  the synthesis of a productive immunoglobulin chain due to altered V-  (D)-J or switch recombination and/or splicing site (at mRNA level)  and/or conserved amino acid change (protein level) (PubMed:9619395).  Immunoglobulins, also known as antibodies, are membrane-bound or  secreted glycoproteins produced by B lymphocytes. In the recognition  phase of humoral immunity, the membrane-bound immunoglobulins serve as  receptors which, upon binding of a specific antigen, trigger the clonal  expansion and differentiation of B lymphocytes into immunoglobulins-  secreting plasma cells. Secreted immunoglobulins mediate the effector  phase of humoral immunity, which results in the elimination of bound  antigens (PubMed:22158414, PubMed:20176268). The antigen binding site  is formed by the variable domain of one heavy chain, together with that  of its associated light chain. Thus, each immunoglobulin has two  antigen binding sites with remarkable affinity for a particular  antigen. The variable domains are assembled by a process called V-(D)-J  rearrangement and can then be subjected to somatic hypermutations  which, after exposure to antigen and selection, allow affinity  maturation for a particular antigen (PubMed:20176268, PubMed:17576170). (from UniProt A0A0C4DH30)
6IGHVII-60-1n/a
    
    
     
n/achr14 106,637,845immunoglobulin heavy variable (II)-60-1 (pseudogene) (from HGNC IGHVII-60-1)
7IGHV3-52n/a
    
    
     
n/achr14 106,586,601immunoglobulin heavy variable 3-52 (pseudogene) (from HGNC IGHV3-52)
8PRELID3BP6n/a
    
    
     
n/achr5 42,917,699PRELI domain containing 3B pseudogene 6 (from HGNC PRELID3BP6)
9ENSG00000258115n/a
    
    
     
n/achr12 72,051,763ENSG00000258115 (from geneSymbol)
10IGKV1D-17n/a
    
    
     
n/achr2 90,082,963V region of the variable domain of immunoglobulin light  chains that participates in the antigen recognition (PubMed:24600447).  Immunoglobulins, also known as antibodies, are membrane-bound or  secreted glycoproteins produced by B lymphocytes. In the recognition  phase of humoral immunity, the membrane-bound immunoglobulins serve as  receptors which, upon binding of a specific antigen, trigger the clonal  expansion and differentiation of B lymphocytes into immunoglobulins-  secreting plasma cells. Secreted immunoglobulins mediate the effector  phase of humoral immunity, which results in the elimination of bound  antigens (PubMed:20176268, PubMed:22158414). The antigen binding site  is formed by the variable domain of one heavy chain, together with that  of its associated light chain. Thus, each immunoglobulin has two  antigen binding sites with remarkable affinity for a particular  antigen. The variable domains are assembled by a process called V-(D)-J  rearrangement and can then be subjected to somatic hypermutations  which, after exposure to antigen and selection, allow affinity  maturation for a particular antigen (PubMed:20176268, PubMed:17576170). (from UniProt A0A075B6S4)
11SNX18P25n/a
    
    
     
n/achr4 49,589,150sorting nexin 18 pseudogene 25 (from HGNC SNX18P25)
12RNU6-226Pn/a
    
    
     
n/achr5 175,703,951RNA, U6 small nuclear 226, pseudogene (from HGNC RNU6-226P)
13PPIAP60n/a
n/a
n/a
n/a
n/achr2 11,351,872peptidylprolyl isomerase A pseudogene 60 (from HGNC PPIAP60)
14GZMAP1n/a
    
    
     
n/achr5 55,084,784granzyme A pseudogene 1 (from HGNC GZMAP1)
15IGHV1-14n/a
    
    
     
n/achr14 106,146,011immunoglobulin heavy variable 1-14 (pseudogene) (from HGNC IGHV1-14)
16ENSG00000224523n/a
    
    
     
n/achrX 81,418,107ENSG00000224523 (from geneSymbol)
17MTCO3P39n/a
    
    
     
n/achr4 49,246,279mitochondrially encoded cytochrome c oxidase III pseudogene 39 (from HGNC MTCO3P39)
18OR9G4n/a
    
    
     
n/achr11 56,744,960olfactory receptor family 9 subfamily G member 4, transcript variant 2 (from RefSeq NM_001390832.1)
19RARRES2P2n/a
    
    
     
n/achr10 133,637,650retinoic acid receptor responder 2 pseudogene 2 (from HGNC RARRES2P2)
20OR51I2n/a
n/a
n/a
n/a
n/achr11 5,452,920olfactory receptor family 51 subfamily I member 2, transcript variant 1, coding (from RefSeq NM_001004754.3)
21IGHV1-67n/a
    
    
     
n/achr14 106,680,822immunoglobulin heavy variable 1-67 (pseudogene) (from HGNC IGHV1-67)
22LGALS9DPn/a
    
    
     
n/achr17 27,750,543galectin 9D, pseudogene (from HGNC LGALS9DP)
23ENSG00000253273n/a
    
    
     
n/achr8 73,831,545ENSG00000253273 (from geneSymbol)
24FABP5P14n/a
    
    
     
n/achr2 216,805,933fatty acid binding protein 5 pseudogene 14 (from HGNC FABP5P14)
25C9orf85P2n/a
    
    
     
n/achr3 182,953,545C9orf85P2 (from geneSymbol)
26IGLV3-13n/a
    
    
     
n/achr22 22,762,405immunoglobulin lambda variable 3-13 (pseudogene) (from HGNC IGLV3-13)
27ENSG00000276636n/a
n/a
n/a
n/a
n/achr22_KI270879v1_alt 262,993ENSG00000276636 (from geneSymbol)
28IGHV3-71n/a
    
    
     
n/achr14 106,775,387immunoglobulin heavy variable 3-71 (pseudogene) (from HGNC IGHV3-71)
29IGKV2D-23n/a
    
    
     
n/achr2 90,009,664immunoglobulin kappa variable 2D-23 (pseudogene) (from HGNC IGKV2D-23)
30RPS20P32n/a
n/a
n/a
n/a
n/achr13 27,017,731ribosomal protein S20 pseudogene 32 (from HGNC RPS20P32)
31IGHV1-12n/a
    
    
     
n/achr14 106,122,564immunoglobulin heavy variable 1-12 (pseudogene) (from HGNC IGHV1-12)
32ENSG00000225741n/a
    
    
     
n/achr22 22,104,038ENSG00000225741 (from geneSymbol)
33NUTF2P7n/a
    
    
     
n/achrX 71,016,718nuclear transport factor 2 pseudogene 7 (from HGNC NUTF2P7)
34FAM74A3n/a
n/a
n/a
n/a
n/achr9 66,976,755family with sequence similarity 74 member A3 (from HGNC FAM74A3)
35ENSG00000292994n/a
n/a
n/a
n/a
n/achr1 308,912ENSG00000292994 (from geneSymbol)
36RFKP5n/a
    
    
     
n/achr1 212,647,525RFKP5 (from geneSymbol)
37IKBKGP1n/a
n/a
n/a
n/a
n/achrX 154,644,126inhibitor of nuclear factor kappa B kinase subunit gamma pseudogene 1 (from HGNC IKBKGP1)
38DEFB118n/a
    
    
     
n/achr20 31,371,262defensin beta 118 (from RefSeq NM_054112.3)
39CROCCP5n/a
    
    
     
n/achr1 21,435,938ciliary rootlet coiled-coil, rootletin pseudogene 5 (from HGNC CROCCP5)
40OR2B3n/a
n/a
n/a
n/a
n/achr6 29,086,760olfactory receptor family 2 subfamily B member 3 (from RefSeq NM_001005226.2)
41GOLGA6L11Pn/a
    
    
     
n/achrY 24,171,340golgin A6 family-like 11, pseudogene (from HGNC GOLGA6L11P)
42RAC1P6n/a
    
    
     
n/achr7 115,136,847Rac family small GTPase 1 pseudogene 6 (from HGNC RAC1P6)
43CBX3P6n/a
    
    
     
n/achr2 154,940,804chromobox 3 pseudogene 6 (from HGNC CBX3P6)
44ENSG00000232174n/a
    
    
     
n/achr5 138,620,646ENSG00000232174 (from geneSymbol)
45ENSG00000232436n/a
    
    
     
n/achr1 221,509,769ENSG00000232436 (from geneSymbol)
46ENSG00000232693n/a
    
    
     
n/achr2 65,377,192ENSG00000232693 (from geneSymbol)
47IGKV1OR2-1n/a
n/a
n/a
n/a
n/achr2 91,818,009immunoglobulin kappa variable 1/OR2-1 (pseudogene) (from HGNC IGKV1OR2-1)
48UBE2V1P6n/a
    
    
     
n/achr2 169,115,437ubiquitin conjugating enzyme E2 V1 pseudogene 6 (from HGNC UBE2V1P6)
49RPL21P33n/a
    
    
     
n/achr2 60,852,501ribosomal protein L21 pseudogene 33 (from HGNC RPL21P33)
50OR2L9Pn/a
    
    
     
n/achr1 247,975,197olfactory receptor family 2 subfamily L member 9 pseudogene (from HGNC OR2L9P)