UCSC Human Gene Sorter
 
genome assembly search
sort by display output 
#
Name
VisiGene
BLASTP
E-Value
Genome Position
Description
1ENSG00000267016n/a
    
    
     
n/achr17 77,470,966ENSG00000267016 (from geneSymbol)
2SIDT1-AS1n/a
    
    
     
n/achr3 113,589,468SIDT1 antisense RNA 1 (from RefSeq NR_046729.1)
3CENPUP2n/a
    
    
     
n/achr12 25,093,307centromere protein U pseudogene 2 (from HGNC CENPUP2)
4RNU6-722Pn/a
    
    
     
n/achrX 48,959,230RNA, U6 small nuclear 722, pseudogene (from HGNC RNU6-722P)
5TRGV1n/a
    
    
     
n/achr7 38,367,877Probable non-functional open reading frame (ORF) of V region  of the variable domain of T cell receptor (TR) gamma chain  (PubMed:24600447). Non-functional ORF generally cannot participate in  the synthesis of a productive T cell receptor (TR) chain due to altered  V-(D)-J or switch recombination and/or splicing site (at mRNA level)  and/or conserved amino acid change (protein level) (PubMed:9619395).  Gamma-delta TRs recognize a variety of self and foreign non-peptide  antigens frequently expressed at the epithelial boundaries between the  host and external environment, including endogenous lipids presented by  MH-like protein CD1D and phosphoantigens presented by butyrophilin-like  molecule BTN3A1. Upon antigen recognition induces rapid, innate-like  immune responses involved in pathogen clearance and tissue repair  (PubMed:23348415, PubMed:28920588). Binding of gamma-delta TR complex  to antigen triggers phosphorylation of immunoreceptor tyrosine-based  activation motifs (ITAMs) in the CD3 chains by the LCK and FYN kinases,  allowing the recruitment, phosphorylation, and activation of ZAP70 that  facilitates phosphorylation of the scaffolding proteins LCP2 and LAT.  This lead to the formation of a supramolecular signalosome that  recruits the phospholipase PLCG1, resulting in calcium mobilization and  ERK activation, ultimately leading to T cell expansion and  differentiation into effector cells (PubMed:25674089). Gamma-delta TRs  are produced through somatic rearrangement of a limited repertoire of  variable (V), diversity (D), and joining (J) genes. The potential  diversity of gamma-delta TRs is conferred by the unique ability to  rearrange (D) genes in tandem and to utilize all three reading frames.  The combinatorial diversity is considerably increased by the sequence  exonuclease trimming and random nucleotide (N) region additions which  occur during the V-(D)-J rearrangements (PubMed:24387714). (from UniProt A0A0A0MS02)
6ATP5MC2P3n/a
    
    
     
n/achr2 197,263,323ATP synthase membrane subunit c locus 2 pseudogene 3 (from HGNC ATP5MC2P3)
7ENSG00000258760n/a
    
    
     
n/achr14 65,269,580ENSG00000258760 (from geneSymbol)
8GLYATL1Bn/a
    
    
     
n/achr11 59,090,546glycine-N-acyltransferase like 1B (from RefSeq NM_001355566.1)
9FARSA-AS1n/a
    
    
     
n/achr19 12,931,909FARSA antisense RNA 1 (from RefSeq NR_149078.1)
10ENSG00000262703n/a
    
    
     
n/achr16 11,348,732ENSG00000262703 (from geneSymbol)
11RPL26P29n/a
    
    
     
n/achr10 68,424,778ribosomal protein L26 pseudogene 29 (from HGNC RPL26P29)
12RPL21P110n/a
    
    
     
n/achr13 72,703,915ribosomal protein L21 pseudogene 110 (from HGNC RPL21P110)
13TPM3P8n/a
    
    
     
n/achr2 230,573,488tropomyosin 3 pseudogene 8 (from HGNC TPM3P8)
14RN7SL146Pn/a
    
    
     
n/achr19 16,539,836RNA, 7SL, cytoplasmic 146, pseudogene (from HGNC RN7SL146P)
15ENSG00000256988n/a
    
    
     
n/achr12 4,817,638ENSG00000256988 (from geneSymbol)
16ENSG00000217512n/a
    
    
     
n/achr6 79,067,915ENSG00000217512 (from geneSymbol)
17ENSG00000236941n/a
n/a
n/a
n/a
n/achr4 164,948,758ENSG00000236941 (from geneSymbol)
18RNA5SP69n/a
    
    
     
n/achr1 178,560,971RNA, 5S ribosomal pseudogene 69 (from HGNC RNA5SP69)
19MAF1P1n/a
    
    
     
n/achr3 133,491,164MAF1P1 (from geneSymbol)
20ENSG00000235419n/a
n/a
n/a
n/a
n/achr2 230,550,300ENSG00000235419 (from geneSymbol)
21FGF19n/a
    
    
     
n/achr11 69,701,130fibroblast growth factor 19 (from RefSeq NM_005117.3)
22SNORA68Bn/a
    
    
     
n/achr19 32,608,403small nucleolar RNA, H/ACA box 68B (from RefSeq NR_145718.1)
23ENSG00000267044n/a
    
    
     
n/achr19 45,136,485ENSG00000267044 (from geneSymbol)
24H2BP9n/a
    
    
     
n/achrX 103,904,538H2BP9 (from geneSymbol)
25LINC01934n/a
n/a
n/a
n/a
n/achr2 181,266,579long intergenic non-protein coding RNA 1934 (from RefSeq NR_130784.1)
26ARB2BPn/a
n/a
n/a
n/a
n/achr3 101,522,435ARB2BP (from geneSymbol)
27RNU6-216Pn/a
    
    
     
n/achr11 74,968,240RNA, U6 small nuclear 216, pseudogene (from HGNC RNU6-216P)
28RNVU1-15n/a
    
    
     
n/achr1 144,412,658RNA, variant U1 small nuclear 15 (from RefSeq NR_104076.1)
29ENSG00000254556n/a
    
    
     
n/achr8 11,137,752ENSG00000254556 (from geneSymbol)
30RPL17P29n/a
    
    
     
n/achr8 11,175,310ribosomal protein L17 pseudogene 29 (from HGNC RPL17P29)
31MTATP6P27n/a
    
    
     
n/achr19 12,507,139mitochondrially encoded ATP synthase 6 pseudogene 27 (from HGNC MTATP6P27)
32ENSG00000262810n/a
    
    
     
n/achr17 2,095,620ENSG00000262810 (from geneSymbol)
33ENSG00000279040n/a
n/a
n/a
n/a
n/achr17 2,101,604ENSG00000279040 (from geneSymbol)
34DEFB131Bn/a
n/a
n/a
n/a
n/achr11 71,881,507defensin beta 131B (from RefSeq NM_001242853.1)
35LINC02896n/a
    
    
     
n/achr15 69,460,164LINC02896 (from geneSymbol)
36ENSG00000267501n/a
    
    
     
n/achr18 58,756,350ENSG00000267501 (from geneSymbol)
37RPL4P1n/a
    
    
     
n/achr14 21,750,907ribosomal protein L4 pseudogene 1 (from HGNC RPL4P1)
38RPL12P15n/a
    
    
     
n/achr2 121,658,724ribosomal protein L12 pseudogene 15 (from HGNC RPL12P15)
39ENSG00000279846n/a
n/a
n/a
n/a
n/achr15 99,498,093ENSG00000279846 (from geneSymbol)
40VTRNA1-3n/a
    
    
     
n/achr5 140,726,202vault RNA 1-3 (from RefSeq NR_026705.1)
41ENSG00000237756n/a
    
    
     
n/achr1 163,260,254ENSG00000237756 (from geneSymbol)
42ENSG00000260035n/a
    
    
     
n/achr15 45,200,478ENSG00000260035 (from geneSymbol)
43ENSG00000258878n/a
    
    
     
n/achr14 65,234,808ENSG00000258878 (from geneSymbol)
44RNU1-11Pn/a
    
    
     
n/achr6 13,214,137RNA, U1 small nuclear 11, pseudogene (from HGNC RNU1-11P)
45TNPO1P1n/a
    
    
     
n/achr10 84,391,476transportin 1 pseudogene 1 (from HGNC TNPO1P1)
46ENSG00000268289n/a
    
    
     
n/achr19 17,053,540ENSG00000268289 (from geneSymbol)
47LINC02909n/a
n/a
n/a
n/a
n/achr12 25,000,733LINC02909 (from geneSymbol)
48RNU2-6Pn/a
    
    
     
n/achr13 46,374,495RNA, U2 small nuclear 6, pseudogene (from HGNC RNU2-6P)
49ENSG00000249148n/a
    
    
     
n/achr4 13,632,209ENSG00000249148 (from geneSymbol)
50HMGN1P15n/a
    
    
     
n/achr5 115,289,183high mobility group nucleosome binding domain 1 pseudogene 15 (from HGNC HMGN1P15)