UCSC Human Gene Sorter
 
genome assembly search
sort by display output 
#
Name
VisiGene
BLASTP
E-Value
Genome Position
Description
1TRBV7-7n/a
n/a
n/a
n/a
4e-64chr7_KI270803v1_alt 495,472V region of the variable domain of T cell receptor (TR) beta  chain that participates in the antigen recognition (PubMed:24600447).  Alpha-beta T cell receptors are antigen specific receptors which are  essential to the immune response and are present on the cell surface of  T lymphocytes. Recognize peptide-major histocompatibility (MH) (pMH)  complexes that are displayed by antigen presenting cells (APC), a  prerequisite for efficient T cell adaptive immunity against pathogens  (PubMed:25493333). Binding of alpha-beta TR to pMH complex initiates  TR-CD3 clustering on the cell surface and intracellular activation of  LCK that phosphorylates the ITAM motifs of CD3G, CD3D, CD3E and CD247  enabling the recruitment of ZAP70. In turn ZAP70 phosphorylates LAT,  which recruits numerous signaling molecules to form the LAT  signalosome. The LAT signalosome propagates signal branching to three  major signaling pathways, the calcium, the mitogen-activated protein  kinase (MAPK) kinase and the nuclear factor NF-kappa-B (NF-kB)  pathways, leading to the mobilization of transcription factors that are  critical for gene expression and essential for T cell growth and  differentiation (PubMed:23524462). The T cell repertoire is generated  in the thymus, by V-(D)-J rearrangement. This repertoire is then shaped  by intrathymic selection events to generate a peripheral T cell pool of  self-MH restricted, non-autoaggressive T cells. Post-thymic interaction  of alpha-beta TR with the pMH complexes shapes TR structural and  functional avidity (PubMed:15040585). (from UniProt A0A0K0K1E9)
2TRBV10-1n/a
n/a
n/a
n/a
0.000000000000004chr7_KI270803v1_alt 383,711V region of the variable domain of T cell receptor (TR) beta  chain that participates in the antigen recognition (PubMed:24600447).  Alpha-beta T cell receptors are antigen specific receptors which are  essential to the immune response and are present on the cell surface of  T lymphocytes. Recognize peptide-major histocompatibility (MH) (pMH)  complexes that are displayed by antigen presenting cells (APC), a  prerequisite for efficient T cell adaptive immunity against pathogens  (PubMed:25493333). Binding of alpha-beta TR to pMH complex initiates  TR-CD3 clustering on the cell surface and intracellular activation of  LCK that phosphorylates the ITAM motifs of CD3G, CD3D, CD3E and CD247  enabling the recruitment of ZAP70. In turn ZAP70 phosphorylates LAT,  which recruits numerous signaling molecules to form the LAT  signalosome. The LAT signalosome propagates signal branching to three  major signaling pathways, the calcium, the mitogen-activated protein  kinase (MAPK) kinase and the nuclear factor NF-kappa-B (NF-kB)  pathways, leading to the mobilization of transcription factors that are  critical for gene expression and essential for T cell growth and  differentiation (PubMed:23524462). The T cell repertoire is generated  in the thymus, by V-(D)-J rearrangement. This repertoire is then shaped  by intrathymic selection events to generate a peripheral T cell pool of  self-MH restricted, non-autoaggressive T cells. Post-thymic interaction  of alpha-beta TR with the pMH complexes shapes TR structural and  functional avidity (PubMed:15040585). (from UniProt A0A0K0K1A3)
3ENSG00000269385n/a
    
    
     
n/achr19 6,898,492ENSG00000269385 (from geneSymbol)
4TAF11L2n/a
n/a
n/a
n/a
n/achr5 17,498,529TATA-box binding protein associated factor 11 like 2 (from RefSeq NM_001401696.1)
5MTCO2P33n/a
    
    
     
n/achr6 24,948,112mitochondrially encoded cytochrome c oxidase II pseudogene 33 (from HGNC MTCO2P33)
6DPPA2P2n/a
    
    
     
n/achr1 26,519,802developmental pluripotency associated 2 pseudogene 2 (from HGNC DPPA2P2)
7SOD1P1n/a
    
    
     
n/achr6 53,196,939superoxide dismutase 1 pseudogene 1 (from HGNC SOD1P1)
8MTCO3P23n/a
    
    
     
n/achr15 58,150,419mitochondrially encoded cytochrome c oxidase III pseudogene 23 (from HGNC MTCO3P23)
9SEPTIN7P8n/a
    
    
     
n/achr19 53,772,893SEPTIN7P8 (from geneSymbol)
10IGLV7-35n/a
    
    
     
n/achr22 22,450,427immunoglobulin lambda variable 7-35 (pseudogene) (from HGNC IGLV7-35)
11H2BP6n/a
    
    
     
n/achr13 21,484,004H2BP6 (from geneSymbol)
12ENSG00000231317n/a
    
    
     
n/achr7 55,667,629ENSG00000231317 (from geneSymbol)
13KIR2DL1n/a
n/a
n/a
n/a
n/achr19 54,777,057killer cell immunoglobulin like receptor, two Ig domains and long cytoplasmic tail 1 (from RefSeq NM_014218.3)
14ENSG00000215765n/a
    
    
     
n/achr19 54,761,390ENSG00000215765 (from geneSymbol)
15TRBV7-5n/a
n/a
n/a
n/a
n/achr7_KI270803v1_alt 457,929T cell receptor beta variable 7-5 (pseudogene) (from HGNC TRBV7-5)
16RN7SL634Pn/a
n/a
n/a
n/a
n/achr14 104,013,787RNA, 7SL, cytoplasmic 634, pseudogene (from HGNC RN7SL634P)
17CEACAMP3n/a
    
    
     
n/achr19 41,602,478carcinoembryonic antigen related cell adhesion molecule pseudogene 3 (from HGNC CEACAMP3)
18ENSG00000291001n/a
    
    
     
n/achr19 41,604,113ENSG00000291001 (from geneSymbol)
19TUBBP6n/a
    
    
     
n/achr7 55,646,285tubulin beta class I pseudogene 6 (from HGNC TUBBP6)
20ENSG00000254325n/a
    
    
     
n/achr8 55,894,667ENSG00000254325 (from geneSymbol)
21CUBNP1n/a
    
    
     
n/achr10 42,704,473cubilin pseudogene 1 (from HGNC CUBNP1)
22GPC5-AS2n/a
    
    
     
n/achr13 92,359,665GPC5 antisense RNA 2 (from HGNC GPC5-AS2)
23ENSG00000236504n/a
    
    
     
n/achr17 20,664,543ENSG00000236504 (from geneSymbol)
24ENSG00000238224n/a
    
    
     
n/achr1 245,614,959ENSG00000238224 (from geneSymbol)
25MTND3P13n/a
    
    
     
n/achr16 10,723,595mitochondrially encoded NADH:ubiquinone oxidoreductase core subunit 3 pseudogene 13 (from HGNC MTND3P13)
26ENSG00000270713n/a
    
    
     
n/achr14 38,973,742ENSG00000270713 (from geneSymbol)
27HMGN3P1n/a
    
    
     
n/achr1 152,399,673high mobility group nucleosomal binding domain 3 pseudogene 1 (from HGNC HMGN3P1)
28KRTAP20-2n/a
    
    
     
n/achr21 30,635,412keratin associated protein 20-2 (from RefSeq NM_181616.3)
29OR52A4Pn/a
n/a
n/a
n/a
n/achr11 5,121,099olfactory receptor family 52 subfamily A member 4 pseudogene (from HGNC OR52A4P)
30PPIAP89n/a
    
    
     
n/achrX 100,800,543peptidylprolyl isomerase A pseudogene 89 (from HGNC PPIAP89)
31LINC01205n/a
    
    
     
n/achr3 109,566,650long intergenic non-protein coding RNA 1205 (from HGNC LINC01205)
32ENSG00000229679n/a
    
    
     
n/achr7 36,230,193ENSG00000229679 (from geneSymbol)
33MTND2P6n/a
    
    
     
n/achr7 57,186,926mitochondrially encoded NADH:ubiquinone oxidoreductase core subunit 2 pseudogene 6 (from HGNC MTND2P6)
34RN7SL523Pn/a
n/a
n/a
n/a
n/achr14 100,319,221RNA, 7SL, cytoplasmic 523, pseudogene (from HGNC RN7SL523P)
35ENSG00000248744n/a
    
    
     
n/achr4 45,030,596ENSG00000248744 (from geneSymbol)
36ENSG00000258214n/a
    
    
     
n/achr12 59,388,694ENSG00000258214 (from geneSymbol)
37ENSG00000258273n/a
    
    
     
n/achr12 48,333,828ENSG00000258273 (from geneSymbol)
38ENSG00000270688n/a
    
    
     
n/achr9 86,228,899ENSG00000270688 (from geneSymbol)
39PPP1R14BP4n/a
    
    
     
n/achr7 35,971,357protein phosphatase 1 regulatory inhibitor subunit 14B pseudogene 4 (from HGNC PPP1R14BP4)
40ENSG00000290651n/a
n/a
n/a
n/a
n/achr11 5,122,834ENSG00000290651 (from geneSymbol)
41TRIM49Cn/a
n/a
n/a
n/a
n/achr11 90,036,565tripartite motif containing 49C (from RefSeq NM_001195234.1)
42RPL21P107n/a
    
    
     
n/achr13 110,762,903ribosomal protein L21 pseudogene 107 (from HGNC RPL21P107)
43IL9RP1n/a
    
    
     
n/achr9 138,140,479interleukin 9 receptor pseudogene 1 (from HGNC IL9RP1)
44ENSG00000231357n/a
    
    
     
n/achr7 2,835,821ENSG00000231357 (from geneSymbol)
45RPL5P2n/a
    
    
     
n/achr20 45,491,244ribosomal protein L5 pseudogene 2 (from HGNC RPL5P2)
46MTCO1P18n/a
    
    
     
n/achr2 131,383,352mitochondrially encoded cytochrome c oxidase I pseudogene 18 (from HGNC MTCO1P18)
47RPL27P12n/a
    
    
     
n/achr12 123,721,442ribosomal protein L27 pseudogene 12 (from HGNC RPL27P12)
48RPS29P1n/a
    
    
     
n/achr14 69,023,229ribosomal protein S29 pseudogene 1 (from HGNC RPS29P1)
49ENSG00000255011n/a
    
    
     
n/achr11 90,072,095ENSG00000255011 (from geneSymbol)
50ENSG00000264149n/a
    
    
     
n/achr18 21,882,721ENSG00000264149 (from geneSymbol)