UCSC Human Gene Sorter
 
genome assembly search
sort by display output 
#
Name
VisiGene
BLASTP
E-Value
Genome Position
Description
1TRBV7-3n/a
n/a
n/a
n/a
1e-56chr7_KI270803v1_alt 368,178T cell receptor beta variable 7-3 (from HGNC TRBV7-3)
2TRBV5-6n/a
n/a
n/a
n/a
0.000000000000002chr7_KI270803v1_alt 483,878V region of the variable domain of T cell receptor (TR) beta  chain that participates in the antigen recognition (PubMed:24600447).  Alpha-beta T cell receptors are antigen specific receptors which are  essential to the immune response and are present on the cell surface of  T lymphocytes. Recognize peptide-major histocompatibility (MH) (pMH)  complexes that are displayed by antigen presenting cells (APC), a  prerequisite for efficient T cell adaptive immunity against pathogens  (PubMed:25493333). Binding of alpha-beta TR to pMH complex initiates  TR-CD3 clustering on the cell surface and intracellular activation of  LCK that phosphorylates the ITAM motifs of CD3G, CD3D, CD3E and CD247  enabling the recruitment of ZAP70. In turn ZAP70 phosphorylates LAT,  which recruits numerous signaling molecules to form the LAT  signalosome. The LAT signalosome propagates signal branching to three  major signaling pathways, the calcium, the mitogen-activated protein  kinase (MAPK) kinase and the nuclear factor NF-kappa-B (NF-kB)  pathways, leading to the mobilization of transcription factors that are  critical for gene expression and essential for T cell growth and  differentiation (PubMed:23524462). The T cell repertoire is generated  in the thymus, by V-(D)-J rearrangement. This repertoire is then shaped  by intrathymic selection events to generate a peripheral T cell pool of  self-MH restricted, non-autoaggressive T cells. Post-thymic interaction  of alpha-beta TR with the pMH complexes shapes TR structural and  functional avidity (PubMed:15040585). (from UniProt A0A599)
3ENSG00000267670n/a
    
    
     
n/achr19 14,031,206ENSG00000267670 (from geneSymbol)
4ENSG00000272396n/a
    
    
     
n/achr19 43,364,827ENSG00000272396 (from geneSymbol)
5TCL1Bn/a
n/a
n/a
n/a
n/achr14 95,689,527TCL1 family AKT coactivator B (from RefSeq NM_004918.4)
6ENSG00000259084n/a
n/a
n/a
n/a
n/achr14 95,677,942ENSG00000259084 (from geneSymbol)
7LINC01888n/a
    
    
     
n/achr2 68,834,876long intergenic non-protein coding RNA 1888 (from HGNC LINC01888)
8ENSG00000244086n/a
    
    
     
n/achr17 38,855,492ENSG00000244086 (from geneSymbol)
9PTCHD3P3n/a
    
    
     
n/achr6 109,289,537patched domain containing 3 pseudogene 3 (from HGNC PTCHD3P3)
10LINC01777n/a
n/a
n/a
n/a
n/achr1 4,418,369long intergenic non-protein coding RNA 1777 (from RefSeq NR_027088.1)
11NRBF2P2n/a
    
    
     
n/achr3 46,023,726nuclear receptor binding factor 2 pseudogene 2 (from HGNC NRBF2P2)
12ENSG00000228714n/a
    
    
     
n/achr9 115,676,045ENSG00000228714 (from geneSymbol)
13GRM8-AS1n/a
n/a
n/a
n/a
n/achr7 127,222,524GRM8 antisense RNA 1, transcript variant 1 (from RefSeq NR_110194.1)
14ENSG00000249782n/a
    
    
     
n/achr5 8,543,053uncharacterized LOC105374647, transcript variant 1 (from RefSeq NR_188263.1)
15ENSG00000262633n/a
n/a
n/a
n/a
n/achr17 46,985,143Involved in transport of proteins from the cis/medial-Golgi  to the trans-Golgi network. (from UniProt E7EQ34)
16LRRC37A17Pn/a
n/a
n/a
n/a
n/achr17 47,035,881leucine rich repeat containing 37 member A17, pseudogene (from HGNC LRRC37A17P)
17MS4A13n/a
n/a
n/a
n/a
n/achr11 60,529,056membrane spanning 4-domains A13, transcript variant 1 (from RefSeq NM_001012417.3)
18ENSG00000249642n/a
    
    
     
n/achr4 187,663,029ENSG00000249642 (from geneSymbol)
19LINC02052n/a
n/a
n/a
n/a
n/achr3 186,474,326long intergenic non-protein coding RNA 2052 (from RefSeq NR_033844.1)
20TRBV4-2n/a
    
    
     
0.0000000003chr7 142,345,703V region of the variable domain of T cell receptor (TR) beta  chain that participates in the antigen recognition (PubMed:24600447).  Alpha-beta T cell receptors are antigen specific receptors which are  essential to the immune response and are present on the cell surface of  T lymphocytes. Recognize peptide-major histocompatibility (MH) (pMH)  complexes that are displayed by antigen presenting cells (APC), a  prerequisite for efficient T cell adaptive immunity against pathogens  (PubMed:25493333). Binding of alpha-beta TR to pMH complex initiates  TR-CD3 clustering on the cell surface and intracellular activation of  LCK that phosphorylates the ITAM motifs of CD3G, CD3D, CD3E and CD247  enabling the recruitment of ZAP70. In turn ZAP70 phosphorylates LAT,  which recruits numerous signaling molecules to form the LAT  signalosome. The LAT signalosome propagates signal branching to three  major signaling pathways, the calcium, the mitogen-activated protein  kinase (MAPK) kinase and the nuclear factor NF-kappa-B (NF-kB)  pathways, leading to the mobilization of transcription factors that are  critical for gene expression and essential for T cell growth and  differentiation (PubMed:23524462). The T cell repertoire is generated  in the thymus, by V-(D)-J rearrangement. This repertoire is then shaped  by intrathymic selection events to generate a peripheral T cell pool of  self-MH restricted, non-autoaggressive T cells. Post-thymic interaction  of alpha-beta TR with the pMH complexes shapes TR structural and  functional avidity (PubMed:15040585). (from UniProt A0A539)
21LINC01365n/a
n/a
n/a
n/a
n/achr4 119,801,798long intergenic non-protein coding RNA 1365 (from HGNC LINC01365)
22RNU1-64Pn/a
    
    
     
n/achr6 11,503,590RNA, U1 small nuclear 64, pseudogene (from HGNC RNU1-64P)
23FKBP6P1n/a
    
    
     
n/achr7 72,970,770FKBP6P1 (from geneSymbol)
24TRAV8-4n/a
    
    
     
n/achr14 21,894,731V region of the variable domain of T cell receptor (TR) alpha  chain that participates in the antigen recognition (PubMed:24600447).  Alpha-beta T cell receptors are antigen specific receptors which are  essential to the immune response and are present on the cell surface of  T lymphocytes. Recognize peptide-major histocompatibility (MH) (pMH)  complexes that are displayed by antigen presenting cells (APC), a  prerequisite for efficient T cell adaptive immunity against pathogens  (PubMed:25493333). Binding of alpha-beta TR to pMH complex initiates  TR-CD3 clustering on the cell surface and intracellular activation of  LCK that phosphorylates the ITAM motifs of CD3G, CD3D, CD3E and CD247  enabling the recruitment of ZAP70. In turn ZAP70 phosphorylates LAT,  which recruits numerous signaling molecules to form the LAT  signalosome. The LAT signalosome propagates signal branching to three  major signaling pathways, the calcium, the mitogen-activated protein  kinase (MAPK) kinase and the nuclear factor-kappa-B (NF-kB) pathways,  leading to the mobilization of transcription factors that are critical  for gene expression and essential for T cell growth and differentiation  (PubMed:23524462). The T cell repertoire is generated in the thymus, by  V-(D)-J rearrangement. This repertoire is then shaped by intrathymic  selection events to generate a peripheral T cell pool of self-MH  restricted, non-autoaggressive T cells. Post-thymic interaction of  alpha-beta TR with the pMH complexes shapes TR structural and  functional avidity (PubMed:15040585). (from UniProt P01737)
25ZFP42n/a
n/a
n/a
n/a
n/achr4 188,000,408ZFP42 zinc finger protein, transcript variant 1 (from RefSeq NM_174900.5)
26ENSG00000228123n/a
    
    
     
n/achr9 82,432,397ENSG00000228123 (from geneSymbol)
27LINC01241n/a
n/a
n/a
n/a
n/achr9 25,798,272long intergenic non-protein coding RNA 1241 (from HGNC LINC01241)
28ENSG00000269826n/a
    
    
     
n/achr16 86,348,499ENSG00000269826 (from geneSymbol)
29LINC02647n/a
    
    
     
n/achr10 85,405,601LINC02647 (from geneSymbol)
30FAM230Dn/a
    
    
     
n/achr22 18,191,976family with sequence similarity 230 member D (from RefSeq NR_136570.2)
31LINC00838n/a
    
    
     
n/achr10 33,766,184long intergenic non-protein coding RNA 838 (from HGNC LINC00838)
32LINC00904n/a
    
    
     
n/achr19 34,898,361long intergenic non-protein coding RNA 904 (from HGNC LINC00904)
33ENSG00000249084n/a
    
    
     
n/achr4 177,350,018ENSG00000249084 (from geneSymbol)
34ENSG00000228021n/a
n/a
n/a
n/a
n/achr10 125,696,460uncharacterized LOC283038 (from RefSeq NR_033848.1)
35TSPY7Pn/a
    
    
     
n/achrY 9,379,496testis specific protein, Y-linked 7, pseudogene (from HGNC TSPY7P)
36TPTE2P7n/a
    
    
     
n/achr3 97,481,341TPTE2P7 (from geneSymbol)
37RHBDF1P1n/a
    
    
     
n/achr3 14,573,822RHBDF1 pseudogene 1 (from HGNC RHBDF1P1)
38LINC01192n/a
n/a
n/a
n/a
n/achr3 163,207,208long intergenic non-protein coding RNA 1192 (from HGNC LINC01192)
39LINC00378n/a
n/a
n/a
n/a
n/achr13 60,897,891long intergenic non-protein coding RNA 378 (from HGNC LINC00378)
40POM121L14Pn/a
    
    
     
n/achr6 57,938,236POM121 transmembrane nucleoporin like 14, pseudogene (from HGNC POM121L14P)
41OR6F1n/a
    
    
     
n/achr1 247,714,041olfactory receptor family 6 subfamily F member 1 (from RefSeq NM_001005286.2)
42ENSG00000239395n/a
    
    
     
n/achr1 247,717,788ENSG00000239395 (from geneSymbol)
43ENSG00000254236n/a
    
    
     
n/achr8 103,020,807ENSG00000254236 (from geneSymbol)
44ENSG00000260835n/a
    
    
     
n/achr16 6,575,563ENSG00000260835 (from geneSymbol)
45FAM32DPn/a
    
    
     
n/achr18 67,708,087family with sequence similarity 32 member D, pseudogene (from HGNC FAM32DP)
46ENSG00000257746n/a
    
    
     
n/achr12 93,099,547uncharacterized LOC105369908, transcript variant 4 (from RefSeq NR_188219.1)
47ENSG00000293375n/a
n/a
n/a
n/a
n/achr8 39,551,555ENSG00000293375 (from geneSymbol)
48LINC01673n/a
    
    
     
n/achr21 27,656,831long intergenic non-protein coding RNA 1673, transcript variant 3 (from RefSeq NR_183538.1)
49ENSG00000250674n/a
    
    
     
n/achr5 179,455,755ENSG00000250674 (from geneSymbol)
50ENSG00000241577n/a
    
    
     
n/achr10 48,909,584ENSG00000241577 (from geneSymbol)