UCSC Human Gene Sorter
 
genome assembly search
sort by display output 
#
Name
VisiGene
BLASTP
E-Value
Genome Position
Description
1IGHV4-80n/a
n/a
n/a
n/a
n/achr14 106,872,984immunoglobulin heavy variable 4-80 (pseudogene) (from HGNC IGHV4-80)
2ENSG00000258021n/a
    
    
     
n/achr12 51,900,950ENSG00000258021 (from geneSymbol)
3UGT1A13Pn/a
    
    
     
n/achr2 233,648,476UDP glucuronosyltransferase family 1 member A13, pseudogene (from HGNC UGT1A13P)
4RNU2-33Pn/a
    
    
     
n/achr14 96,384,719RNA, U2 small nuclear 33, pseudogene (from HGNC RNU2-33P)
5IGHV3-79n/a
n/a
n/a
n/a
n/achr14 106,867,876immunoglobulin heavy variable 3-79 (pseudogene) (from HGNC IGHV3-79)
6HTR3E-AS1n/a
    
    
     
n/achr3 184,100,148HTR3E antisense RNA 1 (from RefSeq NR_133658.1)
7RPL32P33n/a
    
    
     
n/achr17 72,627,427ribosomal protein L32 pseudogene 33 (from HGNC RPL32P33)
8CTNNA1P1n/a
    
    
     
n/achr5 115,391,006catenin alpha 1 pseudogene 1 (from HGNC CTNNA1P1)
9RPS18P8n/a
    
    
     
n/achr6 4,979,283ribosomal protein S18 pseudogene 8 (from HGNC RPS18P8)
10ENSG00000251691n/a
    
    
     
n/achr4 69,306,821ENSG00000251691 (from geneSymbol)
11BUB1P1n/a
    
    
     
n/achr10 127,868,184BUB1 mitotic checkpoint serine/threonine kinase pseudogene 1 (from HGNC BUB1P1)
12AKIRIN1P1n/a
    
    
     
n/achr12 80,561,288akirin 1 pseudogene 1 (from HGNC AKIRIN1P1)
13ENSG00000226991n/a
    
    
     
n/achr2 110,358,958ENSG00000226991 (from geneSymbol)
14ENSG00000282610n/a
n/a
n/a
n/a
n/achr7_KI270803v1_alt 511,206V region of the variable domain of T cell receptor (TR) beta  chain that participates in the antigen recognition (PubMed:24600447).  Alpha-beta T cell receptors are antigen specific receptors which are  essential to the immune response and are present on the cell surface of  T lymphocytes. Recognize peptide-major histocompatibility (MH) (pMH)  complexes that are displayed by antigen presenting cells (APC), a  prerequisite for efficient T cell adaptive immunity against pathogens  (PubMed:25493333). Binding of alpha-beta TR to pMH complex initiates  TR-CD3 clustering on the cell surface and intracellular activation of  LCK that phosphorylates the ITAM motifs of CD3G, CD3D, CD3E and CD247  enabling the recruitment of ZAP70. In turn ZAP70 phosphorylates LAT,  which recruits numerous signaling molecules to form the LAT  signalosome. The LAT signalosome propagates signal branching to three  major signaling pathways, the calcium, the mitogen-activated protein  kinase (MAPK) kinase and the nuclear factor NF-kappa-B (NF-kB)  pathways, leading to the mobilization of transcription factors that are  critical for gene expression and essential for T cell growth and  differentiation (PubMed:23524462). The T cell repertoire is generated  in the thymus, by V-(D)-J rearrangement. This repertoire is then shaped  by intrathymic selection events to generate a peripheral T cell pool of  self-MH restricted, non-autoaggressive T cells. Post-thymic interaction  of alpha-beta TR with the pMH complexes shapes TR structural and  functional avidity (PubMed:15040585). (from UniProt A0A0J9YX75)
15APOOP2n/a
    
    
     
n/achr3 87,595,107apolipoprotein O pseudogene 2 (from HGNC APOOP2)
16ENSG00000268209n/a
    
    
     
n/achr4 69,387,943ENSG00000268209 (from geneSymbol)
17RN7SL246Pn/a
n/a
n/a
n/a
n/achr12 45,874,182RNA, 7SL, cytoplasmic 246, pseudogene (from HGNC RN7SL246P)
18RPS3AP46n/a
    
    
     
n/achr14 53,613,064ribosomal protein S3a pseudogene 46 (from HGNC RPS3AP46)
19ENSG00000240995n/a
    
    
     
n/achr17 49,148,725ENSG00000240995 (from geneSymbol)
20RPL9P28n/a
    
    
     
n/achr17 48,691,405ribosomal protein L9 pseudogene 28 (from HGNC RPL9P28)
21BRWD1P3n/a
    
    
     
n/achr7 17,033,283bromodomain and WD repeat domain containing 1 pseudogene 3 (from HGNC BRWD1P3)
22RN7SL865Pn/a
n/a
n/a
n/a
n/achr12 115,717,869RNA, 7SL, cytoplasmic 865, pseudogene (from HGNC RN7SL865P)
23TAS2R38n/a
    
    
     
n/achr7 141,973,202taste 2 receptor member 38 (from RefSeq NM_176817.5)
24ENSG00000261627n/a
    
    
     
n/achr18 6,642,224ENSG00000261627 (from geneSymbol)
25RN7SL385Pn/a
n/a
n/a
n/a
n/achr22 37,669,601RNA, 7SL, cytoplasmic 385, pseudogene (from HGNC RN7SL385P)
26RPS4XP8n/a
    
    
     
n/achr6 154,576,694ribosomal protein S4X pseudogene 8 (from HGNC RPS4XP8)
27ENSG00000228289n/a
    
    
     
n/achr1 163,769,515ENSG00000228289 (from geneSymbol)
28ENSG00000228776n/a
    
    
     
n/achr1 42,141,013ENSG00000228776 (from geneSymbol)
29RN7SKP249n/a
    
    
     
n/achr8 101,138,136RNA, 7SK small nuclear pseudogene 249 (from HGNC RN7SKP249)
30GMFBP1n/a
    
    
     
n/achr3 100,665,263glia maturation factor beta pseudogene 1 (from HGNC GMFBP1)
31SPINT4n/a
    
    
     
n/achr20 45,724,088serine peptidase inhibitor, Kunitz type 4 (from RefSeq NM_178455.3)
32ENSG00000251858n/a
    
    
     
n/achr14 41,594,527ENSG00000251858 (from geneSymbol)
33OR1L1n/a
    
    
     
n/achr9 122,662,182olfactory receptor family 1 subfamily L member 1 (from RefSeq NM_001005236.3)
34ENSG00000229960n/a
    
    
     
n/achr1 244,080,923ENSG00000229960 (from geneSymbol)
35ENSG00000261765n/a
    
    
     
n/achr16 71,881,913ENSG00000261765 (from geneSymbol)
36ENSG00000225678n/a
    
    
     
n/achr11 102,753,006ENSG00000225678 (from geneSymbol)
37ENSG00000290773n/a
    
    
     
n/achr11 102,752,787ENSG00000290773 (from geneSymbol)
38PFN1P9n/a
    
    
     
n/achr1 119,853,532profilin 1 pseudogene 9 (from HGNC PFN1P9)
39ENSG00000256843n/a
    
    
     
n/achr12 31,748,170ENSG00000256843 (from geneSymbol)
40ENSG00000248358n/a
    
    
     
n/achr14 21,715,528ENSG00000248358 (from geneSymbol)
41Y_RNAn/a
    
    
     
n/achr1 111,446,853Y_RNA (from geneSymbol)
42KRT8P10n/a
    
    
     
n/achr2 183,071,763keratin 8 pseudogene 10 (from HGNC KRT8P10)
43DEFA11Pn/a
    
    
     
n/achr8 7,029,065defensin alpha 11, pseudogene (from RefSeq NR_073421.2)
44ENSG00000260600n/a
    
    
     
n/achr16 61,692,753ENSG00000260600 (from geneSymbol)
45TJAP1P1n/a
    
    
     
n/achrX 129,042,359TJAP1P1 (from geneSymbol)
46RPS16P2n/a
    
    
     
n/achr2 20,155,837ribosomal protein S16 pseudogene 2 (from HGNC RPS16P2)
47ENSG00000225286n/a
    
    
     
n/achr7 28,615,492ENSG00000225286 (from geneSymbol)
48PHB1P8n/a
    
    
     
n/achr3 119,792,191PHB1P8 (from geneSymbol)
49ENSG00000268931n/a
    
    
     
n/achr19 8,425,591ENSG00000268931 (from geneSymbol)
50ENSG00000232337n/a
    
    
     
n/achr2 161,049,576ENSG00000232337 (from geneSymbol)