UCSC Human Gene Sorter
 
genome assembly search
sort by display output 
#
Name
VisiGene
BLASTP
E-Value
Genome Position
Description
1GYPAn/a
n/a
n/a
n/a
1e-70chr4 144,125,010glycophorin A (MNS blood group), transcript variant 1 (from RefSeq NM_002099.8)
2ENSG00000285783n/a
n/a
n/a
n/a
n/achr4 144,490,996ENSG00000285783 (from geneSymbol)
3DEFA8Pn/a
    
    
     
n/achr8 6,951,162defensin alpha 8, pseudogene (from RefSeq NR_073407.1)
4NLRP9P1n/a
    
    
     
n/achr12 129,014,999NLR family pyrin domain containing 9 pseudogene 1 (from HGNC NLRP9P1)
5FLT1P1n/a
    
    
     
n/achr3 46,143,017fms related tyrosine kinase 1 pseudogene 1 (from HGNC FLT1P1)
6KIR2DP1n/a
    
    
     
n/achr19 54,761,197killer cell immunoglobulin like receptor, two Ig domains pseudogene 1 (from HGNC KIR2DP1)
7CABP5n/a
    
    
     
n/achr19 48,036,731calcium binding protein 5 (from RefSeq NM_019855.5)
8RNU6-917Pn/a
    
    
     
n/achr20 1,529,107RNA, U6 small nuclear 917, pseudogene (from HGNC RNU6-917P)
9ENSG00000232208n/a
    
    
     
n/achr1 8,907,568ENSG00000232208 (from geneSymbol)
10ENSG00000261245n/a
    
    
     
n/achr16 31,361,486ENSG00000261245 (from geneSymbol)
11RNU6-1005Pn/a
    
    
     
n/achr16 21,642,107RNA, U6 small nuclear 1005, pseudogene (from HGNC RNU6-1005P)
12CSF2RBP1n/a
    
    
     
n/achr22 36,952,126colony stimulating factor 2 receptor beta common subunit pseudogene 1 (from HGNC CSF2RBP1)
13RPL30P7n/a
    
    
     
n/achr5 10,488,981ribosomal protein L30 pseudogene 7 (from HGNC RPL30P7)
14AK3P6n/a
    
    
     
n/achr12 128,944,738adenylate kinase 3 pseudogene 6 (from HGNC AK3P6)
15MPHOSPH10P1n/a
    
    
     
n/achr16 53,369,032MPHOSPH10P1 (from geneSymbol)
16TRBV5-5n/a
n/a
n/a
n/a
n/achr7_KI270803v1_alt 466,379T cell receptor beta variable 5-5 (from HGNC TRBV5-5)
17VN1R90Pn/a
    
    
     
n/achr19 23,288,982vomeronasal 1 receptor 90 pseudogene (from HGNC VN1R90P)
18HNRNPA1P52n/a
    
    
     
n/achr19 41,830,315heterogeneous nuclear ribonucleoprotein A1 pseudogene 52 (from HGNC HNRNPA1P52)
19PSME2P5n/a
    
    
     
n/achr8 26,548,066proteasome activator subunit 2 pseudogene 5 (from HGNC PSME2P5)
20SCARNA20n/a
    
    
     
n/achr17 60,231,581small Cajal body-specific RNA 20 (from RefSeq NR_002999.2)
21TRDV2n/a
    
    
     
n/achr14 22,422,706V region of the variable domain of T cell receptor (TR) delta  chain that participates in the antigen recognition (PubMed:24600447).  Gamma-delta TRs recognize a variety of self and foreign non-peptide  antigens frequently expressed at the epithelial boundaries between the  host and external environment, including endogenous lipids presented by  MH-like protein CD1D and phosphoantigens presented by butyrophilin-like  molecule BTN3A1. Upon antigen recognition induces rapid, innate-like  immune responses involved in pathogen clearance and tissue repair  (PubMed:28920588, PubMed:23348415). Binding of gamma-delta TR complex  to antigen triggers phosphorylation of immunoreceptor tyrosine-based  activation motifs (ITAMs) in the CD3 chains by the LCK and FYN kinases,  allowing the recruitment, phosphorylation, and activation of ZAP70 that  facilitates phosphorylation of the scaffolding proteins LCP2 and LAT.  This lead to the formation of a supramolecular signalosome that  recruits the phospholipase PLCG1, resulting in calcium mobilization and  ERK activation, ultimately leading to T cell expansion and  differentiation into effector cells (PubMed:25674089). Gamma-delta TRs  are produced through somatic rearrangement of a limited repertoire of  variable (V), diversity (D), and joining (J) genes. The potential  diversity of gamma-delta TRs is conferred by the unique ability to  rearrange (D) genes in tandem and to utilize all three reading frames.  The combinatorial diversity is considerably increased by the sequence  exonuclease trimming and random nucleotide (N) region additions which  occur during the V-(D)-J rearrangements (PubMed:24387714). (from UniProt A0JD36)
22ANP32CPn/a
    
    
     
n/achr4 164,197,359ANP32CP (from geneSymbol)
23ENSG00000267630n/a
    
    
     
n/achr19 27,924,156ENSG00000267630 (from geneSymbol)
24ENSG00000225402n/a
    
    
     
n/achr2 37,817,438ENSG00000225402 (from geneSymbol)
25OPCML-IT1n/a
    
    
     
n/achr11 133,363,054OPCML intronic transcript 1 (from RefSeq NR_046790.1)
26ENSG00000288177n/a
    
    
     
n/achr11 49,868,258ENSG00000288177 (from geneSymbol)
27TRAV26-2n/a
    
    
     
n/achr14 22,202,975V region of the variable domain of T cell receptor (TR) alpha  chain that participates in the antigen recognition (PubMed:24600447).  Alpha-beta T cell receptors are antigen specific receptors which are  essential to the immune response and are present on the cell surface of  T lymphocytes. Recognize peptide-major histocompatibility (MH) (pMH)  complexes that are displayed by antigen presenting cells (APC), a  prerequisite for efficient T cell adaptive immunity against pathogens  (PubMed:25493333). Binding of alpha-beta TR to pMH complex initiates  TR-CD3 clustering on the cell surface and intracellular activation of  LCK that phosphorylates the ITAM motifs of CD3G, CD3D, CD3E and CD247  enabling the recruitment of ZAP70. In turn ZAP70 phosphorylates LAT,  which recruits numerous signaling molecules to form the LAT  signalosome. The LAT signalosome propagates signal branching to three  major signaling pathways, the calcium, the mitogen-activated protein  kinase (MAPK) kinase and the nuclear factor NF-kappa-B (NF-kB)  pathways, leading to the mobilization of transcription factors that are  critical for gene expression and essential for T cell growth and  differentiation (PubMed:23524462). The T cell repertoire is generated  in the thymus, by V-(D)-J rearrangement. This repertoire is then shaped  by intrathymic selection events to generate a peripheral T cell pool of  self-MH restricted, non-autoaggressive T cells. Post-thymic interaction  of alpha-beta TR with the pMH complexes shapes TR structural and  functional avidity (PubMed:15040585). (from UniProt A0A0B4J265)
28ENSG00000251557n/a
    
    
     
n/achr11 43,262,767ENSG00000251557 (from geneSymbol)
29ENSG00000260385n/a
    
    
     
n/achr13 112,084,510ENSG00000260385 (from geneSymbol)
30CD300LDn/a
    
    
     
n/achr17 74,585,824CD300 molecule like family member d (from RefSeq NM_001115152.2)
31ENSG00000226012n/a
    
    
     
n/achr21 38,237,709ENSG00000226012 (from geneSymbol)
32ENSG00000179253n/a
    
    
     
n/achr20 61,718,627uncharacterized LOC100128310 (from RefSeq NR_147702.1)
33MTCO3P5n/a
    
    
     
n/achr2 143,099,415mitochondrially encoded cytochrome c oxidase III pseudogene 5 (from HGNC MTCO3P5)
34TREML5Pn/a
    
    
     
n/achr6 41,248,509triggering receptor expressed on myeloid cells like 5, pseudogene (from HGNC TREML5P)
35ENSG00000254800n/a
    
    
     
n/achr11 49,883,546ENSG00000254800 (from geneSymbol)
36ENSG00000200235n/a
    
    
     
n/achr5 140,579,729ENSG00000200235 (from geneSymbol)
37ENSG00000271522n/a
    
    
     
n/achr7 130,790,966ENSG00000271522 (from geneSymbol)
38ENSG00000275390n/a
n/a
n/a
n/a
n/achr9 40,787,107ENSG00000275390 (from geneSymbol)
39ENSG00000238150n/a
    
    
     
n/achr19 53,775,740ENSG00000238150 (from geneSymbol)
40TRAV38-1n/a
    
    
     
n/achr14 22,272,265V region of the variable domain of T cell receptor (TR) alpha  chain that participates in the antigen recognition (PubMed:24600447).  Alpha-beta T cell receptors are antigen specific receptors which are  essential to the immune response and are present on the cell surface of  T lymphocytes. Recognize peptide-major histocompatibility (MH) (pMH)  complexes that are displayed by antigen presenting cells (APC), a  prerequisite for efficient T cell adaptive immunity against pathogens  (PubMed:25493333). Binding of alpha-beta TR to pMH complex initiates  TR-CD3 clustering on the cell surface and intracellular activation of  LCK that phosphorylates the ITAM motifs of CD3G, CD3D, CD3E and CD247  enabling the recruitment of ZAP70. In turn ZAP70 phosphorylates LAT,  which recruits numerous signaling molecules to form the LAT  signalosome. The LAT signalosome propagates signal branching to three  major signaling pathways, the calcium, the mitogen-activated protein  kinase (MAPK) kinase and the nuclear factor NF-kappa-B (NF-kB)  pathways, leading to the mobilization of transcription factors that are  critical for gene expression and essential for T cell growth and  differentiation (PubMed:23524462). The T cell repertoire is generated  in the thymus, by V-(D)-J rearrangement. This repertoire is then shaped  by intrathymic selection events to generate a peripheral T cell pool of  self-MH restricted, non-autoaggressive T cells. Post-thymic interaction  of alpha-beta TR with the pMH complexes shapes TR structural and  functional avidity (PubMed:15040585). (from UniProt A0A0B4J264)
41FOXD4L3n/a
n/a
n/a
n/a
n/achr9 68,303,975forkhead box D4 like 3 (from RefSeq NM_199135.4)
42RPL5P25n/a
    
    
     
n/achr10 13,058,289ribosomal protein L5 pseudogene 25 (from HGNC RPL5P25)
43ENSG00000250761n/a
    
    
     
n/achr5 7,728,784ENSG00000250761 (from geneSymbol)
44RN7SL798Pn/a
n/a
n/a
n/a
n/achr8 55,980,390RNA, 7SL, cytoplasmic 798, pseudogene (from HGNC RN7SL798P)
45GOLGA5P1n/a
    
    
     
n/achr5 39,169,772golgin A5 pseudogene 1 (from HGNC GOLGA5P1)
46TRBV11-1n/a
n/a
n/a
n/a
n/achr7_KI270803v1_alt 391,491V region of the variable domain of T cell receptor (TR) beta  chain that participates in the antigen recognition (PubMed:24600447).  Alpha-beta T cell receptors are antigen specific receptors which are  essential to the immune response and are present on the cell surface of  T lymphocytes. Recognize peptide-major histocompatibility (MH) (pMH)  complexes that are displayed by antigen presenting cells (APC), a  prerequisite for efficient T cell adaptive immunity against pathogens  (PubMed:25493333). Binding of alpha-beta TR to pMH complex initiates  TR-CD3 clustering on the cell surface and intracellular activation of  LCK that phosphorylates the ITAM motifs of CD3G, CD3D, CD3E and CD247  enabling the recruitment of ZAP70. In turn ZAP70 phosphorylates LAT,  which recruits numerous signaling molecules to form the LAT  signalosome. The LAT signalosome propagates signal branching to three  major signaling pathways, the calcium, the mitogen-activated protein  kinase (MAPK) kinase and the nuclear factor NF-kappa-B (NF-kB)  pathways, leading to the mobilization of transcription factors that are  critical for gene expression and essential for T cell growth and  differentiation (PubMed:23524462). The T cell repertoire is generated  in the thymus, by V-(D)-J rearrangement. This repertoire is then shaped  by intrathymic selection events to generate a peripheral T cell pool of  self-MH restricted, non-autoaggressive T cells. Post-thymic interaction  of alpha-beta TR with the pMH complexes shapes TR structural and  functional avidity (PubMed:15040585). (from UniProt A0A0K0K1C0)
47MTND5P32n/a
    
    
     
n/achr15 58,153,506mitochondrially encoded NADH:ubiquinone oxidoreductase core subunit 5 pseudogene 32 (from HGNC MTND5P32)
48ENSG00000245008n/a
    
    
     
n/achr11 128,650,390ENSG00000245008 (from geneSymbol)
49TRIM51FPn/a
    
    
     
n/achr11 49,836,230tripartite motif-containing 51F, pseudogene (from HGNC TRIM51FP)
50ENSG00000225840n/a
n/a
n/a
n/a
n/achrY 10,198,179ENSG00000225840 (from geneSymbol)