UCSC Human Gene Sorter
 
genome assembly search
sort by display output 
#
Name
VisiGene
BLASTP
E-Value
Genome Position
Description
1P2RX2n/a
n/a
n/a
n/a
0chr12 132,620,582purinergic receptor P2X 2, transcript variant 1 (from RefSeq NM_170682.4)
2RPL7P16n/a
    
    
     
n/achr3 132,243,896ribosomal protein L7 pseudogene 16 (from HGNC RPL7P16)
3TGM4n/a
n/a
n/a
n/a
n/achr3 44,894,799transglutaminase 4 (from RefSeq NM_003241.4)
4FOXF2-DTn/a
    
    
     
n/achr6 1,384,428FOXF2-DT (from geneSymbol)
5KLKP1n/a
n/a
n/a
n/a
n/achr19 50,888,067kallikrein pseudogene 1 (from HGNC KLKP1)
6KLKP1n/a
n/a
n/a
n/a
n/achr19 50,889,247kallikrein pseudogene 1 (from RefSeq NR_002948.1)
7CTLA4n/a
n/a
n/a
n/a
n/achr2 203,870,868cytotoxic T-lymphocyte associated protein 4, transcript variant 1 (from RefSeq NM_005214.5)
8TRGJ1n/a
    
    
     
n/achr7 38,269,515J region of the variable domain of T cell receptor (TR) gamma  chain that participates in the antigen recognition (PubMed:24600447).  Gamma-delta TRs recognize a variety of self and foreign non-peptide  antigens frequently expressed at the epithelial boundaries between the  host and external environment, including endogenous lipids presented by  MH-like protein CD1D and phosphoantigens presented by butyrophilin-like  molecule BTN3A1. Upon antigen recognition induces rapid, innate-like  immune responses involved in pathogen clearance and tissue repair  (PubMed:28920588, PubMed:23348415). Binding of gamma-delta TR complex  to antigen triggers phosphorylation of immunoreceptor tyrosine-based  activation motifs (ITAMs) in the CD3 chains by the LCK and FYN kinases,  allowing the recruitment, phosphorylation, and activation of ZAP70 that  facilitates phosphorylation of the scaffolding proteins LCP2 and LAT.  This lead to the formation of a supramolecular signalosome that  recruits the phospholipase PLCG1, resulting in calcium mobilization and  ERK activation, ultimately leading to T cell expansion and  differentiation into effector cells (PubMed:25674089). Gamma-delta TRs  are produced through somatic rearrangement of a limited repertoire of  variable (V), diversity (D), and joining (J) genes. The potential  diversity of gamma-delta TRs is conferred by the unique ability to  rearrange (D) genes in tandem and to utilize all three reading frames.  The combinatorial diversity is considerably increased by the sequence  exonuclease trimming and random nucleotide (N) region additions which  occur during the V-(D)-J rearrangements (PubMed:24387714). (from UniProt A0A075B6S0)
9ZDHHC20P1n/a
    
    
     
n/achr6 29,708,336zinc finger DHHC-type containing 20 pseudogene 1 (from HGNC ZDHHC20P1)
10HMGN2P46n/a
n/a
n/a
n/a
n/achr15 45,555,726high mobility group nucleosomal binding domain 2 pseudogene 46 (from HGNC HMGN2P46)
11ENSG00000293154n/a
n/a
n/a
n/a
n/achr15 45,533,933ENSG00000293154 (from geneSymbol)
12LINC00163n/a
    
    
     
n/achr21 44,991,975long intergenic non-protein coding RNA 163 (from RefSeq NR_033840.1)
13LINC00578n/a
n/a
n/a
n/a
n/achr3 177,604,653long intergenic non-protein coding RNA 578 (from HGNC LINC00578)
14ENSG00000259514n/a
    
    
     
n/achr15 76,340,836ENSG00000259514 (from geneSymbol)
15ENSG00000268777n/a
    
    
     
n/achr19 51,519,995ENSG00000268777 (from geneSymbol)
16ENSG00000267218n/a
    
    
     
n/achr19 15,902,769ENSG00000267218 (from geneSymbol)
17TIMM8AP1n/a
    
    
     
n/achr2 162,077,504translocase of inner mitochondrial membrane 8A pseudogene 1 (from HGNC TIMM8AP1)
18ENSG00000272264n/a
    
    
     
n/achr8 80,033,012ENSG00000272264 (from geneSymbol)
19SIGLEC6n/a
n/a
n/a
n/a
n/achr19 51,524,744sialic acid binding Ig like lectin 6, transcript variant 1 (from RefSeq NM_001245.7)
20CPA6n/a
n/a
n/a
n/a
n/achr8 67,584,199carboxypeptidase A6 (from RefSeq NM_020361.5)
21LINC01297n/a
n/a
n/a
n/a
n/achr14 19,366,401long intergenic non-protein coding RNA 1297 (from HGNC LINC01297)
22LINC02469n/a
    
    
     
n/achr4 79,680,299long intergenic non-protein coding RNA 2469 (from HGNC LINC02469)
23TRGV2n/a
    
    
     
n/achr7 38,363,191V region of the variable domain of T cell receptor (TR) gamma  chain that participates in the antigen recognition (PubMed:24600447).  Gamma-delta TRs recognize a variety of self and foreign non-peptide  antigens frequently expressed at the epithelial boundaries between the  host and external environment, including endogenous lipids presented by  MH-like protein CD1D and phosphoantigens presented by butyrophilin-like  molecule BTN3A1. Upon antigen recognition induces rapid, innate-like  immune responses involved in pathogen clearance and tissue repair  (PubMed:23348415, PubMed:28920588). Binding of gamma-delta TR complex  to antigen triggers phosphorylation of immunoreceptor tyrosine-based  activation motifs (ITAMs) in the CD3 chains by the LCK and FYN kinases,  allowing the recruitment, phosphorylation, and activation of ZAP70 that  facilitates phosphorylation of the scaffolding proteins LCP2 and LAT.  This lead to the formation of a supramolecular signalosome that  recruits the phospholipase PLCG1, resulting in calcium mobilization and  ERK activation, ultimately leading to T cell expansion and  differentiation into effector cells (PubMed:25674089). Gamma-delta TRs  are produced through somatic rearrangement of a limited repertoire of  variable (V), diversity (D), and joining (J) genes. The potential  diversity of gamma-delta TRs is conferred by the unique ability to  rearrange (D) genes in tandem and to utilize all three reading frames.  The combinatorial diversity is considerably increased by the sequence  exonuclease trimming and random nucleotide (N) region additions which  occur during the V-(D)-J rearrangements (PubMed:24387714). (from UniProt A0A075B6R0)
24MROH3Pn/a
n/a
n/a
n/a
n/achr1 200,941,998maestro heat like repeat family member 3, pseudogene (from HGNC MROH3P)
25ENSG00000293444n/a
n/a
n/a
n/a
n/achr1 200,944,679maestro heat like repeat family member 3, pseudogene (from RefSeq NR_147176.1)
26PTPRN2-AS1n/a
n/a
n/a
n/a
n/achr7 157,856,190PTPRN2 antisense RNA 1 (from RefSeq NR_038966.1)
27ENSG00000260996n/a
    
    
     
n/achr9 137,294,794ENSG00000260996 (from geneSymbol)
28RPLP0P2n/a
n/a
n/a
n/a
n/achr11 61,637,160ribosomal protein lateral stalk subunit P0 pseudogene 2 (from HGNC RPLP0P2)
29RPLP0P2n/a
n/a
n/a
n/a
n/achr11 61,627,242ribosomal protein lateral stalk subunit P0 pseudogene 2 (from RefSeq NR_002775.2)
30ENSG00000257989n/a
    
    
     
n/achr12 52,098,391ENSG00000257989 (from geneSymbol)
31ENSG00000242407n/a
    
    
     
n/achr17 48,733,489ENSG00000242407 (from geneSymbol)
32TLX2n/a
n/a
n/a
n/a
n/achr2 74,515,799T cell leukemia homeobox 2 (from RefSeq NM_016170.5)
33ENSG00000262488n/a
    
    
     
n/achr16 10,840,964ENSG00000262488 (from geneSymbol)
34FOXH1n/a
    
    
     
n/achr8 144,474,630forkhead box H1 (from RefSeq NM_003923.3)
35ENSG00000271926n/a
    
    
     
n/achr5 72,953,954ENSG00000271926 (from geneSymbol)
36CHRNA2n/a
n/a
n/a
n/a
n/achr8 27,469,508cholinergic receptor nicotinic alpha 2 subunit, transcript variant 1 (from RefSeq NM_000742.4)
37BCO1n/a
n/a
n/a
n/a
n/achr16 81,264,915beta-carotene oxygenase 1 (from RefSeq NM_017429.3)
38LINC00479n/a
n/a
n/a
n/a
n/achr21 41,713,647long intergenic non-protein coding RNA 479 (from RefSeq NR_027272.1)
39PDE6An/a
n/a
n/a
n/a
n/achr5 149,901,373phosphodiesterase 6A, transcript variant 1 (from RefSeq NM_000440.3)
40TRIM40n/a
n/a
n/a
n/a
n/achr6 30,142,434tripartite motif containing 40, transcript variant 1 (from RefSeq NM_001286633.2)
41ISL2n/a
n/a
n/a
n/a
n/achr15 76,339,624ISL LIM homeobox 2 (from RefSeq NM_145805.3)
42MAGEB17n/a
n/a
n/a
n/a
n/achrX 16,169,472MAGE family member B17 (from RefSeq NM_001277307.2)
43ENSG00000272347n/a
    
    
     
n/achr5 1,005,831ENSG00000272347 (from geneSymbol)
44ENSG00000217275n/a
    
    
     
n/achr6 26,202,405ENSG00000217275 (from geneSymbol)
45TMEM231P1n/a
    
    
     
n/achr16 75,502,535TMEM231P1 (from geneSymbol)
46KLRC4-KLRK1n/a
n/a
n/a
n/a
n/achr12 10,391,227Membrane ; Single-  pass type II membrane protein (from UniProt H3BQV0)
47FABP6-AS1n/a
    
    
     
n/achr5 160,200,708FABP6-AS1 (from geneSymbol)
48CYSLTR1n/a
n/a
n/a
n/a
n/achrX 78,299,539cysteinyl leukotriene receptor 1, transcript variant 3 (from RefSeq NM_006639.4)
49SCTn/a
    
    
     
n/achr11 626,745secretin (from RefSeq NM_021920.4)
50CTBP2P8n/a
    
    
     
n/achr1 68,162,425C-terminal binding protein 2 pseudogene 8 (from HGNC CTBP2P8)