UCSC Human Gene Sorter
 
genome assembly search
sort by display output 
#
Name
VisiGene
BLASTP
E-Value
Genome Position
Description
1CDRT15P3n/a
n/a
n/a
n/a
n/achr2 131,795,657CDRT15P3 (from geneSymbol)
2CDRT15P3n/a
n/a
n/a
n/a
n/achr2 131,798,311CDRT15 pseudogene 3 (from RefSeq NR_161366.1)
3ENSG00000267478n/a
    
    
     
n/achr18 12,092,407ENSG00000267478 (from geneSymbol)
4RPS20P1n/a
    
    
     
n/achr21 35,724,923ribosomal protein S20 pseudogene 1 (from HGNC RPS20P1)
5OR10G4n/a
    
    
     
n/achr11 124,015,864olfactory receptor family 10 subfamily G member 4 (from RefSeq NM_001004462.2)
6CFTR-AS1n/a
    
    
     
n/achr7 117,562,704CFTR antisense RNA 1 (from RefSeq NR_149084.1)
7RN7SKP259n/a
    
    
     
n/achr11 57,451,856RNA, 7SK small nuclear pseudogene 259 (from HGNC RN7SKP259)
8ENSG00000258665n/a
    
    
     
n/achr15 91,032,073ENSG00000258665 (from geneSymbol)
9MIX23P3n/a
    
    
     
n/achr18 12,211,592MIX23P3 (from geneSymbol)
10ATP5F1EP1n/a
    
    
     
n/achr4 105,532,552ATP synthase F1 subunit epsilon pseudogene 1 (from HGNC ATP5F1EP1)
11RNU2-70Pn/a
    
    
     
n/achr1 236,267,869RNA, U2 small nuclear 70, pseudogene (from HGNC RNU2-70P)
12RN7SL825Pn/a
n/a
n/a
n/a
n/achr10 31,992,234RNA, 7SL, cytoplasmic 825, pseudogene (from HGNC RN7SL825P)
13SPOPLP3n/a
    
    
     
n/achr4 68,884,162SPOPLP3 (from geneSymbol)
14MYLKP1n/a
    
    
     
n/achr3 75,333,810myosin light chain kinase pseudogene 1 (from HGNC MYLKP1)
15ENSG00000248613n/a
    
    
     
n/achr4 68,900,780ENSG00000248613 (from geneSymbol)
16OR8D4n/a
n/a
n/a
n/a
n/achr11 123,905,698olfactory receptor family 8 subfamily D member 4 (from RefSeq NM_001005197.2)
17IGHV3-35n/a
    
    
     
n/achr14 106,389,625Probable non-functional open reading frame (ORF) of V region  of the variable domain of immunoglobulin heavy chains  (PubMed:24600447). Non-functional ORF generally cannot participate in  the synthesis of a productive immunoglobulin chain due to altered V-  (D)-J or switch recombination and/or splicing site (at mRNA level)  and/or conserved amino acid change (protein level) (PubMed:9619395).  Immunoglobulins, also known as antibodies, are membrane-bound or  secreted glycoproteins produced by B lymphocytes. In the recognition  phase of humoral immunity, the membrane-bound immunoglobulins serve as  receptors which, upon binding of a specific antigen, trigger the clonal  expansion and differentiation of B lymphocytes into immunoglobulins-  secreting plasma cells. Secreted immunoglobulins mediate the effector  phase of humoral immunity, which results in the elimination of bound  antigens (PubMed:22158414, PubMed:20176268). The antigen binding site  is formed by the variable domain of one heavy chain, together with that  of its associated light chain. Thus, each immunoglobulin has two  antigen binding sites with remarkable affinity for a particular  antigen. The variable domains are assembled by a process called V-(D)-J  rearrangement and can then be subjected to somatic hypermutations  which, after exposure to antigen and selection, allow affinity  maturation for a particular antigen (PubMed:20176268, PubMed:17576170). (from UniProt A0A0C4DH35)
18TRBV12-1n/a
n/a
n/a
n/a
n/achr7_KI270803v1_alt 399,032T cell receptor beta variable 12-1 (pseudogene) (from HGNC TRBV12-1)
19ENSG00000255491n/a
n/a
n/a
n/a
n/achr8 124,829,669ENSG00000255491 (from geneSymbol)
20RN7SL411Pn/a
n/a
n/a
n/a
n/achr3 40,209,154RNA, 7SL, cytoplasmic 411, pseudogene (from HGNC RN7SL411P)
21PMM2P2n/a
    
    
     
n/achr18 12,192,568phosphomannomutase 2 pseudogene 2 (from HGNC PMM2P2)
22IGHV3-16n/a
    
    
     
n/achr14 106,165,467Probable non-functional open reading frame (ORF) of V region  of the variable domain of immunoglobulin heavy chains  (PubMed:24600447). Non-functional ORF generally cannot participate in  the synthesis of a productive immunoglobulin chain due to altered V-  (D)-J or switch recombination and/or splicing site (at mRNA level)  and/or conserved amino acid change (protein level) (PubMed:9619395).  Immunoglobulins, also known as antibodies, are membrane-bound or  secreted glycoproteins produced by B lymphocytes. In the recognition  phase of humoral immunity, the membrane-bound immunoglobulins serve as  receptors which, upon binding of a specific antigen, trigger the clonal  expansion and differentiation of B lymphocytes into immunoglobulins-  secreting plasma cells. Secreted immunoglobulins mediate the effector  phase of humoral immunity, which results in the elimination of bound  antigens (PubMed:22158414, PubMed:20176268). The antigen binding site  is formed by the variable domain of one heavy chain, together with that  of its associated light chain. Thus, each immunoglobulin has two  antigen binding sites with remarkable affinity for a particular  antigen. The variable domains are assembled by a process called V-(D)-J  rearrangement and can then be subjected to somatic hypermutations  which, after exposure to antigen and selection, allow affinity  maturation for a particular antigen (PubMed:20176268, PubMed:17576170). (from UniProt A0A0C4DH30)
23IGHV1-14n/a
    
    
     
n/achr14 106,146,011immunoglobulin heavy variable 1-14 (pseudogene) (from HGNC IGHV1-14)
24ENSG00000224523n/a
    
    
     
n/achrX 81,418,107ENSG00000224523 (from geneSymbol)
25PRELID3BP6n/a
    
    
     
n/achr5 42,917,699PRELI domain containing 3B pseudogene 6 (from HGNC PRELID3BP6)
26ENSG00000258115n/a
    
    
     
n/achr12 72,051,763ENSG00000258115 (from geneSymbol)
27IGHV3-52n/a
    
    
     
n/achr14 106,586,601immunoglobulin heavy variable 3-52 (pseudogene) (from HGNC IGHV3-52)
28SNX18P25n/a
    
    
     
n/achr4 49,589,150sorting nexin 18 pseudogene 25 (from HGNC SNX18P25)
29IGHVII-60-1n/a
    
    
     
n/achr14 106,637,845immunoglobulin heavy variable (II)-60-1 (pseudogene) (from HGNC IGHVII-60-1)
30RN7SL321Pn/a
n/a
n/a
n/a
n/achr3 48,379,983RNA, 7SL, cytoplasmic 321, pseudogene (from HGNC RN7SL321P)
31GZMAP1n/a
    
    
     
n/achr5 55,084,784granzyme A pseudogene 1 (from HGNC GZMAP1)
32ENSG00000255065n/a
    
    
     
n/achr11 106,310,918ENSG00000255065 (from geneSymbol)
33ENSG00000083622n/a
    
    
     
n/achr7 117,626,103ENSG00000083622 (from geneSymbol)
34ENSG00000251471n/a
    
    
     
n/achr3 139,848,557ENSG00000251471 (from geneSymbol)
35IGLV3-13n/a
    
    
     
n/achr22 22,762,405immunoglobulin lambda variable 3-13 (pseudogene) (from HGNC IGLV3-13)
36IGKV2D-23n/a
    
    
     
n/achr2 90,009,664immunoglobulin kappa variable 2D-23 (pseudogene) (from HGNC IGKV2D-23)
37RNU6-226Pn/a
    
    
     
n/achr5 175,703,951RNA, U6 small nuclear 226, pseudogene (from HGNC RNU6-226P)
38IGHV1-12n/a
    
    
     
n/achr14 106,122,564immunoglobulin heavy variable 1-12 (pseudogene) (from HGNC IGHV1-12)
39ENSG00000225741n/a
    
    
     
n/achr22 22,104,038ENSG00000225741 (from geneSymbol)
40PPIAP60n/a
n/a
n/a
n/a
n/achr2 11,351,872peptidylprolyl isomerase A pseudogene 60 (from HGNC PPIAP60)
41PIMREGP2n/a
    
    
     
n/achr4 105,526,996PIMREGP2 (from geneSymbol)
42RN7SL346Pn/a
n/a
n/a
n/a
n/achr15 90,166,379RNA, 7SL, cytoplasmic 346, pseudogene (from HGNC RN7SL346P)
43OR9G4n/a
    
    
     
n/achr11 56,744,960olfactory receptor family 9 subfamily G member 4, transcript variant 2 (from RefSeq NM_001390832.1)
44IGHV1-67n/a
    
    
     
n/achr14 106,680,822immunoglobulin heavy variable 1-67 (pseudogene) (from HGNC IGHV1-67)
45IGLVI-63n/a
    
    
     
n/achr22 22,080,016immunoglobulin lambda variable (I)-63 (pseudogene) (from HGNC IGLVI-63)
46LGALS9DPn/a
    
    
     
n/achr17 27,750,543galectin 9D, pseudogene (from HGNC LGALS9DP)
47ENSG00000228391n/a
    
    
     
n/achr2 2,870,894ENSG00000228391 (from geneSymbol)
48HSPA8P5n/a
    
    
     
n/achr12 4,098,485heat shock protein family A (Hsp70) member 8 pseudogene 5 (from HGNC HSPA8P5)
49ENSG00000251529n/a
    
    
     
n/achr4 68,878,878ENSG00000251529 (from geneSymbol)
50TRBV10-1n/a
n/a
n/a
n/a
n/achr7_KI270803v1_alt 383,711V region of the variable domain of T cell receptor (TR) beta  chain that participates in the antigen recognition (PubMed:24600447).  Alpha-beta T cell receptors are antigen specific receptors which are  essential to the immune response and are present on the cell surface of  T lymphocytes. Recognize peptide-major histocompatibility (MH) (pMH)  complexes that are displayed by antigen presenting cells (APC), a  prerequisite for efficient T cell adaptive immunity against pathogens  (PubMed:25493333). Binding of alpha-beta TR to pMH complex initiates  TR-CD3 clustering on the cell surface and intracellular activation of  LCK that phosphorylates the ITAM motifs of CD3G, CD3D, CD3E and CD247  enabling the recruitment of ZAP70. In turn ZAP70 phosphorylates LAT,  which recruits numerous signaling molecules to form the LAT  signalosome. The LAT signalosome propagates signal branching to three  major signaling pathways, the calcium, the mitogen-activated protein  kinase (MAPK) kinase and the nuclear factor NF-kappa-B (NF-kB)  pathways, leading to the mobilization of transcription factors that are  critical for gene expression and essential for T cell growth and  differentiation (PubMed:23524462). The T cell repertoire is generated  in the thymus, by V-(D)-J rearrangement. This repertoire is then shaped  by intrathymic selection events to generate a peripheral T cell pool of  self-MH restricted, non-autoaggressive T cells. Post-thymic interaction  of alpha-beta TR with the pMH complexes shapes TR structural and  functional avidity (PubMed:15040585). (from UniProt A0A0K0K1A3)