Affine Alignment
 
Alignment between CHD4 (top ENST00000544040.7_14 1912aa) and CHD4 (bottom ENST00000544040.7_14 1912aa) score 192318

0001 MASGLGSPSPCSAGSEEEDMDALLNNSLPPPHPENEEDPEEDLSETETPKLKKKKKPKKP 0060
     ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
0001 MASGLGSPSPCSAGSEEEDMDALLNNSLPPPHPENEEDPEEDLSETETPKLKKKKKPKKP 0060

0061 RDPKIPKSKRQKKERMLLCRQLGDSSGEGPEFVEEEEEVALRSDSEGSDYTPGKKKKKKL 0120
     ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
0061 RDPKIPKSKRQKKERMLLCRQLGDSSGEGPEFVEEEEEVALRSDSEGSDYTPGKKKKKKL 0120

0121 GPKKEKKSKSKRKEEEEEEDDDDDSKEPKSSAQLLEDWGMEDIDHVFSEEDYRTLTNYKA 0180
     ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
0121 GPKKEKKSKSKRKEEEEEEDDDDDSKEPKSSAQLLEDWGMEDIDHVFSEEDYRTLTNYKA 0180

0181 FSQFVRPLIAAKNPKIAVSKMMMVLGAKWREFSTNNPFKGSSGASVAAAAAAAVAVVESM 0240
     ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
0181 FSQFVRPLIAAKNPKIAVSKMMMVLGAKWREFSTNNPFKGSSGASVAAAAAAAVAVVESM 0240

0241 VTATEVAPPPPPVEVPIRKAKTKEGKGPNARRKPKGSPRVPDAKKPKPKKVAPLKIKLGG 0300
     ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
0241 VTATEVAPPPPPVEVPIRKAKTKEGKGPNARRKPKGSPRVPDAKKPKPKKVAPLKIKLGG 0300

0301 FGSKRKRSSSEDDDLDVESDFDDASINSYSVSDGSTSRSSRSRKKLRTTKKKKKGEEEVT 0360
     ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
0301 FGSKRKRSSSEDDDLDVESDFDDASINSYSVSDGSTSRSSRSRKKLRTTKKKKKGEEEVT 0360

0361 AVDGYETDHQDYCEVCQQGGEIILCDTCPRAYHMVCLDPDMEKAPEGKWSCPHCEKEGIQ 0420
     ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
0361 AVDGYETDHQDYCEVCQQGGEIILCDTCPRAYHMVCLDPDMEKAPEGKWSCPHCEKEGIQ 0420

0421 WEAKEDNSEGEEILEEVGGDLEEEDDHHMEFCRVCKDGGELLCCDTCPSSYHIHCLNPPL 0480
     ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
0421 WEAKEDNSEGEEILEEVGGDLEEEDDHHMEFCRVCKDGGELLCCDTCPSSYHIHCLNPPL 0480

0481 PEIPNGEWLCPRCTCPALKGKVQKILIWKWGQPPSPTPVPRPPDADPNTPSPKPLEGRPE 0540
     ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
0481 PEIPNGEWLCPRCTCPALKGKVQKILIWKWGQPPSPTPVPRPPDADPNTPSPKPLEGRPE 0540

0541 RQFFVKWQGMSYWHCSWVSELQLELHCQVMFRNYQRKNDMDEPPSGDFGGDEEKSRKRKN 0600
     ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
0541 RQFFVKWQGMSYWHCSWVSELQLELHCQVMFRNYQRKNDMDEPPSGDFGGDEEKSRKRKN 0600

0601 KDPKFAEMEERFYRYGIKPEWMMIHRILNHSVDKKGHVHYLIKWRDLPYDQASWESEDVE 0660
     ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
0601 KDPKFAEMEERFYRYGIKPEWMMIHRILNHSVDKKGHVHYLIKWRDLPYDQASWESEDVE 0660

0661 IQDYDLFKQSYWNHRELMRGEEGRPGKKLKKVKLRKLERPPETPTVDPTVKYERQPEYLD 0720
     ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
0661 IQDYDLFKQSYWNHRELMRGEEGRPGKKLKKVKLRKLERPPETPTVDPTVKYERQPEYLD 0720

0721 ATGGTLHPYQMEGLNWLRFSWAQGTDTILADEMGLGKTVQTAVFLYSLYKEGHSKGPFLV 0780
     ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
0721 ATGGTLHPYQMEGLNWLRFSWAQGTDTILADEMGLGKTVQTAVFLYSLYKEGHSKGPFLV 0780

0781 SAPLSTIINWEREFEMWAPDMYVVTYVGDKDSRAIIRENEFSFEDNAIRGGKKASRMKKE 0840
     ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
0781 SAPLSTIINWEREFEMWAPDMYVVTYVGDKDSRAIIRENEFSFEDNAIRGGKKASRMKKE 0840

0841 ASVKFHVLLTSYELITIDMAILGSIDWACLIVDEAHRLKNNQSKFFRVLNGYSLQHKLLL 0900
     ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
0841 ASVKFHVLLTSYELITIDMAILGSIDWACLIVDEAHRLKNNQSKFFRVLNGYSLQHKLLL 0900

0901 TGTPLQNNLEELFHLLNFLTPERFHNLEGFLEEFADIAKEDQIKKLHDMLGPHMLRRLKA 0960
     ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
0901 TGTPLQNNLEELFHLLNFLTPERFHNLEGFLEEFADIAKEDQIKKLHDMLGPHMLRRLKA 0960

0961 DVFKNMPSKTELIVRVELSPMQKKYYKYILTRNFEALNARGGGNQVSLLNVVMDLKKCCN 1020
     ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
0961 DVFKNMPSKTELIVRVELSPMQKKYYKYILTRNFEALNARGGGNQVSLLNVVMDLKKCCN 1020

1021 HPYLFPVAAMEAPKMPNGMYDGSALIRASGKLLLLQKMLKNLKEGGHRVLIFSQMTKMLD 1080
     ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
1021 HPYLFPVAAMEAPKMPNGMYDGSALIRASGKLLLLQKMLKNLKEGGHRVLIFSQMTKMLD 1080

1081 LLEDFLEHEGYKYERIDGGITGNMRQEAIDRFNAPGAQQFCFLLSTRAGGLGINLATADT 1140
     ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
1081 LLEDFLEHEGYKYERIDGGITGNMRQEAIDRFNAPGAQQFCFLLSTRAGGLGINLATADT 1140

1141 VIIYDSDWNPHNDIQAFSRAHRIGQNKKVMIYRFVTRASVEERITQVAKKKMMLTHLVVR 1200
     ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
1141 VIIYDSDWNPHNDIQAFSRAHRIGQNKKVMIYRFVTRASVEERITQVAKKKMMLTHLVVR 1200

1201 PGLGSKTGSMSKQELDDILKFGTEELFKDEATDGGGDNKEGEDSSVIHYDDKAIERLLDR 1260
     ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
1201 PGLGSKTGSMSKQELDDILKFGTEELFKDEATDGGGDNKEGEDSSVIHYDDKAIERLLDR 1260

1261 NQDETEDTELQGMNEYLSSFKVAQYVVREEEMGEEEEVEREIIKQEESVDPDYWEKLLRH 1320
     ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
1261 NQDETEDTELQGMNEYLSSFKVAQYVVREEEMGEEEEVEREIIKQEESVDPDYWEKLLRH 1320

1321 HYEQQQEDLARNLGKGKRIRKQVNYNDGSQEDRDWQDDQSDNQSDYSVASEEGDEDFDER 1380
     ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
1321 HYEQQQEDLARNLGKGKRIRKQVNYNDGSQEDRDWQDDQSDNQSDYSVASEEGDEDFDER 1380

1381 SEAPRRPSRKGLRNDKDKPLPPLLARVGGNIEVLGFNARQRKAFLNAIMRYGMPPQDAFT 1440
     ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
1381 SEAPRRPSRKGLRNDKDKPLPPLLARVGGNIEVLGFNARQRKAFLNAIMRYGMPPQDAFT 1440

1441 TQWLVRDLRGKSEKEFKAYVSLFMRHLCEPGADGAETFADGVPREGLSRQHVLTRIGVMS 1500
     ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
1441 TQWLVRDLRGKSEKEFKAYVSLFMRHLCEPGADGAETFADGVPREGLSRQHVLTRIGVMS 1500

1501 LIRKKVQEFEHVNGRWSMPELAEVEENKKMSQPGSPSPKTPTPSTPGDTQPNTPAPVPPA 1560
     ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
1501 LIRKKVQEFEHVNGRWSMPELAEVEENKKMSQPGSPSPKTPTPSTPGDTQPNTPAPVPPA 1560

1561 EDGIKIEENSLKEEESIEGEKEVKSTAPETAIECTQAPAPASEDEKVVVEPPEGEEKVEK 1620
     ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
1561 EDGIKIEENSLKEEESIEGEKEVKSTAPETAIECTQAPAPASEDEKVVVEPPEGEEKVEK 1620

1621 AEVKERTEEPMETEPKGAADVEKVEEKSAIDLTPIVVEDKEEKKEEEEKKEVMLQNGETP 1680
     ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
1621 AEVKERTEEPMETEPKGAADVEKVEEKSAIDLTPIVVEDKEEKKEEEEKKEVMLQNGETP 1680

1681 KDLNDEKQKKNIKQRFMFNIADGGFTELHSLWQNEERAATVTKKTYEIWHRRHDYWLLAG 1740
     ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
1681 KDLNDEKQKKNIKQRFMFNIADGGFTELHSLWQNEERAATVTKKTYEIWHRRHDYWLLAG 1740

1741 IINHGYARWQDIQNDPRYAILNEPFKGEMNRGNFLEIKNKFLARRFKLLEQALVIEEQLR 1800
     ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
1741 IINHGYARWQDIQNDPRYAILNEPFKGEMNRGNFLEIKNKFLARRFKLLEQALVIEEQLR 1800

1801 RAAYLNMSEDPSHPSMALNTRFAEVECLAESHQHLSKESMAGNKPANAVLHKVLKQLEEL 1860
     ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
1801 RAAYLNMSEDPSHPSMALNTRFAEVECLAESHQHLSKESMAGNKPANAVLHKVLKQLEEL 1860

1861 LSDMKADVTRLPATIARIPPVAVRLQMSERNILSRLANRAPEPTPQQVAQQQ 1912
     ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
1861 LSDMKADVTRLPATIARIPPVAVRLQMSERNILSRLANRAPEPTPQQVAQQQ 1912