Affine Alignment
 
Alignment between SMC3 (top ENST00000361804.5_4 1217aa) and SMC3 (bottom ENST00000361804.5_4 1217aa) score 116508

0001 MYIKQVIIQGFRSYRDQTIVDPFSSKHNVIVGRNGSGKSNFFYAIQFVLSDEFSHLRPEQ 0060
     ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
0001 MYIKQVIIQGFRSYRDQTIVDPFSSKHNVIVGRNGSGKSNFFYAIQFVLSDEFSHLRPEQ 0060

0061 RLALLHEGTGPRVISAFVEIIFDNSDNRLPIDKEEVSLRRVIGAKKDQYFLDKKMVTKND 0120
     ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
0061 RLALLHEGTGPRVISAFVEIIFDNSDNRLPIDKEEVSLRRVIGAKKDQYFLDKKMVTKND 0120

0121 VMNLLESAGFSRSNPYYIVKQGKINQMATAPDSQRLKLLREVAGTRVYDERKEESISLMK 0180
     ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
0121 VMNLLESAGFSRSNPYYIVKQGKINQMATAPDSQRLKLLREVAGTRVYDERKEESISLMK 0180

0181 ETEGKREKINELLKYIEERLHTLEEEKEELAQYQKWDKMRRALEYTIYNQELNETRAKLD 0240
     ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
0181 ETEGKREKINELLKYIEERLHTLEEEKEELAQYQKWDKMRRALEYTIYNQELNETRAKLD 0240

0241 ELSAKRETSGEKSRQLRDAQQDARDKMEDIERQVRELKTKISAMKEEKEQLSAERQEQIK 0300
     ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
0241 ELSAKRETSGEKSRQLRDAQQDARDKMEDIERQVRELKTKISAMKEEKEQLSAERQEQIK 0300

0301 QRTKLELKAKDLQDELAGNSEQRKRLLKERQKLLEKIEEKQKELAETEPKFNSVKEKEER 0360
     ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
0301 QRTKLELKAKDLQDELAGNSEQRKRLLKERQKLLEKIEEKQKELAETEPKFNSVKEKEER 0360

0361 GIARLAQATQERTDLYAKQGRGSQFTSKEERDKWIKKELKSLDQAINDKKRQIAAIHKDL 0420
     ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
0361 GIARLAQATQERTDLYAKQGRGSQFTSKEERDKWIKKELKSLDQAINDKKRQIAAIHKDL 0420

0421 EDTEANKEKNLEQYNKLDQDLNEVKARVEELDRKYYEVKNKKDELQSERNYLWREENAEQ 0480
     ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
0421 EDTEANKEKNLEQYNKLDQDLNEVKARVEELDRKYYEVKNKKDELQSERNYLWREENAEQ 0480

0481 QALAAKREDLEKKQQLLRAATGKAILNGIDSINKVLDHFRRKGINQHVQNGYHGIVMNNF 0540
     ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
0481 QALAAKREDLEKKQQLLRAATGKAILNGIDSINKVLDHFRRKGINQHVQNGYHGIVMNNF 0540

0541 ECEPAFYTCVEVTAGNRLFYHIVDSDEVSTKILMEFNKMNLPGEVTFLPLNKLDVRDTAY 0600
     ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
0541 ECEPAFYTCVEVTAGNRLFYHIVDSDEVSTKILMEFNKMNLPGEVTFLPLNKLDVRDTAY 0600

0601 PETNDAIPMISKLRYNPRFDKAFKHVFGKTLICRSMEVSTQLARAFTMDCITLEGDQVSH 0660
     ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
0601 PETNDAIPMISKLRYNPRFDKAFKHVFGKTLICRSMEVSTQLARAFTMDCITLEGDQVSH 0660

0661 RGALTGGYYDTRKSRLELQKDVRKAEEELGELEAKLNENLRRNIERINNEIDQLMNQMQQ 0720
     ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
0661 RGALTGGYYDTRKSRLELQKDVRKAEEELGELEAKLNENLRRNIERINNEIDQLMNQMQQ 0720

0721 IETQQRKFKASRDSILSEMKMLKEKRQQSEKTFMPKQRSLQSLEASLHAMESTRESLKAE 0780
     ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
0721 IETQQRKFKASRDSILSEMKMLKEKRQQSEKTFMPKQRSLQSLEASLHAMESTRESLKAE 0780

0781 LGTDLLSQLSLEDQKRVDALNDEIRQLQQENRQLLNERIKLEGIITRVETYLNENLRKRL 0840
     ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
0781 LGTDLLSQLSLEDQKRVDALNDEIRQLQQENRQLLNERIKLEGIITRVETYLNENLRKRL 0840

0841 DQVEQELNELRETEGGTVLTATTSELEAINKRVKDTMARSEDLDNSIDKTEAGIKELQKS 0900
     ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
0841 DQVEQELNELRETEGGTVLTATTSELEAINKRVKDTMARSEDLDNSIDKTEAGIKELQKS 0900

0901 MERWKNMEKEHMDAINHDTKELEKMTNRQGMLLKKKEECMKKIRELGSLPQEAFEKYQTL 0960
     ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
0901 MERWKNMEKEHMDAINHDTKELEKMTNRQGMLLKKKEECMKKIRELGSLPQEAFEKYQTL 0960

0961 SLKQLFRKLEQCNTELKKYSHVNKKALDQFVNFSEQKEKLIKRQEELDRGYKSIMELMNV 1020
     ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
0961 SLKQLFRKLEQCNTELKKYSHVNKKALDQFVNFSEQKEKLIKRQEELDRGYKSIMELMNV 1020

1021 LELRKYEAIQLTFKQVSKNFSEVFQKLVPGGKATLVMKKGDVEGSQSQDEGEGSGESERG 1080
     ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
1021 LELRKYEAIQLTFKQVSKNFSEVFQKLVPGGKATLVMKKGDVEGSQSQDEGEGSGESERG 1080

1081 SGSQSSVPSVDQFTGVGIRVSFTGKQGEMREMQQLSGGQKSLVALALIFAIQKCDPAPFY 1140
     ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
1081 SGSQSSVPSVDQFTGVGIRVSFTGKQGEMREMQQLSGGQKSLVALALIFAIQKCDPAPFY 1140

1141 LFDEIDQALDAQHRKAVSDMIMELAVHAQFITTTFRPELLESADKFYGVKFRNKVSHIDV 1200
     ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
1141 LFDEIDQALDAQHRKAVSDMIMELAVHAQFITTTFRPELLESADKFYGVKFRNKVSHIDV 1200

1201 ITAEMAKDFVEDDTTHG 1217
     |||||||||||||||||
1201 ITAEMAKDFVEDDTTHG 1217