UCSC C. elegans Gene Sorter
 
genome assembly search
sort by display output 
#
Name
WormBase
BLASTP
E-Value
Genome Position
Description
1cdr-2C54D10.15.0000000000000004e-163chrV 12,415,171C. elegans CDR-2 protein; contains similarity to Pfam domain PF00043 Glutathione S-transferase, C-terminal domain contains similarity to Interpro domains IPR012336 (Thioredoxin-like fold), IPR012335 (Thioredoxin fold), IPR004046 (Glutathione S-transferase, C-terminal), IPR010987 (Glutathione S-transferase, C-terminal-like)
2hum-5T02C12.1n/achrIII 4,032,950C. elegans HUM-5 protein; contains similarity to Pfam domains PF00612 (IQ calmodulin-binding motif) , PF06017 (Myosin tail) , PF00063 (Myosin head (motor domain)) contains similarity to Interpro domains IPR010926 (Myosin tail 2), IPR000048 (IQ calmodulin-binding region), IPR001609 (Myosin head, motor region)
3H03A11.2H03A11.2n/achrX 15,228,166contains similarity to Trypanosoma brucei Putative uncharacterized protein.; TR:Q57WE8
4C49C3.9C49C3.9n/achrIV 17,340,941contains similarity to Brassaiopsis tripteris NADH dehydrogenase subunit F (Fragment).; TR:Q85UX5
5pgp-1K08E7.9n/achrIV 12,595,402pgp-1 encodes a transmembrane protein that is a member of the P-glycoprotein subclass of the ATP-binding cassette (ABC) transporter superfamily; along with PGP-3, PGP-1 is required for defense against the pathogenic Pseudomonas aeruginosa strain PA14, and may facilitate ATP-dependent efflux of the toxic phenazine compounds produced by the bacteria; PGP-1 is expressed in the apical membrane of intestinal cells and in the intestinal valve cells; loss of pgp-1 activity via large-scale RNAi screens does not result in any obvious abnormalities.
6K08E3.4K08E3.4n/achrIII 13,760,645contains similarity to Pfam domains PF07653 (Variant SH3 domain) , PF00018 (SH3 domain) , PF00241 (Cofilin/tropomyosin-type actin-binding protein) contains similarity to Interpro domains IPR002108 (Actin-binding, cofilin/tropomyosin type), IPR001452 (Src homology-3), IPR000108 (Neutrophil cytosol factor 2), IPR000694 (Proline-rich region), IPR013315 (Spectrin alpha chain), IPR011511 (Variant SH3)
7T26E3.7T26E3.7n/achrI 12,655,698contains similarity to Pfam domain PF00006 ATP synthase alpha/beta family, nucleotide-binding domain contains similarity to Interpro domain IPR000194 (ATPase, F1/V1/A1 complex, alpha/beta subunit, nucleotide-binding)
8H03A11.1H03A11.1n/achrX 15,211,201H03A11.1 encodes an FAM20 ortholog; murine FAM20A is a secreted protein expressed in hematopoietic cells.
9irs-1R11A8.6n/achrIV 10,370,700irs-1 encodes a predicted cytoplasmic isoleucyl-tRNA synthetase (IleRS), an aminoacyl-tRNA synthetase that catalyzes the attachment of isoleucine to its cognate tRNA and is thus required for protein biosynthesis; loss of irs-1 activity via RNA-mediated interference (RNAi) results in sterility, embryonic lethality, and slower rates of growth, indicating that IRS-1 is essential for development.
10F43G9.1F43G9.1n/achrI 8,607,769contains similarity to Pfam domain PF00180 Isocitrate/isopropylmalate dehydrogenase contains similarity to Interpro domains IPR004434 (Isocitrate dehydrogenase NAD-dependent, mitochondrial), IPR001804 (Isocitrate/isopropylmalate dehydrogenase)
11K10C2.4K10C2.4n/achrX 6,447,827K10C2.4 encodes a putative fumarylacetoacetate hydrolase, orthologous to human FAH (OMIM:276700, mutated in type I tyrosinemia), that is required for tyrosine metabolism, resistance to oxidative and protein-folding stresses, and more generally for normally rapid growth, normal locomotion, fertility, and viability; K10C2.4 is expressed in hypodermis and intestine; the intestines of K10C2.4(RNAi) animals atrophy rapidly, and show an abnormally active oxidative stress response (seen via gst-4::GFP) and ER stress response (seen via hsp-4::GFP); while RNAi against enzymes upstream of K10C2.4 suppresses the K10C2.4(RNAi) phenotype, excess dietary tyrosine or homogentisic acid enhances it, and exogenous succinylacetone (SA) mimics it, consistent with the hypothesis that blocked SA metabolism is toxic in K10C2.4(RNAi) animals.
12asg-2C53B7.4n/achrX 6,841,624asg-2 encodes a homolog of subunit G of the membrane-bound F0 proton channel portion of ATP synthase (mitochondrial respiratory chain [MRC] complex V); asg-2 activity is required for growth at a normally high rate and for normal osmoregulation; in addition, asg-2 activity is required for response to hermaphrodite contact, the first step in a series of stereotypical male mating behaviors; an ASG-2::GFP fusion localizes to mitochondria and to cilia of the male-specific CEM neurons.
13C17H12.4C17H12.4n/achrIV 6,800,609contains similarity to Pfam domain PF00135 Carboxylesterase contains similarity to Interpro domain IPR002018 (Carboxylesterase, type B)
14K07H8.3K07H8.3n/achrIV 8,290,863contains similarity to Pfam domain PF00583 Acetyltransferase (GNAT) family contains similarity to Interpro domains IPR000182 (GCN5-related N-acetyltransferase), IPR016181 (Acyl-CoA N-acyltransferase)
15K04A8.1K04A8.1n/achrV 6,567,604contains similarity to Pfam domain PF03269 Caenorhabditis protein of unknown function, DUF268 contains similarity to Interpro domain IPR004951 (Protein of unknown function DUF268, Caenorhabditis species)
16T20D4.6T20D4.6n/achrV 3,411,676contains similarity to Pfam domains PF00339 (Arrestin (or S-antigen), N-terminal domain) , PF02752 (Arrestin (or S-antigen), C-terminal domain) contains similarity to Interpro domains IPR014756 (Immunoglobulin E-set), IPR011022 (Arrestin-like, C-terminal), IPR014752 (Arrestin, C-terminal), IPR011021 (Arrestin-like, N-terminal)
17C34C6.4C34C6.4n/achrII 8,697,694contains similarity to Pfam domains PF00732 (GMC oxidoreductase) , PF05199 (GMC oxidoreductase) contains similarity to Interpro domains IPR013027 (FAD-dependent pyridine nucleotide-disulphide oxidoreductase), IPR012132 (Glucose-methanol-choline oxidoreductase), IPR007867 (Glucose-methanol-choline oxidoreductase, C-terminal), IPR000172 (Glucose-methanol-choline oxidoreductase, N-terminal), IPR001100 (Pyridine nucleotide-disulphide oxidoreductase, class I)
18Y49G5A.1Y49G5A.1n/achrV 5,286,867contains similarity to Pfam domain PF00014 Kunitz/Bovine pancreatic trypsin inhibitor domain contains similarity to Interpro domain IPR002223 (Proteinase inhibitor I2, Kunitz metazoa)
19F15E11.2F15E11.2n/achrV 2,335,582contains similarity to Pfam domain PF01030 Receptor L domain contains similarity to Interpro domain IPR000494 (EGF receptor, L domain)
20T01E8.5T01E8.5n/achrII 10,245,041contains similarity to Pfam domain PF08424 Protein of unknown function (DUF1740) contains similarity to Interpro domain IPR013633 (Protein of unknown function DUF1740)
21T26E4.5T26E4.5n/achrV 15,787,827contains similarity to Interpro domain IPR008996 ()
22kqt-2M60.5n/achrX 8,244,691kqt-2 encodes one of three C. elegans KCNQ-like potassium channel subunits for which mutations in humans are associated with heredity diseases that affect epithelial cells, cardiac muscle and neurons; a KQT-2::GFP fusion protein is expressed exclusively in the intestine.
23ucr-1F56D2.1n/achrIII 5,593,099C. elegans UCR-1 protein; contains similarity to Pfam domains PF00675 (Insulinase (Peptidase family M16)) , PF05193 (Peptidase M16 inactive domain) contains similarity to Interpro domains IPR001431 (Peptidase M16, zinc-binding site), IPR011765 (Peptidase M16, N-terminal), IPR000209 (Peptidase S8 and S53, subtilisin, kexin, sedolisin), IPR011237 (Peptidase M16, core), IPR007863 (Peptidase M16, C-terminal), IPR011249 (Metalloenzyme, LuxS/M16 peptidase-like, metal-binding)
24T04F3.1T04F3.1n/achrV 11,747,105contains similarity to Pfam domain PF00155 Aminotransferase class I and II contains similarity to Interpro domains IPR001176 (1-aminocyclopropane-1-carboxylate synthase), IPR015422 (Pyridoxal phosphate-dependent transferase, major region, subdomain 2), IPR015424 (Pyridoxal phosphate-dependent transferase, major region), IPR004839 (Aminotransferase, class I and II), IPR015421 (Pyridoxal phosphate-dependent transferase, major region, subdomain 1)
25ZK370.8ZK370.8n/achrIII 8,753,333contains similarity to Interpro domains IPR011990 (Tetratricopeptide-like helical), IPR013026 (Tetratricopeptide region)
26pmp-4T02D1.5n/achrIV 17,404,001The pmp-4 gene encodes a homolog of human ALD, which when mutated leads to X-linked adrenoleukodystrophy (OMIM:300100).
27F19C7.1F19C7.1n/achrIV 4,606,991contains similarity to Pfam domain PF06879 Protein of unknown function (DUF1261) contains similarity to Interpro domain IPR009673 (Protein of unknown function DUF1261)
28Y56A3A.19Y56A3A.19n/achrIII 11,915,313contains similarity to Pfam domain PF00550 Phosphopantetheine attachment site contains similarity to Interpro domains IPR006163 (Phosphopantetheine-binding), IPR009081 (Acyl carrier protein-like), IPR003231 (Acyl carrier protein (ACP))
29dhs-7E04F6.7n/achrII 7,207,642dhs-7 encodes a short-chain dehydrogenase predicted to be mitochondrial.
30ZK328.6ZK328.6n/achrIII 6,029,645contains similarity to Pfam domains PF02818 (PPAK motif) , PF00646 (F-box domain) contains similarity to Interpro domain IPR001810 (Cyclin-like F-box)
31lgc-50T20B12.9n/achrIII 7,393,409C. elegans LGC-50 protein; contains similarity to Pfam domains PF02931 (Neurotransmitter-gated ion-channel ligand binding domain) , PF02932 (Neurotransmitter-gated ion-channel transmembrane region) contains similarity to Interpro domains IPR002289 (Gamma-aminobutyric-acid A receptor, beta subunit), IPR006028 (Gamma-aminobutyric acid A receptor), IPR006201 (Neurotransmitter-gated ion-channel), IPR006202 (Neurotransmitter-gated ion-channel ligand-binding), IPR006029 (Neurotransmitter-gated ion-channel transmembrane region)
32T28F3.8T28F3.8n/achrIV 17,306,594contains similarity to Interpro domain IPR013032 (EGF-like region, conserved site)
33K02B12.7K02B12.7n/achrI 8,528,009contains similarity to Pfam domain PF01412 Putative GTPase activating protein for Arf contains similarity to Interpro domain IPR001164 (Arf GTPase activating protein)
34T04A8.5T04A8.5n/achrIII 4,690,700contains similarity to Pfam domains PF00310 (Glutamine amidotransferases class-II) , PF00156 (Phosphoribosyl transferase domain) contains similarity to Interpro domains IPR000583 (Glutamine amidotransferase, class-II), IPR005854 (Amidophosphoribosyl transferase), IPR000836 (Phosphoribosyltransferase), IPR002375 (Purine/pyrimidine phosphoribosyl transferase, conserved site)
35R05F9.12R05F9.12n/achrII 4,919,859contains similarity to Pfam domains PF01055 (Glycosyl hydrolases family 31) , PF00088 (Trefoil (P-type) domain) contains similarity to Interpro domains IPR000519 (P-type trefoil), IPR017853 (Glycoside hydrolase, catalytic core), IPR000322 (Glycoside hydrolase, family 31)
36K02C4.2K02C4.2n/achrII 8,076,226contains similarity to Brugia pahangi Alt-1 protein.; TR:O96781
37B0286.3B0286.3n/achrII 4,371,091contains similarity to Pfam domains PF01259 (SAICAR synthetase) , PF00731 (AIR carboxylase) contains similarity to Interpro domains IPR001636 (SAICAR synthetase), IPR000031 (1-(5-Phosphoribosyl)-5-amino-4-imidazole-carboxylate (AIR) carboxylase), IPR013816 (ATP-grasp fold, subdomain 2)
38B0416.1B0416.1n/achrX 9,307,010contains similarity to Pfam domain PF07810 TMC domain contains similarity to Interpro domain IPR012496 (TMC)
39maoc-1E04F6.3n/achrII 7,196,834maoc-1 encodes an ortholog of human HSD17B4 (OMIM:601860, mutated in D-bifunctional protein deficiency); MAOC-1 contains a MaoC-like domain found in diverse enzymes (HSD17B4, peroxisomal hydratase-dehydrogenase-epimerase, and the fatty acid synthase beta subunit) and by homology, is predicted to function in peroxisomal fatty acid beta-oxidation; loss of maoc-1 activity via RNAi results in lifespan extension, increased fat content, and an increased susceptibility to pathogens.
40pcca-1F27D9.5n/achrX 7,659,204The F27D9.5 gene encodes an ortholog of the human gene PROPIONYL-COA CARBOXYLASE ALPHA SUBUNIT (PCCA), which when mutated leads to propionicaciduria, type I (OMIM:232000).
41C49C3.4C49C3.4n/achrIV 17,324,683contains similarity to Interpro domains IPR000742 (EGF-like, type 3), IPR006210 (EGF), IPR002049 (EGF-like, laminin), IPR013032 (EGF-like region, conserved site)
42fbxa-58C29F9.11n/achrIII 110,182C. elegans FBXA-58 protein; contains similarity to Pfam domains PF01827 (FTH domain) , PF00646 (F-box domain) contains similarity to Interpro domain IPR002900 (Protein of unknown function DUF38, Caenorhabditis species)
43F55E10.6F55E10.6n/achrX 8,345,470contains similarity to Pfam domain PF00106 short chain dehydrogenase contains similarity to Interpro domains IPR003560 (2,3-dihydro-2,3-dihydroxybenzoate dehydrogenase), IPR002347 (Glucose/ribitol dehydrogenase), IPR002198 (Short-chain dehydrogenase/reductase SDR), IPR016040 (NAD(P)-binding)
44F55A3.6F55A3.6n/achrI 10,784,384contains similarity to Pfam domain PF00334 Nucleoside diphosphate kinase contains similarity to Interpro domain IPR001564 (Nucleoside diphosphate kinase, core)
45F55B11.1F55B11.1n/achrIV 14,406,976The F55B11.1 gene encodes an ortholog of the human gene XANTHINE DEHYDROGENASE (XDH), which when mutated leads to xanthinuria (OMIM:278300).
46C25F9.4C25F9.4n/achrV 19,412,581contains similarity to Arabidopsis thaliana Putative SWI/SNF-related matrix-associated actin-dependent regulatorsof chromatin subfamily A member 3-like 3 (EC 3.6.1.-) (SMARCA3-likesprotein 3).; SW:Q9FIY7
47tag-314F15H10.4n/achrV 10,427,635C. elegans TAG-314 protein; contains similarity to Interpro domains IPR001841 (Zinc finger, RING-type), IPR013083 (Zinc finger, RING/FYVE/PHD-type), IPR002867 (Zinc finger, C6HC-type)
48mdh-1F20H11.3n/achrIII 6,607,404mdh-1 encodes a homolog of malate dehydrogenase that is predicted to be mitochondrial.
49ugt-1AC3.7n/achrV 10,396,677C. elegans UGT-1 protein; contains similarity to Pfam domain PF00201 UDP-glucoronosyl and UDP-glucosyl transferase contains similarity to Interpro domain IPR002213 (UDP-glucuronosyl/UDP-glucosyltransferase)
50tag-18T14G12.3n/achrX 3,732,674C. elegans TAG-18 protein ;