UCSC C. elegans Gene Sorter
 
genome assembly search
sort by display output 
#
Name
WormBase
BLASTP
E-Value
Genome Position
Description
1F39F10.5F39F10.52e-97chrX 16,913,317
2srh-49C10G11.4n/achrI 6,298,750C. elegans SRH-49 protein; contains similarity to Pfam domain PF01461 7TM chemoreceptor contains similarity to Interpro domain IPR003002 (7TM chemoreceptor, subfamily 1)
3srz-53Y102A5C.23n/achrV 16,977,768C. elegans SRZ-53 protein; contains similarity to Pfam domain PF01748 Caenorhabditis serpentine receptor-like protein contains similarity to Interpro domain IPR002651 (Protein of unknown function DUF32)
4sra-39T21H8.4n/achrX 13,902,169C. elegans SRA-39 protein; contains similarity to Pfam domains PF02117 (C.elegans Sra family integral membrane protein) , PF03125 (C. elegans Sre G protein-coupled chemoreceptor) , PF02175 (C.elegans integral membrane protein Srb) contains similarity to Interpro domains IPR002184 (Serpentine beta receptor), IPR004151 (C. elegans Sre G protein-coupled chemoreceptor), IPR000344 (Nematode chemoreceptor, Sra)
5ZK994.6ZK994.6n/achrV 8,503,564
6clec-179C42D4.11n/achrIV 7,183,961C. elegans CLEC-179 protein; contains similarity to Pfam domain PF08277 PAN-like domain contains similarity to Interpro domains IPR006583 (CW), IPR016187 (C-type lectin fold), IPR016186 (C-type lectin-like), IPR001304 (C-type lectin)
7srt-30R08F11.2n/achrV 3,799,527C. elegans SRT-30 protein; contains similarity to Pfam domain PF01748 Caenorhabditis serpentine receptor-like protein contains similarity to Interpro domains IPR002651 (Protein of unknown function DUF32), IPR001991 (Sodium:dicarboxylate symporter)
8srg-26C10G8.1n/achrV 5,332,145C. elegans SRG-26 protein; contains similarity to Pfam domain PF02118 C.elegans Srg family integral membrane protein contains similarity to Interpro domain IPR000609 (Serpentine gamma receptor, Caenorhabditis species)
9B0205.5B0205.5n/achrI 10,740,393
10sre-51C50E10.10n/achrII 12,312,675C. elegans SRE-51 protein; contains similarity to Pfam domain PF03125 C. elegans Sre G protein-coupled chemoreceptor contains similarity to Interpro domain IPR004151 (C. elegans Sre G protein-coupled chemoreceptor)
11ZC53.4ZC53.4n/achrX 1,931,714contains similarity to Tetrahymena thermophila SB210 Putative uncharacterized protein.; TR:Q227Y0
12C01B7.3C01B7.3n/achrV 8,783,769
13F45F2.1F45F2.1n/achrV 8,538,519contains similarity to Pfam domain PF03189 Protein of unknown function, DUF270 contains similarity to Interpro domain IPR004878 (Protein of unknown function DUF270)
14srd-9T09D3.1n/achrV 5,352,409C. elegans SRD-9 protein; contains similarity to Pfam domain PF01461 7TM chemoreceptor contains similarity to Interpro domains IPR003002 (7TM chemoreceptor, subfamily 1), IPR000276 (GPCR, rhodopsin-like)
15B0244.5B0244.5n/achrIII 5,745,987
16F19B10.1F19B10.1n/achrII 3,683,855contains similarity to Gallus gallus Neurofilament medium polypeptide (NF-M) (Neurofilament triplet Msprotein) (160 kDa neurofilament protein).; SW:P16053
17F47B10.4F47B10.4n/achrX 10,891,428contains similarity to Cyanophage P60 Thioredoxin C3.; TR:Q8W710
18F27C1.13F27C1.13n/achrI 5,445,369contains similarity to Pfam domain PF03607 Doublecortin contains similarity to Interpro domain IPR003533 (Doublecortin)
19rap-2C25D7.7n/achrV 15,062,961rap-2 encodes a Ras-related GTPase that is most similar to the RAP2 members of the Ras GTPase superfamily; by homology, RAP-2 is predicted to function as a membrane-localized GTPase that likely plays a role in signal transduction; as animals homozygous for a rap-2 deletion mutation show no obvious abnormalities, the precise role of RAP-2 in C. elegans development and/or behavior is not yet known.
20Y76A2B.2Y76A2B.2n/achrIII 13,533,575contains similarity to Homo sapiens Reticulon-4 receptor precursor; ENSEMBL:ENSP00000043402
21C31B8.1C31B8.1n/achrV 2,932,269
22srw-76W06G6.6n/achrV 16,637,565C. elegans SRW-76 protein; contains similarity to Interpro domain IPR017452 (GPCR, rhodopsin-like superfamily)
23nhr-241Y69H2.8n/achrV 18,700,186C. elegans NHR-241 protein
24K10H10.9K10H10.9n/achrII 14,514,333contains similarity to Vibrio vulnificus Conserved hypothetical protein.; TR:Q8D6Y7
25C08A9.6C08A9.6n/achrX 17,095,336contains similarity to Pfam domain PF03353 DUF278 contains similarity to Interpro domain IPR005020 (Protein of unknown function DUF278)
26srg-5T12A2.11n/achrIII 6,263,078C. elegans SRG-5 protein; contains similarity to Pfam domain PF02118 C.elegans Srg family integral membrane protein contains similarity to Interpro domain IPR000609 (Serpentine gamma receptor, Caenorhabditis species)
27C36C5.4C36C5.4n/achrV 3,167,003contains similarity to Pfam domain PF01579 Domain of unknown function DUF19 contains similarity to Interpro domains IPR016638 (Uncharacterised conserved protein UPF0376), IPR002542 (Protein of unknown function DUF19)
28Y39A1A.8Y39A1A.8n/achrIII 10,627,062contains similarity to Pfam domain PF03083 MtN3/saliva family contains similarity to Interpro domain IPR004316 (MtN3 and saliva related transmembrane protein)
29sre-4T13F2.5n/achrIV 9,782,834C. elegans SRE-4 protein; contains similarity to Pfam domain PF03125 C. elegans Sre G protein-coupled chemoreceptor contains similarity to Interpro domain IPR004151 (C. elegans Sre G protein-coupled chemoreceptor)
30ceh-16C13G5.1n/achrIII 8,624,237ceh-16 encodes a homeodomain protein orthologous to Drosophila and vertebrate Engrailed proteins involved in segment and appendage development; ceh-16 is an essential gene required for proper specification and differentiation of the lateral seam cells during embryonic development; in specifying seam cell fates, CEH-16 appears to act as a transcriptional regulator, repressing expression of the eff-1 gene required for cell fusion and inducing expression of seam cell-specific genes such as elt-5/GATA, nhr-73, and nhr-74; a rescuing CEH-16::GFP fusion protein is first expressed in the early embryo in cells of the AB lineage; in later embryonic stages CEH-16::GFP is seen in all lateral seam cell nuclei as well as in some anterior neurons; during postembryonic development, CEH-16::GFP is expressed in the DA1 and DD1 motorneurons.
31ZC239.2ZC239.2n/achrII 3,218,443contains similarity to Pfam domain PF02214 K+ channel tetramerisation domain contains similarity to Interpro domains IPR011333 (BTB/POZ fold), IPR003131 (Potassium channel, voltage dependent, Kv, tetramerisation)
32F16G10.4F16G10.4n/achrII 2,369,673contains similarity to Pfam domain PF02343 Domain of unknown function DUF130 contains similarity to Interpro domains IPR003326 (Protein of unknown function DUF130), IPR002371 (Flagellar hook-associated protein)
33T22D1.6T22D1.6n/achrIV 6,899,771
34C17B7.10C17B7.10n/achrV 3,341,460C17B7.10 encodes a neprilysin; neprilysins are thermolysin-like zinc metallopeptidases, found on the outer surface of animal cells, that negatively regulate small signalling peptides (e.g., enkephalin, tachykinin, insulin, and natriuretic peptides) by cleaving them; C17B7.10 has no clear orthologs in other organisms.
35srab-18T11A5.3n/achrV 9,870,635C. elegans SRAB-18 protein; contains similarity to Interpro domain IPR002184 (Serpentine beta receptor)
36F58G11.4F58G11.4n/achrV 13,674,239contains similarity to Pfam domain PF07690 Major Facilitator Superfamily contains similarity to Interpro domains IPR011701 (Major facilitator superfamily MFS-1), IPR016196 (MFS general substrate transporter)
37C06B3.1C06B3.1n/achrV 13,903,319contains similarity to Pfam domain PF01461 7TM chemoreceptor contains similarity to Interpro domains IPR008365 (Prostanoid receptor), IPR003002 (7TM chemoreceptor, subfamily 1)
38Y51B9A.6Y51B9A.6n/achrII 9,401,875contains similarity to Pfam domain PF07690 Major Facilitator Superfamily contains similarity to Interpro domains IPR007114 (Major facilitator superfamily), IPR011701 (Major facilitator superfamily MFS-1), IPR016196 (MFS general substrate transporter)
39dhs-27C04F6.5n/achrX 3,415,914dhs-27 encodes a short-chain dehydrogenase predicted to be mitochondrial.
40ZC416.2ZC416.2n/achrIV 3,634,511n/a
41stdh-2F11A5.12n/achrV 16,224,881stdh-2 encodes a putative steroid dehydrogenase required for normally short lifespan; STDH-2 is orthologous to human HSD17B3 (OMIM:605573, mutated in pseudohermaphroditism), HSD17B12 (OMIM:609574), and HSDL1, and paralogous to LET-767, STDH-1, and STDH-3/-4.
42F38E9.4F38E9.4n/achrX 16,452,168
43flp-27C25H3.5n/achrII 5,681,799C. elegans FLP-27 protein ;
44twk-16F52E4.4n/achrX 3,083,226C. elegans TWK-16 protein; contains similarity to Pfam domain PF07885 Ion channel contains similarity to Interpro domains IPR003280 (Potassium channel, two pore-domain), IPR000694 (Proline-rich region), IPR013099 (Ion transport 2), IPR003092 (Potassium channel, two pore-domain, TASK)
45C11G6.3C11G6.3n/achrX 16,343,288contains similarity to Pfam domain PF00628 PHD-finger contains similarity to Interpro domains IPR001965 (Zinc finger, PHD-type), IPR000956 (Stathmin), IPR013083 (Zinc finger, RING/FYVE/PHD-type), IPR003026 (Transcription factor Otx1, C-terminal), IPR000533 (Tropomyosin), IPR011011 (Zinc finger, FYVE/PHD-type)
46T10E10.3T10E10.3n/achrX 6,313,109contains similarity to Interpro domains IPR017452 (GPCR, rhodopsin-like superfamily), IPR000276 (GPCR, rhodopsin-like)
47C17H1.5C17H1.5n/achrI 13,115,023contains similarity to Mus musculus Inner centromere protein.; SW:Q9WU62
48AH10.2AH10.2n/achrV 14,157,204contains similarity to Plasmodium falciparum RIFIN.; TR:Q8I211
49clec-243Y68A4B.1n/achrV 17,248,138C. elegans CLEC-243 protein; contains similarity to Pfam domain PF01764 Lipase (class 3) contains similarity to Interpro domains IPR002921 (Lipase, class 3), IPR008262 (Lipase, active site)
50ZK84.4ZK84.4n/achrII 6,008,570