UCSC C. elegans Gene Sorter
 
genome assembly search
sort by display output 
#
Name
WormBase
BLASTP
E-Value
Genome Position
Description
1fbxb-40M01D1.91.9999999999999998e-166chrII 1,049,413This gene encodes a protein containing an F-box, a motif predicted to mediate protein-protein interactions either with homologs of yeast Skp-1p or with other proteins; its encoded protein also contains a Pfam-B45 motif of presently unknown function.
2ugt-32F47C10.6n/achrV 3,842,918C. elegans UGT-32 protein; contains similarity to Pfam domain PF00201 UDP-glucoronosyl and UDP-glucosyl transferase contains similarity to Interpro domain IPR002213 (UDP-glucuronosyl/UDP-glucosyltransferase)
3nac-2R107.1n/achrIII 9,040,048nac-2 encodes a high affinity sodium-coupled citrate transporter that is orthologous to the mammalian citrate transporter NaCT and is one of four C. elegans proteins related to Drosophila Indy; when expressed in a heterologous system, NAC-2 exhibits high affinity sodium/citrate and sodium/succinate cotransporter activity, although the transport rate for citrate is much higher than that for succinate; nac-2::gfp reporter fusions are expressed in the intestine, from early larval stages through adulthood; the effects of nac-2(RNAi) are variable, with reports of a 19% increase in lifespan accompanied by decreased body size and fat content in affected animals and reports of no apparent decrease in average lifespan.
4sri-1F36G9.8n/achrV 15,966,916C. elegans SRI-1 protein; contains similarity to Pfam domain PF01461 7TM chemoreceptor contains similarity to Interpro domains IPR003002 (7TM chemoreceptor, subfamily 1), IPR002208 (SecY protein)
5srj-57T03D3.14n/achrV 2,854,982C. elegans SRJ-57 protein; contains similarity to Pfam domain PF01461 7TM chemoreceptor contains similarity to Interpro domain IPR003002 (7TM chemoreceptor, subfamily 1)
6srh-182ZK228.5n/achrV 18,472,715C. elegans SRH-182 protein; contains similarity to Pfam domain PF01461 7TM chemoreceptor contains similarity to Interpro domain IPR003002 (7TM chemoreceptor, subfamily 1)
7fbxb-51K05F6.33e-26chrII 1,552,094C. elegans FBXB-51 protein; contains similarity to Pfam domain PF07735 F-box associated contains similarity to Interpro domain IPR012885 (F-box associated type 2)
8T26E4.5T26E4.5n/achrV 15,787,827contains similarity to Interpro domain IPR008996 ()
9knl-2K06A5.4n/achrI 6,462,350C. elegans KNL-2 protein; contains similarity to Pfam domain PF09133 SANTA (SANT Associated) contains similarity to Interpro domain IPR015216 (SANT associated)
10Y43C5A.4Y43C5A.4n/achrIV 10,278,717contains similarity to Interpro domain IPR000694 (Proline-rich region)
11C44C10.7C44C10.7n/achrX 11,687,559contains similarity to Pfam domain PF00069 Protein kinase domain contains similarity to Interpro domains IPR017441 (Protein kinase ATP binding, conserved site), IPR002290 (Serine/threonine protein kinase), IPR011009 (Protein kinase-like), IPR000719 (Protein kinase, core), IPR001245 (Tyrosine protein kinase), IPR017442 (Serine/threonine protein kinase-related)
12srj-49T03D3.12n/achrV 2,847,294C. elegans SRJ-49 protein; contains similarity to Pfam domain PF01461 7TM chemoreceptor contains similarity to Interpro domain IPR003002 (7TM chemoreceptor, subfamily 1)
13Y57A10C.8Y57A10C.8n/achrII 12,428,881contains similarity to Pfam domain PF01748 Caenorhabditis serpentine receptor-like protein contains similarity to Interpro domains IPR017452 (GPCR, rhodopsin-like superfamily), IPR002651 (Protein of unknown function DUF32), IPR002355 (Multicopper oxidase, copper-binding site)
14his-5F45F2.3n/achrV 8,535,370his-5 encodes an H4 histone.
15F46F3.3F46F3.3n/achrV 11,668,418contains similarity to Dictyostelium discoideum Hypothetical protein.; TR:Q86J27
16Y70D2A.1Y70D2A.1n/achrX 14,922,327contains similarity to Pfam domain PF00001 7 transmembrane receptor (rhodopsin family) contains similarity to Interpro domains IPR017452 (GPCR, rhodopsin-like superfamily), IPR008365 (Prostanoid receptor), IPR000276 (GPCR, rhodopsin-like)
17C14A6.8C14A6.8n/achrV 18,170,317contains similarity to Gallus gallus Cellular tumor antigen p53 (Tumor suppressor p53).; SW:P53_CHICK
18his-45B0035.10n/achrIV 11,326,794his-45 encodes an H3 histone.
19T01G6.10T01G6.10n/achrV 502,683contains similarity to Pfam domains PF01370 (NAD dependent epimerase/dehydratase family) , PF00106 (short chain dehydrogenase) contains similarity to Interpro domains IPR002424 (Insect alcohol dehydrogenase family), IPR001509 (NAD-dependent epimerase/dehydratase), IPR003560 (2,3-dihydro-2,3-dihydroxybenzoate dehydrogenase), IPR002347 (Glucose/ribitol dehydrogenase), IPR002198 (Short-chain dehydrogenase/reductase SDR), IPR016040 (NAD(P)-binding), IPR001100 (Pyridine nucleotide-disulphide oxidoreductase, class I)
20str-102R08H2.13n/achrV 15,385,819C. elegans STR-102 protein; contains similarity to Pfam domain PF01461 7TM chemoreceptor contains similarity to Interpro domain IPR003002 (7TM chemoreceptor, subfamily 1)
21F25E2.3F25E2.3n/achrX 812,150contains similarity to Pfam domain PF02551 Acyl-CoA thioesterase contains similarity to Interpro domain IPR003703 (Acyl-CoA thioesterase)
22sdz-31T11A5.5n/achrV 9,880,568C. elegans SDZ-31 protein; contains similarity to Interpro domains IPR001376 (Gliadin, alpha/beta), IPR000896 (Hemocyanin, copper-containing)
23C01G12.5C01G12.5n/achrII 14,586,920contains similarity to Pfam domain PF00106 short chain dehydrogenase contains similarity to Interpro domains IPR002424 (Insect alcohol dehydrogenase family), IPR003560 (2,3-dihydro-2,3-dihydroxybenzoate dehydrogenase), IPR002347 (Glucose/ribitol dehydrogenase), IPR002198 (Short-chain dehydrogenase/reductase SDR), IPR016040 (NAD(P)-binding)
24fbxb-9C08F8.5n/achrIV 11,161,021This gene encodes a protein containing an F-box, a motif predicted to mediate protein-protein interactions either with homologs of yeast Skp-1p or with other proteins; its encoded protein also contains a Pfam-B45 motif of presently unknown function.
25cyp-34A6B0213.11n/achrV 3,959,699C. elegans CYP-34A6 protein; contains similarity to Pfam domain PF00067 Cytochrome P450 contains similarity to Interpro domains IPR001128 (Cytochrome P450), IPR002401 (Cytochrome P450, E-class, group I), IPR002403 (Cytochrome P450, E-class, group IV)
26F35A5.5F35A5.5n/achrX 3,794,638contains similarity to Interpro domains IPR000694 (Proline-rich region), IPR000976 (Wilm's tumour protein)
27ZK1055.4ZK1055.4n/achrV 6,586,468contains similarity to Pfam domain PF03314 Protein of unknown function, DUF273 contains similarity to Interpro domain IPR004988 (Protein of unknown function DUF273)
28tag-81T14G12.2n/achrX 3,730,613C. elegans TAG-81 protein; contains similarity to Interpro domain IPR000727 (Target SNARE coiled-coil region)
29kin-30M01B2.1n/achrV 15,246,214kin-30 encodes a predicted tyrosine kinase; kin-30 is expressed during larval stages, but has not been detected in adults; the expression of kin-30 was experimentally verified by RT-PCR.
30R57.2R57.2n/achrX 298,212contains similarity to Pfam domain PF01682 DB module contains similarity to Interpro domain IPR002602 (Protein of unknown function DB)
31ZK1307.9ZK1307.9n/achrII 9,650,113contains similarity to Pfam domain PF04502 Family of unknown function (DUF572) contains similarity to Interpro domain IPR007590 (Protein of unknown function DUF572)
32cdh-3ZK112.7n/achrIII 7,747,815cdh-3 encodes a member of the cadherin superfamily that affects morphogenesis of tail epithelia and excretory function; expressed predominantly in developing epithelial cells, and also expressed in the AC, excretory cell, various neurons, and vulval cells during different stages of development.
33egl-38C04G2.7n/achrIV 10,108,695The egl-38 gene encodes a Pax5 homolog.
34Y102A5C.27Y102A5C.27n/achrV 16,988,446contains similarity to Pfam domains PF00104 (Ligand-binding domain of nuclear hormone receptor) , PF00105 (Zinc finger, C4 type (two domains)) contains similarity to Interpro domains IPR008946 (Nuclear hormone receptor, ligand-binding), IPR013088 (Zinc finger, NHR/GATA-type), IPR001628 (Zinc finger, nuclear hormone receptor-type), IPR000536 (Nuclear hormone receptor, ligand-binding, core)
35F55H12.3F55H12.3n/achrI 8,884,703contains similarity to Pfam domains PF00008 (EGF-like domain) (5), PF07645 (Calcium binding EGF domain) , PF07699 (GCC2 and GCC3) (3), PF07974 (EGF-like domain) (5), PF00057 (Low-density lipoprotein receptor domain class A) , PF02494 (HYR domain) , PF00084 (Sushi domain (SCR repeat)) (2)contains similarity to Interpro domains IPR000483 (Cysteine-rich flanking region, C-terminal), IPR000742 (EGF-like, type 3), IPR003410 (Hyalin), IPR000436 (Sushi/SCR/CCP), IPR006209 (EGF-like), IPR000152 (Aspartic acid and asparagine hydroxylation site), IPR006210 (EGF), IPR002049 (EGF-like, laminin), IPR002172 (Low density lipoprotein-receptor, class A, cysteine-rich), IPR011641 (GCC2 and GCC3), IPR016187 (C-type lectin fold), IPR001881 (EGF-like calcium-binding), IPR016060 (Complement control module), IPR009030 (Growth factor, receptor), IPR016186 (C-type lectin-like), IPR013032 (EGF-like region, conserved site), IPR001304 (C-type lectin), IPR013111 (EGF, extracellular), IPR013091 (EGF calcium-binding), IPR008985 (Concanavalin A-like lectin/glucanase)
36mab-7ZC13.4n/achrX 895,155mab-7 encodes a protein with a hydrophobic type II transmembrane region at the N-terminus, an EGF-like motif, a ShKT motif and a long C-terminus; mab-7 is involved in morphogenesis of the male tail, specifically affecting the structural cells, neuronal processes and the hypodermal sheath of the sensory rays, as such, it affects mating in males; a mab-7 promoter-gfp construct is expressed in hypodermis, body seam, ray structural cells, and several neurons in the head and tail region.
37K02H11.4K02H11.4n/achrV 1,529,803contains similarity to Pfam domain PF01697 Domain of unknown function contains similarity to Interpro domains IPR008167 (Protein of unknown function DUF23, C-terminal), IPR008166 (Protein of unknown function DUF23)
38daf-10F23B2.4n/achrIV 9,141,552daf-10 encodes a WD- and WAA-repeat containing protein that is the C. elegans ortholog of intraflagellar transport (IFT) complex A component IFT122; daf-10 activity is required for intraflagellar transport and thus for proper development of amphid and phasmid neurons, dauer development, chemotaxis, and normal lifespan; a DAF-10::GFP fusion protein undergoes both anterograde and retrograde intraflagellar transport in amphid or phasmid sensory neurons.
39T21E12.2T21E12.2n/achrI 4,414,499contains similarity to Interpro domain IPR006162 (Phosphopantetheine attachment site)
40srd-69H04J21.2n/achrIII 2,364,601C. elegans SRD-69 protein; contains similarity to Pfam domain PF01461 7TM chemoreceptor contains similarity to Interpro domain IPR003002 (7TM chemoreceptor, subfamily 1)
41lev-8C35C5.5n/achrX 11,562,231lev-8 encodes a novel nicotinic acetylcholine receptor (nAChR) alpha subunit that is a member of the ACR-8 group of nAChR subunits; LEV-8 activity is required for normal rates of pharyngeal pumping and for fully wild-type responses (increased egg laying and body wall muscle contraction) to the nAChR agonist and antihelmintic levamisole; expression of a LEV-8::GFP reporter construct begins at the L1 larval stage and is detected in neurons, body wall and uterine muscle cells, and socket cells of the IL and OL mechanosensory neurons; expression in body wall muscles is strongest in the anterior, consistent with increased levamisole resistance of head, or anterior, muscles seen in lev-8 mutant animals.
42C06E1.11C06E1.11n/achrIII 8,615,394
43C32B5.9C32B5.9n/achrII 955,198
44F09B12.5F09B12.5n/achrX 15,086,421contains similarity to Pfam domain PF00057 Low-density lipoprotein receptor domain class A contains similarity to Interpro domain IPR002172 (Low density lipoprotein-receptor, class A, cysteine-rich)
45F35E8.9F35E8.9n/achrV 15,916,920contains similarity to Pfam domain PF01549 ShK domain-like contains similarity to Interpro domain IPR003582 (Metridin-like ShK toxin)
46F26F2.7F26F2.7n/achrV 20,581,046contains similarity to Pfam domain PF05346 Eukaryotic membrane protein family contains similarity to Interpro domain IPR008010 (Protein of unknown function DUF747, CMV receptor)
47fbxb-5F45C12.14n/achrII 1,721,873This gene encodes a protein containing an F-box, a motif predicted to mediate protein-protein interactions either with homologs of yeast Skp-1p or with other proteins; its encoded protein also contains a Pfam-B45 motif of presently unknown function.
48T03D8.7T03D8.7n/achrV 20,811,735contains similarity to Homo sapiens Uncharacterized protein ENSP00000381489; ENSEMBL:ENSP00000335483
49srxa-4F18E3.1n/achrV 7,421,068C. elegans SRXA-4 protein; contains similarity to Pfam domain PF03383 Caenorhabditis serpentine receptor-like protein, class xa contains similarity to Interpro domain IPR005047 (Protein of unknown function DUF286, G protein-coupled receptor-like putative Caenorhabditis species)
50F28C6.9F28C6.9n/achrII 8,609,707contains similarity to Homo sapiens Hypothetical protein KIAA0562; ENSEMBL:ENSP00000263739