UCSC C. elegans Gene Sorter
 
genome assembly search
sort by display output 
#
Name
WormBase
BLASTP
E-Value
Genome Position
Description
1Y38F1A.1Y38F1A.13e-139chrII 12,953,547contains similarity to Interpro domain IPR010149 ()
2C41G7.6C41G7.6n/achrI 9,526,981contains similarity to Paramecium tetraurelia Chromosome undetermined scaffold_96, whole genome shotgun sequence.; TR:A0EH68
3ZK354.7ZK354.7n/achrIV 5,302,598contains similarity to Pfam domain PF00635 MSP (Major sperm protein) domain contains similarity to Interpro domains IPR008962 (PapD-like), IPR000535 (Major sperm protein), IPR000533 (Tropomyosin)
4F31E8.5F31E8.5n/achrII 6,806,093
5tag-316T01B11.4n/achrIV 8,459,731C. elegans TAG-316 protein; contains similarity to Pfam domain PF00153 Mitochondrial carrier protein contains similarity to Interpro domains IPR002067 (Mitochondrial carrier protein), IPR002030 (Mitochondrial brown fat uncoupling protein), IPR001993 (Mitochondrial substrate carrier), IPR002113 (Adenine nucleotide translocator 1)
6C08F8.6C08F8.6n/achrIV 11,163,509contains similarity to Pfam domain PF00069 Protein kinase domain contains similarity to Interpro domains IPR017441 (Protein kinase ATP binding, conserved site), IPR002290 (Serine/threonine protein kinase), IPR011009 (Protein kinase-like), IPR008271 (Serine/threonine protein kinase, active site), IPR000719 (Protein kinase, core), IPR001245 (Tyrosine protein kinase), IPR017442 (Serine/threonine protein kinase-related)
7C01G12.8C01G12.8n/achrII 14,595,473contains similarity to Pfam domains PF00689 (Cation transporting ATPase, C-terminus) , PF00122 (E1-E2 ATPase) , PF00702 (haloacid dehalogenase-like hydrolase) , PF00690 (Cation transporter/ATPase, N-terminus) contains similarity to Interpro domains IPR005775 (ATPase, P-type cation exchange, alpha subunit, eukaryotic), IPR008250 (E1-E2 ATPase-associated region), IPR006069 (ATPase, P-type cation exchange, alpha subunit), IPR004014 (ATPase, P-type cation-transporter, N-terminal), IPR001757 (ATPase, P-type, K/Mg/Cd/Cu/Zn/Na/Ca/Na/H-transporter), IPR006068 (ATPase, P-type cation-transporter, C-terminal), IPR005834 (Haloacid dehalogenase-like hydrolase), IPR000695 (H+ transporting ATPase, proton pump)
8C34F11.2C34F11.2n/achrII 5,212,509
9C25A8.2C25A8.2n/achrIV 7,010,276contains similarity to Interpro domains IPR005819 (Histone H5), IPR000079 (High mobility group protein HMG14 and HMG17)
10F42C5.5F42C5.5n/achrIV 7,293,350contains similarity to Pfam domain PF00102 Protein-tyrosine phosphatase contains similarity to Interpro domains IPR003595 (Protein-tyrosine phosphatase, catalytic), IPR000242 (Protein-tyrosine phosphatase, receptor/non-receptor type)
11cyc-2.2ZC116.2n/achrV 12,611,951ZC116.2 encodes, along with E04A4.7, one of two C. elegans cytochrome c proteins; the product of ZC116.2 is predicted to function in the electron transport chain by transferring electrons from respiratory chain Complex III to Complex IV; RNAi screens indicate the ZC116.2 activity is required for embryonic development as well as for normal body size and rates of growth.
12Y106G6D.3Y106G6D.3n/achrI 10,113,137contains similarity to Ensis minor Nuclear protein.; TR:Q24898
13AH6.3AH6.3n/achrII 9,519,577contains similarity to Interpro domains IPR005819 (Histone H5), IPR001946 (Adrenergic receptor, alpha-2A)
14T21G5.4T21G5.4n/achrI 6,873,167contains similarity to Interpro domain IPR001478 (PDZ/DHR/GLGF)
15F47B3.5F47B3.5n/achrI 3,963,648contains similarity to Pfam domain PF03057 Protein of unknown function contains similarity to Interpro domains IPR004296 (Protein of unknown function DUF236), IPR005398 (Tubby, N-terminal)
16F13G11.2F13G11.2n/achrIV 14,633,712contains similarity to Rattus norvegicus Chondroadherin precursor (Cartilage leucine-rich protein).; SW:CHAD_RAT
17C43F9.6C43F9.6n/achrIV 10,591,935contains similarity to Pfam domain PF00287 Sodium / potassium ATPase beta chain contains similarity to Interpro domain IPR000402 (ATPase, P-type cation exchange, beta subunit)
18T02E1.7T02E1.7n/achrI 8,209,741contains similarity to Pfam domain PF02077 SURF4 family contains similarity to Interpro domains IPR002995 (Surfeit locus 4), IPR011592 (Surfeit locus 4-related)
19F10G8.1F10G8.1n/achrI 10,020,359contains similarity to Pfam domain PF00102 Protein-tyrosine phosphatase contains similarity to Interpro domains IPR003595 (Protein-tyrosine phosphatase, catalytic), IPR016130 (Protein-tyrosine phosphatase, active site), IPR000242 (Protein-tyrosine phosphatase, receptor/non-receptor type), IPR000387 (Protein-tyrosine phosphatase), IPR000340 (Protein-tyrosine phosphatase, dual specificity)
20F40H6.1F40H6.1n/achrIII 6,057,696
21F42G4.6F42G4.6n/achrII 13,079,994F42G4.6 encodes a nematode-specific sperm protein; F42G4.6 has no obvious non-nematode homologs, but does have a putative central coiled-coil domain, and is is paralogous to four other C. elegans proteins (B0207.11, F42G4.6, F44F4.10, T08G11.2, and Y81G3A.1); F42G4.6(RNAi) animals exhibit aldicarb resistance; F42G4.6 expression is enriched in spermatogenesis.
22W03D8.9W03D8.9n/achrI 2,785,349contains similarity to Pfam domain PF05884 Caenorhabditis elegans protein of unknown function (DUF856) contains similarity to Interpro domains IPR001991 (Sodium:dicarboxylate symporter), IPR008574 (Protein of unknown function DUF856, Caenorhabditis species)
23M7.7M7.7n/achrIV 11,090,870contains similarity to Pfam domain PF00069 Protein kinase domain contains similarity to Interpro domains IPR002290 (Serine/threonine protein kinase), IPR011009 (Protein kinase-like), IPR000719 (Protein kinase, core), IPR001245 (Tyrosine protein kinase), IPR017442 (Serine/threonine protein kinase-related)
24F58A6.5F58A6.5n/achrII 5,147,698contains similarity to Pfam domain PF05884 Caenorhabditis elegans protein of unknown function (DUF856) contains similarity to Interpro domain IPR008574 (Protein of unknown function DUF856, Caenorhabditis species)
25C10H11.7C10H11.7n/achrI 4,720,444contains similarity to Pfam domain PF00635 MSP (Major sperm protein) domain contains similarity to Interpro domains IPR008962 (PapD-like), IPR000535 (Major sperm protein)
26T04F3.3T04F3.3n/achrV 11,759,725contains similarity to Pfam domain PF00102 Protein-tyrosine phosphatase contains similarity to Interpro domains IPR003595 (Protein-tyrosine phosphatase, catalytic), IPR000242 (Protein-tyrosine phosphatase, receptor/non-receptor type), IPR000387 (Protein-tyrosine phosphatase)
27R03D7.5R03D7.5n/achrII 10,948,319contains similarity to Pfam domain PF00069 Protein kinase domain contains similarity to Interpro domains IPR002290 (Serine/threonine protein kinase), IPR011009 (Protein kinase-like), IPR008271 (Serine/threonine protein kinase, active site), IPR000719 (Protein kinase, core), IPR001245 (Tyrosine protein kinase), IPR017442 (Serine/threonine protein kinase-related)
28M70.1M70.1n/achrIV 2,249,128contains similarity to Pfam domain PF02206 Domain of unknown function contains similarity to Interpro domains IPR003004 (Bacterial general secretion pathway protein F), IPR003125 (Protein of unknown function WSN)
29Y81G3A.1Y81G3A.1n/achrII 13,082,998Y81G3A.1 encodes a nematode-specific sperm protein; Y81G3A.1 has no obvious non-nematode homologs, but does have a putative central coiled-coil domain, and is is paralogous to four other C. elegans proteins (B0207.11, F42G4.6, F44F4.10, and T08G11.2); Y81G3A.1(RNAi) animals exhibit aldicarb resistance; Y81G3A.1 expression is enriched in spermatogenesis.
30E03H12.7E03H12.7n/achrIV 4,988,167contains similarity to Danio rerio Protein FAM133.; SW:A1A5I1
31ZK930.7ZK930.7n/achrII 11,914,880contains similarity to Homo sapiens Mucin; TR:Q14851
32T21E12.5T21E12.5n/achrI 4,412,759
33K07A1.5K07A1.5n/achrI 9,591,179contains similarity to Pfam domain PF03057 Protein of unknown function contains similarity to Interpro domains IPR004296 (Protein of unknown function DUF236), IPR001859 (Ribosomal protein P2), IPR003060 (Pyocin S killer protein)
34spe-17ZK617.3n/achrIV 12,013,717C. elegans SPE-17 protein ;
35C04G2.5C04G2.5n/achrIV 10,094,710contains similarity to Arabidopsis thaliana Putative auxin-induced protein.; TR:Q9SKP3
36exl-1F26H11.5n/achrII 14,412,734exl-1 encodes a putative chloride intracellular channel (CLIC) paralogous to EXC-4; transgenic EXL-1 can partially rescue the exc-4(rh133) mutant phenotype when its expression is driven with an exc-4 promoter; EXL-1 is localized to lysosomes in intestinal cells and coelomocytes, endoplasmic reticulum in coelomocytes, Golgi apparatus in muscle and the neurons PVD and CAN, plasma membrane in muscle arms, and to dense bodies linking muscle cytoskeleton to hypodermis through muscle cell membranes; EXL-1 has an N-terminal PTM domain required for its membrane targeting, and a C-terminal domain resembling omega-type glutathione-S-transferases; EXL-1 has no known function in vivo, and exl-1(ok857) mutants have no obvious phenotype.
37F33D11.7F33D11.7n/achrI 5,850,957contains similarity to Pfam domain PF00069 Protein kinase domain contains similarity to Interpro domains IPR002290 (Serine/threonine protein kinase), IPR011009 (Protein kinase-like), IPR000719 (Protein kinase, core), IPR001245 (Tyrosine protein kinase), IPR017442 (Serine/threonine protein kinase-related)
38Y106G6H.13Y106G6H.13n/achrI 10,471,577contains similarity to Bacillus cereus Hypothetical membrane spanning protein.; TR:Q813N7
39C14A6.6C14A6.6n/achrV 18,166,242contains similarity to Saccharomyces cerevisiae involved intracellular protein transport, coiled-coil protein necessary for protein transport from ER to Golgi; SGD:YDL058W
40C08F11.10C08F11.10n/achrIV 13,648,607contains similarity to Bacteroides thetaiotaomicron TPR-repeat-containing protein.; TR:Q8A5L6
41ZK1248.5ZK1248.5n/achrII 5,811,119contains similarity to Pfam domain PF06852 Protein of unknown function (DUF1248) contains similarity to Interpro domains IPR001940 (Peptidase S1C, HrtA/DegP2/Q/S), IPR009658 (Protein of unknown function DUF1248)
42K09C6.8K09C6.8n/achrV 841,718contains similarity to Interpro domains IPR002290 (Serine/threonine protein kinase), IPR011009 (Protein kinase-like), IPR000719 (Protein kinase, core)
43F36H12.9F36H12.9n/achrIV 5,257,678contains similarity to Pfam domain PF00069 Protein kinase domain contains similarity to Interpro domains IPR017441 (Protein kinase ATP binding, conserved site), IPR002290 (Serine/threonine protein kinase), IPR011009 (Protein kinase-like), IPR000719 (Protein kinase, core), IPR001245 (Tyrosine protein kinase), IPR017442 (Serine/threonine protein kinase-related)
44C18A3.7C18A3.7n/achrII 5,730,004contains similarity to Homo sapiens Isoform 1 of Arginine/serine-rich coiled-coil protein 1; ENSEMBL:ENSP00000295930
45B0252.5B0252.5n/achrII 6,917,923
46F58H1.6F58H1.6n/achrV 11,943,743contains similarity to Interpro domains IPR000742 (EGF-like, type 3), IPR013032 (EGF-like region, conserved site)
47C33F10.12C33F10.12n/achrII 4,837,006contains similarity to Pfam domain PF00153 Mitochondrial carrier protein contains similarity to Interpro domains IPR002067 (Mitochondrial carrier protein), IPR001993 (Mitochondrial substrate carrier), IPR000802 (Arsenical pump membrane protein), IPR002113 (Adenine nucleotide translocator 1)
48cyn-2ZK520.5n/achrIII 13,693,091cyn-2 is a predicted member of the cytosolic Cyclosporin A-binding cyclophilin family that is functional when expressed in E. coli.
49C47E8.1C47E8.1n/achrV 14,666,582
50Y106G6G.4Y106G6G.4n/achrI 10,322,489contains similarity to Equine herpesvirus 1 Glycoprotein X precursor.; SW:P28968