UCSC C. elegans Gene Sorter
 
genome assembly search
sort by display output 
#
Name
WormBase
BLASTP
E-Value
Genome Position
Description
1B0547.2B0547.21e-31chrIV 5,646,017
2D1022.5D1022.5n/achrII 7,458,058
3T26E4.5T26E4.5n/achrV 15,787,827contains similarity to Interpro domain IPR008996 ()
4C16H3.1C16H3.1n/achrX 17,618,555contains similarity to Pfam domain PF00036 EF hand contains similarity to Interpro domains IPR001125 (Recoverin), IPR011992 (EF-Hand type), IPR002048 (Calcium-binding EF-hand)
5M04F3.5M04F3.5n/achrI 4,775,768contains similarity to Pfam domain PF08397 IRSp53/MIM homology domain contains similarity to Interpro domain IPR013606 (IRSp53/MIM homology domain (IMD))
6F09G8.7F09G8.7n/achrIII 8,268,070
7D1044.6D1044.6n/achrIII 5,539,373contains similarity to Drosophila melanogaster Flybase gene name is CG2839-PA;; FLYBASE:CG2839
8vps-33.1B0303.9n/achrIII 8,702,024C. elegans VPS-33.1 protein; contains similarity to Pfam domain PF00995 Sec1 family contains similarity to Interpro domain IPR001619 (Sec1-like protein)
9B0361.7B0361.7n/achrIII 7,284,829contains similarity to Pfam domain PF00328 Histidine acid phosphatase contains similarity to Interpro domain IPR000560 (Histidine acid phosphatase)
10srbc-21C45H4.7n/achrV 2,156,083C. elegans SRBC-21 protein; contains similarity to Pfam domain PF01748 Caenorhabditis serpentine receptor-like protein contains similarity to Interpro domains IPR002651 (Protein of unknown function DUF32), IPR001118 (Na+/H+ exchanger, isoform 3 (NHE3))
11C18B2.2C18B2.2n/achrX 3,625,928contains similarity to Pfam domain PF04590 Protein of unknown function, DUF595 contains similarity to Interpro domain IPR007669 (Protein of unknown function DUF595)
12K12B6.6K12B6.6n/achrV 6,294,114
13srt-62T27C10.2n/achrI 10,900,411C. elegans SRT-62 protein; contains similarity to Pfam domain PF01748 Caenorhabditis serpentine receptor-like protein contains similarity to Interpro domain IPR002651 (Protein of unknown function DUF32)
14R09D1.3R09D1.3n/achrII 9,439,305contains similarity to Pfam domain PF00704 Glycosyl hydrolases family 18 contains similarity to Interpro domains IPR011583 (Chitinase II), IPR017853 (Glycoside hydrolase, catalytic core), IPR001223 (Glycoside hydrolase, family 18, catalytic domain), IPR013781 (Glycoside hydrolase, subgroup, catalytic core)
15F20E11.7F20E11.7n/achrV 17,465,622contains similarity to Pfam domain PF03436 Domain of unknown function (DUF281) contains similarity to Interpro domains IPR005098 (Protein of unknown function DUF281), IPR006662 (Thioredoxin-related)
16ZC373.4ZC373.4n/achrX 10,066,060contains similarity to Pfam domain PF00069 Protein kinase domain contains similarity to Interpro domains IPR017441 (Protein kinase ATP binding, conserved site), IPR002290 (Serine/threonine protein kinase), IPR011009 (Protein kinase-like), IPR008271 (Serine/threonine protein kinase, active site), IPR000719 (Protein kinase, core), IPR001245 (Tyrosine protein kinase), IPR017442 (Serine/threonine protein kinase-related)
17srb-12F58A6.10n/achrII 5,153,860C. elegans SRB-12 protein; contains similarity to Pfam domains PF02117 (C.elegans Sra family integral membrane protein) , PF02175 (C.elegans integral membrane protein Srb) contains similarity to Interpro domains IPR002184 (Serpentine beta receptor), IPR000344 (Nematode chemoreceptor, Sra)
18T11F8.2T11F8.2n/achrIV 5,477,982
19F58E1.7F58E1.7n/achrII 1,678,353contains similarity to Pfam domain PF01030 Receptor L domain contains similarity to Interpro domain IPR000494 (EGF receptor, L domain)
20clec-214C50E3.1n/achrV 7,611,567C. elegans CLEC-214 protein; contains similarity to Interpro domains IPR016187 (C-type lectin fold), IPR016186 (C-type lectin-like)
21M4.1M4.1n/achrIV 3,215,716contains similarity to Pfam domain PF00498 FHA domain contains similarity to Interpro domains IPR008984 (SMAD/FHA domain), IPR009053 (Prefoldin), IPR000253 (Forkhead-associated)
22T10B11.6T10B11.6n/achrI 6,944,267contains similarity to Pfam domain PF05705 Eukaryotic protein of unknown function (DUF829) contains similarity to Interpro domain IPR008547 (Protein of unknown function DUF829, eukaryotic)
23F01G10.4F01G10.4n/achrIV 10,231,754contains similarity to Interpro domain IPR008376 (Synembryn)
24srh-36T03D3.4n/achrV 2,820,623C. elegans SRH-36 protein; contains similarity to Pfam domain PF01461 7TM chemoreceptor contains similarity to Interpro domain IPR003002 (7TM chemoreceptor, subfamily 1)
25srg-62C24B9.12n/achrV 2,741,420C. elegans SRG-62 protein; contains similarity to Interpro domain IPR000609 (Serpentine gamma receptor, Caenorhabditis species)
26R106.1R106.1n/achrX 17,479,990
27K11H12.6K11H12.6n/achrIV 667,977
28sra-11F44F4.13n/achrII 10,909,485sra-11 encodes an orphan, G protein-coupled seven-transmembrane receptor; SRA-11 is expressed in three classes of interneurons, AIA, AIY, and AVB throughout larval and adult stages, and analysis of sra-11 mutations indicates that sra-11 activity in AIY is essential for olfactory imprinting; sra-11 expression in AIY is positively regulated by the TTX-3 and CEH-23 homeodomain proteins, with TTX-3 required for both initiation and maintenance of expression and CEH-23 required solely for maintenance.
29gpa-11C16A11.1n/achrII 4,254,160gpa-11 encodes a member of the G protein alpha subunit family of heterotrimeric GTPases; it is expressed in ADL and ASH amphid neurons.
30T21D9.2T21D9.2n/achrX 2,095,709contains similarity to Interpro domain IPR008075 (Lipocalin-1 receptor)
31dsc-1C18B12.3n/achrX 15,032,922C. elegans DSC-1 protein; contains similarity to Pfam domain PF00046 Homeobox domain contains similarity to Interpro domains IPR012287 (Homeodomain-related), IPR001356 (Homeobox), IPR009057 (Homeodomain-like)
32ZC477.4ZC477.4n/achrIV 7,098,647
33R03H10.2R03H10.2n/achrII 4,161,532
34B0284.4B0284.4n/achrIII 4,386,243contains similarity to Homo sapiens similar to forkhead-associated (FHA) phosphopeptide binding domain 1; ENSEMBL:ENSP00000318812
35C18D4.3C18D4.3n/achrV 17,532,536contains similarity to Acetobacter diazotrophicus FixX.; TR:Q9FA07
36B0416.2B0416.2n/achrX 9,299,586
37D1046.4D1046.4n/achrIV 8,935,680contains similarity to Pfam domain PF07690 Major Facilitator Superfamily contains similarity to Interpro domains IPR011701 (Major facilitator superfamily MFS-1), IPR016196 (MFS general substrate transporter)
38rab-39D2013.1n/achrII 9,322,411rab-39 encodes a small, monomeric Rab GTPase that is most closely related to the human and Drosophila Rab39 GTPases; by homology, RAB-39 is predicted to function as a membrane-associated GTPase required for intracellular vesicular trafficking and for regulation of endo- and exocytosis; however, as loss of rab-39 function via RNA-mediated interference (RNAi) does not result in any obvious abnormalities, the precise role of RAB-39 in C. elegans development and/or behavior is not yet known.
39nas-10K09C8.3n/achrX 10,962,779nas-10 encodes an astacin-like metalloprotease.
40K07G5.3K07G5.3n/achrI 7,163,733contains similarity to Pfam domain PF00168 C2 domain contains similarity to Interpro domains IPR008973 (C2 calcium/lipid-binding region, CaLB), IPR000008 (C2 calcium-dependent membrane targeting)
41F54F3.4F54F3.4n/achrV 12,923,361contains similarity to Pfam domain PF00106 short chain dehydrogenase contains similarity to Interpro domains IPR003560 (2,3-dihydro-2,3-dihydroxybenzoate dehydrogenase), IPR002347 (Glucose/ribitol dehydrogenase), IPR002198 (Short-chain dehydrogenase/reductase SDR), IPR016040 (NAD(P)-binding)
42fbxa-88F10A3.2n/achrV 16,142,535This gene encodes a protein containing an F-box, a motif predicted to mediate protein-protein interactions either with homologs of yeast Skp-1p or with other proteins; this gene's encoded protein also contains an FTH/DUF38 motif, which may also mediate protein-protein interaction.
43srx-44T10C6.4n/achrV 16,021,667C. elegans SRX-44 protein ; contains similarity to Rattus norvegicus Blue-sensitive opsin (BOP) (Blue cone photoreceptor pigment) (Shortswavelength-sensitive cone opsin) (S opsin).; SW:Q63652
44F14H3.4F14H3.4n/achrV 16,054,667contains similarity to Interpro domain IPR000215 (Protease inhibitor I4, serpin)
45C54C8.5C54C8.5n/achrI 12,454,277contains similarity to Pfam domain PF03360 Glycosyltransferase family 43 contains similarity to Interpro domain IPR005027 (Glycosyl transferase, family 43)
46M04B2.2M04B2.2n/achrIV 11,529,284contains similarity to Pfam domains PF01170 (Putative RNA methylase family UPF0020) , PF02926 (THUMP domain) contains similarity to Interpro domains IPR004114 (THUMP), IPR001091 (Site-specific DNA-methyltransferase (cytosine-N4-specific)), IPR000241 (Putative RNA methylase)
47srh-3K04F1.5n/achrV 1,683,835C. elegans SRH-3 protein; contains similarity to Pfam domain PF01461 7TM chemoreceptor contains similarity to Interpro domains IPR003002 (7TM chemoreceptor, subfamily 1), IPR001024 (Lipoxygenase, LH2)
48C48C5.1C48C5.1n/achrX 8,982,602contains similarity to Pfam domain PF00001 7 transmembrane receptor (rhodopsin family) contains similarity to Interpro domains IPR017452 (GPCR, rhodopsin-like superfamily), IPR002286 (P2 purinoceptor), IPR005390 (Neuromedin U receptor), IPR000276 (GPCR, rhodopsin-like)
49srx-10R10D12.4n/achrV 13,945,845C. elegans SRX-10 protein; contains similarity to Pfam domain PF08560 Protein of unknown function (DUF1757) contains similarity to Interpro domain IPR013869 (Protein of unknown function DUF1757)
50B0348.2B0348.2n/achrV 46,173contains similarity to Interpro domain IPR006629 (LPS-induced tumor necrosis factor alpha factor)