UCSC C. elegans Gene Sorter
 
genome assembly search
sort by display output 
#
Name
WormBase
BLASTP
E-Value
Genome Position
Description
1ttr-9C33A12.152e-85chrIV 9,505,947C. elegans TTR-9 protein; contains similarity to Pfam domain PF01060 Transthyretin-like family contains similarity to Interpro domain IPR001534 (Transthyretin-like)
2K06H7.8K06H7.8n/achrIII 8,097,370contains similarity to Pfam domain PF00069 Protein kinase domain contains similarity to Interpro domains IPR002290 (Serine/threonine protein kinase), IPR011009 (Protein kinase-like), IPR000719 (Protein kinase, core), IPR001245 (Tyrosine protein kinase), IPR017442 (Serine/threonine protein kinase-related)
3Y106G6G.1Y106G6G.1n/achrI 10,329,688contains similarity to Plasmodium falciparum Hypothetical protein.; TR:Q8I4Z6
4Y57G11C.6Y57G11C.6n/achrIV 14,759,618contains similarity to Pfam domain PF00102 Protein-tyrosine phosphatase contains similarity to Interpro domains IPR003595 (Protein-tyrosine phosphatase, catalytic), IPR000242 (Protein-tyrosine phosphatase, receptor/non-receptor type), IPR000387 (Protein-tyrosine phosphatase)
5K05F1.8K05F1.8n/achrII 5,799,460
6B0511.11B0511.11n/achrI 10,649,379
7B0218.7B0218.7n/achrIV 8,165,316
8T19D12.5T19D12.5n/achrII 6,635,499contains similarity to Pfam domain PF00069 Protein kinase domain contains similarity to Interpro domains IPR017441 (Protein kinase ATP binding, conserved site), IPR002290 (Serine/threonine protein kinase), IPR011009 (Protein kinase-like), IPR008271 (Serine/threonine protein kinase, active site), IPR000719 (Protein kinase, core), IPR001245 (Tyrosine protein kinase), IPR017442 (Serine/threonine protein kinase-related)
9Y45F10B.8Y45F10B.8n/achrIV 13,577,771contains similarity to Pfam domain PF00097 Zinc finger, C3HC4 type (RING finger) contains similarity to Interpro domains IPR001841 (Zinc finger, RING-type), IPR013083 (Zinc finger, RING/FYVE/PHD-type), IPR000533 (Tropomyosin)
10col-53M01A12.1n/achrI 5,645,857C. elegans COL-53 protein; contains similarity to Pfam domain PF01391 Collagen triple helix repeat (20 copies) contains similarity to Interpro domains IPR008161 (Collagen helix repeat), IPR008160 (Collagen triple helix repeat)
11ZK84.2ZK84.2n/achrII 6,015,055
12K02F6.2K02F6.2n/achrII 2,552,853contains similarity to Interpro domains IPR002110 (Ankyrin), IPR001357 (BRCT)
13C50D2.3C50D2.3n/achrII 106,848contains similarity to Pfam domain PF00595 PDZ domain (Also known as DHR or GLGF) contains similarity to Interpro domain IPR001478 (PDZ/DHR/GLGF)
14ZC581.2ZC581.2n/achrI 6,656,611contains similarity to Pfam domain PF00069 Protein kinase domain contains similarity to Interpro domains IPR017441 (Protein kinase ATP binding, conserved site), IPR002290 (Serine/threonine protein kinase), IPR011009 (Protein kinase-like), IPR008271 (Serine/threonine protein kinase, active site), IPR000719 (Protein kinase, core), IPR001245 (Tyrosine protein kinase), IPR017442 (Serine/threonine protein kinase-related)
15C28C12.1C28C12.1n/achrIV 8,502,192contains similarity to Interpro domain IPR002217 (Lipoprotein LPP20)
16Y57G7A.5Y57G7A.5n/achrII 1,274,377
17C32E12.1C32E12.1n/achrI 5,234,144contains similarity to Interpro domain IPR005819 (Histone H5)
18B0334.10B0334.10n/achrII 11,518,945contains similarity to Vaccinia virus TB17L.; TR:Q9JF36
19C24A11.1C24A11.1n/achrI 5,402,352
20C08F8.4C08F8.4n/achrIV 11,158,277contains similarity to Pfam domain PF03062 MBOAT family contains similarity to Interpro domain IPR004299 (Membrane bound O-acyl transferase, MBOAT)
21C52E4.7C52E4.7n/achrV 11,995,047C52E4.7 encodes a member of the histidine phosphatase superfamily orthologous to Bombyx mori ecdysteroid phosphate phosphatase (EPP), human STS1 (OMIM:609201) and human UBASH3A (OMIM:605736); C52E4.7 is also paralogous to C. elegans F09C12.8, F53B6.7, F55A11.11, and T07F12.1; while no explicit prediction has been made for C52E4.7's activity, it might be catalytically inactive; as loss of C52E4.7 activity results in no obvious defects, the precise role of C52E4.7 in C. elegans development and/or behavior is not yet known.
22kin-5T13H10.1n/achrIV 9,968,114kin-5 encodes a predicted protein tyrosine kinase that is most closely related to the non-receptor tyrosine kinases Fes/Fps and Fer that contain an SH2 domain and a tyrosine kinase domain (OMIM:190030, murine Fes appears to be required for hemopoietic homeostasis); as loss of kin-5 activity via large-scale RNAi screens does not result in any obvious abnormalities, the precise role of kin-5 in C. elegans development and/or behavior is not yet known.
23ZK930.4ZK930.4n/achrII 11,908,092contains similarity to Homo sapiens Similar to hypothetical protein FLJ20094; ENSEMBL:ENSP00000324274
24B0218.5B0218.5n/achrIV 8,155,831contains similarity to Pfam domain PF00069 Protein kinase domain contains similarity to Interpro domains IPR017441 (Protein kinase ATP binding, conserved site), IPR002290 (Serine/threonine protein kinase), IPR001245 (Tyrosine protein kinase), IPR017442 (Serine/threonine protein kinase-related), IPR011009 (Protein kinase-like), IPR000719 (Protein kinase, core)
25dlc-6Y106G6G.3n/achrI 10,323,861dlc-6 encodes a putative dynein light chain 1; DLC-6 is orthologous to human DYNLL1 (OMIM:601562) and DYNLL2 (OMIM:608942), but much more divergent from them than its paralog DLC-1; DLC-6's other paralogs are DLC-2/-5; DLC-6 has no obvious function in mass RNAi assays.
26T04F3.3T04F3.3n/achrV 11,759,725contains similarity to Pfam domain PF00102 Protein-tyrosine phosphatase contains similarity to Interpro domains IPR003595 (Protein-tyrosine phosphatase, catalytic), IPR000242 (Protein-tyrosine phosphatase, receptor/non-receptor type), IPR000387 (Protein-tyrosine phosphatase)
27C27B7.6C27B7.6n/achrIV 8,904,670contains similarity to Pfam domain PF00149 Calcineurin-like phosphoesterase contains similarity to Interpro domains IPR000694 (Proline-rich region), IPR004843 (Metallophosphoesterase), IPR006186 (Serine/threonine-specific protein phosphatase and bis(5-nucleosyl)-tetraphosphatase)
28F20B6.1F20B6.1n/achrX 4,200,926contains similarity to Pfam domain PF00102 Protein-tyrosine phosphatase contains similarity to Interpro domains IPR003595 (Protein-tyrosine phosphatase, catalytic), IPR000242 (Protein-tyrosine phosphatase, receptor/non-receptor type), IPR000387 (Protein-tyrosine phosphatase)
29ech-3F43H9.1n/achrV 8,022,781C. elegans ECH-3 protein; contains similarity to Pfam domain PF00378 Enoyl-CoA hydratase/isomerase family contains similarity to Interpro domain IPR001753 (Crotonase, core)
30C09H10.9C09H10.9n/achrII 11,105,179
31R155.2R155.2n/achrIII 1,967,000contains similarity to Pfam domains PF02206 (Domain of unknown function) , PF00102 (Protein-tyrosine phosphatase) contains similarity to Interpro domains IPR003595 (Protein-tyrosine phosphatase, catalytic), IPR000242 (Protein-tyrosine phosphatase, receptor/non-receptor type), IPR013992 (Adenylate cyclase-associated CAP, N-terminal), IPR000387 (Protein-tyrosine phosphatase), IPR003125 (Protein of unknown function WSN)
32K07A12.5K07A12.5n/achrI 8,694,231contains similarity to Plasmodium falciparum Glutamic acid-rich protein precursor.; SW:GARP_PLAFF
33F54C8.1F54C8.1n/achrIII 9,440,304contains similarity to Pfam domains PF00725 (3-hydroxyacyl-CoA dehydrogenase, C-terminal domain) , PF02737 (3-hydroxyacyl-CoA dehydrogenase, NAD binding domain) contains similarity to Interpro domains IPR008927 (6-phosphogluconate dehydrogenase, C-terminal-like), IPR006108 (3-hydroxyacyl-CoA dehydrogenase, C-terminal), IPR013328 (Dehydrogenase, multihelical), IPR006176 (3-hydroxyacyl-CoA dehydrogenase, NAD binding), IPR006180 (3-hydroxyacyl-CoA dehydrogenase, conserved site), IPR016040 (NAD(P)-binding), IPR006036 (Potassium uptake protein TrkA)
34D2024.1D2024.1n/achrIV 7,248,474contains similarity to Pfam domain PF00069 Protein kinase domain contains similarity to Interpro domains IPR017441 (Protein kinase ATP binding, conserved site), IPR002290 (Serine/threonine protein kinase), IPR011009 (Protein kinase-like), IPR000719 (Protein kinase, core), IPR017442 (Serine/threonine protein kinase-related)
35Y51A2B.6Y51A2B.6n/achrV 18,393,120contains similarity to Interpro domain IPR003125 (Protein of unknown function WSN)
36F36H12.4F36H12.4n/achrIV 5,269,346
37T02E1.7T02E1.7n/achrI 8,209,741contains similarity to Pfam domain PF02077 SURF4 family contains similarity to Interpro domains IPR002995 (Surfeit locus 4), IPR011592 (Surfeit locus 4-related)
38F30F8.2F30F8.2n/achrI 7,829,032contains similarity to Pfam domains PF04960 (Glutaminase) , PF00023 (Ankyrin repeat) (3)contains similarity to Interpro domains IPR015868 (Glutaminase, core), IPR002110 (Ankyrin), IPR007043 (Glutaminase), IPR012338 (Beta-lactamase-type transpeptidase fold)
39abt-1C24F3.5n/achrIV 10,210,507abt-1 encodes a predicted ATP-binding cassette (ABC) transporter that is a member of the ABCA subfamily of transport proteins; ABT-1 is predicted to function as a transmembrane protein that couples energy to transport of various molecules across membranes, but as loss of abt-1 activity via RNAi results in no obvious defects, the precise role of abt-1 in C. elegans development and/or behavior is not yet known.
40C14A6.6C14A6.6n/achrV 18,166,242contains similarity to Saccharomyces cerevisiae involved intracellular protein transport, coiled-coil protein necessary for protein transport from ER to Golgi; SGD:YDL058W
41AH6.3AH6.3n/achrII 9,519,577contains similarity to Interpro domains IPR005819 (Histone H5), IPR001946 (Adrenergic receptor, alpha-2A)
42spe-15F47G6.4n/achrI 1,456,004spe-15 encodes an unconventional myosin, and is homologous to both Drosophila and mouse myosin VI; spe-15 was identified in screens for mutants that have defective spermatogenesis; spe-15 is required during the terminal stages of spermatogenesis for the asymmetric partitioning of organelles like the mitochondria and for the proper partitioning of specialized structures called the fibrous-body membranous organelles into the spermatid; mutant spe-15 spermatids contain actin filaments in contrast to wild-type which lack them; spe-15 is also required for the proper morphology and activation of the spermatid; the human gene MYOSIN VI (MYO6; OMIM:600970), when mutated leads to disease that affects hearing.
43K07A1.5K07A1.5n/achrI 9,591,179contains similarity to Pfam domain PF03057 Protein of unknown function contains similarity to Interpro domains IPR004296 (Protein of unknown function DUF236), IPR001859 (Ribosomal protein P2), IPR003060 (Pyocin S killer protein)
44ZK262.4ZK262.4n/achrV 18,424,010contains similarity to Arabidopsis thaliana Similarity to salt-inducible protein.; TR:Q9LVA2
45B0207.9B0207.9n/achrI 5,957,923
46C03B8.1C03B8.1n/achrIII 7,716,961
47C34D4.2C34D4.2n/achrIV 7,155,353contains similarity to Pfam domain PF00149 Calcineurin-like phosphoesterase contains similarity to Interpro domains IPR004843 (Metallophosphoesterase), IPR006186 (Serine/threonine-specific protein phosphatase and bis(5-nucleosyl)-tetraphosphatase)
48ent-3K02E11.1n/achrV 14,234,164C. elegans ENT-3 protein; contains similarity to Pfam domain PF01733 Nucleoside transporter contains similarity to Interpro domain IPR002259 (Delayed-early response protein/equilibrative nucleoside transporter)
49C08F8.6C08F8.6n/achrIV 11,163,509contains similarity to Pfam domain PF00069 Protein kinase domain contains similarity to Interpro domains IPR017441 (Protein kinase ATP binding, conserved site), IPR002290 (Serine/threonine protein kinase), IPR011009 (Protein kinase-like), IPR008271 (Serine/threonine protein kinase, active site), IPR000719 (Protein kinase, core), IPR001245 (Tyrosine protein kinase), IPR017442 (Serine/threonine protein kinase-related)
50C32D5.4C32D5.4n/achrII 6,322,171