UCSC C. elegans Gene Sorter
 
genome assembly search
sort by display output 
#
Name
WormBase
BLASTP
E-Value
Genome Position
Description
1C33F10.4C33F10.43e-169chrII 4,796,475
2nas-28F42A10.8n/achrIII 6,182,093C. elegans NAS-28 protein; contains similarity to Pfam domain PF01400 Astacin (Peptidase family M12A) contains similarity to Interpro domains IPR017050 (Peptidase M12A, astacin, nematode), IPR006025 (Peptidase M, neutral zinc metallopeptidases, zinc-binding site), IPR001506 (Peptidase M12A, astacin), IPR006026 (Peptidase, metallopeptidases), IPR000859 (CUB), IPR013032 (EGF-like region, conserved site)
3C54A12.3C54A12.3n/achrII 5,261,141
4srd-32T19H12.5n/achrV 4,867,995C. elegans SRD-32 protein; contains similarity to Pfam domain PF01461 7TM chemoreceptor contains similarity to Interpro domains IPR003002 (7TM chemoreceptor, subfamily 1), IPR003945 (NADH-plastoquinone oxidoreductase, chain 5)
5sod-4F55H2.1n/achrIII 9,499,079C. elegans SOD-4 protein; contains similarity to Pfam domain PF00080 Copper/zinc superoxide dismutase (SODC) contains similarity to Interpro domain IPR001424 (Superoxide dismutase, copper/zinc binding)
6lgc-6F17E9.8n/achrIV 8,341,064C. elegans LGC-6 protein; contains similarity to Pfam domain PF02931 Neurotransmitter-gated ion-channel ligand binding domain contains similarity to Interpro domains IPR006201 (Neurotransmitter-gated ion-channel), IPR006202 (Neurotransmitter-gated ion-channel ligand-binding)
7stdh-2F11A5.12n/achrV 16,224,881stdh-2 encodes a putative steroid dehydrogenase required for normally short lifespan; STDH-2 is orthologous to human HSD17B3 (OMIM:605573, mutated in pseudohermaphroditism), HSD17B12 (OMIM:609574), and HSDL1, and paralogous to LET-767, STDH-1, and STDH-3/-4.
8srh-227C35D6.2n/achrIV 16,343,304C. elegans SRH-227 protein; contains similarity to Pfam domain PF01461 7TM chemoreceptor contains similarity to Interpro domain IPR003002 (7TM chemoreceptor, subfamily 1)
9ZK688.3ZK688.3n/achrIII 7,894,068contains similarity to Pfam domain PF01557 Fumarylacetoacetate (FAA) hydrolase family contains similarity to Interpro domains IPR010916 (TonB box, conserved site), IPR011234 (Fumarylacetoacetase, C-terminal-related), IPR002529 (Fumarylacetoacetase, C-terminal-like)
10C08A9.6C08A9.6n/achrX 17,095,336contains similarity to Pfam domain PF03353 DUF278 contains similarity to Interpro domain IPR005020 (Protein of unknown function DUF278)
11ZC239.2ZC239.2n/achrII 3,218,443contains similarity to Pfam domain PF02214 K+ channel tetramerisation domain contains similarity to Interpro domains IPR011333 (BTB/POZ fold), IPR003131 (Potassium channel, voltage dependent, Kv, tetramerisation)
12srh-4K09D9.6n/achrV 4,011,203C. elegans SRH-4 protein; contains similarity to Pfam domain PF01461 7TM chemoreceptor contains similarity to Interpro domains IPR003002 (7TM chemoreceptor, subfamily 1), IPR000832 (GPCR, family 2, secretin-like)
13C44H9.2C44H9.2n/achrV 12,832,016contains similarity to Antirrhinum majus ACC synthase 2 (Fragment).; TR:Q9ZT10
14ZC416.2ZC416.2n/achrIV 3,634,511n/a
15Y39A1A.8Y39A1A.8n/achrIII 10,627,062contains similarity to Pfam domain PF03083 MtN3/saliva family contains similarity to Interpro domain IPR004316 (MtN3 and saliva related transmembrane protein)
16F14H3.9F14H3.9n/achrV 16,068,329contains similarity to Pfam domain PF03236 (Domain of unknown function DUF263)
17ZC53.2ZC53.2n/achrX 1,923,975
18dod-20B0554.6n/achrV 423,333C. elegans DOD-20 protein; contains similarity to Pfam domain PF03409 Protein of unknown function (DUF274) contains similarity to Interpro domain IPR005071 (Protein of unknown function DUF274)
19B0244.5B0244.5n/achrIII 5,745,987
20T28H10.1T28H10.1n/achrV 12,504,477contains similarity to Pfam domain PF01648 4'-phosphopantetheinyl transferase superfamily contains similarity to Interpro domain IPR008278 (4'-phosphopantetheinyl transferase)
21F18A12.3F18A12.3n/achrII 3,408,455F18A12.3 encodes a neprilysin; neprilysins are thermolysin-like zinc metallopeptidases, found on the outer surface of animal cells, that negatively regulate small signalling peptides (e.g., enkephalin, tachykinin, insulin, and natriuretic peptides) by cleaving them; F18A12.3 has no clear orthologs in other organisms.
22F39F10.5F39F10.5n/achrX 16,913,317
23C01B7.3C01B7.3n/achrV 8,783,769
24fut-2EGAP9.2n/achrV 6,574,873fut-2 encodes a unique alpha 1,2-fucosyltransferase specifically expressed in intestinal cells of larval and adult animals; recombinant FUT-2 expressed in human 293T cells exhibits a novel acceptor specificity profile compared with mammalian alpha 1,2-fucosyltransferases and the predicted protein shares very low amino acid identity with human alpha 1,2-fucosyltransferases, but its predicted type 2 topology and domain structure are typical of other glucosyltransferases.
25F46F5.15F46F5.15n/achrII 788,813
26sulp-5K12G11.2n/achrV 11,881,591sulp-5 encodes one of eight C. elegans members of the sulfate permease family of anion transporters; by homology, SULP-5 is predicted to function as an anion transporter that regulates cellular pH and volume via transmembrane movement of electrolytes and fluids; a SULP-5::GFP fusion is expressed in punctate structures irregularly distributed along the apical membrane of excretory cell canals and is also expressed weakly in adult seam cells.
27fut-4K12H6.3n/achrII 2,820,961fut-4 encodes a member of the glycosyltransferase 10 family.
28C09G9.5C09G9.5n/achrIV 8,887,547contains similarity to Interpro domain IPR008992 ()
29F19B10.6F19B10.6n/achrII 3,663,696
30ZC196.8ZC196.8n/achrV 8,721,706contains similarity to Pfam domain PF04789 Protein of unknown function (DUF621) contains similarity to Interpro domain IPR006874 (Protein of unknown function DUF621)
31nhr-188F47C10.7n/achrV 3,857,080C. elegans NHR-188 protein; contains similarity to Pfam domains PF00104 (Ligand-binding domain of nuclear hormone receptor) , PF00105 (Zinc finger, C4 type (two domains)) contains similarity to Interpro domains IPR008946 (Nuclear hormone receptor, ligand-binding), IPR000324 (Vitamin D receptor), IPR013088 (Zinc finger, NHR/GATA-type), IPR001628 (Zinc finger, nuclear hormone receptor-type), IPR000536 (Nuclear hormone receptor, ligand-binding, core)
32sre-20ZC455.7n/achrV 12,783,819C. elegans SRE-20 protein; contains similarity to Pfam domain PF03125 C. elegans Sre G protein-coupled chemoreceptor contains similarity to Interpro domains IPR004151 (C. elegans Sre G protein-coupled chemoreceptor), IPR008075 (Lipocalin-1 receptor)
33ZK757.1ZK757.1n/achrIII 9,869,795contains similarity to Pfam domain PF06681 Protein of unknown function (DUF1182) contains similarity to Interpro domains IPR000883 (Cytochrome c oxidase, subunit I), IPR010601 (Protein of unknown function DUF1182)
34ugt-6ZC455.4n/achrV 12,796,799C. elegans UGT-6 protein; contains similarity to Pfam domains PF04101 (Glycosyltransferase family 28 C-terminal domain) , PF00201 (UDP-glucoronosyl and UDP-glucosyl transferase) contains similarity to Interpro domains IPR002213 (UDP-glucuronosyl/UDP-glucosyltransferase), IPR007235 (Glycosyl transferase, family 28, C-terminal)
35T10E10.3T10E10.3n/achrX 6,313,109contains similarity to Interpro domains IPR017452 (GPCR, rhodopsin-like superfamily), IPR000276 (GPCR, rhodopsin-like)
36srz-58F31E9.5n/achrV 17,318,799C. elegans SRZ-58 protein; contains similarity to Pfam domain PF01748 Caenorhabditis serpentine receptor-like protein contains similarity to Interpro domain IPR002651 (Protein of unknown function DUF32)
37C12D5.4C12D5.4n/achrV 7,672,548
38C43H6.6C43H6.6n/achrX 2,397,074contains similarity to Pfam domains PF00059 (Lectin C-type domain) , PF00431 (CUB domain) contains similarity to Interpro domains IPR000859 (CUB), IPR016187 (C-type lectin fold), IPR016186 (C-type lectin-like), IPR001304 (C-type lectin)
39B0462.1B0462.1n/achrV 18,326,871contains similarity to Pfam domain PF05075 Protein of unknown function (DUF684) contains similarity to Interpro domain IPR007767 (Protein of unknown function DUF684)
40Y32B12A.5Y32B12A.5n/achrV 16,487,248contains similarity to Pfam domain PF04590 Protein of unknown function, DUF595 contains similarity to Interpro domain IPR007669 (Protein of unknown function DUF595)
41C07E3.5C07E3.5n/achrII 10,364,567contains similarity to Pfam domain PF04942 CC domain contains similarity to Interpro domain IPR007026 (Domian of unknown function, DUF-CC)
42ZK994.6ZK994.6n/achrV 8,503,564
43C10G11.6C10G11.6n/achrI 6,291,932
44F19B10.3F19B10.3n/achrII 3,664,939
45F48A9.2F48A9.2n/achrI 6,593,082
46gst-11R11G1.3n/achrX 3,633,139C. elegans GST-11 protein; contains similarity to Pfam domains PF00043 (Glutathione S-transferase, C-terminal domain) , PF02798 (Glutathione S-transferase, N-terminal domain) contains similarity to Interpro domains IPR012336 (Thioredoxin-like fold), IPR003080 (Glutathione S-transferase, alpha class), IPR012335 (Thioredoxin fold), IPR004046 (Glutathione S-transferase, C-terminal), IPR004045 (Glutathione S-transferase, N-terminal), IPR010987 (Glutathione S-transferase, C-terminal-like)
47M01G12.7M01G12.7n/achrI 12,115,167contains similarity to Arabidopsis thaliana Hypothetical protein.; TR:Q9LZ50
48srg-7C18F10.8n/achrIII 6,267,278C. elegans SRG-7 protein; contains similarity to Pfam domain PF02118 C.elegans Srg family integral membrane protein contains similarity to Interpro domain IPR000609 (Serpentine gamma receptor, Caenorhabditis species)
49rnt-1B0414.2n/achrI 5,782,356rnt-1 encodes a transcription factor that is the sole C. elegans member of the RUNX family of transcriptional regulators; rnt-1 activity is required for several developmental processes, including regulation of hypodermal seam cell proliferation and proper development of the male tail; RNT-1 can physically interact with SMA-4 and regulates, either directly or indirectly, expression of tlp-1 and cki-1, which encode a C2H2 zinc finger and CDK inhibitor, respectively; RNT-1::GFP reporter fusions are reportedly expressed in the nuclei of hypodermal seam cells, intestinal cells, body wall muscles, and, in males, cells derived from the V5, V6 and T lineages that give rise to the sensory rays.
50T16H12.1T16H12.1n/achrIII 10,084,745contains similarity to Human papillomavirus type 70 E7 protein.; SW:VE7_HPV70