UCSC C. elegans Gene Sorter
 
genome assembly search
sort by display output 
#
Name
WormBase
BLASTP
E-Value
Genome Position
Description
1spon-1F10E7.40chrII 7,118,495C. elegans SPON-1 protein; contains similarity to Pfam domains PF06468 (Spondin_N) , PF00090 (Thrombospondin type 1 domain) (5), PF00014 (Kunitz/Bovine pancreatic trypsin inhibitor domain) , PF02014 (Reeler domain) contains similarity to Interpro domains IPR000884 (Thrombospondin, type I), IPR002223 (Proteinase inhibitor I2, Kunitz metazoa), IPR003067 (Plasmodium circumsporozoite protein), IPR009465 (Spondin, N-terminal), IPR002861 (Reeler region)
2W04E12.7W04E12.7n/achrV 19,731,742contains similarity to Pfam domain PF06162 Caenorhabditis elegans protein of unknown function (DUF976) contains similarity to Interpro domains IPR010381 (Protein of unknown function DUF976, Caenorhabditis species), IPR016125 (Peptidase C15, pyroglutamyl peptidase I-like)
3M03B6.2M03B6.2n/achrX 13,855,038contains similarity to Pfam domain PF07690 Major Facilitator Superfamily contains similarity to Interpro domains IPR007114 (Major facilitator superfamily), IPR011701 (Major facilitator superfamily MFS-1), IPR002455 (GPCR, family 3, gamma-aminobutyric acid receptor, type B), IPR016196 (MFS general substrate transporter)
4K08E4.6K08E4.6n/achrIV 12,077,637contains similarity to Pfam domain PF01105 emp24/gp25L/p24 family/GOLD contains similarity to Interpro domains IPR009038 (GOLD), IPR000348 (emp24/gp25L/p24)
5lst-2R160.7n/achrX 4,380,673C. elegans LST-2 protein; contains similarity to Pfam domain PF01363 FYVE zinc finger contains similarity to Interpro domains IPR000306 (Zinc finger, FYVE-type), IPR013083 (Zinc finger, RING/FYVE/PHD-type), IPR017455 (Zinc finger, FYVE-related), IPR011011 (Zinc finger, FYVE/PHD-type)
6Y37D8A.10Y37D8A.10n/achrIII 12,875,275contains similarity to Pfam domain PF06703 Microsomal signal peptidase 25 kDa subunit (SPC25) contains similarity to Interpro domain IPR009582 (Microsomal signal peptidase 25 kDa subunit)
7C13C4.5C13C4.5n/achrV 12,116,190contains similarity to Pfam domain PF07690 Major Facilitator Superfamily contains similarity to Interpro domains IPR007114 (Major facilitator superfamily), IPR011701 (Major facilitator superfamily MFS-1), IPR016196 (MFS general substrate transporter)
8F53B6.5F53B6.5n/achrI 8,950,742contains similarity to Pfam domain PF00557 metallopeptidase family M24 contains similarity to Interpro domains IPR000994 (Peptidase M24, catalytic core), IPR011991 (Winged helix repressor DNA-binding)
9ari-1C27A12.8n/achrI 6,059,904C. elegans ARI-1 protein; contains similarity to Pfam domain PF01485 IBR domain contains similarity to Interpro domains IPR009060 (UBA-like), IPR002867 (Zinc finger, C6HC-type)
10mppb-1ZC410.2n/achrIV 9,075,567C. elegans MPPB-1 protein; contains similarity to Pfam domains PF00675 (Insulinase (Peptidase family M16)) , PF05193 (Peptidase M16 inactive domain) contains similarity to Interpro domains IPR001431 (Peptidase M16, zinc-binding site), IPR011765 (Peptidase M16, N-terminal), IPR011237 (Peptidase M16, core), IPR007863 (Peptidase M16, C-terminal), IPR011249 (Metalloenzyme, LuxS/M16 peptidase-like, metal-binding)
11fipr-15F13E9.3n/achrIV 10,880,611C. elegans FIPR-15 protein; contains similarity to Interpro domain IPR005137 (Photosystem I assembly BtpA)
12ptr-24F46G10.5n/achrX 13,345,071ptr-24 encodes a nematode-specific member of the sterol sensing domain (SSD) proteins, distantly paralogous to Drosophila PATCHED (PTC) and human PTCH (OMIM:601309, mutated in basal cell nevus syndrome); PTR-24 has no known function in vivo.
13ugt-28C10H11.4n/achrI 4,728,834C. elegans UGT-28 protein; contains similarity to Pfam domain PF00201 UDP-glucoronosyl and UDP-glucosyl transferase contains similarity to Interpro domain IPR002213 (UDP-glucuronosyl/UDP-glucosyltransferase)
14T08D10.3T08D10.3n/achrX 11,956,831contains similarity to Homo sapiens Hypothetical protein KIAA1681; ENSEMBL:ENSP00000316543
15F37H8.5F37H8.5n/achrII 11,188,743contains similarity to Pfam domain PF03227 Gamma interferon inducible lysosomal thiol reductase (GILT) contains similarity to Interpro domain IPR004911 (Gamma interferon inducible lysosomal thiol reductase GILT)
16F35C11.4F35C11.4n/achrII 8,250,751contains similarity to Homo sapiens Uncharacterized protein C9orf125; ENSEMBL:ENSP00000363980
17F55H12.2F55H12.2n/achrI 8,868,112contains similarity to Interpro domain IPR000242 (Tyrosine specific protein phosphatase)
18F22E12.1F22E12.10.0002chrV 10,455,572contains similarity to Pfam domain PF00014 Kunitz/Bovine pancreatic trypsin inhibitor domain contains similarity to Interpro domains IPR002223 (Proteinase inhibitor I2, Kunitz metazoa), IPR000694 (Proline-rich region)
19K03C7.3K03C7.3n/achrX 3,828,246
20F42E8.1F42E8.1n/achrV 13,063,254contains similarity to Campylobacter jejuni DNA polymerase III alpha subunit (EC 2.7.7.7).; SW:DP3A_CAMJE
21F18H3.4F18H3.4n/achrX 13,530,481contains similarity to Mus musculus GRIP1-associated protein 1 (GRASP-1) (HCMV-interacting protein).; SW:Q8VD04
22K02B12.3K02B12.3n/achrI 8,510,282contains similarity to Pfam domain PF00400 WD domain, G-beta repeat contains similarity to Interpro domains IPR011046 (WD40 repeat-like), IPR001680 (WD40 repeat), IPR015943 (WD40/YVTN repeat-like)
23C11E4.6C11E4.6n/achrX 9,613,728contains similarity to Pfam domains PF07647 (SAM domain (Sterile alpha motif)) , PF00640 (Phosphotyrosine interaction domain (PTB/PID)) , PF00023 (Ankyrin repeat) (5), PF00536 (SAM domain (Sterile alpha motif)) contains similarity to Interpro domains IPR010993 (Sterile alpha motif homology), IPR011993 (Pleckstrin homology-type), IPR002110 (Ankyrin), IPR013761 (Sterile alpha motif-type), IPR001660 (Sterile alpha motif SAM), IPR011510 (Sterile alpha motif homology 2), IPR006020 (Phosphotyrosine interaction region)
24eif-3.GF22B5.2n/achrII 8,443,436eif-3.G encodes a homolog of eukaryotic translation initiation factor 3, subunit 4 that affects embryonic viability, fertility, and growth.
25kin-3B0205.7n/achrI 10,735,304kin-3 encodes an ortholog of the catalytic subunit of casein kinase II alpha, which in Drosophila and mammals is required for normal circadian rhythms, and which directly phosphorylates the Drosophila PERIOD protein (which itself regulates circadian rhythms); by analogy, KIN-3 might be expected to help regulate heterochronic functions dependent on such proteins as LIN-42.
26F25B4.5F25B4.5n/achrV 5,680,736contains similarity to Interpro domain IPR003107 (RNA-processing protein, HAT helix)
27B0285.1B0285.1n/achrIII 4,336,901contains similarity to Pfam domain PF00069 Protein kinase domain contains similarity to Interpro domains IPR017441 (Protein kinase ATP binding, conserved site), IPR002290 (Serine/threonine protein kinase), IPR001245 (Tyrosine protein kinase), IPR017442 (Serine/threonine protein kinase-related), IPR011009 (Protein kinase-like), IPR008271 (Serine/threonine protein kinase, active site), IPR000719 (Protein kinase, core), IPR000694 (Proline-rich region)
28F16G10.7F16G10.7n/achrII 2,379,927contains similarity to Pfam domain PF02343 Domain of unknown function DUF130 contains similarity to Interpro domain IPR003326 (Protein of unknown function DUF130)
29lgc-39F09G2.5n/achrV 7,177,156C. elegans LGC-39 protein; contains similarity to Pfam domains PF02931 (Neurotransmitter-gated ion-channel ligand binding domain) , PF02932 (Neurotransmitter-gated ion-channel transmembrane region) contains similarity to Interpro domains IPR006028 (Gamma-aminobutyric acid A receptor), IPR006201 (Neurotransmitter-gated ion-channel), IPR006202 (Neurotransmitter-gated ion-channel ligand-binding), IPR006029 (Neurotransmitter-gated ion-channel transmembrane region)
30unc-116R05D3.7n/achrIII 8,353,130unc-116 encodes a kinesin-1 heavy chain orthologue; UNC-116 is predicted to function as an an anterograde microtubule-based motor and its activity is required for normal early translocation of the meiotic spindle to the oocyte cortex, cortical positioning of the meiosis II spindle, polar body formation, locomotion, and larval development; in regulating meiotic spindle translocation, UNC-116 may function as part of a complex containing the kinesin light chain KLC-2 and a novel cargo adaptor protein, KCA-1.
31H34C03.2H34C03.2n/achrIV 6,759,933contains similarity to Pfam domain PF00443 Ubiquitin carboxyl-terminal hydrolase contains similarity to Interpro domains IPR001394 (Peptidase C19, ubiquitin carboxyl-terminal hydrolase 2), IPR006615 (Ubiquitin carboxyl-terminal hydrolase, N-terminal region 1)
32ZK328.6ZK328.6n/achrIII 6,029,645contains similarity to Pfam domains PF02818 (PPAK motif) , PF00646 (F-box domain) contains similarity to Interpro domain IPR001810 (Cyclin-like F-box)
33W02B12.11W02B12.11n/achrII 11,474,835contains similarity to Pfam domain PF02709 Galactosyltransferase contains similarity to Interpro domain IPR003859 (Metazoa galactosyltransferase)
34pmp-1C44B7.8n/achrII 6,882,170pmp-1 encodes an ATP-binding cassette (ABC) transporter most closely related to the peroxisomal membrane proteins; pmp-1 activity is required for efficient RNA interference (RNAi) of a germline-expressed target, pop-1.
35C03F11.3C03F11.3n/achrX 5,399,097contains similarity to Pfam domain PF01130 CD36 family contains similarity to Interpro domain IPR002159 (CD36 antigen)
36C15B12.1C15B12.1n/achrX 6,477,878contains similarity to Pfam domain PF01266 FAD dependent oxidoreductase contains similarity to Interpro domains IPR006076 (FAD dependent oxidoreductase), IPR000447 (FAD-dependent glycerol-3-phosphate dehydrogenase), IPR016040 (NAD(P)-binding)
37C01F1.1C01F1.1n/achrII 4,303,435contains similarity to Pfam domain PF05793 Transcription initiation factor IIF, alpha subunit (TFIIF-alpha) contains similarity to Interpro domains IPR011991 (Winged helix repressor DNA-binding), IPR008851 (Transcription initiation factor IIF, alpha subunit), IPR011039 (Transcription Factor IIF, Rap30/Rap74, interaction)
38cyp-25A1C36A4.1n/achrIII 3,833,539C. elegans CYP-25A1 protein; contains similarity to Pfam domain PF00067 Cytochrome P450 contains similarity to Interpro domains IPR001128 (Cytochrome P450), IPR002401 (Cytochrome P450, E-class, group I), IPR002402 (Cytochrome P450, E-class, group II), IPR002403 (Cytochrome P450, E-class, group IV), IPR002397 (Cytochrome P450, B-class)
39C56C10.11C56C10.11n/achrII 6,599,683
40fce-1C04F12.10n/achrI 9,711,884fce-1 encodes an ortholog of 'farnesylated-proteins converting enzyme 1' (FACE-1), and thus probably enables post-translational processing of proteins (such as LET-60/RAS) carrying a C-terminal CaaX motif; FCE-1 protein probably accounts for the EDTA-sensitive, tosylphenylalanylchloromethane-insensitive component of CaaX-proteolytic activity in membrane extracts from C. elegans, and FCE-1 can cleave a farnesylated peptide in vitro; the S. cerevisiae homolog of FCE-1 (Ste24p) cleaves the precursor of yeast a-factor mating pheromone after its farnesylated cysteine residue, and transgenic FCE-1 rescues a mating defect of mutant yeast lacking both the Ste24p and the Rce1p CaaX-proteases.
41C30G12.4C30G12.4n/achrII 7,262,590contains similarity to Pfam domain PF02795 Domain of unknown function (DUF225) contains similarity to Interpro domain IPR004024 (Protein of unknown function DUF225)
42Y54G11A.4Y54G11A.4n/achrII 14,294,300contains similarity to Interpro domains IPR011990 (Tetratricopeptide-like helical), IPR003006 (Immunoglobulin/major histocompatibility complex, conserved site), IPR000023 (Phosphofructokinase)
43ubh-4C08B11.7n/achrII 8,038,864C. elegans UBH-4 protein; contains similarity to Pfam domain PF01088 Ubiquitin carboxyl-terminal hydrolase, family 1 contains similarity to Interpro domains IPR001578 (Peptidase C12, ubiquitin carboxyl-terminal hydrolase 1), IPR017390 (Ubiquitinyl hydrolase, UCH37 type)
44K02B12.7K02B12.7n/achrI 8,528,009contains similarity to Pfam domain PF01412 Putative GTPase activating protein for Arf contains similarity to Interpro domain IPR001164 (Arf GTPase activating protein)
45C01B10.10C01B10.10n/achrIV 6,626,165contains similarity to Pfam domain PF00135 Carboxylesterase contains similarity to Interpro domains IPR002410 (Peptidase S33, prolyl aminopeptidase), IPR002018 (Carboxylesterase, type B)
46Y17G7B.11Y17G7B.11n/achrII 12,061,387contains similarity to Pfam domains PF00339 (Arrestin (or S-antigen), N-terminal domain) , PF02752 (Arrestin (or S-antigen), C-terminal domain) contains similarity to Interpro domains IPR014756 (Immunoglobulin E-set), IPR011022 (Arrestin-like, C-terminal), IPR011021 (Arrestin-like, N-terminal)
47lgc-50T20B12.9n/achrIII 7,393,409C. elegans LGC-50 protein; contains similarity to Pfam domains PF02931 (Neurotransmitter-gated ion-channel ligand binding domain) , PF02932 (Neurotransmitter-gated ion-channel transmembrane region) contains similarity to Interpro domains IPR002289 (Gamma-aminobutyric-acid A receptor, beta subunit), IPR006028 (Gamma-aminobutyric acid A receptor), IPR006201 (Neurotransmitter-gated ion-channel), IPR006202 (Neurotransmitter-gated ion-channel ligand-binding), IPR006029 (Neurotransmitter-gated ion-channel transmembrane region)
48M03A8.3M03A8.3n/achrX 6,802,151n/a
49sel-1F45D3.5n/achrV 12,562,037sel-1 encodes two isoforms of a highly conserved transmembrane protein orthologous to human SEL1 (OMIM:602329) and Saccharomyces cerevisiae HRD3, a member of the HMG-CoA Reductase Degradation (HRD) complex that degrades malfolded endoplasmic reticulum (ER)-resident proteins; SEL-1 functions as a negative regulator of the LIN-12/GLP-1 Notch-like signaling pathway in C. elegans where it appears to function cell autonomously to regulate LIN-12 turnover; along with ABU-1, an ER-associated Type I transmembrane protein, SEL-1 may be a component of a cell survival pathway induced when unfolded proteins accumulate in the ER; SEL-1 is expressed throughout larval and adult stages of development, and detected in all tissues except the pharynx; within cells, SEL-1 appears to localize to intracellular vesicles, consistent with its proposed role in protein turnover.
50ark-1C01C7.1n/achrIV 12,626,527ark-1 encodes a homolog of the nonreceptor tyrosine kinase ACK which inhibits signalling through the EGF receptor homolog LET-23, both in (RAS-dependent) vulval development and in (RAS-independent) ovulation.