UCSC C. elegans Gene Sorter
 
genome assembly search
sort by display output 
#
Name
WormBase
BLASTP
E-Value
Genome Position
Description
1F23A7.1F23A7.15.0000000000000004e-29chrX 16,217,447contains similarity to Saccharomyces cerevisiae RSC4 is a member of RSC complex, which remodels the structure of chromatin.; SGD:YKR008W
2srx-21F31F4.4n/achrV 678,220C. elegans SRX-21 protein; contains similarity to Pfam domain PF03383 Caenorhabditis serpentine receptor-like protein, class xa contains similarity to Interpro domains IPR017452 (GPCR, rhodopsin-like superfamily), IPR005047 (Protein of unknown function DUF286, G protein-coupled receptor-like putative Caenorhabditis species)
3F22B7.3F22B7.3n/achrIII 8,649,167
4K12H4.6K12H4.6n/achrIII 8,042,653
5F46F5.14F46F5.14n/achrII 800,774contains similarity to Pfam domain PF03314 Protein of unknown function, DUF273 contains similarity to Interpro domain IPR004988 (Protein of unknown function DUF273)
6med-1T24D3.1n/achrX 12,430,862The med-1 gene encodes a GATA-type transcription factor that is an immediate target of maternal SKN-1, and that participates in specifying the mesendoderm.
7C10A4.3C10A4.3n/achrX 7,408,027
8C03H5.4C03H5.4n/achrII 375,541contains similarity to Pfam domain PF00068 Phospholipase A2 contains similarity to Interpro domains IPR016090 (Phospholipase A2), IPR001211 (Phospholipase A2, eukaryotic), IPR013090 (Phospholipase A2, active site)
9T19D7.7T19D7.7n/achrX 678,427contains similarity to Pfam domain PF00657 GDSL-like Lipase/Acylhydrolase contains similarity to Interpro domains IPR001087 (Lipase, GDSL), IPR013830 (Esterase, SGNH hydrolase-type)
10F58G1.7F58G1.7n/achrII 12,945,904contains similarity to Interpro domain IPR008075 (Lipocalin-1 receptor)
11F53A9.4F53A9.4n/achrX 8,705,694
12F08H9.4F08H9.4n/achrV 14,463,959F08H9.4 encodes a heat shock protein (HSP) of the HSP16 class; unlike most HSP16s in C. elegans, it is specifically expressed in a particular tissue (the excretory canal and ventral nerve-cord neurons), and its expression is only mildly induced by heat shock; however, F08H9.4 expression is increased by heat shock, is induced in a new tissue type (intestine) by heat shock, and probably aids heat shock resistance, since F08H9.4(RNAi) animals die as embryos in heat shock at a higher rate than normal; in general, HSP16 proteins are thought to act as passive ligands for unfolded proteins that keep them safe from aggregation until the proteins can be refolded by a large (ATP-consuming) HSP.
13C39D10.5C39D10.5n/achrX 7,891,348
14F49C5.7F49C5.7n/achrII 12,567,144contains similarity to Candida albicans Hyphal wall protein 1 (Cell elongation protein 2).; SW:HWP1_CANAL
15C16D9.3C16D9.3n/achrV 8,239,232
16nhr-30C25E10.1n/achrV 9,046,045C. elegans NHR-30 protein; contains similarity to Pfam domain PF00105 Zinc finger, C4 type (two domains) contains similarity to Interpro domains IPR008946 (Nuclear hormone receptor, ligand-binding), IPR000324 (Vitamin D receptor), IPR013088 (Zinc finger, NHR/GATA-type), IPR001628 (Zinc finger, nuclear hormone receptor-type), IPR000536 (Nuclear hormone receptor, ligand-binding, core)
17pqn-97ZK488.10n/achrV 609,465The protein product of this gene is predicted to contain a glutamine/asparagine (Q/N)-rich ('prion') domain, by the algorithm of Michelitsch and Weissman (as of the WS77 release of WormBase, i.e., in wormpep77).
18ZC373.2ZC373.2n/achrX 10,058,054contains similarity to Synechococcus elongatus Tll2335 protein.; TR:Q8DGI2
19M28.4M28.4n/achrII 10,645,246contains similarity to Homo sapiens Kinesin-like protein 2; ENSEMBL:ENSP00000324020
20F16B12.4F16B12.4n/achrX 14,097,334contains similarity to Dictyostelium discoideum Myosin II heavy chain, non muscle.; SW:MYS2_DICDI
21clec-264F31D4.4n/achrV 20,844,595C. elegans CLEC-264 protein; contains similarity to Pfam domains PF01466 (Skp1 family, dimerisation domain) , PF03931 (Skp1 family, tetramerisation domain) contains similarity to Interpro domains IPR001232 (SKP1 component), IPR016072 (SKP1 component, dimerisation), IPR011333 (BTB/POZ fold), IPR016073 (SKP1 component, POZ)
22fmo-2K08C7.5n/achrIV 10,683,426fmo-2 encodes a flavin-containing monoxygenase homologous to human FMO1, FMO2, and FMO3 (OMIM:602079, mutated in trimethylaminuria).
23F55E10.2F55E10.2n/achrX 8,340,780
24C55A1.6C55A1.6n/achrV 15,648,434contains similarity to Lactococcus lactis Protein maturation protein.; TR:Q9CEV9
25C34D1.4C34D1.4n/achrV 13,258,178
26B0222.2B0222.2n/achrV 9,136,662contains similarity to Pfam domain PF01384 Phosphate transporter family contains similarity to Interpro domain IPR001204 (Phosphate transporter)
27F08B4.4F08B4.4n/achrIV 8,679,036
28F32H2.6F32H2.6n/achrI 8,999,077contains similarity to Pfam domain PF00109 Beta-ketoacyl synthase, N-terminal domain contains similarity to Interpro domains IPR016038 (Thiolase-like, subgroup), IPR000794 (Beta-ketoacyl synthase), IPR014030 (Beta-ketoacyl synthase, N-terminal), IPR016039 (Thiolase-like)
29M01E10.3M01E10.3n/achrIII 2,054,148contains similarity to Interpro domain IPR016187 (C-type lectin fold)
30R03H10.5R03H10.5n/achrII 4,170,159contains similarity to Pfam domain PF02343 Domain of unknown function DUF130 contains similarity to Interpro domain IPR003326 (Protein of unknown function DUF130)
31T16A1.2T16A1.2n/achrII 2,096,988contains similarity to Pfam domain PF02206 Domain of unknown function contains similarity to Interpro domain IPR003125 (Protein of unknown function WSN)
32srg-14F26B1.6n/achrI 6,313,673C. elegans SRG-14 protein; contains similarity to Pfam domain PF02118 C.elegans Srg family integral membrane protein contains similarity to Interpro domain IPR000609 (Serpentine gamma receptor, Caenorhabditis species)
33D2062.1D2062.1n/achrII 2,632,264contains similarity to Pfam domain PF00188 SCP-like extracellular protein contains similarity to Interpro domains IPR014044 (SCP-like extracellular), IPR002413 (Ves allergen), IPR001283 (Allergen V5/Tpx-1 related)
34ZC168.2ZC168.2n/achrIV 10,728,759contains similarity to Pfam domain PF01147 Crustacean CHH/MIH/GIH neurohormone family contains similarity to Interpro domain IPR001166 (Crustacean neurohormone)
35fbxb-101Y63D3A.3n/achrI 14,088,963C. elegans FBXB-101 protein; contains similarity to Pfam domains PF07735 (F-box associated) , PF00646 (F-box domain) contains similarity to Interpro domains IPR001810 (Cyclin-like F-box), IPR012885 (F-box associated type 2)
36R10H10.4R10H10.4n/achrIV 10,394,780contains similarity to Arabidopsis thaliana T15B16.1 protein.; TR:Q9ZSH8
37C18H7.9C18H7.9n/achrIV 603,317contains similarity to Pfam domains PF08242 (Methyltransferase domain) , PF08241 (Methyltransferase domain) contains similarity to Interpro domains IPR013217 (Methyltransferase type 12), IPR013216 (Methyltransferase type 11)
38T23G4.2T23G4.2n/achrIV 13,688,527contains similarity to Interpro domain IPR001984 (Peptidase S16, Lon protease)
39F46B3.7F46B3.7n/achrV 20,613,776contains similarity to Pfam domain PF03380 Caenorhabditis protein of unknown function, DUF282 contains similarity to Interpro domain IPR005044 (Protein of unknown function DUF282, Caenorhabditis species)
40srh-258T06E6.7n/achrV 15,405,935C. elegans SRH-258 protein; contains similarity to Pfam domain PF01461 7TM chemoreceptor contains similarity to Interpro domains IPR000175 (Sodium:neurotransmitter symporter), IPR003002 (7TM chemoreceptor, subfamily 1)
41gst-8F11G11.1n/achrII 4,884,139gst-8 encodes a predicted glutathione S-transferase.
42T05B4.9T05B4.9n/achrV 4,117,993contains similarity to Pfam domain PF01549 ShK domain-like contains similarity to Interpro domain IPR003582 (Metridin-like ShK toxin)
43F40F11.4F40F11.4n/achrIV 11,590,249contains similarity to Interpro domains IPR000152 (Aspartic acid and asparagine hydroxylation site), IPR006210 (EGF), IPR001881 (EGF-like calcium-binding), IPR013032 (EGF-like region, conserved site)
44srh-100C46E10.10n/achrII 3,713,935C. elegans SRH-100 protein; contains similarity to Pfam domain PF01461 7TM chemoreceptor contains similarity to Interpro domain IPR003002 (7TM chemoreceptor, subfamily 1)
45C35A11.3C35A11.3n/achrV 5,374,943contains similarity to Homo sapiens Uncharacterized protein MUC5AC (Fragment); ENSEMBL:ENSP00000371671
46F28A10.8F28A10.8n/achrII 838,145contains similarity to Pfam domain PF03762 Vitelline membrane outer layer protein I (VOMI) contains similarity to Interpro domain IPR005515 (Vitelline membrane outer layer protein I (VOMI))
47F10G2.7F10G2.7n/achrV 7,335,453contains similarity to Pfam domain PF06852 Protein of unknown function (DUF1248) contains similarity to Interpro domain IPR009658 (Protein of unknown function DUF1248)
48str-106K05D4.2n/achrV 16,181,228C. elegans STR-106 protein; contains similarity to Pfam domain PF01461 7TM chemoreceptor contains similarity to Interpro domain IPR003002 (7TM chemoreceptor, subfamily 1)
49F55C9.11F55C9.11n/achrV 19,307,376This gene encodes a protein containing an F-box, a motif predicted to mediate protein-protein interactions either with homologs of yeast Skp-1p or with other proteins.
50T05F1.7T05F1.7n/achrI 9,640,961contains similarity to Paramecium tetraurelia Chromosome undetermined scaffold_33, whole genome shotgun sequence.; TR:A0D056