UCSC C. elegans Gene Sorter
 
genome assembly search
sort by display output 
#
Name
WormBase
BLASTP
E-Value
Genome Position
Description
1F36A4.2F36A4.27.999999999999999e-87chrIV 4,271,510contains similarity to Pfam domain PF05912 Caenorhabditis elegans protein of unknown function (DUF870) contains similarity to Interpro domain IPR008588 (Protein of unknown function DUF870, Caenorhabditis species)
2mab-9T27A1.6n/achrII 518,813mab-9 encodes a member of the T-box family of transcriptional regulators containing a 200-amino acid T-box DNA-binding domain most similar to mouse Brachyury; mab-9 is involved in hindgut and male tail development, specifically affecting the fate of two posterior blast cells in the hindgut, B and F; in the male this results in a grossly abnormal tail lacking spicules, and renders them incapable of mating; in the hermaphrodite this results in hindgut defects; mab-9 may also be part of a network of T-box genes that includes tbx-8, tbx-9 and vab-7 and is important for the correct patterning of posterior cells in the developing embryo; mab-9 affects movement to some extent though the basis for this defect is unknown; MAB-9 localizes to the nucleus of B and F and their descendents during development.
3B0273.1B0273.1n/achrIV 5,494,609
4T08H10.4T08H10.4n/achrV 4,480,975contains similarity to Pfam domain PF01757 Acyltransferase family contains similarity to Interpro domain IPR002656 (Acyltransferase 3)
5F47D12.7F47D12.7n/achrIII 6,294,525contains similarity to Pfam domains PF01344 (Kelch motif) (5), PF00651 (BTB/POZ domain) , PF07646 (Kelch motif) contains similarity to Interpro domains IPR011043 (Galactose oxidase/kelch, beta-propeller), IPR000210 (BTB/POZ-like), IPR006652 (Kelch repeat type 1), IPR011333 (BTB/POZ fold), IPR011498 (Kelch repeat type 2), IPR015916 (Galactose oxidase, beta-propeller), IPR013069 (BTB/POZ), IPR013089 (Kelch related), IPR006651 (Kelch), IPR015915 (Kelch-type beta propeller)
6R04B5.11R04B5.11n/achrV 10,090,998contains similarity to Homo sapiens Hypothetical protein; ENSEMBL:ENSP00000248104
7R13H9.5R13H9.5n/achrIV 5,066,321contains similarity to Pfam domain PF00069 Protein kinase domain contains similarity to Interpro domains IPR002290 (Serine/threonine protein kinase), IPR011009 (Protein kinase-like), IPR008271 (Serine/threonine protein kinase, active site), IPR000719 (Protein kinase, core), IPR001245 (Tyrosine protein kinase), IPR017442 (Serine/threonine protein kinase-related)
8F36A4.4F36A4.44e-38chrIV 4,267,908contains similarity to Pfam domain PF05912 Caenorhabditis elegans protein of unknown function (DUF870) contains similarity to Interpro domain IPR008588 (Protein of unknown function DUF870, Caenorhabditis species)
9ZC412.9ZC412.9n/achrV 14,881,691contains similarity to Tetrahymena thermophila Micronuclear linker histone polyprotein (MIC LH) [Contains:sMicronuclear linker histone-alpha; Micronuclear linker histone-beta;sMicronuclear linker histone-delta; Micronuclear linker histone-gamma].; SW:P40631
10Y6E2A.8Y6E2A.8n/achrV 15,725,749contains similarity to Encephalitozoon cuniculi UPF0329 protein ECU05_1680/ECU11_0050.; SW:Q8STA9
11ZC477.2ZC477.2n/achrIV 7,109,050contains similarity to Pfam domain PF00149 Calcineurin-like phosphoesterase contains similarity to Interpro domains IPR004843 (Metallophosphoesterase), IPR006186 (Serine/threonine-specific protein phosphatase and bis(5-nucleosyl)-tetraphosphatase)
12dct-9W03F11.3n/achrI 2,234,343C. elegans DCT-9 protein; contains similarity to Interpro domains IPR008962 (PapD-like), IPR000535 (Major sperm protein)
13F46F5.6F46F5.6n/achrII 814,673contains similarity to Interpro domain IPR000104 (Antifreeze protein, type I)
14M7.7M7.7n/achrIV 11,090,870contains similarity to Pfam domain PF00069 Protein kinase domain contains similarity to Interpro domains IPR002290 (Serine/threonine protein kinase), IPR011009 (Protein kinase-like), IPR000719 (Protein kinase, core), IPR001245 (Tyrosine protein kinase), IPR017442 (Serine/threonine protein kinase-related)
15W03D8.9W03D8.9n/achrI 2,785,349contains similarity to Pfam domain PF05884 Caenorhabditis elegans protein of unknown function (DUF856) contains similarity to Interpro domains IPR001991 (Sodium:dicarboxylate symporter), IPR008574 (Protein of unknown function DUF856, Caenorhabditis species)
16F13E9.5F13E9.5n/achrIV 10,883,638contains similarity to Helicobacter pylori;Helicobacter pylori J99 Hypothetical protein HP0031/JHP0027.; SW:Y031_HELPY
17W03D8.5W03D8.5n/achrI 2,817,203contains similarity to Pfam domain PF00635 MSP (Major sperm protein) domain contains similarity to Interpro domains IPR008962 (PapD-like), IPR000535 (Major sperm protein)
18Y81G3A.1Y81G3A.1n/achrII 13,082,998Y81G3A.1 encodes a nematode-specific sperm protein; Y81G3A.1 has no obvious non-nematode homologs, but does have a putative central coiled-coil domain, and is is paralogous to four other C. elegans proteins (B0207.11, F42G4.6, F44F4.10, and T08G11.2); Y81G3A.1(RNAi) animals exhibit aldicarb resistance; Y81G3A.1 expression is enriched in spermatogenesis.
19T22G5.1T22G5.1n/achrV 13,877,372contains similarity to Pfam domain PF03009 Glycerophosphoryl diester phosphodiesterase family contains similarity to Interpro domain IPR004129 (Glycerophosphoryl diester phosphodiesterase)
20Y51A2B.6Y51A2B.6n/achrV 18,393,120contains similarity to Interpro domain IPR003125 (Protein of unknown function WSN)
21F37A8.2F37A8.2n/achrIII 3,930,465contains similarity to Homo sapiens Protein transport protein Sec24B; ENSEMBL:ENSP00000265175
22W02A2.8W02A2.8n/achrIV 13,356,775
23abt-5Y53C10A.9n/achrI 12,014,962abt-5 encodes a predicted ATP-binding cassette (ABC) transporter that is a member of the ABCA subfamily of transport proteins; ABT-5 is predicted to function as a transmembrane protein that couples energy to transport of various molecules across membranes, but as loss of abt-5 activity via RNAi results in no obvious defects, the precise role of abt-5 in C. elegans development and/or behavior is not yet known; abt-5 promoter-gfp fusion proteins are expressed in larvae and adults in the intestine and in unidentified cells in the head.
24H12D21.2H12D21.2n/achrV 14,888,059contains similarity to Tetrahymena thermophila Micronuclear linker histone polyprotein (MIC LH) [Contains:sMicronuclear linker histone-alpha; Micronuclear linker histone-beta;sMicronuclear linker histone-delta; Micronuclear linker histone-gamma].; SW:P40631
25F35H10.2F35H10.2n/achrIV 8,329,510
26F59A6.2F59A6.2n/achrII 5,015,006contains similarity to Homo sapiens High mobility group protein 1-like 10; ENSEMBL:ENSP00000215935
27M162.7M162.7n/achrV 19,789,204contains similarity to Pfam domain PF02206 Domain of unknown function contains similarity to Interpro domain IPR003125 (Protein of unknown function WSN)
28F02E9.3F02E9.3n/achrI 8,405,244contains similarity to Saccharomyces cerevisiae Protein required for the decapping of mRNAs, functions to allow the production of active Dcp1p, contains a pyrophosphatase MutT motif and several alpha-helical leucine-rich motifs; SGD:YNL118C
29F23C8.7F23C8.7n/achrI 2,423,740contains similarity to Pfam domains PF07714 (Protein tyrosine kinase) , PF00069 (Protein kinase domain) , PF00017 (SH2 domain) contains similarity to Interpro domains IPR017441 (Protein kinase ATP binding, conserved site), IPR002290 (Serine/threonine protein kinase), IPR011009 (Protein kinase-like), IPR000719 (Protein kinase, core), IPR001245 (Tyrosine protein kinase), IPR017442 (Serine/threonine protein kinase-related), IPR000980 (SH2 motif), IPR008266 (Tyrosine protein kinase, active site)
30C17C3.5C17C3.5n/achrII 5,552,099contains similarity to Pfam domain PF01827 FTH domain contains similarity to Interpro domain IPR002900 (Protein of unknown function DUF38, Caenorhabditis species)
31clec-129W10G11.15n/achrII 3,572,181C. elegans CLEC-129 protein; contains similarity to Pfam domain PF00059 Lectin C-type domain contains similarity to Interpro domains IPR016187 (C-type lectin fold), IPR016186 (C-type lectin-like), IPR001304 (C-type lectin)
32K07A12.5K07A12.5n/achrI 8,694,231contains similarity to Plasmodium falciparum Glutamic acid-rich protein precursor.; SW:GARP_PLAFF
33F49E11.7F49E11.7n/achrIV 13,054,029contains similarity to Pfam domain PF00149 Calcineurin-like phosphoesterase contains similarity to Interpro domains IPR004843 (Metallophosphoesterase), IPR006186 (Serine/threonine-specific protein phosphatase and bis(5-nucleosyl)-tetraphosphatase)
34R02F2.5R02F2.5n/achrIII 5,479,799contains similarity to Interpro domains IPR003267 (Small proline-rich), IPR000694 (Proline-rich region)
35F43G9.8F43G9.8n/achrI 8,618,137contains similarity to Dugesia japonica DjFGFR1.; TR:Q8MY86
36fbxa-196T05H4.2n/achrV 6,449,403This gene encodes a protein containing an F-box, a motif predicted to mediate protein-protein interactions either with homologs of yeast Skp-1p or with other proteins; this gene's encoded protein also contains an FTH/DUF38 motif, which may also mediate protein-protein interaction.
37F46F5.9F46F5.9n/achrII 822,679contains similarity to Interpro domain IPR000104 (Antifreeze protein, type I)
38F36H12.4F36H12.4n/achrIV 5,269,346
39F57B9.8F57B9.8n/achrIII 6,934,439contains similarity to Pfam domains PF07714 (Protein tyrosine kinase) , PF00069 (Protein kinase domain) , PF00017 (SH2 domain) contains similarity to Interpro domains IPR017441 (Protein kinase ATP binding, conserved site), IPR002290 (Serine/threonine protein kinase), IPR011009 (Protein kinase-like), IPR000719 (Protein kinase, core), IPR001245 (Tyrosine protein kinase), IPR017442 (Serine/threonine protein kinase-related), IPR000980 (SH2 motif), IPR008266 (Tyrosine protein kinase, active site)
40Y18D10A.21Y18D10A.21n/achrI 12,930,221contains similarity to Watermelon silver mottle virus L protein.; TR:Q9DSQ1
41T15H9.4T15H9.4n/achrII 9,612,560contains similarity to Interpro domains IPR002951 (Atrophin), IPR001478 (PDZ/DHR/GLGF)
42W01B6.8W01B6.8n/achrIV 10,083,904contains similarity to Xenopus laevis Nuclear/mitotic apparatus protein.; TR:P70012
43B0207.9B0207.9n/achrI 5,957,923
44tag-212T14D7.3n/achrII 8,859,305C. elegans TAG-212 protein; contains similarity to Pfam domain PF00957 Synaptobrevin contains similarity to Interpro domain IPR001388 (Synaptobrevin)
45Y54E2A.9Y54E2A.9n/achrII 14,785,517contains similarity to Pfam domain PF03762 Vitelline membrane outer layer protein I (VOMI) contains similarity to Interpro domain IPR005515 (Vitelline membrane outer layer protein I (VOMI))
46R13F6.5R13F6.5n/achrIII 6,848,166contains similarity to Pfam domain PF01529 DHHC zinc finger domain contains similarity to Interpro domain IPR001594 (Zinc finger, DHHC-type)
47T28D9.9T28D9.9n/achrII 6,484,502
48ZK930.4ZK930.4n/achrII 11,908,092contains similarity to Homo sapiens Similar to hypothetical protein FLJ20094; ENSEMBL:ENSP00000324274
49clec-134W10G11.11n/achrII 3,580,752C. elegans CLEC-134 protein; contains similarity to Pfam domain PF08277 PAN-like domain contains similarity to Interpro domains IPR006583 (CW), IPR016187 (C-type lectin fold), IPR016186 (C-type lectin-like), IPR001304 (C-type lectin)
50F10E9.2F10E9.2n/achrIII 8,313,421contains similarity to Interpro domain IPR001841 (Zinc finger, RING-type)