UCSC C. elegans Gene Sorter
 
genome assembly search
sort by display output 
#
Name
WormBase
BLASTP
E-Value
Genome Position
Description
1F59A1.6F59A1.63.9999999999999997e-56chrV 17,685,618contains similarity to Brachydanio rerio SI:dZ186F8.4 (Novel immune-type receptor) (Fragment).; TR:Q8UVA1
2skr-9C52D10.7n/achrIV 17,163,837skr-9 encodes a homolog of Skp1 in S. cerevisiae, a component of the SCF (Skp1, Cullin, F-box) ubiquitin-ligase complex that regulates ubiquitin-mediated protein degradation; SKR-9 is required for posterior body morphogenesis, embryonic and larval development, and postembryonic cell proliferation.
3clec-106Y18D10A.12n/achrI 12,866,497C. elegans CLEC-106 protein; contains similarity to Interpro domains IPR016187 (C-type lectin fold), IPR016186 (C-type lectin-like), IPR001304 (C-type lectin)
4F46A8.4F46A8.4n/achrI 11,241,589contains similarity to Pfam domain PF00337 Galactoside-binding lectin contains similarity to Interpro domains IPR001079 (Galectin, galactose-binding lectin), IPR013320 (Concanavalin A-like lectin/glucanase, subgroup), IPR008985 (Concanavalin A-like lectin/glucanase)
5R53.8R53.8n/achrII 9,977,190contains similarity to Homo sapiens Putative uncharacterized protein (Fragment); ENSEMBL:ENSP00000333119
6srj-8T28A11.9n/achrV 3,248,476C. elegans SRJ-8 protein; contains similarity to Pfam domain PF01461 7TM chemoreceptor contains similarity to Interpro domain IPR003002 (7TM chemoreceptor, subfamily 1)
7clec-136F35D11.7n/achrII 4,616,077C. elegans CLEC-136 protein; contains similarity to Interpro domain IPR016187 (C-type lectin fold)
8C16C8.7C16C8.7n/achrII 3,459,961
9F19H6.5F19H6.5n/achrX 12,364,231contains similarity to Homo sapiens Splice isoform 1 of O75143 Hypothetical protein KIAA0652; ENSEMBL:ENSP00000310321
10T19D2.3T19D2.3n/achrX 3,939,726
11clec-221F17C11.5n/achrV 10,953,943C. elegans CLEC-221 protein; contains similarity to Interpro domains IPR016187 (C-type lectin fold), IPR016186 (C-type lectin-like), IPR001304 (C-type lectin)
12T02D1.7T02D1.7n/achrIV 17,406,968contains similarity to Rhizobium meliloti Dihydrolipoamide acetyltransferase component of pyruvate dehydrogenasescomplex (EC 2.3.1.12) (E2).; SW:ODP2_RHIME
13M7.10M7.10n/achrIV 11,102,300contains similarity to Pfam domain PF02520 Domain of unknown function DUF148 contains similarity to Interpro domains IPR001703 (Alpha-fetoprotein), IPR003677 (Protein of unknown function DUF148)
14K12H6.4K12H6.4n/achrII 2,823,987
15C16C8.8C16C8.8n/achrII 3,461,412
16Y26D4A.2Y26D4A.2n/achrI 13,067,990contains similarity to Pfam domain PF08277 PAN-like domain contains similarity to Interpro domains IPR006583 (CW), IPR016187 (C-type lectin fold)
17T01B6.4T01B6.4n/achrX 2,337,975
18K03D3.5K03D3.5n/achrIV 16,320,282contains similarity to Homo sapiens Ski oncogene; ENSEMBL:ENSP00000288796
19C09G12.5C09G12.5n/achrIV 3,479,529
20Y43F8C.17Y43F8C.17n/achrV 19,712,303contains similarity to Rhodosporidium toruloides Rhodotorucine A precursor 2.; SW:RHT2_RHOTO
21sri-37D2062.2n/achrII 2,630,401C. elegans SRI-37 protein; contains similarity to Pfam domain PF01461 7TM chemoreceptor contains similarity to Interpro domain IPR003002 (7TM chemoreceptor, subfamily 1)
22W02B3.7W02B3.7n/achrIII 691,490contains similarity to Interpro domain IPR009644 (Fukutin-related)
23fipr-16C06E1.6n/achrIII 8,590,815C. elegans FIPR-16 protein ;
24clec-96ZK39.5n/achrI 11,151,582C. elegans CLEC-96 protein; contains similarity to Pfam domain PF00059 Lectin C-type domain contains similarity to Interpro domains IPR016187 (C-type lectin fold), IPR016186 (C-type lectin-like), IPR001304 (C-type lectin), IPR001202 (WW/Rsp5/WWP)
25clec-125W09G10.6n/achrII 3,517,674C. elegans CLEC-125 protein; contains similarity to Pfam domain PF00059 Lectin C-type domain contains similarity to Interpro domains IPR016187 (C-type lectin fold), IPR016186 (C-type lectin-like), IPR001304 (C-type lectin)
26try-8F25E5.10n/achrV 7,453,613C. elegans TRY-8 protein; contains similarity to Pfam domains PF00089 (Trypsin) , PF03761 (Domain of unknown function (DUF316)) contains similarity to Interpro domains IPR002195 (Dihydroorotase, conserved site), IPR001254 (Peptidase S1 and S6, chymotrypsin/Hap), IPR005514 (Protein of unknown function DUF316), IPR009003 (Peptidase, trypsin-like serine and cysteine)
27F41B4.3F41B4.3n/achrX 6,835,782
28C16C8.9C16C8.9n/achrII 3,462,897
29nas-19K03B8.5n/achrV 11,402,129nas-19 encodes an astacin-like metalloprotease; large-scale expression studies reveal that a nas-19::GFP promoter fusion is expressed in the pharynx, intestine, vulva, and reproductive system.
30T26A8.3T26A8.3n/achrIV 8,425,562
31F44D12.8F44D12.8n/achrIV 10,024,253contains similarity to Homo sapiens Isoform 1 of MAP7 domain-containing protein 1; ENSEMBL:ENSP00000362244
32clec-94ZK39.3n/achrI 11,147,370C. elegans CLEC-94 protein; contains similarity to Pfam domain PF00059 Lectin C-type domain contains similarity to Interpro domains IPR016187 (C-type lectin fold), IPR016186 (C-type lectin-like), IPR001304 (C-type lectin)
33clec-232F36G9.11n/achrV 15,976,833C. elegans CLEC-232 protein; contains similarity to Interpro domains IPR016187 (C-type lectin fold), IPR016186 (C-type lectin-like), IPR001304 (C-type lectin)
34F58A4.1F58A4.1n/achrIII 9,599,163contains similarity to Drosophila melanogaster Flybase gene name is CG34220-PA;; FLYBASE:CG34220
35Y66A7A.4Y66A7A.4n/achrIII 11,614,038
36F49F1.3F49F1.3n/achrIV 4,115,363contains similarity to Interpro domain IPR000694 (Proline-rich region)
37K12H6.5K12H6.5n/achrII 2,826,180
38Y69E1A.3Y69E1A.3n/achrIV 10,953,548contains similarity to Pfam domains PF07714 (Protein tyrosine kinase) , PF00069 (Protein kinase domain) , PF00017 (SH2 domain) contains similarity to Interpro domains IPR017441 (Protein kinase ATP binding, conserved site), IPR002290 (Serine/threonine protein kinase), IPR011009 (Protein kinase-like), IPR000719 (Protein kinase, core), IPR001245 (Tyrosine protein kinase), IPR017442 (Serine/threonine protein kinase-related), IPR000980 (SH2 motif), IPR008266 (Tyrosine protein kinase, active site)
39F20D6.1F20D6.1n/achrV 8,191,303contains similarity to Interpro domain IPR001478 (PDZ/DHR/GLGF)
40K04H8.3K04H8.3n/achrI 14,256,314contains similarity to Bacteroides thetaiotaomicron Putative phospho-2-dehydro-3-deoxyheptonate aldolase/chorismatesmutase.; TR:Q8A0T7
41Y43F8C.16Y43F8C.16n/achrV 19,710,255contains similarity to Drosophila melanogaster Flybase gene name is CG31439-PA;; FLYBASE:CG31439
42F48G7.9F48G7.9n/achrV 628,338contains similarity to Pfam domain PF00130 Phorbol esters/diacylglycerol binding domain (C1 domain) contains similarity to Interpro domains IPR015727 (Protein kinase C mu-related), IPR002219 (Protein kinase C, phorbol ester/diacylglycerol binding)
43F49F1.10F49F1.10n/achrIV 4,138,758contains similarity to Pfam domain PF00337 Galactoside-binding lectin contains similarity to Interpro domains IPR001079 (Galectin, galactose-binding lectin), IPR013320 (Concanavalin A-like lectin/glucanase, subgroup), IPR008985 (Concanavalin A-like lectin/glucanase)
44clec-207F36F12.5n/achrV 2,096,664C. elegans CLEC-207 protein; contains similarity to Interpro domains IPR016187 (C-type lectin fold), IPR016186 (C-type lectin-like), IPR001304 (C-type lectin)
45scl-7C39E9.5n/achrIV 13,070,819C. elegans SCL-7 protein; contains similarity to Pfam domain PF00188 SCP-like extracellular protein contains similarity to Interpro domains IPR014044 (SCP-like extracellular), IPR002413 (Ves allergen), IPR001283 (Allergen V5/Tpx-1 related)
46Y39F10A.3Y39F10A.3n/achrII 782,448contains similarity to Pfam domain PF05050 Protein of unknown function (DUF672) contains similarity to Interpro domain IPR007744 (Protein of unknown function DUF672)
47F20A1.2F20A1.2n/achrV 7,047,678contains similarity to Interpro domain IPR017452 (GPCR, rhodopsin-like superfamily)
48K12H6.8K12H6.8n/achrII 2,828,347
49F19H6.6F19H6.6n/achrX 12,362,704contains similarity to Saccharomyces cerevisiae Cytoplasmic protein of unknown function, potential Cdc28p substrate; SGD:YAL031C
50D1022.2D1022.2n/achrII 7,459,718contains similarity to Interpro domain IPR000884 (Thrombospondin, type I)