UCSC C. elegans Gene Sorter
 
genome assembly search
sort by display output 
#
Name
WormBase
BLASTP
E-Value
Genome Position
Description
1K04F1.12K04F1.120chrV 1,656,168contains similarity to Pfam domain PF01030 Receptor L domain contains similarity to Interpro domain IPR000494 (EGF receptor, L domain)
2T05C3.2T05C3.2n/achrV 5,498,362The T05C3.2 gene encodes a protein that may be involved in apoptosis.
3twk-7F22B7.7n/achrIII 8,638,816C. elegans TWK-7 protein; contains similarity to Pfam domain PF07885 Ion channel contains similarity to Interpro domains IPR003280 (Potassium channel, two pore-domain), IPR013099 (Ion transport 2), IPR003092 (Potassium channel, two pore-domain, TASK)
4F49C12.10F49C12.10n/achrIV 9,318,735contains similarity to Pfam domain PF08241 Methyltransferase domain contains similarity to Interpro domain IPR013216 (Methyltransferase type 11)
5F56H6.7F56H6.7n/achrI 12,299,265contains similarity to Pfam domain PF03385 Protein of unknown function, DUF288 contains similarity to Interpro domains IPR005049 (Protein of unknown function DUF288), IPR001692 (Histidinol dehydrogenase)
6sre-20ZC455.7n/achrV 12,783,819C. elegans SRE-20 protein; contains similarity to Pfam domain PF03125 C. elegans Sre G protein-coupled chemoreceptor contains similarity to Interpro domains IPR004151 (C. elegans Sre G protein-coupled chemoreceptor), IPR008075 (Lipocalin-1 receptor)
7E03H4.5E03H4.5n/achrI 12,414,766contains similarity to Pfam domain PF01697 Domain of unknown function contains similarity to Interpro domain IPR008166 (Protein of unknown function DUF23)
8sulp-5K12G11.2n/achrV 11,881,591sulp-5 encodes one of eight C. elegans members of the sulfate permease family of anion transporters; by homology, SULP-5 is predicted to function as an anion transporter that regulates cellular pH and volume via transmembrane movement of electrolytes and fluids; a SULP-5::GFP fusion is expressed in punctate structures irregularly distributed along the apical membrane of excretory cell canals and is also expressed weakly in adult seam cells.
9C27H5.6C27H5.6n/achrII 7,186,228
10F55H2.5F55H2.5n/achrIII 9,512,031contains similarity to Pfam domain PF03188 Cytochrome b561 contains similarity to Interpro domains IPR004877 (Cytochrome b561), IPR000366 (Fungal pheromone mating factor STE2 GPCR), IPR006593 (Cytochrome b561 / ferric reductase transmembrane)
11W03D2.7W03D2.7n/achrIV 4,062,904
12cpx-2K03A11.2n/achrX 13,067,761C. elegans CPX-2 protein; contains similarity to Pfam domain PF05835 Synaphin protein contains similarity to Interpro domain IPR008849 (Synaphin)
13F25E5.9F25E5.9n/achrV 7,437,693
14T04C12.1T04C12.1n/achrV 11,058,930n/a
15C23G10.10C23G10.10n/achrIII 6,213,461
16T10C6.2T10C6.2n/achrV 16,013,354contains similarity to Pfam domain PF01461 7TM chemoreceptor contains similarity to Interpro domain IPR003002 (7TM chemoreceptor, subfamily 1)
17C44H9.2C44H9.2n/achrV 12,832,016contains similarity to Antirrhinum majus ACC synthase 2 (Fragment).; TR:Q9ZT10
18K06H6.6K06H6.6n/achrV 584,556contains similarity to Pfam domain PF01531 Glycosyl transferase family 11 contains similarity to Interpro domain IPR002516 (Glycosyl transferase, family 11)
19nas-28F42A10.8n/achrIII 6,182,093C. elegans NAS-28 protein; contains similarity to Pfam domain PF01400 Astacin (Peptidase family M12A) contains similarity to Interpro domains IPR017050 (Peptidase M12A, astacin, nematode), IPR006025 (Peptidase M, neutral zinc metallopeptidases, zinc-binding site), IPR001506 (Peptidase M12A, astacin), IPR006026 (Peptidase, metallopeptidases), IPR000859 (CUB), IPR013032 (EGF-like region, conserved site)
20gst-11R11G1.3n/achrX 3,633,139C. elegans GST-11 protein; contains similarity to Pfam domains PF00043 (Glutathione S-transferase, C-terminal domain) , PF02798 (Glutathione S-transferase, N-terminal domain) contains similarity to Interpro domains IPR012336 (Thioredoxin-like fold), IPR003080 (Glutathione S-transferase, alpha class), IPR012335 (Thioredoxin fold), IPR004046 (Glutathione S-transferase, C-terminal), IPR004045 (Glutathione S-transferase, N-terminal), IPR010987 (Glutathione S-transferase, C-terminal-like)
21F09D12.2F09D12.2n/achrIV 3,443,249F09D12.2 encodes a neprilysin; neprilysins are thermolysin-like zinc metallopeptidases, found on the outer surface of animal cells, that negatively regulate small signalling peptides (e.g., enkephalin, tachykinin, insulin, and natriuretic peptides) by cleaving them; F09D12.2 has no clear orthologs in other organisms.
22ZC239.2ZC239.2n/achrII 3,218,443contains similarity to Pfam domain PF02214 K+ channel tetramerisation domain contains similarity to Interpro domains IPR011333 (BTB/POZ fold), IPR003131 (Potassium channel, voltage dependent, Kv, tetramerisation)
23C54D2.2C54D2.2n/achrX 7,839,011
24sri-2F36G9.9n/achrV 15,964,503C. elegans SRI-2 protein; contains similarity to Pfam domain PF01461 7TM chemoreceptor contains similarity to Interpro domains IPR003002 (7TM chemoreceptor, subfamily 1), IPR002208 (SecY protein)
25C50F4.9C50F4.9n/achrV 9,523,727contains similarity to Streptococcus agalactiae Hypothetical protein.; TR:Q8E2N5
26fbxa-161C08E3.4n/achrII 1,607,102C. elegans FBXA-161 protein; contains similarity to Pfam domain PF01827 FTH domain contains similarity to Interpro domain IPR002900 (Protein of unknown function DUF38, Caenorhabditis species)
27srh-203F20E11.10n/achrV 17,455,364C. elegans SRH-203 protein; contains similarity to Pfam domain PF01461 7TM chemoreceptor contains similarity to Interpro domain IPR003002 (7TM chemoreceptor, subfamily 1)
28glb-15F35B12.8n/achrV 11,617,517glb-15 encodes a globin with no obvious function in mass RNAi assays.
29ins-3ZK75.3n/achrII 5,990,388ins-3 encodes one of several insulin-related peptides; INS-3 is classified as a Type-beta insulin based on the predicted arrangement of disulfide bonds; gfp gene fusions with the promoter and enhancer regions indicate that INS-3 is expressed in some amphid sensory neurons.
30C54D10.8C54D10.8n/achrV 12,445,902contains similarity to Homo sapiens cDNA FLJ44007 fis, clone TESTI4023762; ENSEMBL:ENSP00000364402
31lgc-6F17E9.8n/achrIV 8,341,064C. elegans LGC-6 protein; contains similarity to Pfam domain PF02931 Neurotransmitter-gated ion-channel ligand binding domain contains similarity to Interpro domains IPR006201 (Neurotransmitter-gated ion-channel), IPR006202 (Neurotransmitter-gated ion-channel ligand-binding)
32Y40B1A.1Y40B1A.1n/achrI 13,346,056contains similarity to Lampropeltis getula nigrita Cytochrome b.; TR:Q953V8
33srbc-77T05G11.2n/achrV 15,930,607C. elegans SRBC-77 protein; contains similarity to Pfam domain PF01748 Caenorhabditis serpentine receptor-like protein contains similarity to Interpro domain IPR002651 (Protein of unknown function DUF32)
34srbc-50F54B8.8n/achrV 15,824,406C. elegans SRBC-50 protein; contains similarity to Pfam domain PF01748 Caenorhabditis serpentine receptor-like protein contains similarity to Interpro domain IPR002651 (Protein of unknown function DUF32)
35F23B2.10F23B2.10n/achrIV 9,153,550contains similarity to Interpro domain IPR001841 (Zinc finger, RING-type)
36F19B10.5F19B10.5n/achrII 3,656,709
37bbs-8T25F10.5n/achrV 6,763,757bbs-8 encodes a tetratricopeptide repeat (TPR)-containing protein that is orthologous to the human Bardet-Biedl syndrome protein, BBS8; in C. elegans, bbs-8 activity is required for cilia biogenesis and function; accordingly, bbs-8 mutant animals display odorant chemotaxis defects and exhibit both aberrant motility and abnormal localization of at least two intraflagellar transport (IFT) protein markers; a BBS-8::GFP translational fusion is expressed exclusively in ciliated head and tail neurons, where it localizes predominantly to the base of cilia, known as the ciliary transition zone; BBS-8::GFP is also observed moving bidirectionally (anterograde and retrograde) along the ciliary axoneme; DNA sequences upstream of bbs-8 contain X box DNA binding sites, suggesting that bbs-8 expression may be regulated by the DAF-19 RFX-type transcription factor.
38clec-5C35D10.14n/achrIII 4,882,708C. elegans CLEC-5 protein; contains similarity to Pfam domains PF00431 (CUB domain) , PF00059 (Lectin C-type domain) (2)contains similarity to Interpro domains IPR000859 (CUB), IPR016187 (C-type lectin fold), IPR016186 (C-type lectin-like), IPR013838 (Beta tubulin, autoregulation binding site), IPR001304 (C-type lectin)
39his-8F45F2.12n/achrV 8,532,878his-8 encodes an H2B histone; his-8 is contained within the histone gene cluster HIS2.
40C01B7.3C01B7.3n/achrV 8,783,769
41C09G9.5C09G9.5n/achrIV 8,887,547contains similarity to Interpro domain IPR008992 ()
42C40C9.4C40C9.4n/achrX 13,651,413contains similarity to Saccharomyces cerevisiae Protein with a putative role in sister chromatid segregation, potentially phosphorylated by Cdc28p; green fluorescent protein (GFP)-fusion protein localizes to the nuclear periphery; SGD:YML034W
43R160.4R160.4n/achrX 4,367,984
44C13A2.7C13A2.7n/achrV 7,266,655
45R03H10.1R03H10.1n/achrII 4,181,882This gene encodes a protein containing an F-box, a motif predicted to mediate protein-protein interactions either with homologs of yeast Skp-1p or with other proteins.
46F58G11.4F58G11.4n/achrV 13,674,239contains similarity to Pfam domain PF07690 Major Facilitator Superfamily contains similarity to Interpro domains IPR011701 (Major facilitator superfamily MFS-1), IPR016196 (MFS general substrate transporter)
47F33D11.8F33D11.8n/achrI 5,854,677
48nhr-260C38C3.9n/achrV 1,510,828C. elegans NHR-260 protein; contains similarity to Pfam domains PF00104 (Ligand-binding domain of nuclear hormone receptor) , PF00105 (Zinc finger, C4 type (two domains)) contains similarity to Interpro domains IPR008946 (Nuclear hormone receptor, ligand-binding), IPR001723 (Steroid hormone receptor), IPR000324 (Vitamin D receptor), IPR013088 (Zinc finger, NHR/GATA-type), IPR001628 (Zinc finger, nuclear hormone receptor-type), IPR000536 (Nuclear hormone receptor, ligand-binding, core)
49K09D9.9K09D9.9n/achrV 3,993,382
50math-25C46F9.4n/achrII 1,896,912C. elegans MATH-25 protein; contains similarity to Pfam domain PF00917 MATH domain contains similarity to Interpro domains IPR008974 (TRAF-like), IPR002083 (MATH)