UCSC C. elegans Gene Sorter
 
genome assembly search
sort by display output 
#
Name
WormBase
BLASTP
E-Value
Genome Position
Description
1lips-4K12B6.30chrV 6,279,558C. elegans LIPS-4 protein; contains similarity to Pfam domain PF01674 Lipase (class 2) contains similarity to Interpro domain IPR002918 (Lipase, class 2)
2ugt-32F47C10.6n/achrV 3,842,918C. elegans UGT-32 protein; contains similarity to Pfam domain PF00201 UDP-glucoronosyl and UDP-glucosyl transferase contains similarity to Interpro domain IPR002213 (UDP-glucuronosyl/UDP-glucosyltransferase)
3Y43F8B.6Y43F8B.6n/achrV 19,493,363contains similarity to Yersinia pestis Putative insecticial toxin.; TR:Q8ZAV3
4daf-10F23B2.4n/achrIV 9,141,552daf-10 encodes a WD- and WAA-repeat containing protein that is the C. elegans ortholog of intraflagellar transport (IFT) complex A component IFT122; daf-10 activity is required for intraflagellar transport and thus for proper development of amphid and phasmid neurons, dauer development, chemotaxis, and normal lifespan; a DAF-10::GFP fusion protein undergoes both anterograde and retrograde intraflagellar transport in amphid or phasmid sensory neurons.
5sri-1F36G9.8n/achrV 15,966,916C. elegans SRI-1 protein; contains similarity to Pfam domain PF01461 7TM chemoreceptor contains similarity to Interpro domains IPR003002 (7TM chemoreceptor, subfamily 1), IPR002208 (SecY protein)
6R06A10.1R06A10.1n/achrI 1,087,211contains similarity to Interpro domain IPR016196 (MFS general substrate transporter)
7C03A7.12C03A7.12n/achrV 5,179,902contains similarity to Pfam domain PF00201 UDP-glucoronosyl and UDP-glucosyl transferase contains similarity to Interpro domain IPR002213 (UDP-glucuronosyl/UDP-glucosyltransferase)
8skr-9C52D10.7n/achrIV 17,163,837skr-9 encodes a homolog of Skp1 in S. cerevisiae, a component of the SCF (Skp1, Cullin, F-box) ubiquitin-ligase complex that regulates ubiquitin-mediated protein degradation; SKR-9 is required for posterior body morphogenesis, embryonic and larval development, and postembryonic cell proliferation.
9T26E4.5T26E4.5n/achrV 15,787,827contains similarity to Interpro domain IPR008996 ()
10srsx-18C04E6.2n/achrV 5,923,404C. elegans SRSX-18 protein; contains similarity to Interpro domain IPR017452 (GPCR, rhodopsin-like superfamily)
11F35A5.5F35A5.5n/achrX 3,794,638contains similarity to Interpro domains IPR000694 (Proline-rich region), IPR000976 (Wilm's tumour protein)
12srw-17T10H4.6n/achrV 15,276,192C. elegans SRW-17 protein; contains similarity to Interpro domains IPR000190 (AT1 angiotensin II receptor), IPR017452 (GPCR, rhodopsin-like superfamily), IPR002259 (Delayed-early response protein/equilibrative nucleoside transporter)
13fbxb-40M01D1.9n/achrII 1,049,413This gene encodes a protein containing an F-box, a motif predicted to mediate protein-protein interactions either with homologs of yeast Skp-1p or with other proteins; its encoded protein also contains a Pfam-B45 motif of presently unknown function.
14glb-22R11H6.3n/achrV 14,605,162glb-22 encodes a globin with no obvious function in mass RNAi assays.
15C10C6.3C10C6.3n/achrIV 11,464,370contains similarity to Saccharomyces cerevisiae Putative glycosidase of the cell wall, may have a role in cell wall architecture; SGD:YGR189C
16asm-1B0252.2n/achrII 6,911,299asm-1 encodes a protein similar to human acid sphingomyelinase (ASM) or sphingomyelin phosphodiesterase; the ASM-1 protein has a putative secretory signal peptide at the N-terminus, saposin-like and proline-rich domains and putative N-linked glycosylation sites; asm-1 shows phosphodiesterase activity when expressed in COS-7 cells; while mammalian ASM is detected as both intracellular and secreted forms, asm-1 was detected exclusively in the secreted form; northern blot analysis indicates that asm-1 is expressed at higher levels in the embryo compared with other stages.
17F25E2.3F25E2.3n/achrX 812,150contains similarity to Pfam domain PF02551 Acyl-CoA thioesterase contains similarity to Interpro domain IPR003703 (Acyl-CoA thioesterase)
18nhr-42C33G8.6n/achrV 6,999,694C. elegans NHR-42 protein; contains similarity to Pfam domains PF00104 (Ligand-binding domain of nuclear hormone receptor) , PF00105 (Zinc finger, C4 type (two domains)) contains similarity to Interpro domains IPR008946 (Nuclear hormone receptor, ligand-binding), IPR001723 (Steroid hormone receptor), IPR000324 (Vitamin D receptor), IPR013088 (Zinc finger, NHR/GATA-type), IPR001628 (Zinc finger, nuclear hormone receptor-type), IPR000536 (Nuclear hormone receptor, ligand-binding, core)
19R01B10.3R01B10.3n/achrV 6,044,828
20K06A1.3K06A1.3n/achrII 6,442,625contains similarity to Pfam domain PF00100 Zona pellucida-like domain contains similarity to Interpro domain IPR001507 (Endoglin/CD105 antigen)
21K12B6.8K12B6.8n/achrV 6,310,389contains similarity to Interpro domains IPR001841 (Zinc finger, RING-type), IPR001965 (Zinc finger, PHD-type), IPR013083 (Zinc finger, RING/FYVE/PHD-type), IPR002219 (Protein kinase C, phorbol ester/diacylglycerol binding)
22Y116A8B.4Y116A8B.4n/achrIV 17,224,339contains similarity to Clostridium acetobutylicum Predicted membrane protein.; TR:Q97KC4
23nac-2R107.1n/achrIII 9,040,048nac-2 encodes a high affinity sodium-coupled citrate transporter that is orthologous to the mammalian citrate transporter NaCT and is one of four C. elegans proteins related to Drosophila Indy; when expressed in a heterologous system, NAC-2 exhibits high affinity sodium/citrate and sodium/succinate cotransporter activity, although the transport rate for citrate is much higher than that for succinate; nac-2::gfp reporter fusions are expressed in the intestine, from early larval stages through adulthood; the effects of nac-2(RNAi) are variable, with reports of a 19% increase in lifespan accompanied by decreased body size and fat content in affected animals and reports of no apparent decrease in average lifespan.
24T22F7.4T22F7.4n/achrIII 526,147
25C54A12.2C54A12.2n/achrII 5,254,604contains similarity to Pfam domain PF00001 7 transmembrane receptor (rhodopsin family) contains similarity to Interpro domains IPR017452 (GPCR, rhodopsin-like superfamily), IPR002455 (GPCR, family 3, gamma-aminobutyric acid receptor, type B), IPR000276 (GPCR, rhodopsin-like)
26C41G6.6C41G6.6n/achrV 15,222,374contains similarity to Pfam domain PF01030 Receptor L domain contains similarity to Interpro domain IPR000494 (EGF receptor, L domain)
27F31E8.1F31E8.1n/achrII 6,829,225
28T28A11.18T28A11.18n/achrV 3,267,438contains similarity to Pfam domain PF01579 Domain of unknown function DUF19 contains similarity to Interpro domains IPR016638 (Uncharacterised conserved protein UPF0376), IPR002542 (Protein of unknown function DUF19)
29scl-4C39E9.1n/achrIV 13,062,457C. elegans SCL-4 protein; contains similarity to Pfam domain PF00188 SCP-like extracellular protein contains similarity to Interpro domains IPR014044 (SCP-like extracellular), IPR002413 (Ves allergen), IPR001283 (Allergen V5/Tpx-1 related), IPR000480 (Glutelin)
30ttr-54T14G10.4n/achrIV 10,156,441C. elegans TTR-54 protein; contains similarity to Pfam domain PF01060 Transthyretin-like family contains similarity to Interpro domain IPR001534 (Transthyretin-like)
31C31H5.1C31H5.1n/achrI 9,028,536contains similarity to Pfam domain PF06342 Alpha/beta hydrolase of unknown function (DUF1057) contains similarity to Interpro domains IPR008262 (Lipase, active site), IPR010463 (Protein of unknown function DUF1057, lipase putative)
32F08G2.8F08G2.8n/achrII 13,853,676contains similarity to Triticum aestivum Alpha/beta-gliadin A-IV precursor (Prolamin).; SW:GDA4_WHEAT
33Y37D8A.4Y37D8A.4n/achrIII 12,837,949contains similarity to Pfam domain PF00017 SH2 domain contains similarity to Interpro domain IPR000980 (SH2 motif)
34Y44A6D.3Y44A6D.3n/achrV 20,786,983contains similarity to Interpro domain IPR009057 (Homeodomain-like)
35Y62H9A.2Y62H9A.2n/achrX 11,877,730contains similarity to Homo sapiens Angiomotin; ENSEMBL:ENSP00000305557
36srh-182ZK228.5n/achrV 18,472,715C. elegans SRH-182 protein; contains similarity to Pfam domain PF01461 7TM chemoreceptor contains similarity to Interpro domain IPR003002 (7TM chemoreceptor, subfamily 1)
37srt-58C29G2.5n/achrV 2,575,489C. elegans SRT-58 protein; contains similarity to Pfam domains PF01748 (Caenorhabditis serpentine receptor-like protein) , PF00105 (Zinc finger, C4 type (two domains)) contains similarity to Interpro domains IPR002651 (Protein of unknown function DUF32), IPR013088 (Zinc finger, NHR/GATA-type), IPR001628 (Zinc finger, nuclear hormone receptor-type)
38F57B9.1F57B9.1n/achrIII 6,962,648contains similarity to Pfam domain PF01243 Pyridoxamine 5'-phosphate oxidase contains similarity to Interpro domains IPR012349 (FMN-binding split barrel), IPR011576 (Pyridoxamine 5'-phosphate oxidase-related, FMN-binding core), IPR009002 (FMN-binding split barrel, related), IPR000659 (Pyridoxamine 5'-phosphate oxidase)
39M01B2.6M01B2.6n/achrV 15,242,739contains similarity to Pfam domain PF00704 Glycosyl hydrolases family 18 contains similarity to Interpro domains IPR011583 (Chitinase II), IPR017853 (Glycoside hydrolase, catalytic core), IPR001223 (Glycoside hydrolase, family 18, catalytic domain), IPR013781 (Glycoside hydrolase, subgroup, catalytic core)
40twk-23F19D8.1n/achrX 13,819,543twk-23 encodes one of 44 C. elegans TWK (two-P domain K+) potassium channel subunits that contain two pore-forming domains and four transmembrane domains; the precise role of TWK-23 in C. elegans development and/or behavior is not yet known, however TWK-23 may function redundantly with other TWK channels; TWK-23 is expressed in neurons, muscle, the posterior intestine, and diffusely in many other tissues.
41egl-38C04G2.7n/achrIV 10,108,695The egl-38 gene encodes a Pax5 homolog.
42his-9ZK131.3n/achrII 13,823,762his-9 encodes an H3 histone; by homology, HIS-9 is predicted to function as a nucleosome component required for packaging of DNA into chromatin; his-9 is a replication-dependent histone locus that resides in the HIS3 cluster on chromosome II.
43W04A8.3W04A8.3n/achrI 13,845,353contains similarity to Plasmodium falciparum Reticulocyte-binding protein, putative.; TR:Q8I4R2
44F22F1.2F22F1.2n/achrX 8,150,103contains similarity to Pfam domain PF00069 Protein kinase domain contains similarity to Interpro domains IPR017441 (Protein kinase ATP binding, conserved site), IPR002290 (Serine/threonine protein kinase), IPR011009 (Protein kinase-like), IPR008271 (Serine/threonine protein kinase, active site), IPR000719 (Protein kinase, core), IPR001245 (Tyrosine protein kinase), IPR017442 (Serine/threonine protein kinase-related)
45bbs-5R01H10.6n/achrIII 10,260,159C. elegans BBS-5 protein; contains similarity to Pfam domain PF07289 Protein of unknown function (DUF1448) contains similarity to Interpro domains IPR006606 (Protein of unknown function DUF1448), IPR008162 (Inorganic pyrophosphatase), IPR014003 (Protein of unknown function DM16)
46srsx-12C13D9.5n/achrV 4,980,446C. elegans SRSX-12 protein; contains similarity to Pfam domain PF00001 7 transmembrane receptor (rhodopsin family) contains similarity to Interpro domains IPR017452 (GPCR, rhodopsin-like superfamily), IPR000276 (GPCR, rhodopsin-like)
47H25K10.2H25K10.2n/achrIV 16,210,717contains similarity to Halobacterium sp ORF H0114.; TR:O51964
48C14A6.8C14A6.8n/achrV 18,170,317contains similarity to Gallus gallus Cellular tumor antigen p53 (Tumor suppressor p53).; SW:P53_CHICK
49F47C12.1F47C12.1n/achrIV 4,001,937contains similarity to Pfam domains PF00008 (EGF-like domain) (4), PF00754 (F5/8 type C domain) , PF07645 (Calcium binding EGF domain) (2), PF07699 (GCC2 and GCC3) (3), PF00431 (CUB domain) , PF07974 (EGF-like domain) , PF02494 (HYR domain) (2), PF00084 (Sushi domain (SCR repeat)) (6)contains similarity to Interpro domains IPR001438 (EGF-like, type 2), IPR000742 (EGF-like, type 3), IPR003410 (Hyalin), IPR000436 (Sushi/SCR/CCP), IPR006209 (EGF-like), IPR000152 (Aspartic acid and asparagine hydroxylation site), IPR006210 (EGF), IPR002049 (EGF-like, laminin), IPR008979 (Galactose-binding like), IPR000859 (CUB), IPR011641 (GCC2 and GCC3), IPR001881 (EGF-like calcium-binding), IPR016060 (Complement control module), IPR009030 (Growth factor, receptor), IPR013032 (EGF-like region, conserved site), IPR000421 (Coagulation factor 5/8 type, C-terminal), IPR013111 (EGF, extracellular), IPR013091 (EGF calcium-binding)
50R07A4.4R07A4.4n/achrX 10,753,200contains similarity to Pfam domain PF00024 PAN domain contains similarity to Interpro domains IPR000884 (Thrombospondin, type I), IPR003609 (Apple-like), IPR003014 (N/apple PAN), IPR008266 (Tyrosine protein kinase, active site)