UCSC C. elegans Gene Sorter
 
genome assembly search
sort by display output 
#
Name
WormBase
BLASTP
E-Value
Genome Position
Description
1nlp-12M01D7.57e-44chrI 1,843,618nlp-12 encodes two predicted neuropeptide-like proteins; nlp-12 is part of a LQFamide neuropeptide family that has members in at least one other nematode species; nlp-12 is expressed in one tail neuron; as loss of nlp-12 activity via large-scale RNAi screens does not result in any obvious abnormalities, the precise role of nlp-12-encoded peptides in development and/or behavior is not yet known.
2bra-2F23H11.1n/achrIII 911,744The bra-2 gene encodes a homolog of the human BMP receptor-associated molecule (BRAM1), paralogous to bra-1, that may act upon the SMA-6 TGF-beta signalling pathway
3F46A8.7F46A8.7n/achrI 11,238,164contains similarity to Homo sapiens hypothetical protein MGC35285; ENSEMBL:ENSP00000279688
4Y73F4A.3Y73F4A.3n/achrIV 9,040,014contains similarity to Pfam domain PF03351 DOMON domain contains similarity to Interpro domains IPR005018 (DOMON related), IPR008960 (Carbohydrate-binding family 9/cellobiose dehydrogenase, cytochrome), IPR013050 (DOMON)
5F12D9.2F12D9.2n/achrX 8,646,792
6fbxa-24F54D10.2n/achrII 3,817,370C. elegans FBXA-24 protein; contains similarity to Pfam domain PF01827 FTH domain contains similarity to Interpro domain IPR002900 (Protein of unknown function DUF38, Caenorhabditis species)
7ZK971.1ZK971.1n/achrII 10,279,516contains similarity to Arabidopsis thaliana Gb|AAB67622.1.; TR:Q9LT65
8nhr-79T26H2.9n/achrV 19,209,750C. elegans NHR-79 protein; contains similarity to Pfam domains PF00104 (Ligand-binding domain of nuclear hormone receptor) , PF00105 (Zinc finger, C4 type (two domains)) contains similarity to Interpro domains IPR008946 (Nuclear hormone receptor, ligand-binding), IPR001723 (Steroid hormone receptor), IPR000324 (Vitamin D receptor), IPR013088 (Zinc finger, NHR/GATA-type), IPR001628 (Zinc finger, nuclear hormone receptor-type), IPR000536 (Nuclear hormone receptor, ligand-binding, core)
9F47B8.2F47B8.2n/achrV 14,316,299contains similarity to Lyngbya lagerheimii CP 43 protein (Fragment).; TR:Q937F7
10F36D1.7F36D1.7n/achrI 11,263,396contains similarity to Bacteriophage T5 L-shaped tail fiber protein (LTF protein).; SW:VLTF_BPT5
11F58E10.7F58E10.7n/achrV 13,993,064contains similarity to Xenopus laevis FK506-binding protein.; TR:Q9I8P8
12F07C3.9F07C3.9n/achrV 9,254,456
13C34F11.8C34F11.8n/achrII 5,210,353contains similarity to Interpro domain IPR002952 (Eggshell protein)
14F08G12.8F08G12.8n/achrX 11,317,416contains similarity to Mus musculus Tenascin-R.; TR:Q8BYI9
15T24F1.5T24F1.5n/achrII 11,319,376contains similarity to Bombyx mori Lebocin 1/2 precursor.; SW:LEB1_BOMMO
16F07C4.6F07C4.6n/achrV 7,627,266contains similarity to Pfam domain PF01549 ShK domain-like contains similarity to Interpro domain IPR003582 (Metridin-like ShK toxin)
17gst-41R13D7.7n/achrV 7,398,864C. elegans GST-41 protein; contains similarity to Pfam domains PF00043 (Glutathione S-transferase, C-terminal domain) , PF02798 (Glutathione S-transferase, N-terminal domain) contains similarity to Interpro domains IPR012336 (Thioredoxin-like fold), IPR012335 (Thioredoxin fold), IPR004046 (Glutathione S-transferase, C-terminal), IPR004045 (Glutathione S-transferase, N-terminal), IPR010987 (Glutathione S-transferase, C-terminal-like)
18C13A2.4C13A2.4n/achrV 7,279,942contains similarity to Pfam domain PF01482 Domain of unknown function DUF13 contains similarity to Interpro domain IPR002485 (Protein of unknown function DUF13)
19C03G6.17C03G6.17n/achrV 7,380,393contains similarity to Interpro domain IPR016181 (Acyl-CoA N-acyltransferase)
20nlp-35C33A12.2n/achrIV 9,518,633C. elegans NLP-35 protein ;
21T20D4.11T20D4.11n/achrV 3,399,039contains similarity to Pfam domain PF01579 Domain of unknown function DUF19 contains similarity to Interpro domains IPR016638 (Uncharacterised conserved protein UPF0376), IPR002542 (Protein of unknown function DUF19)
22dhs-26ZK816.5n/achrX 3,361,621dhs-26 encodes a short-chain dehydrogenase predicted to be mitochondrial.
23dhs-31T04B2.6n/achrIV 10,040,250C. elegans DHS-31 protein; contains similarity to Pfam domain PF00106 short chain dehydrogenase contains similarity to Interpro domains IPR003560 (2,3-dihydro-2,3-dihydroxybenzoate dehydrogenase), IPR002347 (Glucose/ribitol dehydrogenase), IPR002198 (Short-chain dehydrogenase/reductase SDR), IPR016040 (NAD(P)-binding)
24gst-3K08F4.11n/achrIV 10,139,782gst-3 encodes a predicted glutathione S-transferase.
25fip-1F22B7.4n/achrIII 8,639,817C. elegans FIP-1 protein ; contains similarity to Homo sapiens Isoform A2 of Heterogeneous nuclear ribonucleoproteins A2/B1; ENSEMBL:ENSP00000354021
26ZK970.7ZK970.7n/achrII 10,312,538contains similarity to Pfam domain PF02520 Domain of unknown function DUF148 contains similarity to Interpro domain IPR003677 (Protein of unknown function DUF148)
27F14F11.2F14F11.2n/achrII 8,295,048contains similarity to Rhodopirellula baltica Methanol dehydrogenase regulatory protein (EC 1.1.1.244).; TR:Q7UX83
28cex-1F56D1.6n/achrII 5,448,034C. elegans CEX-1 protein; contains similarity to Pfam domain PF00036 EF hand contains similarity to Interpro domains IPR011992 (EF-Hand type), IPR002048 (Calcium-binding EF-hand)
29ins-11C17C3.4n/achrII 5,556,897ins-11 encodes an insulin-like peptide of the insulin superfamily of proteins (OMIM:176730, 147440); INS-11 is one of 38 insulin-like peptides in C. elegans and is expressed in the labial sensory neurons, the nerve ring, and other neurons; although the precise role of INS-11 in C. elegans development is not yet clear, loss of INS-11 function via RNA-mediated interference can result in animals that are smaller than wild type (Sma).
30ttr-29R90.4n/achrV 12,906,429C. elegans TTR-29 protein; contains similarity to Pfam domain PF01060 Transthyretin-like family contains similarity to Interpro domain IPR001534 (Transthyretin-like)
31C17B7.4C17B7.4n/achrV 3,339,687contains similarity to Pfam domain PF01579 Domain of unknown function DUF19 contains similarity to Interpro domains IPR016638 (Uncharacterised conserved protein UPF0376), IPR003559 (Cytolethal distending toxin C), IPR002542 (Protein of unknown function DUF19)
32ttr-27R90.2n/achrV 12,903,803C. elegans TTR-27 protein; contains similarity to Pfam domain PF01060 Transthyretin-like family contains similarity to Interpro domain IPR001534 (Transthyretin-like)
33col-35C15A11.1n/achrI 7,386,359col-35 encodes a collagen that is individually dispensable for viability and gross morphology in mass RNAi screens; the amino- and carboxyl-terminal cysteine-rich regions of COL-35 are most closely related to those of COL-8, COL-19, and COL-39.
34C17G10.7C17G10.7n/achrII 5,607,281
35cpr-2F36D3.9n/achrV 16,533,516C. elegans CPR-2 protein; contains similarity to Pfam domain PF00112 Papain family cysteine protease contains similarity to Interpro domains IPR013128 (Peptidase C1A, papain), IPR000169 (Peptidase, cysteine peptidase active site), IPR000668 (Peptidase C1A, papain C-terminal)
36nlp-37F48B9.4n/achrX 2,163,570C. elegans NLP-37 protein ;
37clec-98ZK39.7n/achrI 11,154,783C. elegans CLEC-98 protein; contains similarity to Pfam domain PF00059 Lectin C-type domain contains similarity to Interpro domains IPR016187 (C-type lectin fold), IPR016186 (C-type lectin-like), IPR001304 (C-type lectin)
38lact-6C06A12.5n/achrIV 17,430,817lact-6 encodes a beta-lactamase domain-containing protein that contains a predicted signal sequence in its N terminus.
39F47B8.8F47B8.8n/achrV 14,332,167contains similarity to Pfam domain PF01433 Peptidase family M1 contains similarity to Interpro domain IPR014782 (Peptidase M1, membrane alanine aminopeptidase, N-terminal)
40ttr-1K03H1.6n/achrIII 9,929,635ttr-1 encodes a protein containing a predicted signal sequence followed by a transthyretin-like domain; although TTR-1 belongs to a family of apparently nematode-specific proteins whose function is not yet known, loss of ttr-1 function via RNAi can result in enhanced dauer formation and daf-16-dependent lifespan extension.
41F53F4.7F53F4.7n/achrV 13,613,185contains similarity to Pfam domain PF03407 Protein of unknown function (DUF271) contains similarity to Interpro domain IPR005069 (Protein of unknown function DUF271)
42W01F3.2W01F3.2n/achrV 20,656,586contains similarity to Interpro domain IPR000585 (Hemopexin)
43F32G8.3F32G8.3n/achrV 10,554,899contains similarity to Homo sapiens Splice isoform Long of Q13595 Transformer-2 protein homolog; ENSEMBL:ENSP00000297071
44F35F10.1F35F10.1n/achrV 3,317,203contains similarity to Pfam domain PF04721 Domain of unknown function (DUF750) contains similarity to Interpro domain IPR006588 (Protein of unknown function PAW)
45T28A11.5T28A11.5n/achrV 3,270,895contains similarity to Pfam domain PF01579 Domain of unknown function DUF19 contains similarity to Interpro domains IPR016638 (Uncharacterised conserved protein UPF0376), IPR003559 (Cytolethal distending toxin C), IPR002542 (Protein of unknown function DUF19)
46C13A2.3C13A2.3n/achrV 7,283,523contains similarity to Pfam domain PF03269 Caenorhabditis protein of unknown function, DUF268 contains similarity to Interpro domain IPR004951 (Protein of unknown function DUF268, Caenorhabditis species)
47C06G3.3C06G3.3n/achrIV 7,036,272
48F47B8.4F47B8.4n/achrV 14,324,002contains similarity to Pfam domain PF00462 Glutaredoxin contains similarity to Interpro domains IPR002109 (Glutaredoxin), IPR012336 (Thioredoxin-like fold)
49nlp-20F45E4.8n/achrIV 7,642,623nlp-20 encodes a predicted neuropeptide of the FAFA family; expressed in pharyngeal neurons.
50dct-7F15E6.8n/achrIV 4,290,416C. elegans DCT-7 protein ;