UCSC C. elegans Gene Sorter
 
genome assembly search
sort by display output 
#
Name
WormBase
BLASTP
E-Value
Genome Position
Description
1R08H2.8R08H2.80chrV 15,371,455contains similarity to Mycoplasma penetrans Conserved hypothetical protein.; TR:Q8EV71
2T26E4.5T26E4.5n/achrV 15,787,827contains similarity to Interpro domain IPR008996 ()
3F58H7.7F58H7.7n/achrIV 911,281This gene encodes a protein containing an F-box, a motif predicted to mediate protein-protein interactions either with homologs of yeast Skp-1p or with other proteins.
4C29F9.4C29F9.4n/achrIII 122,565
5K08D9.6K08D9.6n/achrV 3,233,173contains similarity to Pfam domain PF01697 Domain of unknown function contains similarity to Interpro domains IPR008167 (Protein of unknown function DUF23, C-terminal), IPR008166 (Protein of unknown function DUF23)
6F53F4.4F53F4.4n/achrV 13,596,162contains similarity to Candida albicans Chitinase 3 precursor (EC 3.2.1.14).; SW:CHI3_CANAL
7T15D6.7T15D6.7n/achrI 12,387,268contains similarity to Pfam domain PF03360 Glycosyltransferase family 43 contains similarity to Interpro domain IPR005027 (Glycosyl transferase, family 43)
8T05C3.2T05C3.2n/achrV 5,498,362The T05C3.2 gene encodes a protein that may be involved in apoptosis.
9F17E9.2F17E9.2n/achrIV 8,356,187
10ref-1T01E8.2n/achrII 10,219,169ref-1 encodes a protein with two basic helix-loop-helix (bHLH) domains that is distantly related to the hairy/Enhancer of split subfamily of bHLH transcription factors; REF-1 is required in hermaphrodites during early larval development for regulating the pattern of posterior Pn.p hypodermal cell fusions, primarily through regulation of MAB-5 homeodomain protein activity; REF-1 is also required for head morphogenesis and specification of the V6 lateral seam cell fate; in males, ref-1 is a target of MAB-3 transcriptional repression which in turn, promotes expression of LIN-32, a proneural bHLH transcription factor.
11C40C9.4C40C9.4n/achrX 13,651,413contains similarity to Saccharomyces cerevisiae Protein with a putative role in sister chromatid segregation, potentially phosphorylated by Cdc28p; green fluorescent protein (GFP)-fusion protein localizes to the nuclear periphery; SGD:YML034W
12clec-249Y51A2A.7n/achrV 18,304,784C. elegans CLEC-249 protein; contains similarity to Interpro domains IPR016187 (C-type lectin fold), IPR016186 (C-type lectin-like), IPR001304 (C-type lectin)
13C27H5.6C27H5.6n/achrII 7,186,228
14K06H6.6K06H6.6n/achrV 584,556contains similarity to Pfam domain PF01531 Glycosyl transferase family 11 contains similarity to Interpro domain IPR002516 (Glycosyl transferase, family 11)
15str-171T01G5.5n/achrV 15,131,482C. elegans STR-171 protein; contains similarity to Pfam domain PF01461 7TM chemoreceptor contains similarity to Interpro domain IPR003002 (7TM chemoreceptor, subfamily 1)
16F57E7.2F57E7.2n/achrV 16,482,980contains similarity to Psilotum nudum Hypothetical protein.; TR:Q8WHW9
17F56H6.7F56H6.7n/achrI 12,299,265contains similarity to Pfam domain PF03385 Protein of unknown function, DUF288 contains similarity to Interpro domains IPR005049 (Protein of unknown function DUF288), IPR001692 (Histidinol dehydrogenase)
18spp-20K04A8.8n/achrV 6,557,433C. elegans SPP-20 protein; contains similarity to Pfam domain PF05184 Saposin-like type B, region 1 contains similarity to Interpro domains IPR011001 (Saposin-like), IPR007856 (Saposin-like type B, 1), IPR008139 (Saposin B)
19ttr-19C12D8.4n/achrV 10,227,127C. elegans TTR-19 protein; contains similarity to Pfam domain PF01060 Transthyretin-like family contains similarity to Interpro domain IPR001534 (Transthyretin-like)
20Y38H6C.19Y38H6C.19n/achrV 20,548,064contains similarity to Pfam domain PF03762 Vitelline membrane outer layer protein I (VOMI) contains similarity to Interpro domain IPR005515 (Vitelline membrane outer layer protein I (VOMI))
21scl-1F49E11.9n/achrIV 13,056,795scl-1 encodes a predicted secretory protein that is a member of the cysteine-rich secretory protein (CRISP) family; scl-1 activity positively regulates longevity and stress resistance; in wild-type animals, scl-1 mRNA is detected solely in eggs, while in daf-2 mutants it is detected in eggs and late adult stages; scl-1 expression appears to be under the control of the DAF-2/insulin-like signaling pathway as, in mixed-stage cultures, scl-1 mRNA levels are increased in daf-2 and age-1 mutants and undetectable in daf-16 mutants; scl-1 contains a DAF-16 consensus binding element within its predicted regulatory regions.
22pgp-8T21E8.3n/achrX 10,861,813pgp-8 encodes an ATP-binding protein that is a member of the P-glycoprotein subclass of the ATP-binding cassette (ABC) transporter superfamily; PGP-8 is predicted to function as a transmembrane protein that couples energy to transport of various molecules across membranes, but as loss of pgp-8 activity via RNAi results in no obvious defects, the precise role of PGP-8 in C. elegans development and/or behavior is not yet known; pgp-8 promoter-gfp fusion proteins are expressed in adult head neurons.
23C01G6.4C01G6.4n/achrII 9,272,092contains similarity to Pfam domain PF00097 Zinc finger, C3HC4 type (RING finger) contains similarity to Interpro domains IPR001841 (Zinc finger, RING-type), IPR013083 (Zinc finger, RING/FYVE/PHD-type), IPR011016 (Zinc finger, variant RING-type)
24F57A8.4F57A8.4n/achrV 10,067,924contains similarity to Interpro domains IPR017452 (GPCR, rhodopsin-like superfamily), IPR000276 (GPCR, rhodopsin-like)
25K09D9.9K09D9.9n/achrV 3,993,382
26R09D1.1R09D1.1n/achrII 9,442,815contains similarity to Pfam domain PF00704 Glycosyl hydrolases family 18 contains similarity to Interpro domains IPR011583 (Chitinase II), IPR017853 (Glycoside hydrolase, catalytic core), IPR001223 (Glycoside hydrolase, family 18, catalytic domain), IPR013781 (Glycoside hydrolase, subgroup, catalytic core)
27E03H4.5E03H4.5n/achrI 12,414,766contains similarity to Pfam domain PF01697 Domain of unknown function contains similarity to Interpro domain IPR008166 (Protein of unknown function DUF23)
28sulp-5K12G11.2n/achrV 11,881,591sulp-5 encodes one of eight C. elegans members of the sulfate permease family of anion transporters; by homology, SULP-5 is predicted to function as an anion transporter that regulates cellular pH and volume via transmembrane movement of electrolytes and fluids; a SULP-5::GFP fusion is expressed in punctate structures irregularly distributed along the apical membrane of excretory cell canals and is also expressed weakly in adult seam cells.
29clec-5C35D10.14n/achrIII 4,882,708C. elegans CLEC-5 protein; contains similarity to Pfam domains PF00431 (CUB domain) , PF00059 (Lectin C-type domain) (2)contains similarity to Interpro domains IPR000859 (CUB), IPR016187 (C-type lectin fold), IPR016186 (C-type lectin-like), IPR013838 (Beta tubulin, autoregulation binding site), IPR001304 (C-type lectin)
30K04F1.12K04F1.12n/achrV 1,656,168contains similarity to Pfam domain PF01030 Receptor L domain contains similarity to Interpro domain IPR000494 (EGF receptor, L domain)
31srh-227C35D6.2n/achrIV 16,343,304C. elegans SRH-227 protein; contains similarity to Pfam domain PF01461 7TM chemoreceptor contains similarity to Interpro domain IPR003002 (7TM chemoreceptor, subfamily 1)
32C31H5.6C31H5.6n/achrI 9,045,096contains similarity to Pfam domains PF08840 (BAAT / Acyl-CoA thioester hydrolase C terminal) , PF04775 (Acyl-CoA thioester hydrolase / Bile acid-CoA amino acid N-acetyltransferase) contains similarity to Interpro domains IPR006862 (Acyl-CoA thioester hydrolase/bile acid-CoA amino acid N-acetyltransferase), IPR014940 (BAAT/Acyl-CoA thioester hydrolase C-terminal), IPR016662 (Acyl-CoA thioesterase, long chain)
33Y38H6C.21Y38H6C.21n/achrV 20,550,079contains similarity to Aquifex aeolicus Flagellar biosynthetic protein flhB.; SW:FLHB_AQUAE
34C32D5.1C32D5.1n/achrII 6,344,783
35H12D21.4H12D21.4n/achrV 14,892,420contains similarity to Pfam domain PF00581 Rhodanese-like domain contains similarity to Interpro domains IPR001763 (Rhodanese-like), IPR001307 (Thiosulphate sulphurtransferase, conserved site)
36spp-6T08A9.10n/achrX 7,317,449spp-6 encodes a predicted transmembrane protein containing a saposin (B) domain that is a member of a saposin-like protein superfamily containing mammalian NK-lysin and granulysin and the protozoan amoebapores; SPP-6 is predicted to function as a lipid-binding protein that may possess pore-forming, cytotoxic activity; as loss of SPP-6 function via RNA-mediated interference (RNAi) does not result in any abnormalities, the precise role of SPP-6 in C. elegans development and/or behavior is not yet known.
37fbxa-161C08E3.4n/achrII 1,607,102C. elegans FBXA-161 protein; contains similarity to Pfam domain PF01827 FTH domain contains similarity to Interpro domain IPR002900 (Protein of unknown function DUF38, Caenorhabditis species)
38ugt-18ZC443.5n/achrV 12,821,489C. elegans UGT-18 protein; contains similarity to Pfam domains PF04101 (Glycosyltransferase family 28 C-terminal domain) , PF00201 (UDP-glucoronosyl and UDP-glucosyl transferase) contains similarity to Interpro domains IPR002213 (UDP-glucuronosyl/UDP-glucosyltransferase), IPR007235 (Glycosyl transferase, family 28, C-terminal)
39Y6E2A.4Y6E2A.4n/achrV 15,713,920contains similarity to Pfam domains PF00104 (Ligand-binding domain of nuclear hormone receptor) , PF00105 (Zinc finger, C4 type (two domains)) contains similarity to Interpro domains IPR008946 (Nuclear hormone receptor, ligand-binding), IPR001723 (Steroid hormone receptor), IPR000324 (Vitamin D receptor), IPR013088 (Zinc finger, NHR/GATA-type), IPR001628 (Zinc finger, nuclear hormone receptor-type), IPR000536 (Nuclear hormone receptor, ligand-binding, core), IPR002219 (Protein kinase C, phorbol ester/diacylglycerol binding)
40T04A11.5T04A11.5n/achrIV 12,485,693contains similarity to Pfam domain PF02567 Phenazine biosynthesis-like protein contains similarity to Interpro domain IPR003719 (Phenazine biosynthesis PhzC/PhzF protein)
41R03H4.5R03H4.5n/achrV 9,020,799contains similarity to Pfam domain PF01757 Acyltransferase family contains similarity to Interpro domain IPR002656 (Acyltransferase 3)
42Y106G6D.6Y106G6D.6n/achrI 10,120,080contains similarity to Interpro domain IPR016054 (Ly-6 antigen / uPA receptor -like)
43H43I07.1H43I07.1n/achrV 4,206,564contains similarity to Interpro domains IPR010754 (Optic atrophy 3-like), IPR005819 (Histone H5)
44C54D10.8C54D10.8n/achrV 12,445,902contains similarity to Homo sapiens cDNA FLJ44007 fis, clone TESTI4023762; ENSEMBL:ENSP00000364402
45T23F4.3T23F4.3n/achrII 1,170,980contains similarity to Pfam domain PF01738 Dienelactone hydrolase family contains similarity to Interpro domain IPR002925 (Dienelactone hydrolase)
46srx-84F35B12.1n/achrV 11,599,872C. elegans SRX-84 protein; contains similarity to Pfam domain PF01748 Caenorhabditis serpentine receptor-like protein contains similarity to Interpro domain IPR002651 (Protein of unknown function DUF32)
47H12D21.3H12D21.3n/achrV 14,886,000contains similarity to Plasmodium cynomolgi Circumsporozoite protein precursor (CS).; SW:P08675
48C42C1.2C42C1.2n/achrIV 12,266,886contains similarity to Pfam domain PF00481 Protein phosphatase 2C contains similarity to Interpro domains IPR001932 (Protein phosphatase 2C-related), IPR000222 (), IPR014045 (Protein phosphatase 2C, N-terminal), IPR015655 (Protein phosphatase 2C)
49T13F3.4T13F3.4n/achrV 16,265,325contains similarity to Pfam domain PF01579 Domain of unknown function DUF19 contains similarity to Interpro domain IPR002542 (Protein of unknown function DUF19)
50F15D4.2F15D4.2n/achrII 13,216,307contains similarity to Strongylocentrotus purpuratus Protein ENDO16 (Fragment).; SW:P13665