UCSC C. elegans Gene Sorter
 
genome assembly search
sort by display output 
#
Name
WormBase
BLASTP
E-Value
Genome Position
Description
1T10E10.4T10E10.40chrX 6,318,637T10E10.4 encodes a large (966-residue) protein, predicted to be secreted, with two N-terminal chitin-binding peritrophin-A domains followed by 14 cysteine-rich domains and one C-terminal EB module; the general organization of T10E10.4 protein resembles that of K04H4.2; T10E10.4 has no obvious function in mass RNAi assays but, like CEJ-1 and CPG-2, might participate in chitin synthesis.
2F46F5.14F46F5.14n/achrII 800,774contains similarity to Pfam domain PF03314 Protein of unknown function, DUF273 contains similarity to Interpro domain IPR004988 (Protein of unknown function DUF273)
3F34H10.4F34H10.4n/achrX 9,649,656contains similarity to Interpro domain IPR002253 (Flavin-containing monooxygenase (FMO) 1)
4ZK488.6ZK488.6n/achrV 591,473contains similarity to Pfam domain PF01697 Domain of unknown function contains similarity to Interpro domain IPR008166 (Protein of unknown function DUF23)
5R53.4R53.4n/achrII 9,967,683contains similarity to Homo sapiens 10 kDa protein; ENSEMBL:ENSP00000377740
6C26E1.2C26E1.2n/achrV 13,306,168contains similarity to Interpro domain IPR000169 (Eukaryotic thiol (cysteine) protease)
7B0238.1B0238.1n/achrV 5,241,934contains similarity to Pfam domain PF00135 Carboxylesterase contains similarity to Interpro domain IPR002018 (Carboxylesterase, type B)
8orai-1C09F5.2n/achrIII 653,677C. elegans ORAI-1 protein; contains similarity to Pfam domain PF07856 Protein of unknown function (DUF1650) contains similarity to Interpro domain IPR012446 (Protein of unknown function DUF1650)
9C32D5.6C32D5.6n/achrII 6,332,890contains similarity to Interpro domain IPR013026 (Tetratricopeptide region)
10R05D3.6R05D3.6n/achrIII 8,350,531R05D3.6 encodes the epsilon subunit of the soluble, catalytic F1 portion of ATP synthase (mitochondrial respiratory chain [MRC] complex V); RNAi experiments indicate that loss of R05D3.6 activity has minor effects on growth rate.
11T20D4.6T20D4.6n/achrV 3,411,676contains similarity to Pfam domains PF00339 (Arrestin (or S-antigen), N-terminal domain) , PF02752 (Arrestin (or S-antigen), C-terminal domain) contains similarity to Interpro domains IPR014756 (Immunoglobulin E-set), IPR011022 (Arrestin-like, C-terminal), IPR014752 (Arrestin, C-terminal), IPR011021 (Arrestin-like, N-terminal)
12F25C8.4F25C8.4n/achrV 20,901,062contains similarity to Pfam domain PF00501 AMP-binding enzyme contains similarity to Interpro domain IPR000873 (AMP-dependent synthetase and ligase)
13fip-4F41E6.10n/achrV 8,611,069C. elegans FIP-4 protein
14bcmo-2F53C3.12n/achrII 3,909,661C. elegans BCMO-2 protein; contains similarity to Pfam domain PF03055 Retinal pigment epithelial membrane protein contains similarity to Interpro domains IPR004294 (Carotenoid oxygenase), IPR015123 (Bcr-Abl oncoprotein oligomerisation)
15ugt-42F31F4.7n/achrV 648,465C. elegans UGT-42 protein; contains similarity to Pfam domain PF00201 UDP-glucoronosyl and UDP-glucosyl transferase contains similarity to Interpro domain IPR002213 (UDP-glucuronosyl/UDP-glucosyltransferase)
16C49C3.10C49C3.10n/achrIV 17,337,847contains similarity to Pfam domain PF00069 Protein kinase domain contains similarity to Interpro domains IPR002290 (Serine/threonine protein kinase), IPR011009 (Protein kinase-like), IPR008271 (Serine/threonine protein kinase, active site), IPR000719 (Protein kinase, core), IPR000215 (Protease inhibitor I4, serpin), IPR001245 (Tyrosine protein kinase), IPR017442 (Serine/threonine protein kinase-related)
17F41E7.6F41E7.6n/achrX 10,308,733contains similarity to Pfam domain PF00755 Choline/Carnitine o-acyltransferase contains similarity to Interpro domain IPR000542 (Acyltransferase ChoActase/COT/CPT)
18T21C9.6T21C9.6n/achrV 10,584,474contains similarity to Pfam domains PF00391 (PEP-utilising enzyme, mobile domain) , PF01326 (Pyruvate phosphate dikinase, PEP/pyruvate binding domain) contains similarity to Interpro domains IPR008279 (PEP-utilising enzyme, mobile region), IPR013815 (ATP-grasp fold, subdomain 1), IPR002192 (Pyruvate phosphate dikinase, PEP/pyruvate-binding), IPR013816 (ATP-grasp fold, subdomain 2)
19abf-4Y38H6C.22n/achrV 20,553,545abf-4 encodes a homolog of the antibacterial factor ASABF from Ascaris suum; ABF-4 may play a role in innate immunity, though at present the only evidence for its having an antimicrobial humoral function is its sequence similarity.
20W04C9.2W04C9.2n/achrI 489,263
21T28F3.9T28F3.9n/achrIV 17,310,065contains similarity to Pfam domain PF02485 Core-2/I-Branching enzyme contains similarity to Interpro domain IPR003406 (Glycosyl transferase, family 14)
22C01F1.4C01F1.4n/achrII 4,277,663contains similarity to Pfam domain PF00001 7 transmembrane receptor (rhodopsin family) contains similarity to Interpro domains IPR017452 (GPCR, rhodopsin-like superfamily), IPR000276 (GPCR, rhodopsin-like)
23pxn-1ZK994.3n/achrV 8,498,505C. elegans PXN-1 protein; contains similarity to Pfam domains PF07686 (Immunoglobulin V-set domain) , PF00047 (Immunoglobulin domain) (2), PF00560 (Leucine Rich Repeat) (4), PF01462 (Leucine rich repeat N-terminal domain) , PF07679 (Immunoglobulin I-set domain) (2), PF03098 (Animal haem peroxidase) contains similarity to Interpro domains IPR003598 (Immunoglobulin subtype 2), IPR000483 (Cysteine-rich flanking region, C-terminal), IPR001611 (Leucine-rich repeat), IPR013098 (Immunoglobulin I-set), IPR010255 (Haem peroxidase), IPR003596 (Immunoglobulin V-set, subgroup), IPR013783 (Immunoglobulin-like fold), IPR003591 (Leucine-rich repeat, typical subtype), IPR013106 (Immunoglobulin V-set), IPR007110 (Immunoglobulin-like), IPR002007 (Haem peroxidase, animal), IPR000372 (Leucine-rich repeat, cysteine-rich flanking region, N-terminal), IPR003599 (Immunoglobulin subtype), IPR013151 (Immunoglobulin)
24T19H12.3T19H12.3n/achrV 4,886,241contains similarity to Interpro domain IPR002213 (UDP-glucuronosyl/UDP-glucosyltransferase)
25mab-10R166.1n/achrII 10,532,058C. elegans MAB-10 protein; contains similarity to Pfam domains PF04905 (NAB conserved region 2 (NCD2)) , PF04904 (NAB conserved region 1 (NCD1)) contains similarity to Interpro domains IPR010993 (Sterile alpha motif homology), IPR006988 (Nab, N-terminal), IPR006989 (Nab, central region)
26gnrr-6F13D2.2n/achrX 11,179,951C. elegans GNRR-6 protein; contains similarity to Pfam domain PF00001 7 transmembrane receptor (rhodopsin family) contains similarity to Interpro domains IPR017452 (GPCR, rhodopsin-like superfamily), IPR000276 (GPCR, rhodopsin-like)
27F46G10.4F46G10.4n/achrX 13,335,352contains similarity to Pfam domain PF01764 Lipase (class 3) contains similarity to Interpro domain IPR002921 (Lipase, class 3)
28F19C7.2F19C7.2n/achrIV 4,601,343contains similarity to Pfam domain PF05577 Serine carboxypeptidase S28 contains similarity to Interpro domain IPR008758 (Peptidase S28)
29B0554.2B0554.2n/achrV 435,748contains similarity to Pfam domain PF02795 Domain of unknown function (DUF225) contains similarity to Interpro domain IPR004024 (Protein of unknown function DUF225)
30T25F10.1T25F10.1n/achrV 6,768,591
31C06E2.1C06E2.1n/achrX 8,873,724contains similarity to Interpro domain IPR007087 (Zinc finger, C2H2-type)
32fozi-1K01B6.1n/achrIII 9,291,244fozi-1 encodes an unusual zinc-finger protein that has two C2H2 zinc-finger motifs that probably mediate transcriptional regulation along with a glutamine-rich region and a vestigial formin homology 2 (FH2) domain that has lost its ability to polymerize actin but retained its ability to dimerize; during postembryonic development, FOZI-1 acts with MAB-5 and redundantly with HLH-1/CeMyoD to autonomously specify coelomocyte and striated body wall muscle fates; in addition, fozi-1 is required for the fully asymmetrical phenotypic distinction of ASER cells from ASEL cells; fozi-1 mutant animals variably express flp-4, gcy-6, gcy-7 and lim-6, genes normally restricted to ASEL, in ASER as well, while maintaining expression of ASER-specific genes; ectopic FOZI-1 expression in ASEL can suppress lim-6 expression; fozi-1 genetically interacts with several regulatory proteins and miRNAs; FOZI-1 is a nuclear protein that is expressed in neuronal lineages beginning at the 2-fold stage of embryogenesis, and then in neurons and cells derived from the M mesoblast during larval development; expression in the M lineage corresponds to cells that will generate coelomocytes and body wall muscles and is not seen in the sex myoblasts (SMs); FOZI-1 expression in the M lineage requires the Hox co-factor CEH-20.
33ttll-15K07C5.7n/achrV 10,359,962ttll-15 encodes a putative tubulin polyaminoacid ligase orthologous to Drosophila melanogaster CG4089 and Tetrahymena thermophila TTLL15; TTLL-15 has no obvious function in mass RNAi assays.
34F58E2.4F58E2.4n/achrIV 3,465,102contains similarity to Pfam domains PF01827 (FTH domain) (2), PF00646 (F-box domain) contains similarity to Interpro domain IPR002900 (Protein of unknown function DUF38, Caenorhabditis species)
35H10E21.1H10E21.1n/achrIII 16,729
36F32B4.6F32B4.6n/achrI 11,516,108contains similarity to Pfam domains PF07819 (PGAP1-like protein) , PF00561 (alpha/beta hydrolase fold) contains similarity to Interpro domains IPR000073 (Alpha/beta hydrolase fold-1), IPR012908 (PGAP1-like)
37F42C5.4F42C5.4n/achrIV 7,290,079contains similarity to Interpro domain IPR001841 (Zinc finger, RING-type)
38F56A12.2F56A12.2n/achrV 14,377,560contains similarity to Interpro domain IPR017452 (GPCR, rhodopsin-like superfamily)
39R09D1.7R09D1.7n/achrII 9,455,937contains similarity to Pfam domain PF00704 Glycosyl hydrolases family 18 contains similarity to Interpro domains IPR011583 (Chitinase II), IPR017853 (Glycoside hydrolase, catalytic core), IPR001223 (Glycoside hydrolase, family 18, catalytic domain), IPR013781 (Glycoside hydrolase, subgroup, catalytic core), IPR001574 (Ribosome-inactivating protein)
40W02B12.9W02B12.9n/achrII 11,470,937contains similarity to Pfam domain PF00153 Mitochondrial carrier protein contains similarity to Interpro domains IPR002067 (Mitochondrial carrier protein), IPR001993 (Mitochondrial substrate carrier), IPR002113 (Adenine nucleotide translocator 1)
41F32A11.1F32A11.1n/achrII 13,158,777contains similarity to Interpro domains IPR016071 (Staphylococcal nuclease (SNase-like), OB-fold), IPR006021 (Staphylococcal nuclease (SNase-like))
42C30F12.2C30F12.2n/achrI 6,969,030contains similarity to Pfam domain PF03969 AFG1-like ATPase contains similarity to Interpro domains IPR005654 (AFG1-like ATPase), IPR003593 (AAA+ ATPase, core)
43R08E3.2R08E3.2n/achrX 4,823,223contains similarity to Interpro domains IPR001438 (EGF-like, type 2), IPR000742 (EGF-like, type 3), IPR013032 (EGF-like region, conserved site)
44H02F09.3H02F09.3n/achrX 1,570,762contains similarity to Interpro domain IPR001757 (ATPase, P-type, K/Mg/Cd/Cu/Zn/Na/Ca/Na/H-transporter)
45K10D11.5K10D11.5n/achrIV 12,990,724contains similarity to Pfam domain PF02408 CUB-like domain contains similarity to Interpro domains IPR000859 (CUB), IPR003006 (Immunoglobulin/major histocompatibility complex, conserved site), IPR003366 (CUB-like region)
46C42C1.7C42C1.7n/achrIV 12,297,231contains similarity to Pfam domain PF01757 Acyltransferase family contains similarity to Interpro domain IPR002656 (Acyltransferase 3)
47C12D12.5C12D12.5n/achrX 3,505,953contains similarity to Pfam domain PF00505 HMG (high mobility group) box contains similarity to Interpro domains IPR000910 (High mobility group box, HMG1/HMG2), IPR009071 (High mobility group box, HMG)
48F16H6.10F16H6.10n/achrV 18,223,587contains similarity to Haemophilus influenzae Putative protease HI0419 (EC 3.4.-.-).; SW:YEGQ_HAEIN
49gcy-1AH6.1n/achrII 9,514,635gcy-1 is predicted to encode a guanylate cyclase; however, transcriptional fusions of the putative upstream regulatory region with a GFP reporter did not confirm its expression.
50C29E6.4C29E6.4n/achrIV 11,881,077contains similarity to Pfam domain PF00024 PAN domain contains similarity to Interpro domains IPR003609 (Apple-like), IPR003014 (N/apple PAN), IPR001507 (Endoglin/CD105 antigen)