UCSC C. elegans Gene Sorter
 
genome assembly search
sort by display output 
#
Name
WormBase
BLASTP
E-Value
Genome Position
Description
1str-124T22H6.30chrX 12,788,379C. elegans STR-124 protein; contains similarity to Pfam domain PF01461 7TM chemoreceptor contains similarity to Interpro domain IPR003002 (7TM chemoreceptor, subfamily 1)
2sra-17F28C12.1n/achrI 12,689,638C. elegans SRA-17 protein; contains similarity to Pfam domain PF02117 C.elegans Sra family integral membrane protein contains similarity to Interpro domain IPR000344 (Nematode chemoreceptor, Sra)
3srw-143H27D07.3n/achrV 2,940,553C. elegans SRW-143 protein; contains similarity to Interpro domain IPR017452 (GPCR, rhodopsin-like superfamily)
4clec-46F07C4.9n/achrV 7,637,516C. elegans CLEC-46 protein; contains similarity to Pfam domain PF00059 Lectin C-type domain contains similarity to Interpro domains IPR016187 (C-type lectin fold), IPR016186 (C-type lectin-like), IPR001304 (C-type lectin)
5F58E2.5F58E2.5n/achrIV 3,445,718contains similarity to Pfam domain PF00188 SCP-like extracellular protein contains similarity to Interpro domains IPR014044 (SCP-like extracellular), IPR001283 (Allergen V5/Tpx-1 related)
6ZK994.1ZK994.1n/achrV 8,511,428contains similarity to Pfam domain PF00135 Carboxylesterase contains similarity to Interpro domain IPR002018 (Carboxylesterase, type B)
7str-252C06B3.95e-32chrV 13,917,252C. elegans STR-252 protein; contains similarity to Pfam domain PF01461 7TM chemoreceptor contains similarity to Interpro domains IPR008365 (Prostanoid receptor), IPR003002 (7TM chemoreceptor, subfamily 1)
8sre-38F15A4.1n/achrII 12,458,457C. elegans SRE-38 protein; contains similarity to Pfam domain PF03125 C. elegans Sre G protein-coupled chemoreceptor contains similarity to Interpro domain IPR004151 (C. elegans Sre G protein-coupled chemoreceptor)
9C18A11.6C18A11.6n/achrX 8,034,037
10T26C11.4T26C11.4n/achrX 1,843,047contains similarity to Dictyostelium discoideum Similar to Homo sapiens (Human). Dentin sialophosphoprotein [Contains:sDentin phosphoprotein (Dentin phosphophoryn) (DPP); Dentinssialoprotein (DSP)].; TR:Q869X8
11Y75B8A.34Y75B8A.34n/achrIII 12,360,286contains similarity to Homo sapiens Kappa-type opioid receptor; ENSEMBL:ENSP00000265572
12old-1C08H9.5n/achrII 9,867,626old-1 encodes a receptor protein tyrosine kinase; old-1 activity is required for stress resistance and regulation of adult lifespan: old-1 mRNA expression is upregulated in response to stress and in daf-2 and age-1 mutant backgrounds; likewise, overexpression of old-1 in wild-type animals extends lifespan and increases resistance to heat and UV irradiation; an OLD-1::GFP fusion protein is expressed in the anterior region of worms, in neuronal, hypodermal, and pharyngeal tissues, as well as in the proximal region of the male gonad; expression is visible in young adults and appears to increase as animals age and in response to heat, starvation, or UV irradiation.
13nkat-1F28H6.3n/achrX 14,139,007nkat-1 encodes kynurenine aminotransferase III, an ortholog of mammalian KAT3; nkat-1(RNAi) animals have no obvious phenotype.
14srx-76K12G11.5n/achrV 11,892,608C. elegans SRX-76 protein; contains similarity to Pfam domain PF01748 Caenorhabditis serpentine receptor-like protein contains similarity to Interpro domain IPR002651 (Protein of unknown function DUF32)
15C31B8.2C31B8.2n/achrV 2,917,112contains similarity to Pfam domain PF08277 PAN-like domain contains similarity to Interpro domain IPR006583 (CW)
16R10A10.1R10A10.1n/achrI 6,418,689
17Y39E4B.13Y39E4B.13n/achrIII 13,092,265contains similarity to Caulobacter crescentus Localization factor podJL (Polar organelle development protein)s[Contains: Localization factor podJS].; SW:PODJ_CAUCR
18D2007.2D2007.2n/achrIII 8,153,415D2007.2 is orthologous to the human gene TRANSKETOLASE (WERNICKE-KORSAKOFF SYNDROME) (TNF; OMIM:606781), which when mutated leads to disease.
19C07D8.3C07D8.3n/achrX 7,361,807
20F54G2.2F54G2.2n/achrX 2,636,226contains similarity to Pfam domain PF00098 Zinc knuckle contains similarity to Interpro domains IPR009007 (Peptidase aspartic, catalytic), IPR001969 (Peptidase aspartic, active site), IPR001878 (Zinc finger, CCHC-type)
21C50H2.6C50H2.6n/achrV 9,921,737contains similarity to Pfam domain PF00501 AMP-binding enzyme contains similarity to Interpro domain IPR000873 (AMP-dependent synthetase and ligase)
22srbc-48F54B8.6n/achrV 15,820,807C. elegans SRBC-48 protein; contains similarity to Pfam domain PF01748 Caenorhabditis serpentine receptor-like protein contains similarity to Interpro domains IPR017452 (GPCR, rhodopsin-like superfamily), IPR002651 (Protein of unknown function DUF32)
23str-38T23D5.22e-22chrV 15,731,518C. elegans STR-38 protein; contains similarity to Pfam domain PF01461 7TM chemoreceptor contains similarity to Interpro domain IPR003002 (7TM chemoreceptor, subfamily 1)
24tbx-9T07C4.6n/achrIII 10,340,812C. elegans TBX-9 protein; contains similarity to Pfam domain PF00907 T-box contains similarity to Interpro domains IPR008967 (p53-like transcription factor, DNA-binding), IPR001699 (Transcription factor, T-box)
25C17H1.6C17H1.6n/achrI 13,131,624contains similarity to Danio rerio Arginine and glutamate-rich protein 1-B.; SW:Q6P5L7
26sodh-2K12G11.4n/achrV 11,890,433C. elegans SODH-2 protein; contains similarity to Pfam domains PF00107 (Zinc-binding dehydrogenase) , PF08240 (Alcohol dehydrogenase GroES-like domain) contains similarity to Interpro domains IPR013149 (Alcohol dehydrogenase, zinc-binding), IPR011032 (GroES-like), IPR013154 (Alcohol dehydrogenase GroES-like), IPR002085 (Alcohol dehydrogenase superfamily, zinc-containing), IPR016040 (NAD(P)-binding), IPR002328 (Alcohol dehydrogenase, zinc-containing, conserved site)
27F09F9.1F09F9.1n/achrX 4,116,127contains similarity to Dirofilaria immitis Cuticular antigen.; TR:Q965D8
28math-16C16C4.8n/achrII 1,878,171C. elegans MATH-16 protein; contains similarity to Pfam domain PF00917 MATH domain contains similarity to Interpro domains IPR008974 (TRAF-like), IPR002083 (MATH)
29srg-44F31E9.2n/achrV 17,329,671C. elegans SRG-44 protein; contains similarity to Pfam domain PF02118 C.elegans Srg family integral membrane protein contains similarity to Interpro domain IPR000609 (Serpentine gamma receptor, Caenorhabditis species)
30C07E3.8C07E3.8n/achrII 10,352,798contains similarity to Pfam domain PF06542 Protein of unknown function (DUF1114) contains similarity to Interpro domain IPR009497 (Protein of unknown function DUF1114)
31str-109F10A3.53e-33chrV 16,161,427C. elegans STR-109 protein; contains similarity to Pfam domain PF01461 7TM chemoreceptor contains similarity to Interpro domain IPR003002 (7TM chemoreceptor, subfamily 1)
32srbc-23C45H4.9n/achrV 2,154,343C. elegans SRBC-23 protein; contains similarity to Pfam domain PF01748 Caenorhabditis serpentine receptor-like protein contains similarity to Interpro domain IPR002651 (Protein of unknown function DUF32)
33nas-16K03B8.1n/achrV 11,392,697nas-16 encodes an astacin-like metalloprotease.
34clec-198C49C3.13n/achrIV 17,349,079C. elegans CLEC-198 protein; contains similarity to Pfam domain PF00059 Lectin C-type domain contains similarity to Interpro domains IPR016187 (C-type lectin fold), IPR016186 (C-type lectin-like), IPR001304 (C-type lectin)
35hil-1C30G7.1n/achrV 14,951,239C. elegans HIL-1 protein; contains similarity to Pfam domain PF00538 linker histone H1 and H5 family contains similarity to Interpro domains IPR011991 (Winged helix repressor DNA-binding), IPR005819 (Histone H5), IPR005818 (Histone H1/H5), IPR003216 (Linker histone, N-terminal)
36Y37A1B.9Y37A1B.9n/achrIV 14,018,009contains similarity to Pfam domain PF01030 Receptor L domain contains similarity to Interpro domain IPR000494 (EGF receptor, L domain)
37F58D12.3F58D12.3n/achrV 14,062,015contains similarity to Interpro domain IPR009091 (Regulator of chromosome condensation/beta-lactamase-inhibitor protein II)
38T05A10.6T05A10.6n/achrX 10,793,737contains similarity to Interpro domain IPR014044 (SCP-like extracellular)
39F16G10.8F16G10.8n/achrII 2,382,692contains similarity to Pfam domain PF02343 Domain of unknown function DUF130 contains similarity to Interpro domain IPR003326 (Protein of unknown function DUF130)
40C03E10.1C03E10.1n/achrV 11,291,855contains similarity to Anopheles quadrimaculatus NADH-ubiquinone oxidoreductase chain 4 (EC 1.6.5.3).; SW:NU4M_ANOQU
41F21H12.2F21H12.2n/achrII 6,088,063
42gst-30ZK546.11n/achrII 4,934,462C. elegans GST-30 protein; contains similarity to Pfam domains PF00043 (Glutathione S-transferase, C-terminal domain) , PF02798 (Glutathione S-transferase, N-terminal domain) contains similarity to Interpro domains IPR012336 (Thioredoxin-like fold), IPR012335 (Thioredoxin fold), IPR004046 (Glutathione S-transferase, C-terminal), IPR004045 (Glutathione S-transferase, N-terminal), IPR010987 (Glutathione S-transferase, C-terminal-like)
43F16G10.1F16G10.1n/achrII 2,402,918contains similarity to Pfam domain PF02343 Domain of unknown function DUF130 contains similarity to Interpro domain IPR003326 (Protein of unknown function DUF130)
44srxa-7C31A11.6n/achrV 16,308,625C. elegans SRXA-7 protein; contains similarity to Pfam domain PF03383 Caenorhabditis serpentine receptor-like protein, class xa contains similarity to Interpro domain IPR005047 (Protein of unknown function DUF286, G protein-coupled receptor-like putative Caenorhabditis species)
45fbxa-41F52D2.1n/achrX 1,949,939This gene encodes a protein containing an F-box, a motif predicted to mediate protein-protein interactions either with homologs of yeast Skp-1p or with other proteins; this gene's encoded protein also contains an FTH/DUF38 motif, which may also mediate protein-protein interaction.
46C31E10.4C31E10.4n/achrX 13,989,751
47nhr-79T26H2.9n/achrV 19,209,750C. elegans NHR-79 protein; contains similarity to Pfam domains PF00104 (Ligand-binding domain of nuclear hormone receptor) , PF00105 (Zinc finger, C4 type (two domains)) contains similarity to Interpro domains IPR008946 (Nuclear hormone receptor, ligand-binding), IPR001723 (Steroid hormone receptor), IPR000324 (Vitamin D receptor), IPR013088 (Zinc finger, NHR/GATA-type), IPR001628 (Zinc finger, nuclear hormone receptor-type), IPR000536 (Nuclear hormone receptor, ligand-binding, core)
48F46B3.2F46B3.2n/achrV 20,594,388contains similarity to Pfam domain PF01549 ShK domain-like contains similarity to Interpro domain IPR003582 (Metridin-like ShK toxin)
49ZK1055.5ZK1055.5n/achrV 6,582,618contains similarity to Pfam domain PF03269 Caenorhabditis protein of unknown function, DUF268 contains similarity to Interpro domain IPR004951 (Protein of unknown function DUF268, Caenorhabditis species)
50Y26D4A.5Y26D4A.5n/achrI 13,076,809contains similarity to Staphylococcus aureus Hypothetical protein SAV2385 (Hypothetical protein MW2305).; TR:Q99RP4