UCSC C. elegans Gene Sorter
 
genome assembly search
sort by display output 
#
Name
WormBase
BLASTP
E-Value
Genome Position
Description
1T26H2.5T26H2.51e-105chrV 19,231,365contains similarity to Pfam domain PF00569 Zinc finger, ZZ type contains similarity to Interpro domain IPR000433 (Zinc finger, ZZ-type)
2skr-9C52D10.7n/achrIV 17,163,837skr-9 encodes a homolog of Skp1 in S. cerevisiae, a component of the SCF (Skp1, Cullin, F-box) ubiquitin-ligase complex that regulates ubiquitin-mediated protein degradation; SKR-9 is required for posterior body morphogenesis, embryonic and larval development, and postembryonic cell proliferation.
3nhr-195F59E11.10n/achrV 8,971,529C. elegans NHR-195 protein; contains similarity to Pfam domain PF00105 Zinc finger, C4 type (two domains) contains similarity to Interpro domains IPR008946 (Nuclear hormone receptor, ligand-binding), IPR013088 (Zinc finger, NHR/GATA-type), IPR001628 (Zinc finger, nuclear hormone receptor-type), IPR000536 (Nuclear hormone receptor, ligand-binding, core)
4W03D2.9W03D2.9n/achrIV 4,074,075contains similarity to Interpro domain IPR009151 (Basigin)
5Y44F5A.1Y44F5A.1n/achrIII 4,246,236contains similarity to Interpro domains IPR017422 (WD repeat protein 55), IPR011046 (WD40 repeat-like), IPR001680 (WD40 repeat), IPR015943 (WD40/YVTN repeat-like)
6srt-47Y41E3.12n/achrIV 15,051,352C. elegans SRT-47 protein; contains similarity to Pfam domain PF01748 Caenorhabditis serpentine receptor-like protein contains similarity to Interpro domains IPR002651 (Protein of unknown function DUF32), IPR006121 (Heavy metal transport/detoxification protein)
7E03H4.11E03H4.11n/achrI 12,433,962contains similarity to Pfam domain PF01762 Galactosyltransferase contains similarity to Interpro domain IPR002659 (Glycosyl transferase, family 31)
8srh-24R10D12.11n/achrV 13,959,859C. elegans SRH-24 protein; contains similarity to Pfam domain PF01461 7TM chemoreceptor contains similarity to Interpro domain IPR003002 (7TM chemoreceptor, subfamily 1)
9R06A10.1R06A10.1n/achrI 1,087,211contains similarity to Interpro domain IPR016196 (MFS general substrate transporter)
10C46A5.1C46A5.1n/achrIV 7,765,495contains similarity to Pfam domain PF00102 Protein-tyrosine phosphatase contains similarity to Interpro domains IPR003595 (Protein-tyrosine phosphatase, catalytic), IPR000242 (Protein-tyrosine phosphatase, receptor/non-receptor type), IPR000387 (Protein-tyrosine phosphatase)
11srh-212T22F3.6n/achrV 3,596,155C. elegans SRH-212 protein; contains similarity to Pfam domain PF01461 7TM chemoreceptor contains similarity to Interpro domains IPR001463 (Sodium:alanine symporter), IPR003002 (7TM chemoreceptor, subfamily 1)
12T08G3.6T08G3.6n/achrV 16,446,543contains similarity to Interpro domain IPR008975 ()
13K02F6.7K02F6.7n/achrII 2,527,240
14ced-3C48D1.2n/achrIV 13,202,258The ced-3 gene encodes a protease required for apoptosis.
15scl-8C39E9.6n/achrIV 13,072,085C. elegans SCL-8 protein; contains similarity to Pfam domain PF00188 SCP-like extracellular protein contains similarity to Interpro domains IPR014044 (SCP-like extracellular), IPR002413 (Ves allergen), IPR001283 (Allergen V5/Tpx-1 related)
16T05B4.4T05B4.4n/achrV 4,128,560
17str-60T06C12.1n/achrV 15,898,679C. elegans STR-60 protein; contains similarity to Pfam domain PF01461 7TM chemoreceptor contains similarity to Interpro domain IPR003002 (7TM chemoreceptor, subfamily 1)
18C54C8.3C54C8.3n/achrI 12,447,783contains similarity to Pfam domain PF01762 Galactosyltransferase contains similarity to Interpro domain IPR002659 (Glycosyl transferase, family 31)
19C03B1.3C03B1.3n/achrX 6,366,380
20B0554.7B0554.7n/achrV 439,300contains similarity to Pfam domains PF07690 (Major Facilitator Superfamily) , PF05978 (Eukaryotic protein of unknown function (DUF895)) contains similarity to Interpro domains IPR010291 (Protein of unknown function DUF895, eukaryotic), IPR011701 (Major facilitator superfamily MFS-1), IPR016196 (MFS general substrate transporter)
21C23H4.4C23H4.4n/achrX 12,231,444contains similarity to Pfam domain PF00135 Carboxylesterase contains similarity to Interpro domains IPR008262 (Lipase, active site), IPR000062 (Thymidylate kinase), IPR002018 (Carboxylesterase, type B)
22F14F8.9F14F8.9n/achrV 16,668,104contains similarity to Interpro domain IPR002625 (Smr protein/MutS2 C-terminal)
23srh-11R09F10.6n/achrX 8,318,283C. elegans SRH-11 protein; contains similarity to Pfam domain PF01461 7TM chemoreceptor contains similarity to Interpro domain IPR003002 (7TM chemoreceptor, subfamily 1)
24T08G3.7T08G3.7n/achrV 16,464,369contains similarity to Pfam domains PF02206 (Domain of unknown function) , PF00023 (Ankyrin repeat) , PF00533 (BRCA1 C Terminus (BRCT) domain) contains similarity to Interpro domains IPR002110 (Ankyrin), IPR003125 (Protein of unknown function WSN), IPR001357 (BRCT)
25R05C11.2R05C11.2n/achrIV 2,058,493contains similarity to Pfam domain PF01827 FTH domain contains similarity to Interpro domain IPR002900 (Protein of unknown function DUF38, Caenorhabditis species)
26ZK402.2ZK402.2n/achrX 1,403,926contains similarity to Pfam domain PF04435 Domain of unknown function (DUF545) contains similarity to Interpro domain IPR006570 (SPK)
27fbxa-7T20H9.1n/achrIII 2,250,698C. elegans FBXA-7 protein; contains similarity to Pfam domains PF01827 (FTH domain) , PF00646 (F-box domain) contains similarity to Interpro domains IPR002900 (Protein of unknown function DUF38, Caenorhabditis species), IPR001810 (Cyclin-like F-box)
28Y6B3B.3Y6B3B.3n/achrI 13,716,143contains similarity to Interpro domain IPR010133 ()
29F10C2.7F10C2.7n/achrV 12,055,113contains similarity to Pfam domain PF07690 Major Facilitator Superfamily contains similarity to Interpro domains IPR007114 (Major facilitator superfamily), IPR011701 (Major facilitator superfamily MFS-1), IPR016196 (MFS general substrate transporter)
30C47E8.6C47E8.6n/achrV 14,690,485contains similarity to Pfam domains PF07735 (F-box associated) , PF00646 (F-box domain) contains similarity to Interpro domains IPR001810 (Cyclin-like F-box), IPR012885 (F-box associated type 2)
31K02F6.6K02F6.6n/achrII 2,530,385contains similarity to Pfam domain PF02214 K+ channel tetramerisation domain contains similarity to Interpro domains IPR011333 (BTB/POZ fold), IPR003131 (Potassium channel, voltage dependent, Kv, tetramerisation)
32clec-188M199.3n/achrIV 15,117,866C. elegans CLEC-188 protein; contains similarity to Pfam domain PF08277 PAN-like domain contains similarity to Interpro domains IPR006583 (CW), IPR016187 (C-type lectin fold), IPR001304 (C-type lectin)
33sre-21C47A10.4n/achrV 17,771,397C47A10.4 is orthologous to the human gene ALBINISM, OCULAR, TYPE I (OA1; OMIM:300500), which when mutated leads to Nettleship-Falls type ocular albinism.
34sri-25C41G6.10n/achrV 15,218,422C. elegans SRI-25 protein; contains similarity to Pfam domain PF01461 7TM chemoreceptor contains similarity to Interpro domain IPR003002 (7TM chemoreceptor, subfamily 1)
35srw-77W06G6.8n/achrV 16,642,725C. elegans SRW-77 protein ;
36F54E4.2F54E4.2n/achrX 14,627,172contains similarity to Interpro domains IPR017452 (GPCR, rhodopsin-like superfamily), IPR000276 (GPCR, rhodopsin-like)
37srbc-65Y32B12B.3n/achrV 16,551,603C. elegans SRBC-65 protein; contains similarity to Pfam domain PF01748 Caenorhabditis serpentine receptor-like protein contains similarity to Interpro domain IPR002651 (Protein of unknown function DUF32)
38str-68Y73C8C.6n/achrV 3,106,888C. elegans STR-68 protein; contains similarity to Pfam domain PF01461 7TM chemoreceptor contains similarity to Interpro domain IPR003002 (7TM chemoreceptor, subfamily 1)
39srt-20F47D2.7n/achrV 4,277,348C. elegans SRT-20 protein; contains similarity to Pfam domain PF01748 Caenorhabditis serpentine receptor-like protein contains similarity to Interpro domain IPR002651 (Protein of unknown function DUF32)
40C25G6.3C25G6.3n/achrX 1,235,994contains similarity to Pfam domain PF02178 AT hook motif contains similarity to Interpro domains IPR000637 (HMG-I and HMG-Y, DNA-binding), IPR011130 (SecA preprotein cross-linking region), IPR007087 (Zinc finger, C2H2-type)
41T07G12.5T07G12.5n/achrIV 10,543,255contains similarity to Pfam domain PF00860 Permease family contains similarity to Interpro domain IPR006043 (Xanthine/uracil/vitamin C permease)
42T22C8.1T22C8.1n/achrII 8,613,779contains similarity to Rattus norvegicus Cysteinyl leukotriene receptor 2 (CysLTR2) (RSBPT32).; SW:CLT2_RAT
43F25A2.1F25A2.1n/achrV 1,180,578contains similarity to Rattus norvegicus C-X-C chemokine receptor type 7 (CXC-R7) (CXCR-7) (G-protein coupledsreceptor RDC1 homolog) (RDC-1) (Chemokine orphan receptor 1).; SW:O89039
44npr-1C39E6.6n/achrX 4,768,551npr-1 encodes a predicted G protein-coupled neuropeptide receptor that is homologous to the mammalian neuropeptide Y (NPY) receptor (OMIM:162641) required for regulating anxiety, food consumption, and pain sensation; in C. elegans, NPR-1 is involved in ethological variations of social behavior such as social versus solitary feeding; NPR-1 also affects some aspect of UNC-6/netrin-mediated branching of motor neurons, as strong npr-1 mutations can suppress abnormal migration of ventral nerve cord neurons induced by overexpression of UNC-6 lacking domain C; NPR-1 is expressed predominantly in the nervous system, and particularly in the AQR, PQR, and URX neurons that are exposed to the body fluid.
45T03E6.2T03E6.2n/achrV 16,582,078contains similarity to Pfam domain PF01461 7TM chemoreceptor contains similarity to Interpro domain IPR003002 (7TM chemoreceptor, subfamily 1)
46R07E5.5R07E5.5n/achrIII 4,398,025contains similarity to Interpro domains IPR015880 (Zinc finger, C2H2-like), IPR007087 (Zinc finger, C2H2-type)
47M02B7.5M02B7.5n/achrIV 3,813,489contains similarity to Pfam domains PF00612 (IQ calmodulin-binding motif) , PF01369 (Sec7 domain) contains similarity to Interpro domains IPR011993 (Pleckstrin homology-type), IPR000904 (SEC7-like)
48nas-16K03B8.1n/achrV 11,392,697nas-16 encodes an astacin-like metalloprotease.
49B0024.3B0024.3n/achrV 10,288,395contains similarity to Pfam domain PF01705 CX module contains similarity to Interpro domain IPR002619 (Protein of unknown function CX)
50F46F5.10F46F5.10n/achrII 824,543contains similarity to Pfam domain PF07801 Protein of unknown function (DUF1647) contains similarity to Interpro domain IPR012444 (Protein of unknown function DUF1647)