UCSC C. elegans Gene Sorter
 
genome assembly search
sort by display output 
#
Name
WormBase
BLASTP
E-Value
Genome Position
Description
1T28A11.5T28A11.53e-114chrV 3,270,895contains similarity to Pfam domain PF01579 Domain of unknown function DUF19 contains similarity to Interpro domains IPR016638 (Uncharacterised conserved protein UPF0376), IPR003559 (Cytolethal distending toxin C), IPR002542 (Protein of unknown function DUF19)
2bra-2F23H11.1n/achrIII 911,744The bra-2 gene encodes a homolog of the human BMP receptor-associated molecule (BRAM1), paralogous to bra-1, that may act upon the SMA-6 TGF-beta signalling pathway
3C17B7.4C17B7.43.9999999999999996e-100chrV 3,339,687contains similarity to Pfam domain PF01579 Domain of unknown function DUF19 contains similarity to Interpro domains IPR016638 (Uncharacterised conserved protein UPF0376), IPR003559 (Cytolethal distending toxin C), IPR002542 (Protein of unknown function DUF19)
4dhs-31T04B2.6n/achrIV 10,040,250C. elegans DHS-31 protein; contains similarity to Pfam domain PF00106 short chain dehydrogenase contains similarity to Interpro domains IPR003560 (2,3-dihydro-2,3-dihydroxybenzoate dehydrogenase), IPR002347 (Glucose/ribitol dehydrogenase), IPR002198 (Short-chain dehydrogenase/reductase SDR), IPR016040 (NAD(P)-binding)
5ins-11C17C3.4n/achrII 5,556,897ins-11 encodes an insulin-like peptide of the insulin superfamily of proteins (OMIM:176730, 147440); INS-11 is one of 38 insulin-like peptides in C. elegans and is expressed in the labial sensory neurons, the nerve ring, and other neurons; although the precise role of INS-11 in C. elegans development is not yet clear, loss of INS-11 function via RNA-mediated interference can result in animals that are smaller than wild type (Sma).
6F53F4.7F53F4.7n/achrV 13,613,185contains similarity to Pfam domain PF03407 Protein of unknown function (DUF271) contains similarity to Interpro domain IPR005069 (Protein of unknown function DUF271)
7K01A2.10K01A2.10n/achrII 322,278contains similarity to Homo sapiens Coiled-coil domain-containing protein 92; ENSEMBL:ENSP00000238156
8C07A9.8C07A9.8n/achrIII 9,688,522contains similarity to Pfam domain PF01062 Bestrophin contains similarity to Interpro domain IPR000615 (Bestrophin)
9dhs-26ZK816.5n/achrX 3,361,621dhs-26 encodes a short-chain dehydrogenase predicted to be mitochondrial.
10C32F10.4C32F10.4n/achrI 5,809,249
11srw-120K12D9.5n/achrV 2,995,551C. elegans SRW-120 protein; contains similarity to Interpro domain IPR017452 (GPCR, rhodopsin-like superfamily)
12C36C5.12C36C5.120.00000000000002chrV 3,158,933contains similarity to Pfam domain PF01579 Domain of unknown function DUF19 contains similarity to Interpro domains IPR016638 (Uncharacterised conserved protein UPF0376), IPR002542 (Protein of unknown function DUF19)
13F47B8.4F47B8.4n/achrV 14,324,002contains similarity to Pfam domain PF00462 Glutaredoxin contains similarity to Interpro domains IPR002109 (Glutaredoxin), IPR012336 (Thioredoxin-like fold)
14C17G10.7C17G10.7n/achrII 5,607,281
15F35F10.1F35F10.1n/achrV 3,317,203contains similarity to Pfam domain PF04721 Domain of unknown function (DUF750) contains similarity to Interpro domain IPR006588 (Protein of unknown function PAW)
16nlp-31B0213.6n/achrV 3,980,323nlp-31 encodes five predicted neuropeptide-like proteins; in C. elegans, nlp-31 is part of the YGGWamide neuropeptide family that also contains nlp-24, nlp-25, and nlp-27-32; nlp-31 is expressed in the hypodermis, suggesting that the peptides it encodes may have a non-neuronal function; nlp-31 expression is also detected in precomma-stage embryos; as loss of nlp-31 activity via large-scale RNAi screens does not result in any obvious abnormalities, the precise role of the nlp-31-encoded peptides in development and/or behavior is not yet known.
17F53A9.1F53A9.1n/achrX 8,711,652contains similarity to Interpro domains IPR006025 (Peptidase M, neutral zinc metallopeptidases, zinc-binding site), IPR002395 (HMW kininogen)
18F07C3.9F07C3.9n/achrV 9,254,456
19C32H11.3C32H11.3n/achrIV 12,919,384contains similarity to Pfam domain PF02408 CUB-like domain contains similarity to Interpro domain IPR003366 (CUB-like region)
20nlp-30B0213.5n/achrV 3,982,348nlp-30 encodes five predicted neuropeptide-like proteins; in C. elegans, nlp-30 is part of the YGGWamide neuropeptide family that also contains nlp-24, nlp-25, and nlp-27-32; nlp-30 is expressed in the hypodermis, suggesting that the peptides it encodes may have a non-neuronal function; as loss of nlp-30 activity via large-scale RNAi screens does not result in any obvious abnormalities, the precise role of the nlp-30-encoded peptides in development and/or behavior is not yet known.
21gst-41R13D7.7n/achrV 7,398,864C. elegans GST-41 protein; contains similarity to Pfam domains PF00043 (Glutathione S-transferase, C-terminal domain) , PF02798 (Glutathione S-transferase, N-terminal domain) contains similarity to Interpro domains IPR012336 (Thioredoxin-like fold), IPR012335 (Thioredoxin fold), IPR004046 (Glutathione S-transferase, C-terminal), IPR004045 (Glutathione S-transferase, N-terminal), IPR010987 (Glutathione S-transferase, C-terminal-like)
22T19D12.3T19D12.3n/achrII 6,660,581
23tag-38B0222.4n/achrV 9,145,742C. elegans TAG-38 protein; contains similarity to Pfam domains PF00282 (Pyridoxal-dependent decarboxylase conserved domain) , PF00266 (Aminotransferase class-V) contains similarity to Interpro domains IPR002129 (Pyridoxal phosphate-dependent decarboxylase), IPR015424 (Pyridoxal phosphate-dependent transferase, major region), IPR006025 (Peptidase M, neutral zinc metallopeptidases, zinc-binding site), IPR000192 (Aminotransferase, class V/Cysteine desulphurase), IPR015421 (Pyridoxal phosphate-dependent transferase, major region, subdomain 1)
24tag-243T04A8.4n/achrIII 4,686,618C. elegans TAG-243 protein; contains similarity to Interpro domain IPR000637 (HMG-I and HMG-Y, DNA-binding)
25srbc-20C45H4.11n/achrV 2,147,858C. elegans SRBC-20 protein; contains similarity to Pfam domain PF01748 Caenorhabditis serpentine receptor-like protein contains similarity to Interpro domain IPR002651 (Protein of unknown function DUF32)
26C13A2.3C13A2.3n/achrV 7,283,523contains similarity to Pfam domain PF03269 Caenorhabditis protein of unknown function, DUF268 contains similarity to Interpro domain IPR004951 (Protein of unknown function DUF268, Caenorhabditis species)
27flp-24C24A1.1n/achrIII 725,550C. elegans FLP-24 protein ;
28C03G6.6C03G6.6n/achrV 7,358,148contains similarity to Pfam domain PF01482 Domain of unknown function DUF13 contains similarity to Interpro domain IPR002485 (Protein of unknown function DUF13)
29ZC196.2ZC196.2n/achrV 8,740,693contains similarity to Pfam domain PF00635 MSP (Major sperm protein) domain contains similarity to Interpro domains IPR008962 (PapD-like), IPR000535 (Major sperm protein)
30ins-7ZK1251.2n/achrIV 9,682,219ins-7 encodes an insulin/IGF-1-like peptide; INS-7 is one of 40 insulin-like peptides in C. elegans; INS-7 likely functions as an agonist for the DAF-2 insulin/IGF-1 receptor, as loss of ins-7 activity via RNAi results in: 1) a significantly increased lifespan that is not further extended in long-lived daf-2 mutant animals, and 2) an increased frequency of dauer formation in animals containing an incompletely penetrant daf-2 mutation; an ins-7 promoter fusion is expressed in amphid sensory neurons, labial neurons, the nerve ring, and ventral cord and tail neurons; ins-7 expression is positively regulated by DAF-2-mediated insulin signaling, suggesting that a positive feedback loop involving INS-7 may amplify DAF-2 pathway activity.
31fbxa-164C08E3.7n/achrII 1,613,450This gene encodes a protein containing an F-box, a motif predicted to mediate protein-protein interactions either with homologs of yeast Skp-1p or with other proteins; this gene's encoded protein also contains an FTH/DUF38 motif, which may also mediate protein-protein interaction.
32skr-5F47H4.10n/achrV 17,348,283The skr-5 gene encodes a homolog of Skp1 in S. cerevisiae that has no known function in vivo, since skr-5(RNAi) animals are at least superficially normal.
33F18G5.6F18G5.6n/achrX 9,263,128
34C08E8.4C08E8.4n/achrV 18,372,276contains similarity to Pfam domain PF08719 Domain of unknown function (DUF1768) contains similarity to Interpro domain IPR012816 (Conserved hypothetical protein CHP02464)
35thn-2F28D1.5n/achrIV 12,383,557C. elegans THN-2 protein; contains similarity to Pfam domain PF00314 Thaumatin family contains similarity to Interpro domain IPR001938 (Thaumatin, pathogenesis-related)
36C14A6.2C14A6.2n/achrV 18,151,568contains similarity to Pfam domain PF07690 Major Facilitator Superfamily contains similarity to Interpro domains IPR007114 (Major facilitator superfamily), IPR001991 (Sodium:dicarboxylate symporter), IPR011701 (Major facilitator superfamily MFS-1), IPR016196 (MFS general substrate transporter)
37ilys-3C45G7.3n/achrIV 2,464,939C. elegans ILYS-3 protein; contains similarity to Pfam domain PF05497 Destabilase contains similarity to Interpro domain IPR008597 (Destabilase)
38F55G1.7F55G1.7n/achrIV 7,467,673
39scl-2F49E11.10n/achrIV 13,058,350C. elegans SCL-2 protein; contains similarity to Pfam domain PF00188 SCP-like extracellular protein contains similarity to Interpro domains IPR014044 (SCP-like extracellular), IPR002413 (Ves allergen), IPR001283 (Allergen V5/Tpx-1 related)
40ttr-1K03H1.6n/achrIII 9,929,635ttr-1 encodes a protein containing a predicted signal sequence followed by a transthyretin-like domain; although TTR-1 belongs to a family of apparently nematode-specific proteins whose function is not yet known, loss of ttr-1 function via RNAi can result in enhanced dauer formation and daf-16-dependent lifespan extension.
41F53A9.7F53A9.7n/achrX 8,716,682contains similarity to Interpro domain IPR002395 (HMW kininogen)
42F48G7.2F48G7.2n/achrV 637,034
43F49H6.5F49H6.5n/achrV 17,024,380The F49H6.5 gene encodes a homolog of the human gene MOCS1A, which when mutated leads to molybdenum cofactor deficiency (OMIM:252150).
44K02A6.2K02A6.2n/achrX 8,224,536
45fbxa-24F54D10.2n/achrII 3,817,370C. elegans FBXA-24 protein; contains similarity to Pfam domain PF01827 FTH domain contains similarity to Interpro domain IPR002900 (Protein of unknown function DUF38, Caenorhabditis species)
46ncx-9C13D9.8n/achrV 4,993,269ncx-9 encodes a putative Na[+]/Ca[2+] exchanger of uncertain stoichiometry and affinity, orthologous to human SLC24A6 and paralogous to NCX-6/-8 and NCX-10; NCX-9 may function intracellularly; NCX-9 has tandem Calx-alpha domains predicted to carry out ion transport; NCX-9 has no obvious function in mass RNAi assays.
47F46A8.7F46A8.7n/achrI 11,238,164contains similarity to Homo sapiens hypothetical protein MGC35285; ENSEMBL:ENSP00000279688
48nlp-7F18E9.2n/achrX 8,593,444C. elegans NLP-7 protein ;
49far-3F15B9.1n/achrV 12,997,151C. elegans FAR-3 protein; contains similarity to Pfam domain PF05823 Nematode fatty acid retinoid binding protein (Gp-FAR-1) contains similarity to Interpro domain IPR008632 (Nematode fatty acid retinoid binding)
50C03G6.17C03G6.17n/achrV 7,380,393contains similarity to Interpro domain IPR016181 (Acyl-CoA N-acyltransferase)