UCSC C. elegans Gene Sorter
 
genome assembly search
sort by display output 
#
Name
WormBase
BLASTP
E-Value
Genome Position
Description
1nspa-8W06A7.50.000000000001chrV 14,826,947C. elegans NSPA-8 protein ;
2bra-2F23H11.1n/achrIII 911,744The bra-2 gene encodes a homolog of the human BMP receptor-associated molecule (BRAM1), paralogous to bra-1, that may act upon the SMA-6 TGF-beta signalling pathway
3nspa-3ZC412.70.000000000002chrV 14,880,465C. elegans NSPA-3 protein ;
4nspa-5ZC412.60.000000000005chrV 14,878,391C. elegans NSPA-5 protein ;
5msp-74F09C12.7n/achrII 5,115,201msp-74 encodes a protein that belongs to a family of proteins called the Major Sperm Proteins (MSPs) that is conserved in nematodes; this family consists of closely related, small, basic proteins that make up 15% of sperm protein; this multigene family consists of over fifty genes, including many pseudogenes; MSPs are involved in both extracellular signaling and cytoskeletal functions during reproduction-MSP antagonizes Eph/ephrin signaling, in part, by binding VAB-1 Eph receptor tyrosine kinase on oocytes and sheath cells to promote oocyte maturation and MAPK activation; MSPs assemble into fibrous networks that drive movement of the C. elegans sperm; msp genes are expressed only in late primary spermatocytes.
6gst-9R05F9.5n/achrII 4,892,523gst-9 encodes a predicted glutathione S-transferase; by homology, GST-9 is predicted to play a role in the detoxification of environmental toxins and xenobiotics by transferring glutathione to reactive electrophilic compounds; however, as loss of gst-9 activity via large-scale RNAi screens does not result in any obvious abnormalities, the precise role of GST-9 in C. elegans development and/or behavior is not yet known.
7nspa-1H12D21.10.000000000002chrV 14,886,813C. elegans NSPA-1 protein ;
8F35H8.1F35H8.1n/achrII 9,552,878contains similarity to Plasmodium falciparum Hypothetical protein.; TR:Q8ILJ6
9F37A8.1F37A8.1n/achrIII 3,928,769contains similarity to Rattus norvegicus Myotonic dystrophy kinase-related Cdc42-binding kinase MRCK-beta.; TR:O54875
10clec-79F47C12.4n/achrIV 3,974,525C. elegans CLEC-79 protein; contains similarity to Pfam domain PF00059 Lectin C-type domain contains similarity to Interpro domains IPR000538 (Link), IPR016187 (C-type lectin fold), IPR016186 (C-type lectin-like), IPR001304 (C-type lectin)
11T25B9.6T25B9.6n/achrIV 10,759,435contains similarity to Interpro domain IPR006162 (Phosphopantetheine attachment site)
12msp-32R05F9.3n/achrII 4,898,889msp-32 encodes a protein that belongs to a family of proteins called the Major Sperm Proteins (MSPs) that is conserved in nematodes; msp-32 has a C. briggsae homolog as predicted by the Wobble Aware Bulk Aligner (WABA); the msp family consists of closely related, small, basic proteins that make up 15% of sperm protein; this multigene family consists of over fifty genes, including many pseudogenes; MSPs are involved in both extracellular signaling and cytoskeletal functions during reproduction-MSP antagonizes Eph/ephrin signaling, in part, by binding VAB-1 Eph receptor tyrosine kinase on oocytes and sheath cells to promote oocyte maturation and MAPK activation; MSPs assemble into fibrous networks that drive movement of the C. elegans sperm; msp genes are expressed only in late primary spermatocytes.
13mab-9T27A1.6n/achrII 518,813mab-9 encodes a member of the T-box family of transcriptional regulators containing a 200-amino acid T-box DNA-binding domain most similar to mouse Brachyury; mab-9 is involved in hindgut and male tail development, specifically affecting the fate of two posterior blast cells in the hindgut, B and F; in the male this results in a grossly abnormal tail lacking spicules, and renders them incapable of mating; in the hermaphrodite this results in hindgut defects; mab-9 may also be part of a network of T-box genes that includes tbx-8, tbx-9 and vab-7 and is important for the correct patterning of posterior cells in the developing embryo; mab-9 affects movement to some extent though the basis for this defect is unknown; MAB-9 localizes to the nucleus of B and F and their descendents during development.
14msp-49C34F11.6n/achrII 5,194,543msp-49 encodes a protein that belongs to a family of proteins called the Major Sperm Proteins (MSPs) that is conserved in nematodes; this family consists of closely related, small, basic proteins that make up 15% of sperm protein; this multigene family consists of over fifty genes, including many pseudogenes; MSPs are involved in both extracellular signaling and cytoskeletal functions during reproduction-MSP antagonizes Eph/ephrin signaling, in part, by binding VAB-1 Eph receptor tyrosine kinase on oocytes and sheath cells to promote oocyte maturation and MAPK activation; MSPs assemble into fibrous networks that drive movement of the C. elegans sperm; msp genes are expressed only in late primary spermatocytes.
15nspd-4T23B7.1n/achrII 4,842,734C. elegans NSPD-4 protein; contains similarity to Pfam domain PF05611 Caenorhabditis elegans protein of unknown function (DUF780) contains similarity to Interpro domain IPR008498 (Protein of unknown function DUF780, Caenorhabditis species)
16W09C3.7W09C3.7n/achrI 4,714,903
17F36A4.4F36A4.4n/achrIV 4,267,908contains similarity to Pfam domain PF05912 Caenorhabditis elegans protein of unknown function (DUF870) contains similarity to Interpro domain IPR008588 (Protein of unknown function DUF870, Caenorhabditis species)
18ssp-9E03H12.10n/achrIV 4,994,521C. elegans SSP-9 protein; contains similarity to Pfam domain PF00635 MSP (Major sperm protein) domain contains similarity to Interpro domains IPR008962 (PapD-like), IPR000535 (Major sperm protein)
19W03D8.9W03D8.9n/achrI 2,785,349contains similarity to Pfam domain PF05884 Caenorhabditis elegans protein of unknown function (DUF856) contains similarity to Interpro domains IPR001991 (Sodium:dicarboxylate symporter), IPR008574 (Protein of unknown function DUF856, Caenorhabditis species)
20sss-1F32B6.5n/achrIV 9,893,216C. elegans SSS-1 protein ;
21msp-79T13F2.10n/achrIV 9,766,938msp-79 encodes a member of the major sperm protein family.
22ZK354.7ZK354.7n/achrIV 5,302,598contains similarity to Pfam domain PF00635 MSP (Major sperm protein) domain contains similarity to Interpro domains IPR008962 (PapD-like), IPR000535 (Major sperm protein), IPR000533 (Tropomyosin)
23T28H11.7T28H11.7n/achrIV 5,015,779contains similarity to Interpro domain IPR004148 (BAR)
24R13H9.5R13H9.5n/achrIV 5,066,321contains similarity to Pfam domain PF00069 Protein kinase domain contains similarity to Interpro domains IPR002290 (Serine/threonine protein kinase), IPR011009 (Protein kinase-like), IPR008271 (Serine/threonine protein kinase, active site), IPR000719 (Protein kinase, core), IPR001245 (Tyrosine protein kinase), IPR017442 (Serine/threonine protein kinase-related)
25T09F5.10T09F5.10n/achrV 15,180,897contains similarity to Pfam domain PF06852 Protein of unknown function (DUF1248) contains similarity to Interpro domain IPR009658 (Protein of unknown function DUF1248)
26nspd-1ZK484.8n/achrI 6,097,668C. elegans NSPD-1 protein; contains similarity to Pfam domain PF05611 Caenorhabditis elegans protein of unknown function (DUF780) contains similarity to Interpro domains IPR002952 (Eggshell protein), IPR008498 (Protein of unknown function DUF780, Caenorhabditis species)
27C41G7.6C41G7.6n/achrI 9,526,981contains similarity to Paramecium tetraurelia Chromosome undetermined scaffold_96, whole genome shotgun sequence.; TR:A0EH68
28T08B2.12T08B2.12n/achrI 6,231,810contains similarity to Equine herpesvirus 1 Glycoprotein X precursor.; SW:Q6S6W0
29ssp-11T28H11.6n/achrIV 4,999,632C. elegans SSP-11 protein; contains similarity to Pfam domain PF00635 MSP (Major sperm protein) domain contains similarity to Interpro domains IPR008962 (PapD-like), IPR000535 (Major sperm protein)
30msp-65ZK354.1n/achrIV 5,316,705msp-65 encodes a protein that belongs to a family of proteins called the Major Sperm Proteins (MSPs) that is conserved in nematodes; this family consists of closely related, small, basic proteins that make up 15% of sperm protein; this multigene family consists of over fifty genes, including many pseudogenes; MSPs are involved in both extracellular signaling and cytoskeletal functions during reproduction-MSP antagonizes Eph/ephrin signaling, in part, by binding VAB-1 Eph receptor tyrosine kinase on oocytes and sheath cells to promote oocyte maturation and MAPK activation; MSPs assemble into fibrous networks that drive movement of the C. elegans sperm; msp genes are expressed only in late primary spermatocytes.
31F40H6.1F40H6.1n/achrIII 6,057,696
32C49H3.3C49H3.3n/achrIV 7,924,622contains similarity to Xenopus tropicalis UPF0446 protein C12orf31 homolog.; SW:Q6NVR5
33K01H12.4K01H12.4n/achrIV 9,714,029contains similarity to Simian T-lymphotropic virus 1 Rex p27 protein (Fragment).; TR:O12387
34ins-7ZK1251.2n/achrIV 9,682,219ins-7 encodes an insulin/IGF-1-like peptide; INS-7 is one of 40 insulin-like peptides in C. elegans; INS-7 likely functions as an agonist for the DAF-2 insulin/IGF-1 receptor, as loss of ins-7 activity via RNAi results in: 1) a significantly increased lifespan that is not further extended in long-lived daf-2 mutant animals, and 2) an increased frequency of dauer formation in animals containing an incompletely penetrant daf-2 mutation; an ins-7 promoter fusion is expressed in amphid sensory neurons, labial neurons, the nerve ring, and ventral cord and tail neurons; ins-7 expression is positively regulated by DAF-2-mediated insulin signaling, suggesting that a positive feedback loop involving INS-7 may amplify DAF-2 pathway activity.
35Y81G3A.1Y81G3A.1n/achrII 13,082,998Y81G3A.1 encodes a nematode-specific sperm protein; Y81G3A.1 has no obvious non-nematode homologs, but does have a putative central coiled-coil domain, and is is paralogous to four other C. elegans proteins (B0207.11, F42G4.6, F44F4.10, and T08G11.2); Y81G3A.1(RNAi) animals exhibit aldicarb resistance; Y81G3A.1 expression is enriched in spermatogenesis.
36W03D8.10W03D8.10n/achrI 2,786,824contains similarity to Pfam domain PF05884 Caenorhabditis elegans protein of unknown function (DUF856) contains similarity to Interpro domains IPR001991 (Sodium:dicarboxylate symporter), IPR008574 (Protein of unknown function DUF856, Caenorhabditis species)
37B0273.1B0273.1n/achrIV 5,494,609
38ZK1251.3ZK1251.3n/achrIV 9,684,045contains similarity to Pfam domain PF02544 3-oxo-5-alpha-steroid 4-dehydrogenase contains similarity to Interpro domains IPR001104 (3-oxo-5-alpha-steroid 4-dehydrogenase, C-terminal), IPR016636 (3-oxo-5-alpha-steroid 4-dehydrogenase)
39hdl-1ZK829.2n/achrIV 11,947,905C. elegans HDL-1 protein; contains similarity to Pfam domain PF00282 Pyridoxal-dependent decarboxylase conserved domain contains similarity to Interpro domains IPR002129 (Pyridoxal phosphate-dependent decarboxylase), IPR010977 (Aromatic-L-amino-acid decarboxylase), IPR015422 (Pyridoxal phosphate-dependent transferase, major region, subdomain 2), IPR015424 (Pyridoxal phosphate-dependent transferase, major region), IPR015421 (Pyridoxal phosphate-dependent transferase, major region, subdomain 1)
40msp-81K07F5.1n/achrIV 9,836,198msp-81 encodes a member of the major sperm protein family.
41F17E9.5F17E9.5n/achrIV 8,346,163
42W02D7.4W02D7.4n/achrV 8,297,041contains similarity to Interpro domain IPR016181 (Acyl-CoA N-acyltransferase)
43C02F5.5C02F5.5n/achrIII 8,236,454
44K06A5.2K06A5.2n/achrI 6,468,758contains similarity to Pfam domain PF05884 Caenorhabditis elegans protein of unknown function (DUF856) contains similarity to Interpro domains IPR001991 (Sodium:dicarboxylate symporter), IPR008574 (Protein of unknown function DUF856, Caenorhabditis species)
45ssq-1K07F5.11n/achrIV 9,853,029C. elegans SSQ-1 protein; contains similarity to Interpro domain IPR002952 (Eggshell protein)
46msp-64ZK1248.6n/achrII 5,810,101msp-64 encodes a protein that belongs to a family of proteins called the Major Sperm Proteins (MSPs) that is conserved in nematodes; this family consists of closely related, small, basic proteins that make up 15% of sperm protein; this multigene family consists of over fifty genes, including many pseudogenes; MSPs are involved in both extracellular signaling and cytoskeletal functions during reproduction-MSP antagonizes Eph/ephrin signaling, in part, by binding VAB-1 Eph receptor tyrosine kinase on oocytes and sheath cells to promote oocyte maturation and MAPK activation; MSPs assemble into fibrous networks that drive movement of the C. elegans sperm; msp genes are expressed only in late primary spermatocytes.
47nspa-9C40H5.10.00000000007chrX 11,739,026C. elegans NSPA-9 protein ;
48ZK1251.1ZK1251.1n/achrIV 9,683,245contains similarity to Pfam domains PF00808 (Histone-like transcription factor (CBF/NF-Y) and archaeal histone) , PF00125 (Core histone H2A/H2B/H3/H4) contains similarity to Interpro domains IPR009072 (Histone-fold), IPR007125 (Histone core), IPR002119 (Histone H2A), IPR003958 (Transcription factor CBF/NF-Y/archaeal histone)
49ssq-4T28H11.1n/achrIV 5,017,101C. elegans SSQ-4 protein; contains similarity to Interpro domains IPR013027 (FAD-dependent pyridine nucleotide-disulphide oxidoreductase), IPR002952 (Eggshell protein), IPR000817 (Prion protein), IPR000103 (Pyridine nucleotide-disulphide oxidoreductase, class-II), IPR000158 (Cell division protein FtsZ, N-terminal), IPR013286 (Annexin, type VII)
50C10G11.9C10G11.9n/achrI 6,274,923contains similarity to Urechis caupo Sperm acrosomal protein.; TR:A4GND9