UCSC C. elegans Gene Sorter
 
genome assembly search
sort by display output 
#
Name
WormBase
BLASTP
E-Value
Genome Position
Description
1ZK1193.4ZK1193.42e-107chrX 424,854
2K08E4.4K08E4.4n/achrIV 12,066,699contains similarity to Entamoeba histolytica Pyruvate,phosphate dikinase (EC 2.7.9.1) (Pyruvate,orthophosphatesdikinase).; SW:PODK_ENTHI
3mce-1D2030.5n/achrI 7,582,722C. elegans MCE-1 protein; contains similarity to Pfam domain PF00903 Glyoxalase/Bleomycin resistance protein/Dioxygenase superfamily contains similarity to Interpro domain IPR004360 (Glyoxalase/bleomycin resistance protein/dioxygenase)
4his-1T10C6.14n/achrV 16,042,648his-1 encodes an H4 histone; his-1 is contained within the histone gene cluster HIS1; transcript analysis suggests that it encodes the major class of H4 transcripts.
5F53G2.2F53G2.2n/achrII 2,483,921
6B0222.9B0222.9n/achrV 9,170,672contains similarity to Pfam domains PF00941 (FAD binding domain in molybdopterin dehydrogenase) , PF02738 (Aldehyde oxidase and xanthine dehydrogenase, molybdopterin binding domain) , PF00111 (2Fe-2S iron-sulfur cluster binding domain) , PF01799 ([2Fe-2S] binding domain) , PF01315 (Aldehyde oxidase and xanthine dehydrogenase, a/b hammerhead domain) contains similarity to Interpro domains IPR017441 (Protein kinase ATP binding, conserved site), IPR001041 (Ferredoxin), IPR002346 (Molybdopterin dehydrogenase, FAD-binding), IPR012675 (Beta-grasp fold, ferredoxin-type), IPR002888 ([2Fe-2S]-binding), IPR016166 (FAD-binding, type 2), IPR006058 (2Fe-2S ferredoxin, iron-sulphur binding site), IPR016169 (CO dehydrogenase flavoprotein-like, FAD-binding, subdomain 2), IPR000674 (Aldehyde oxidase and xanthine dehydrogenase, a/b hammerhead), IPR008274 (Aldehyde oxidase and xanthine dehydrogenase, molybdopterin binding)
7F20D1.4F20D1.4n/achrX 14,982,392contains similarity to Pfam domain PF04845 PurA ssDNA and RNA-binding protein contains similarity to Interpro domain IPR006628 (PUR-alpha/beta/gamma, DNA/RNA-binding)
8T25G12.3T25G12.3n/achrX 17,234,022
9ZK262.9ZK262.9n/achrV 18,440,924contains similarity to Brachydanio rerio Similar to formin binding protein 3.; TR:Q7ZUE4
10math-23C46F9.2n/achrII 1,903,365The C46F9.2 gene encodes a protein closely similar to C46F9.3, which has a meprin-associated Traf homology (MATH) domain and may be involved in apoptosis.
11C35E7.8C35E7.8n/achrI 10,809,484
12C45G9.7C45G9.7n/achrIII 5,046,619contains similarity to Pfam domain PF00595 PDZ domain (Also known as DHR or GLGF) contains similarity to Interpro domains IPR017268 (Tax1-binding protein 3), IPR001478 (PDZ/DHR/GLGF)
13T13F3.6T13F3.6n/achrV 16,270,691contains similarity to Paramecium tetraurelia 51B type surface protein.; TR:Q27167
14C26B2.8C26B2.8n/achrIV 8,014,864contains similarity to Interpro domains IPR008914 (Phosphatidylethanolamine-binding protein PEBP), IPR006150 (Cysteine-rich repeat)
15sdz-15F23F12.4n/achrIII 6,499,273This gene encodes a protein containing an F-box, a motif predicted to mediate protein-protein interactions either with homologs of yeast Skp-1p or with other proteins.
16scrm-3C04E12.7n/achrV 3,356,584scrm-3 encodes a putative phospholipid scramblase homologous to human PLSCR1-5, and paralogous to other C. elegans SCRMs (e.g., SCRM-1); SCRM-3 is expressed in neurons, anal depressor muscle, and occasionally in body wall muscle cells; however, in apoptotic germline cells, SCRM-3 is fully dispensable for normally rapid engulfment and largely dispensable for phosphatidylserine exposure; SCRM-3 does not bind WAH-1 in vitro, and scrm-3(tm631) mutants have no obvious phenotype.
17C05E11.2C05E11.2n/achrX 4,587,427
18F58A3.3F58A3.3n/achrX 11,012,975contains similarity to Mus musculus Glucosidase II beta-subunit (Fragment).; TR:Q9R1N5
19K09H9.7K09H9.7n/achrI 3,151,195contains similarity to Interpro domains IPR015880 (Zinc finger, C2H2-like), IPR007087 (Zinc finger, C2H2-type)
20K08C7.7K08C7.7n/achrIV 10,665,006This gene encodes a protein containing an F-box, a motif predicted to mediate protein-protein interactions either with homologs of yeast Skp-1p or with other proteins.
21F46C5.7F46C5.7n/achrII 8,839,705contains similarity to Homo sapiens Splice isoform 1 of Q8WXQ8 Carboxypeptidase A5 precursor; ENSEMBL:ENSP00000289573
22his-44F08G2.1n/achrII 13,826,823his-44 encodes an H2B histone.
23btb-16F39E9.2n/achrII 3,297,442C. elegans BTB-16 protein; contains similarity to Pfam domain PF00651 BTB/POZ domain contains similarity to Interpro domains IPR000210 (BTB/POZ-like), IPR011333 (BTB/POZ fold), IPR013069 (BTB/POZ)
24clec-44R07C3.12n/achrII 921,144C. elegans CLEC-44 protein; contains similarity to Pfam domain PF00059 Lectin C-type domain contains similarity to Interpro domains IPR000859 (CUB), IPR016187 (C-type lectin fold), IPR016186 (C-type lectin-like), IPR001304 (C-type lectin)
25T15D6.5T15D6.5n/achrI 12,382,523contains similarity to Pfam domain PF01762 Galactosyltransferase contains similarity to Interpro domain IPR002659 (Glycosyl transferase, family 31)
26srw-31K03D7.2n/achrV 17,507,514C. elegans SRW-31 protein; contains similarity to Pfam domain PF06976 Protein of unknown function (DUF1300) contains similarity to Interpro domains IPR017452 (GPCR, rhodopsin-like superfamily), IPR010726 (Protein of unknown function DUF1300), IPR000832 (GPCR, family 2, secretin-like), IPR000276 (GPCR, rhodopsin-like)
27str-136F21F8.9n/achrV 8,278,202C. elegans STR-136 protein; contains similarity to Pfam domain PF01461 7TM chemoreceptor contains similarity to Interpro domains IPR017452 (GPCR, rhodopsin-like superfamily), IPR003002 (7TM chemoreceptor, subfamily 1)
28ZC132.4ZC132.4n/achrV 4,302,829contains similarity to Uukuniemi virus Envelope glycoprotein precursor (GP) (M polyprotein) [Contains:sGlycoprotein G1; Glycoprotein G2].; SW:P09613
29srv-22H04M03.9n/achrIV 5,879,196C. elegans SRV-22 protein; contains similarity to Pfam domain PF01748 Caenorhabditis serpentine receptor-like protein contains similarity to Interpro domains IPR017452 (GPCR, rhodopsin-like superfamily), IPR002651 (Protein of unknown function DUF32)
30smgl-1F20G4.1n/achrI 7,922,384C. elegans SMGL-1 protein; contains similarity to Interpro domain IPR011046 (WD40 repeat-like)
31C04E12.5C04E12.5n/achrV 3,359,866contains similarity to Pfam domain PF04721 Domain of unknown function (DUF750) contains similarity to Interpro domain IPR006588 (Protein of unknown function PAW)
32B0334.6B0334.6n/achrII 11,512,193contains similarity to Pfam domain PF00001 7 transmembrane receptor (rhodopsin family) contains similarity to Interpro domains IPR017452 (GPCR, rhodopsin-like superfamily), IPR000276 (GPCR, rhodopsin-like)
33btb-4F59H6.12n/achrII 2,032,856C. elegans BTB-4 protein; contains similarity to Pfam domain PF00651 BTB/POZ domain contains similarity to Interpro domains IPR000210 (BTB/POZ-like), IPR011333 (BTB/POZ fold), IPR013069 (BTB/POZ)
34C33E10.8C33E10.8n/achrX 17,293,743This gene encodes a protein containing an F-box, a motif predicted to mediate protein-protein interactions either with homologs of yeast Skp-1p or with other proteins.
35ver-4F59F3.5n/achrX 10,985,087C. elegans VER-4 protein; contains similarity to Pfam domains PF07686 (Immunoglobulin V-set domain) , PF00047 (Immunoglobulin domain) (2), PF07714 (Protein tyrosine kinase) , PF00069 (Protein kinase domain) , PF07679 (Immunoglobulin I-set domain) contains similarity to Interpro domains IPR003598 (Immunoglobulin subtype 2), IPR017441 (Protein kinase ATP binding, conserved site), IPR002290 (Serine/threonine protein kinase), IPR013098 (Immunoglobulin I-set), IPR011009 (Protein kinase-like), IPR003596 (Immunoglobulin V-set, subgroup), IPR013783 (Immunoglobulin-like fold), IPR000719 (Protein kinase, core), IPR013106 (Immunoglobulin V-set), IPR007110 (Immunoglobulin-like), IPR003599 (Immunoglobulin subtype), IPR001245 (Tyrosine protein kinase), IPR017442 (Serine/threonine protein kinase-related), IPR008266 (Tyrosine protein kinase, active site), IPR013151 (Immunoglobulin)
36R11D1.2R11D1.2n/achrV 12,709,668contains similarity to Pfam domain PF00646 F-box domain contains similarity to Interpro domain IPR001810 (Cyclin-like F-box)
37cyn-16Y17G7B.9n/achrII 12,032,664cyn-16 encodes a highly diverged member of the cyclophilin family; CYN-16 exhibits low levels of peptidyl-prolyl cis/trans isomerase activity in vitro that is insensitive to the presence of cyclosporin A; a cyn-16::gfp fusion protein is expressed in the intestine during larval and adult stages of development, with particularly strong expression seen in the anterior and posterior ends; in dauer larvae, the cyn-16::gfp reporter is expressed in cell bodies and processes of ventral cord neurons and is no longer visible in the intestine.
38W02A2.5W02A2.5n/achrIV 13,344,491contains similarity to Interpro domains IPR000589 (Ribosomal protein S15), IPR015683 (Glutamate receptor-related), IPR001508 (NMDA receptor)
39F02E9.1F02E9.1n/achrI 8,407,250F02E9.1 encodes a divergent ortholog of S. cerevisiae VMA22; like VMA22, F02E9.1 may be required for vacuolar proton-translocating ATPase (V-ATPase) assembly in the endoplasmic reticulum.
40C30H6.8C30H6.8n/achrIV 17,382,648contains similarity to Pfam domain PF00085 Thioredoxin contains similarity to Interpro domains IPR012336 (Thioredoxin-like fold), IPR012335 (Thioredoxin fold), IPR013766 (Thioredoxin domain), IPR006662 (Thioredoxin-related)
41sptf-2T22C8.5n/achrII 8,626,542C. elegans SPTF-2 protein; contains similarity to Pfam domain PF00096 Zinc finger, C2H2 type contains similarity to Interpro domains IPR015880 (Zinc finger, C2H2-like), IPR013087 (Zinc finger, C2H2-type/integrase, DNA-binding), IPR003656 (Zinc finger, BED-type predicted), IPR007087 (Zinc finger, C2H2-type)
42R12B2.3R12B2.3n/achrIII 5,806,220
43F25H9.3F25H9.3n/achrV 13,456,608contains similarity to Interpro domain IPR016054 (Ly-6 antigen / uPA receptor -like)
44sre-39F10G7.7n/achrII 4,688,304C. elegans SRE-39 protein; contains similarity to Pfam domain PF03125 C. elegans Sre G protein-coupled chemoreceptor contains similarity to Interpro domain IPR004151 (C. elegans Sre G protein-coupled chemoreceptor)
45K02F3.8K02F3.8n/achrIII 838,968
46K07G6.1K07G6.1n/achrII 1,741,871
47sri-42T10D4.9n/achrII 3,141,931C. elegans SRI-42 protein; contains similarity to Pfam domain PF01461 7TM chemoreceptor contains similarity to Interpro domain IPR003002 (7TM chemoreceptor, subfamily 1)
48F22H10.6F22H10.6n/achrX 16,690,126
49let-70M7.1n/achrIV 11,081,640let-70 encodes a class I E2 ubiquitin conjugating enzyme; let-70 was identified in screens for essential genes and phenotypic analyses indicate that loss of let-70 activity results in embryonic and larval lethality with defects in sarcomere assembly; purified LET-70 can stimulate the self-ubiquitylation activities of CHN-1 and UFD-2, E4 ubiquitin conjugation factors and, in addition, can stimulate the CHN-1- and UFD-2-dependent multiubiquitylation of UNC-45, a myosin-directed chaperone; in this manner, LET-70 may regulate UNC-45 degradation and myosin assembly; RNA blot analyses and a let-70-lacZ reporter fusion reveal that let-70 is abundantly expressed at all stages of development, including the dauer larval stage; strong staining is observed in most somatic tissues until adult stages, when expression generally becomes restricted to the nervous system.
50C32B5.14C32B5.14n/achrII 966,320