UCSC C. elegans Gene Sorter
 
genome assembly search
sort by display output
#
Name
WormBase
BLASTP
E-Value
Genome Position
Description                                       
1ZK930.2ZK930.22.9999999999999997e-166chrII 11,892,790contains similarity to Interpro domain IPR010989 (t-SNARE)
2K09E2.1K09E2.1n/achrX 8,683,969contains similarity to Pfam domain PF00092 von Willebrand factor type A domain contains similarity to Interpro domain IPR002035 (von Willebrand factor, type A)
3Y40H7A.11Y40H7A.11n/achrIV 15,219,977contains similarity to Interpro domain IPR006629 (LPS-induced tumor necrosis factor alpha factor)
4grl-3K03B8.7n/achrV 11,411,850grl-3 encodes a hedgehog-like protein, with an N-terminal signal sequence, a central low-complexity region, and a C-terminal Ground-like (Grl) domain; GRL-3 is expressed in intestine, larval renal gland cells, and larval neurons; the Grl domain is predicted to form a cysteine-crosslinked protein involved in intercellular signalling, and it has subtle similarity to the N-terminal Hedge domain of HEDGEHOG proteins.
5F14H3.12F14H3.12n/achrV 16,074,705contains similarity to Pfam domain PF02149 Kinase associated domain 1 contains similarity to Interpro domain IPR001772 (Kinase-associated KA1)
6F14D2.8F14D2.8n/achrII 3,348,717This gene encodes a protein containing an F-box, a motif predicted to mediate protein-protein interactions either with homologs of yeast Skp-1p or with other proteins; this gene's encoded protein also contains an FTH/DUF38 motif, which may also mediate protein-protein interaction.
7Y51B9A.8Y51B9A.8n/achrII 9,399,270contains similarity to Pfam domains PF04942 (CC domain) (2), PF01549 (ShK domain-like) contains similarity to Interpro domains IPR007026 (Domian of unknown function, DUF-CC), IPR003582 (Metridin-like ShK toxin)
8spp-6T08A9.10n/achrX 7,317,449spp-6 encodes a predicted transmembrane protein containing a saposin (B) domain that is a member of a saposin-like protein superfamily containing mammalian NK-lysin and granulysin and the protozoan amoebapores; SPP-6 is predicted to function as a lipid-binding protein that may possess pore-forming, cytotoxic activity; as loss of SPP-6 function via RNA-mediated interference (RNAi) does not result in any abnormalities, the precise role of SPP-6 in C. elegans development and/or behavior is not yet known.
9F57A10.4F57A10.4n/achrV 15,769,845contains similarity to Oceanobacillus iheyensis Alkaliphily related protein.; TR:Q8EQ12
10C07D8.5C07D8.5n/achrX 7,344,247contains similarity to Pfam domain PF00248 Aldo/keto reductase family contains similarity to Interpro domain IPR001395 (Aldo/keto reductase)
11T26H5.8T26H5.8n/achrV 15,429,911contains similarity to Pfam domains PF04789 (Protein of unknown function (DUF621)) , PF01748 (Caenorhabditis serpentine receptor-like protein) contains similarity to Interpro domains IPR017452 (GPCR, rhodopsin-like superfamily), IPR002651 (Protein of unknown function DUF32), IPR006874 (Protein of unknown function DUF621)
12dnj-4C01G8.4n/achrI 5,283,025This gene encodes a protein containing a DnaJ ('J') domain.
13F15D4.2F15D4.2n/achrII 13,216,307contains similarity to Strongylocentrotus purpuratus Protein ENDO16 (Fragment).; SW:P13665
14F46F5.14F46F5.14n/achrII 800,774contains similarity to Pfam domain PF03314 Protein of unknown function, DUF273 contains similarity to Interpro domain IPR004988 (Protein of unknown function DUF273)
15W03G11.2W03G11.2n/achrX 12,107,432contains similarity to Pfam domain PF03381 LEM3 (ligand-effect modulator 3) family / CDC50 family contains similarity to Interpro domain IPR005045 (Protein of unknown function DUF284, transmembrane eukaryotic)
16ttr-37F21E9.3n/achrX 1,336,135C. elegans TTR-37 protein; contains similarity to Pfam domain PF01060 Transthyretin-like family contains similarity to Interpro domain IPR001534 (Transthyretin-like)
17C18D4.4C18D4.4n/achrV 17,530,973contains similarity to Pfam domain PF03762 Vitelline membrane outer layer protein I (VOMI) contains similarity to Interpro domain IPR005515 (Vitelline membrane outer layer protein I (VOMI))
18C13A2.11C13A2.11n/achrV 7,281,405contains similarity to Pfam domain PF01697 Domain of unknown function contains similarity to Interpro domains IPR008167 (Protein of unknown function DUF23, C-terminal), IPR008166 (Protein of unknown function DUF23)
19ZK686.1ZK686.1n/achrIII 7,773,406contains similarity to Interpro domain IPR004038 (Ribosomal protein L7Ae/L30e/S12e/Gadd45)
20F53H2.1F53H2.1n/achrV 20,385,929contains similarity to Pfam domain PF05218 Protein of unknown function (DUF713) contains similarity to Interpro domains IPR010989 (t-SNARE), IPR007883 (Protein of unknown function DUF713)
21C41G6.13C41G6.13n/achrV 15,208,853contains similarity to Homo sapiens Xylosyltransferase I; ENSEMBL:ENSP00000261381
22M116.1M116.1n/achrIV 8,411,585
23ttr-30T08A9.2n/achrX 7,331,455C. elegans TTR-30 protein; contains similarity to Pfam domain PF01060 Transthyretin-like family contains similarity to Interpro domain IPR001534 (Transthyretin-like)
24F26A3.1F26A3.1n/achrI 7,641,050contains similarity to Interpro domain IPR008262 (Lipase, active site)
25B0304.2B0304.2n/achrII 4,524,073
26C15B12.2C15B12.2n/achrX 6,464,379
27C16A3.6C16A3.6n/achrIII 6,379,994contains similarity to Pfam domain PF04874 Mak16 protein contains similarity to Interpro domain IPR006958 (Mak16 protein)
28C47D12.5C47D12.5n/achrII 11,685,843
29C43F9.4C43F9.4n/achrIV 10,588,322
30W07A12.6W07A12.6n/achrII 9,158,925contains similarity to Pfam domain PF01757 Acyltransferase family contains similarity to Interpro domain IPR002656 (Acyltransferase 3)
31str-139ZC513.9n/achrV 8,061,503C. elegans STR-139 protein; contains similarity to Pfam domain PF01461 7TM chemoreceptor contains similarity to Interpro domains IPR003002 (7TM chemoreceptor, subfamily 1), IPR002091 (Aromatic amino acid permease)
32Y57G11C.18Y57G11C.18n/achrIV 14,841,760contains similarity to Interpro domain IPR000767 (Disease resistance protein)
33H43I07.1H43I07.1n/achrV 4,206,564contains similarity to Interpro domains IPR010754 (Optic atrophy 3-like), IPR005819 (Histone H5)
34math-7C16C4.12n/achrII 1,885,961C. elegans MATH-7 protein; contains similarity to Pfam domain PF00917 MATH domain contains similarity to Interpro domains IPR008974 (TRAF-like), IPR002083 (MATH)
35srd-16C04E6.9n/achrV 5,899,272C. elegans SRD-16 protein; contains similarity to Pfam domain PF01461 7TM chemoreceptor contains similarity to Interpro domains IPR017452 (GPCR, rhodopsin-like superfamily), IPR003002 (7TM chemoreceptor, subfamily 1), IPR000276 (GPCR, rhodopsin-like)
36srw-19T10H4.8n/achrV 15,280,555C. elegans SRW-19 protein; contains similarity to Interpro domain IPR017452 (GPCR, rhodopsin-like superfamily)
37EEED8.13EEED8.13n/achrII 5,411,874contains similarity to Interpro domain IPR011038 (Calycin-like)
38F57E7.2F57E7.2n/achrV 16,482,980contains similarity to Psilotum nudum Hypothetical protein.; TR:Q8WHW9
39str-227C07G3.3n/achrV 3,518,993C. elegans STR-227 protein; contains similarity to Pfam domain PF01461 7TM chemoreceptor contains similarity to Interpro domain IPR003002 (7TM chemoreceptor, subfamily 1)
40F26D11.6F26D11.6n/achrV 7,955,880
41Y106G6D.6Y106G6D.6n/achrI 10,120,080contains similarity to Interpro domain IPR016054 (Ly-6 antigen / uPA receptor -like)
42clec-234F26D2.12n/achrV 16,432,515C. elegans CLEC-234 protein; contains similarity to Pfam domain PF00059 Lectin C-type domain contains similarity to Interpro domains IPR016187 (C-type lectin fold), IPR016186 (C-type lectin-like), IPR001304 (C-type lectin)
43K08D9.6K08D9.6n/achrV 3,233,173contains similarity to Pfam domain PF01697 Domain of unknown function contains similarity to Interpro domains IPR008167 (Protein of unknown function DUF23, C-terminal), IPR008166 (Protein of unknown function DUF23)
44M02B7.1M02B7.1n/achrIV 3,806,054
45T13F2.6T13F2.6n/achrIV 9,779,719
46B0035.3B0035.3n/achrIV 11,314,534contains similarity to Pfam domain PF01661 Macro domain contains similarity to Interpro domain IPR002589 (Appr-1-p processing)
47Y38H6C.21Y38H6C.21n/achrV 20,550,079contains similarity to Aquifex aeolicus Flagellar biosynthetic protein flhB.; SW:FLHB_AQUAE
48C01G6.4C01G6.4n/achrII 9,272,092contains similarity to Pfam domain PF00097 Zinc finger, C3HC4 type (RING finger) contains similarity to Interpro domains IPR001841 (Zinc finger, RING-type), IPR013083 (Zinc finger, RING/FYVE/PHD-type), IPR011016 (Zinc finger, variant RING-type)
49T19H5.1T19H5.1n/achrII 9,473,432contains similarity to Pfam domain PF00704 Glycosyl hydrolases family 18 contains similarity to Interpro domains IPR011583 (Chitinase II), IPR017853 (Glycoside hydrolase, catalytic core), IPR001223 (Glycoside hydrolase, family 18, catalytic domain), IPR013781 (Glycoside hydrolase, subgroup, catalytic core)
50clec-12T27F6.2n/achrI 12,477,625C. elegans CLEC-12 protein; contains similarity to Pfam domains PF00431 (CUB domain) , PF00059 (Lectin C-type domain) (2)contains similarity to Interpro domains IPR000859 (CUB), IPR016187 (C-type lectin fold), IPR016186 (C-type lectin-like), IPR001304 (C-type lectin)