UCSC C. elegans Gene Sorter
 
genome assembly search
sort by display output 
#
Name
WormBase
BLASTP
E-Value
Genome Position
Description
1F59F5.5F59F5.50chrX 10,547,442contains similarity to Actinobacillus pleuropneumoniae KDO transferase.; TR:Q9AIE5
2dod-22F55G11.5n/achrIV 12,966,321C. elegans DOD-22 protein; contains similarity to Pfam domain PF02408 CUB-like domain contains similarity to Interpro domains IPR000859 (CUB), IPR003366 (CUB-like region)
3C39F7.1C39F7.1n/achrV 1,261,350
4fbxa-81T24C2.4n/achrX 14,541,293This gene encodes a protein containing an F-box, a motif predicted to mediate protein-protein interactions either with homologs of yeast Skp-1p or with other proteins; this gene's encoded protein also contains an FTH/DUF38 motif, which may also mediate protein-protein interaction.
5F53B1.8F53B1.8n/achrX 2,126,824contains similarity to Interpro domain IPR001441 (Di-trans-poly-cis-decaprenylcistransferase)
6nhr-74C27C7.3n/achrI 11,430,558C. elegans NHR-74 protein; contains similarity to Pfam domains PF00104 (Ligand-binding domain of nuclear hormone receptor) , PF00105 (Zinc finger, C4 type (two domains)) contains similarity to Interpro domains IPR008946 (Nuclear hormone receptor, ligand-binding), IPR001723 (Steroid hormone receptor), IPR013088 (Zinc finger, NHR/GATA-type), IPR001628 (Zinc finger, nuclear hormone receptor-type), IPR000536 (Nuclear hormone receptor, ligand-binding, core)
7glb-16F46C8.7n/achrX 7,538,934glb-16 encodes a globin required for normally high fat content.
8nhr-207R07B7.14n/achrV 12,097,016C. elegans NHR-207 protein; contains similarity to Pfam domains PF00104 (Ligand-binding domain of nuclear hormone receptor) , PF00105 (Zinc finger, C4 type (two domains)) contains similarity to Interpro domains IPR008946 (Nuclear hormone receptor, ligand-binding), IPR001723 (Steroid hormone receptor), IPR001728 (Thyroid hormone receptor), IPR000324 (Vitamin D receptor), IPR013088 (Zinc finger, NHR/GATA-type), IPR001628 (Zinc finger, nuclear hormone receptor-type), IPR000536 (Nuclear hormone receptor, ligand-binding, core)
9sre-45F54F11.3n/achrII 13,520,326C. elegans SRE-45 protein; contains similarity to Pfam domain PF03125 C. elegans Sre G protein-coupled chemoreceptor contains similarity to Interpro domain IPR004151 (C. elegans Sre G protein-coupled chemoreceptor)
10Y39A3A.3Y39A3A.3n/achrIII 2,067,514contains similarity to Pfam domain PF03762 Vitelline membrane outer layer protein I (VOMI) contains similarity to Interpro domain IPR005515 (Vitelline membrane outer layer protein I (VOMI))
11C15C8.1C15C8.1n/achrV 12,735,091contains similarity to Interpro domains IPR000694 (Proline-rich region), IPR003073 (Orphan nuclear receptor, NURR type)
12F19C7.4F19C7.4n/achrIV 4,604,373contains similarity to Pfam domain PF05577 Serine carboxypeptidase S28 contains similarity to Interpro domain IPR008758 (Peptidase S28)
13C01A2.4C01A2.4n/achrI 13,393,035contains similarity to Pfam domain PF03357 Snf7 contains similarity to Interpro domain IPR005024 (Snf7)
14F32D8.1F32D8.1n/achrV 10,882,070contains similarity to Pfam domains PF07714 (Protein tyrosine kinase) , PF00069 (Protein kinase domain) contains similarity to Interpro domains IPR017441 (Protein kinase ATP binding, conserved site), IPR002290 (Serine/threonine protein kinase), IPR011009 (Protein kinase-like), IPR008271 (Serine/threonine protein kinase, active site), IPR000719 (Protein kinase, core), IPR001245 (Tyrosine protein kinase), IPR017442 (Serine/threonine protein kinase-related)
15C35A5.7C35A5.7n/achrV 10,512,499contains similarity to Interpro domains IPR017452 (GPCR, rhodopsin-like superfamily), IPR000276 (GPCR, rhodopsin-like)
16M176.4M176.4n/achrII 9,421,150contains similarity to Pfam domain PF07947 YhhN-like protein contains similarity to Interpro domains IPR012506 (YhhN-like), IPR003492 (Batten's disease protein Cln3)
17T26F2.2T26F2.2n/achrV 13,982,237contains similarity to Homo sapiens Isoform 1 of Protein Dom3Z; ENSEMBL:ENSP00000337759
18F07C6.3F07C6.3n/achrIV 12,789,701contains similarity to Coxiella burnetii Hypothetical protein.; TR:Q83D43
19fbxa-148Y102A5C.9n/achrV 16,939,509C. elegans FBXA-148 protein; contains similarity to Interpro domain IPR001810 (Cyclin-like F-box)
20K04H4.5K04H4.5n/achrIII 9,360,700contains similarity to Yaba monkey tumor virus Yb-L1L protein.; TR:Q9QBC3
21F55A4.2F55A4.2n/achrX 1,015,147
22C17H1.3C17H1.3n/achrI 13,105,263contains similarity to Trichomonas vaginalis G3 Smooth muscle caldesmon, putative.; TR:A2FBI1
23F58F9.1F58F9.1n/achrIV 6,251,691contains similarity to Pfam domain PF00268 Ribonucleotide reductase, small chain contains similarity to Interpro domains IPR012348 (Ribonucleotide reductase-related), IPR000358 (Ribonucleotide reductase), IPR009078 (Ferritin/ribonucleotide reductase-like)
24T14G12.6T14G12.6n/achrX 3,758,129contains similarity to Pfam domain PF02343 Domain of unknown function DUF130 contains similarity to Interpro domain IPR003326 (Protein of unknown function DUF130)
25C09F5.1C09F5.1n/achrIII 660,714
26C54E4.5C54E4.5n/achrIV 2,148,654contains similarity to Pfam domain PF05153 Family of unknown function (DUF706) contains similarity to Interpro domain IPR007828 (Protein of unknown function DUF706)
27srb-6R05H5.6n/achrII 10,195,792C. elegans SRB-6 protein; contains similarity to Pfam domains PF02117 (C.elegans Sra family integral membrane protein) , PF02175 (C.elegans integral membrane protein Srb) contains similarity to Interpro domains IPR002184 (Serpentine beta receptor), IPR000344 (Nematode chemoreceptor, Sra)
28bbs-2F20D12.3n/achrIV 7,935,876bbs-2 is orthologous to human BBS2 (OMIM:606151, mutated in Bardet-Biedl syndrome 2); while the function of BBS-2 is unknown, it shares conserved domains with its human paralogs BBS1 and BBS7, which also are mutated in other Bardet-Biedl syndromes.
29sprr-1R03A10.6n/achrX 15,467,342C. elegans SPRR-1 protein; contains similarity to Pfam domain PF00001 7 transmembrane receptor (rhodopsin family) contains similarity to Interpro domains IPR017452 (GPCR, rhodopsin-like superfamily), IPR000276 (GPCR, rhodopsin-like)
30C45G7.4C45G7.4n/achrIV 2,434,709contains similarity to Pfam domain PF00097 Zinc finger, C3HC4 type (RING finger) contains similarity to Interpro domains IPR001841 (Zinc finger, RING-type), IPR013083 (Zinc finger, RING/FYVE/PHD-type)
31R07G3.8R07G3.8n/achrII 7,619,307contains similarity to Pfam domain PF07159 Protein of unknown function (DUF1394) contains similarity to Interpro domain IPR009828 (Protein of unknown function DUF1394)
32C31B8.9C31B8.9n/achrV 2,912,083contains similarity to Pfam domain PF04590 Protein of unknown function, DUF595 contains similarity to Interpro domain IPR007669 (Protein of unknown function DUF595)
33C40A11.5C40A11.5n/achrII 2,134,686contains similarity to Pfam domain PF00102 Protein-tyrosine phosphatase contains similarity to Interpro domains IPR003595 (Protein-tyrosine phosphatase, catalytic), IPR000242 (Protein-tyrosine phosphatase, receptor/non-receptor type), IPR000387 (Protein-tyrosine phosphatase)
34B0198.2B0198.2n/achrX 12,030,645contains similarity to Dictyostelium discoideum Non-receptor tyrosine kinase spore lysis A (EC 2.7.1.112) (Tyrosine-sprotein kinase 1).; SW:KYK1_DICDI
35C34F6.7C34F6.7n/achrX 11,212,716contains similarity to Drosophila melanogaster Flybase gene name is CG14646-PA;; FLYBASE:CG14646
36clec-34T25E12.8n/achrV 16,736,555C. elegans CLEC-34 protein; contains similarity to Pfam domain PF00059 Lectin C-type domain contains similarity to Interpro domains IPR016187 (C-type lectin fold), IPR016186 (C-type lectin-like), IPR001304 (C-type lectin)
37str-52C45H4.12n/achrV 2,145,082C. elegans STR-52 protein; contains similarity to Pfam domain PF01461 7TM chemoreceptor contains similarity to Interpro domain IPR003002 (7TM chemoreceptor, subfamily 1)
38nhr-36F07C3.10n/achrV 9,258,968C. elegans NHR-36 protein; contains similarity to Pfam domains PF00104 (Ligand-binding domain of nuclear hormone receptor) , PF01461 (7TM chemoreceptor) , PF00105 (Zinc finger, C4 type (two domains)) contains similarity to Interpro domains IPR008946 (Nuclear hormone receptor, ligand-binding), IPR003002 (7TM chemoreceptor, subfamily 1), IPR001723 (Steroid hormone receptor), IPR000324 (Vitamin D receptor), IPR013088 (Zinc finger, NHR/GATA-type), IPR001628 (Zinc finger, nuclear hormone receptor-type), IPR000536 (Nuclear hormone receptor, ligand-binding, core)
39ugt-20K08B4.4n/achrIV 6,082,263C. elegans UGT-20 protein; contains similarity to Pfam domains PF04101 (Glycosyltransferase family 28 C-terminal domain) , PF00201 (UDP-glucoronosyl and UDP-glucosyl transferase) contains similarity to Interpro domains IPR002213 (UDP-glucuronosyl/UDP-glucosyltransferase), IPR007235 (Glycosyl transferase, family 28, C-terminal)
40amt-3M195.3n/achrII 8,366,108amt-3 encodes one of four C. elegans homologs of AMT1 (AT11_ARATH), a high-affinity ammonium transporter from Arabidopsis thaliana; AMT-3 is closely similar to its paralog AMT-2, with somewhat more distant paralogy to AMT-1 and AMT-4.
41C38D9.5C38D9.5n/achrV 17,589,380contains similarity to Pfam domain PF02206 Domain of unknown function contains similarity to Interpro domains IPR002110 (Ankyrin), IPR003125 (Protein of unknown function WSN), IPR001357 (BRCT)
42srsx-35F53F8.2n/achrV 20,677,605C. elegans SRSX-35 protein; contains similarity to Pfam domain PF00001 7 transmembrane receptor (rhodopsin family) contains similarity to Interpro domains IPR017452 (GPCR, rhodopsin-like superfamily), IPR013305 (ABC transporter, ABCB2), IPR000276 (GPCR, rhodopsin-like)
43glb-9C28F5.2n/achrII 7,510,599glb-9 encodes a globin with no obvious function in mass RNAi assays.
44C15C8.5C15C8.5n/achrV 12,749,106contains similarity to Interpro domain IPR016054 (Ly-6 antigen / uPA receptor -like)
45pbs-6C02F5.9n/achrIII 8,243,577The pbs-6 gene encodes a homolog of mammalian PSMB1.
46F38C2.4F38C2.4n/achrIV 16,270,980contains similarity to Pfam domain PF05050 Protein of unknown function (DUF672) contains similarity to Interpro domain IPR007744 (Protein of unknown function DUF672)
47dhs-16C10F3.2n/achrV 5,984,592dhs-16 encodes a short-chain dehydrogenase predicted to be mitochondrial.
48npr-1C39E6.6n/achrX 4,768,551npr-1 encodes a predicted G protein-coupled neuropeptide receptor that is homologous to the mammalian neuropeptide Y (NPY) receptor (OMIM:162641) required for regulating anxiety, food consumption, and pain sensation; in C. elegans, NPR-1 is involved in ethological variations of social behavior such as social versus solitary feeding; NPR-1 also affects some aspect of UNC-6/netrin-mediated branching of motor neurons, as strong npr-1 mutations can suppress abnormal migration of ventral nerve cord neurons induced by overexpression of UNC-6 lacking domain C; NPR-1 is expressed predominantly in the nervous system, and particularly in the AQR, PQR, and URX neurons that are exposed to the body fluid.
49srr-1W07G4.6n/achrV 13,051,818C. elegans SRR-1 protein; contains similarity to Pfam domain PF03268 Caenorhabditis protein of unknown function, DUF267 contains similarity to Interpro domain IPR004950 (Protein of unknown function DUF267, Caenorhabditis species)
50K11H3.5K11H3.5n/achrIII 9,844,623contains similarity to Homo sapiens Splice isoform 1 of P49321 Nuclear autoantigenic sperm protein; ENSEMBL:ENSP00000320980