Affine Alignment
 
Alignment between CDK13 (top ENST00000181839.10_6 1512aa) and CDK13 (bottom ENST00000181839.10_6 1512aa) score 148599

0001 MPSSSDTALGGGGGLSWAEKKLEERRKRRRFLSPQQPPLLLPLLQPQLLQPPPPPPPLLF 0060
     ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
0001 MPSSSDTALGGGGGLSWAEKKLEERRKRRRFLSPQQPPLLLPLLQPQLLQPPPPPPPLLF 0060

0061 LAAPGTAAAAAAAAAASSSCFSPGPPLEVKRLARGKRRAGGRQKRRRGPRAGQEAEKRRV 0120
     ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
0061 LAAPGTAAAAAAAAAASSSCFSPGPPLEVKRLARGKRRAGGRQKRRRGPRAGQEAEKRRV 0120

0121 FSLPQPQQDGGGGASSGGGVTPLVEYEDVSSQSEQGLLLGGASAATAATAAGGTGGSGGS 0180
     ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
0121 FSLPQPQQDGGGGASSGGGVTPLVEYEDVSSQSEQGLLLGGASAATAATAAGGTGGSGGS 0180

0181 PASSSGTQRRGEGSERRPRRDRRSSSGRSKERHREHRRRDGQRGGSEASKSRSRHSHSGE 0240
     ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
0181 PASSSGTQRRGEGSERRPRRDRRSSSGRSKERHREHRRRDGQRGGSEASKSRSRHSHSGE 0240

0241 ERAEVAKSGSSSSSGGRRKSASATSSSSSSRKDRDSKAHRSRTKSSKEPPSAYKEPPKAY 0300
     ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
0241 ERAEVAKSGSSSSSGGRRKSASATSSSSSSRKDRDSKAHRSRTKSSKEPPSAYKEPPKAY 0300

0301 REDKTEPKAYRRRRSLSPLGGRDDSPVSHRASQSLRSRKSPSPAGGGSSPYSRRLPRSPS 0360
     ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
0301 REDKTEPKAYRRRRSLSPLGGRDDSPVSHRASQSLRSRKSPSPAGGGSSPYSRRLPRSPS 0360

0361 PYSRRRSPSYSRHSSYERGGDVSPSPYSSSSWRRSRSPYSPVLRRSGKSRSRSPYSSRHS 0420
     ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
0361 PYSRRRSPSYSRHSSYERGGDVSPSPYSSSSWRRSRSPYSPVLRRSGKSRSRSPYSSRHS 0420

0421 RSRSRHRLSRSRSRHSSISPSTLTLKSSLAAELNKNKKARAAEAARAAEAAKAAEATKAA 0480
     ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
0421 RSRSRHRLSRSRSRHSSISPSTLTLKSSLAAELNKNKKARAAEAARAAEAAKAAEATKAA 0480

0481 EAAAKAAKASNTSTPTKGNTETSASASQTNHVKDVKKIKIEHAPSPSSGGTLKNDKAKTK 0540
     ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
0481 EAAAKAAKASNTSTPTKGNTETSASASQTNHVKDVKKIKIEHAPSPSSGGTLKNDKAKTK 0540

0541 PPLQVTKVENNLIVDKATKKAVIVGKESKSAATKEESVSLKEKTKPLTPSIGAKEKEQHV 0600
     ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
0541 PPLQVTKVENNLIVDKATKKAVIVGKESKSAATKEESVSLKEKTKPLTPSIGAKEKEQHV 0600

0601 ALVTSTLPPLPLPPMLPEDKEADSLRGNISVKAVKKEVEKKLRCLLADLPLPPELPGGDD 0660
     ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
0601 ALVTSTLPPLPLPPMLPEDKEADSLRGNISVKAVKKEVEKKLRCLLADLPLPPELPGGDD 0660

0661 LSKSPEEKKTATQLHSKRRPKICGPRYGETKEKDIDWGKRCVDKFDIIGIIGEGTYGQVY 0720
     ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
0661 LSKSPEEKKTATQLHSKRRPKICGPRYGETKEKDIDWGKRCVDKFDIIGIIGEGTYGQVY 0720

0721 KARDKDTGEMVALKKVRLDNEKEGFPITAIREIKILRQLTHQSIINMKEIVTDKEDALDF 0780
     ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
0721 KARDKDTGEMVALKKVRLDNEKEGFPITAIREIKILRQLTHQSIINMKEIVTDKEDALDF 0780

0781 KKDKGAFYLVFEYMDHDLMGLLESGLVHFNENHIKSFMRQLMEGLDYCHKKNFLHRDIKC 0840
     ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
0781 KKDKGAFYLVFEYMDHDLMGLLESGLVHFNENHIKSFMRQLMEGLDYCHKKNFLHRDIKC 0840

0841 SNILLNNRGQIKLADFGLARLYSSEESRPYTNKVITLWYRPPELLLGEERYTPAIDVWSC 0900
     ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
0841 SNILLNNRGQIKLADFGLARLYSSEESRPYTNKVITLWYRPPELLLGEERYTPAIDVWSC 0900

0901 GCILGELFTKKPIFQANQELAQLELISRICGSPCPAVWPDVIKLPYFNTMKPKKQYRRKL 0960
     ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
0901 GCILGELFTKKPIFQANQELAQLELISRICGSPCPAVWPDVIKLPYFNTMKPKKQYRRKL 0960

0961 REEFVFIPAAALDLFDYMLALDPSKRCTAEQALQCEFLRDVEPSKMPPPDLPLWQDCHEL 1020
     ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
0961 REEFVFIPAAALDLFDYMLALDPSKRCTAEQALQCEFLRDVEPSKMPPPDLPLWQDCHEL 1020

1021 WSKKRRRQKQMGMTDDVSTIKAPRKDLSLGLDDSRTNTPQGVLPSSQLKSQGSSNVAPVK 1080
     ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
1021 WSKKRRRQKQMGMTDDVSTIKAPRKDLSLGLDDSRTNTPQGVLPSSQLKSQGSSNVAPVK 1080

1081 TGPGQHLNHSELAILLNLLQSKTSVNMADFVQVLNIKVNSETQQQLNKINLPAGILATGE 1140
     ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
1081 TGPGQHLNHSELAILLNLLQSKTSVNMADFVQVLNIKVNSETQQQLNKINLPAGILATGE 1140

1141 KQTDPSTPQQESSKPLGGIQPSSQTIQPKVETDAAQAAVQSAFAVLLTQLIKAQQSKQKD 1200
     ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
1141 KQTDPSTPQQESSKPLGGIQPSSQTIQPKVETDAAQAAVQSAFAVLLTQLIKAQQSKQKD 1200

1201 VLLEERENGSGHEASLQLRPPPEPSTPVSGQDDLIQHQDMRILELTPEPDRPRILPPDQR 1260
     ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
1201 VLLEERENGSGHEASLQLRPPPEPSTPVSGQDDLIQHQDMRILELTPEPDRPRILPPDQR 1260

1261 PPEPPEPPPVTEEDLDYRTENQHVPTTSSSLTDPHAGVKAALLQLLAQHQPQDDPKREGG 1320
     ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
1261 PPEPPEPPPVTEEDLDYRTENQHVPTTSSSLTDPHAGVKAALLQLLAQHQPQDDPKREGG 1320

1321 IDYQAGDTYVSTSDYKDNFGSSSFSSAPYVSNDGLGSSSAPPLERRSFIGNSDIQSLDNY 1380
     ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
1321 IDYQAGDTYVSTSDYKDNFGSSSFSSAPYVSNDGLGSSSAPPLERRSFIGNSDIQSLDNY 1380

1381 STASSHSGGPPQPSAFSESFPSSVAGYGDIYLNAGPMLFSGDKDHRFEYSHGPIAVLANS 1440
     ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
1381 STASSHSGGPPQPSAFSESFPSSVAGYGDIYLNAGPMLFSGDKDHRFEYSHGPIAVLANS 1440

1441 SDPSTGPESTHPLPAKMHNYNYGGNLQENPSGPSLMHGQTWTSPAQGPGYSQGYRGHIST 1500
     ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
1441 SDPSTGPESTHPLPAKMHNYNYGGNLQENPSGPSLMHGQTWTSPAQGPGYSQGYRGHIST 1500

1501 STGRGRGRGLPY 1512
     ||||||||||||
1501 STGRGRGRGLPY 1512