Alignment between PCDHB3 (top ENST00000231130.3 796aa) and PCDHB9 (bottom ENST00000316105.7 797aa) score 57247

001 MEAGGERFLRQRQVLLLFVFLGGSLAGSESRRYSVAEEKEKGFLIANLAKDLGLRVEELA 060
    |+  |  | |||||| ||+| | |||||   |||| || |||  + ||||||||   |||
001 MKTRGFSFPRQRQVLFLFLFWGVSLAGSGFGRYSVTEETEKGSFVVNLAKDLGLAEGELA 060

061 ARGAQVVSKGNKQHFQLSHQTGDLLLNEKLDREELCGPTEPCILHFQILLQNPLQFVTNE 120
    ||| +|||  |||+  |   ||+|| |||||||+|||| |||+|+||||+ +| |    |
061 ARGTRVVSDDNKQYLLLDSHTGNLLTNEKLDREKLCGPKEPCMLYFQILMDDPFQIYRAE 120

121 LRIIDVNDHSPVFFENEMHLKILESTLPGTVIPLGNAEDLDVGRNSLQNYTITPNSHFHV 180
    ||+ |+|||||||   || ||| |+|  ||   |  |+| | | ||+|||||+ || ||+
121 LRVRDINDHSPVFRHKEMVLKISENTAEGTAFRLERAQDPDEGHNSIQNYTISSNSFFHI 180

181 LTRSRRDGRKYPELVLDKALDPEEQPELSLTLTALDGGSPPRSGTAQINIQVLDINDNAP 240
          +|  ||||||||||| ||| |||||||||||||| ||||+ | | |||+||| |
181 KISGSDEGMIYPELVLDKALDREEQEELSLTLTALDGGSPSRSGTSTIRIVVLDVNDNVP 240

241 EFAQPLYEVAVLENTPVNSVIVTVSASDLDTGSFGTISYAFFHASEEIRKTFQLNPITGD 300
    +||| |||    ||+|| |+|| ||| | |+|    +||+|| |||+|  |||+|| +|+
241 QFAQALYETQAPENSPVGSLIVKVSAGDADSGVNAEVSYSFFDASEDILTTFQINPFSGE 300

301 MQLVKYLNFEAINSYEVDIEAKDGGGLSGKSTVIVQVVDVNDNPPELTLSSVNSPIPENS 360
    + | + |++| +|||+++|+| |||||| + ||+++|+| ||||||| +||+++ + |||
301 IFLRELLDYELVNSYKINIQAMDGGGLSARCTVLIKVLDSNDNPPELIISSLSNSVAENS 360

361 GETVLAVFSVSDLDSGDNGRVMCSIENNLPFFLKPSVENFYTLVSEGALDRETRSEYNIT 420
       ||||| + | |||+||+ +| +++||||||||||+||| |++|||||||+++|||||
361 PGIVLAVFKIKDRDSGENGKTICYVQDNLPFFLKPSVDNFYILMTEGALDRESKAEYNIT 420

421 ITITDLGTPRLKTKYNITVLVSDVNDNAPAFTQISYTLFVRENNSPALHIGSVSATDRDS 480
    ||+||||||||||+++||+ ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||
421 ITVTDLGTPRLKTEHSITLQVSDVNDNAPAFTQTSYTLFVRENNSPALHIGSVSATDRDS 480

481 GTNAQVTYSLLPPQDPHLPLSSLVSINADNGHLFALRSLDYEALQAFEFRVGATDRGSPA 540
    ||||||||||||||||||||+||||||||||||||||||||||||||+|||||+||||||
481 GTNAQVTYSLLPPQDPHLPLASLVSINADNGHLFALRSLDYEALQAFDFRVGASDRGSPA 540

541 LSSEALVRVLVLDANDNSPFVLYPLQNGSAPCTELVPRAAEPGYLVTKVVAVDGDSGQNA 600
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
541 LSSEALVRVLVLDANDNSPFVLYPLQNGSAPCTELVPRAAEPGYLVTKVVAVDGDSGQNA 600

601 WLSYQLLKATEPGLFGVWAHNGEVRTARLLSERDAAKHRLVVLVKDNGEPPRSATATLHV 660
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
601 WLSYQLLKATEPGLFGVWAHNGEVRTARLLSERDAAKHRLVVLVKDNGEPPRSATATLHV 660

661 LLVDGFSQPYLPLPEAAPAQAQADLLTVYLVVALASVSSLFLFSVLLFVAVRLCRRSRAA 720
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||
661 LLVDGFSQPYLPLPEAAPAQAQADLLTVYLVVALASVSSLFLLSVLLFVAVRLCRRSRAA 720

721 SVGRCSVPEGPFPGQMVDVSGTGTLSQSYQYEVCLTGGSGTNEFKFLKPIIPNFVAQGAE 780
    |||||||||||||| +||||||||| ||||||||||||| | |||||||| |+       
721 SVGRCSVPEGPFPGHLVDVSGTGTLFQSYQYEVCLTGGSETGEFKFLKPITPHLPPHRGG 780

781 RVSEANPSFRKSFEFS 796
    +  | | +   || |+
781 KEIEENSTLPNSFGFN 796